MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas stutzeri CCUG 29243 chromosome

Total Repeats: 107443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_018028	TCG	2	6	551715	551720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419570
13002	NC_018028	TCG	2	6	551729	551734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419570
13003	NC_018028	GCT	2	6	551769	551774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419570
13004	NC_018028	GTG	2	6	551794	551799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419570
13005	NC_018028	GC	3	6	551818	551823	0 %	0 %	50 %	50 %	392419570
13006	NC_018028	CGG	2	6	551850	551855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419570
13007	NC_018028	GGC	2	6	551955	551960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419570
13008	NC_018028	CCGG	2	8	552002	552009	0 %	0 %	50 %	50 %	392419570
13009	NC_018028	CCG	2	6	552019	552024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419570
13010	NC_018028	TGC	2	6	552047	552052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419570
13011	NC_018028	GCT	2	6	552150	552155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419570
13012	NC_018028	GTC	2	6	552178	552183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419570
13013	NC_018028	GAG	2	6	552208	552213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392419570
13014	NC_018028	CTGG	2	8	552216	552223	0 %	25 %	50 %	25 %	392419570
13015	NC_018028	GAC	2	6	552231	552236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419570
13016	NC_018028	CTG	2	6	552247	552252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419570
13017	NC_018028	CAA	2	6	552297	552302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392419570
13018	NC_018028	ATC	2	6	552304	552309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419570
13019	NC_018028	GCCG	2	8	552369	552376	0 %	0 %	50 %	50 %	392419570
13020	NC_018028	TGC	2	6	552389	552394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419570
13021	NC_018028	CAA	2	6	552468	552473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392419570
13022	NC_018028	CTTT	2	8	552602	552609	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13023	NC_018028	GAA	2	6	552688	552693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419571
13024	NC_018028	TGC	2	6	552696	552701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419571
13025	NC_018028	TTG	2	6	552716	552721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392419571
13026	NC_018028	GCC	2	6	552821	552826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419571
13027	NC_018028	TGC	2	6	552828	552833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419571
13028	NC_018028	GC	3	6	552919	552924	0 %	0 %	50 %	50 %	392419571
13029	NC_018028	GGGC	2	8	552930	552937	0 %	0 %	75 %	25 %	392419571
13030	NC_018028	TGC	2	6	552966	552971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419571
13031	NC_018028	CTGGC	2	10	552977	552986	0 %	20 %	40 %	40 %	392419571
13032	NC_018028	CGGCC	2	10	553012	553021	0 %	0 %	40 %	60 %	392419571
13033	NC_018028	AGG	2	6	553167	553172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392419571
13034	NC_018028	CGAC	2	8	553188	553195	25 %	0 %	25 %	50 %	392419571
13035	NC_018028	CTG	2	6	553217	553222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419571
13036	NC_018028	GCT	2	6	553404	553409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13037	NC_018028	GCAG	2	8	553413	553420	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13038	NC_018028	GCG	2	6	553494	553499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13039	NC_018028	CAG	2	6	553599	553604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419572
13040	NC_018028	CAG	2	6	553620	553625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419572
13041	NC_018028	GCA	2	6	553635	553640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419572
13042	NC_018028	CGGA	2	8	553662	553669	25 %	0 %	50 %	25 %	392419572
13043	NC_018028	CG	4	8	553672	553679	0 %	0 %	50 %	50 %	392419572
13044	NC_018028	CTG	2	6	553680	553685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419572
13045	NC_018028	CAG	2	6	553722	553727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419572
13046	NC_018028	GGCT	2	8	553768	553775	0 %	25 %	50 %	25 %	392419572
13047	NC_018028	AGC	2	6	553777	553782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419572
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13049	NC_018028	CGC	2	6	553904	553909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419572
13050	NC_018028	TCG	2	6	553939	553944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419572
13051	NC_018028	CTG	2	6	553969	553974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419572
13052	NC_018028	TTG	2	6	554019	554024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392419572
13053	NC_018028	GCA	2	6	554045	554050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419572
13054	NC_018028	GCG	2	6	554076	554081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419572
13055	NC_018028	CCG	2	6	554095	554100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419572
13056	NC_018028	GGT	2	6	554146	554151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419572
13057	NC_018028	GAACG	2	10	554184	554193	40 %	0 %	40 %	20 %	392419572
13058	NC_018028	TCG	2	6	554194	554199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419572
13059	NC_018028	GTC	2	6	554214	554219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419572
13060	NC_018028	TCG	2	6	554257	554262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419572
13061	NC_018028	TGC	2	6	554315	554320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419572
13062	NC_018028	GTC	3	9	554343	554351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419572
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13066	NC_018028	GCT	2	6	554603	554608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419572
13067	NC_018028	CTG	2	6	554613	554618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419572
13068	NC_018028	CTG	2	6	554709	554714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419572
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13076	NC_018028	CAG	3	9	554967	554975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419572
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13082	NC_018028	TGCC	2	8	555202	555209	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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13084	NC_018028	GC	3	6	555224	555229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13085	NC_018028	TGCC	2	8	555261	555268	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13086	NC_018028	GC	3	6	555450	555455	0 %	0 %	50 %	50 %	392419573
13087	NC_018028	TCG	2	6	555457	555462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419573
13088	NC_018028	CAG	2	6	555502	555507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419573
13089	NC_018028	GGGCA	2	10	555556	555565	20 %	0 %	60 %	20 %	392419573
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13093	NC_018028	GCCG	2	8	555750	555757	0 %	0 %	50 %	50 %	392419573
13094	NC_018028	GC	3	6	555771	555776	0 %	0 %	50 %	50 %	392419573
13095	NC_018028	CCG	2	6	555840	555845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419573
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13101	NC_018028	TCG	2	6	556250	556255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419573
13102	NC_018028	CTG	2	6	556276	556281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419573
13103	NC_018028	GGCC	2	8	556368	556375	0 %	0 %	50 %	50 %	392419573
13104	NC_018028	CTG	2	6	556462	556467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419573
13105	NC_018028	AAC	2	6	556516	556521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13106	NC_018028	GTC	2	6	556651	556656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419574
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13109	NC_018028	GGTCA	2	10	556810	556819	20 %	20 %	40 %	20 %	392419574
13110	NC_018028	GGC	2	6	556912	556917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419574
13111	NC_018028	CGC	2	6	556923	556928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419574
13112	NC_018028	CTT	2	6	556950	556955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392419574
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13115	NC_018028	CGG	2	6	557076	557081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419574
13116	NC_018028	CAC	2	6	557116	557121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392419574
13117	NC_018028	GCC	2	6	557144	557149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419574
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13119	NC_018028	TCG	2	6	557201	557206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419574
13120	NC_018028	GCC	2	6	557302	557307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419574
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13227	NC_018028	ATG	2	6	561832	561837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13228	NC_018028	ATG	2	6	561843	561848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13229	NC_018028	CGT	2	6	561882	561887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13230	NC_018028	GTT	2	6	561988	561993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392419577
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13232	NC_018028	GATG	2	8	562078	562085	25 %	25 %	50 %	0 %	392419577
13233	NC_018028	GC	5	10	562087	562096	0 %	0 %	50 %	50 %	392419577
13234	NC_018028	TCG	2	6	562101	562106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419577
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13238	NC_018028	CGC	2	6	562399	562404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419577
13239	NC_018028	CCG	2	6	562434	562439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419577
13240	NC_018028	GCTG	2	8	562507	562514	0 %	25 %	50 %	25 %	392419577
13241	NC_018028	GCGG	2	8	562561	562568	0 %	0 %	75 %	25 %	392419577
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13350	NC_018028	ATCAGC	2	12	566789	566800	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	392419581
13351	NC_018028	GCG	2	6	566832	566837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419581
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13353	NC_018028	GGT	2	6	566900	566905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419581
13354	NC_018028	AGATC	2	10	566914	566923	40 %	20 %	20 %	20 %	392419581
13355	NC_018028	GTG	2	6	566930	566935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419581
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13473	NC_018028	CAGG	2	8	572272	572279	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13474	NC_018028	CG	4	8	572405	572412	0 %	0 %	50 %	50 %	392419587
13475	NC_018028	AGC	2	6	572418	572423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419587
13476	NC_018028	TTC	2	6	572436	572441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392419587
13477	NC_018028	ACA	2	6	572575	572580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392419587
13478	NC_018028	GCA	2	6	572584	572589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419587
13479	NC_018028	CGACAG	2	12	572591	572602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419587
13480	NC_018028	GCC	2	6	572621	572626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419587
13481	NC_018028	GCT	2	6	572707	572712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419587
13482	NC_018028	TCC	2	6	572795	572800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13483	NC_018028	AG	3	6	572841	572846	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13484	NC_018028	AGCGC	2	10	572958	572967	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13485	NC_018028	TGC	2	6	573022	573027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419588
13486	NC_018028	CTGG	2	8	573041	573048	0 %	25 %	50 %	25 %	392419588
13487	NC_018028	TGC	2	6	573097	573102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419588
13488	NC_018028	CAT	2	6	573110	573115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419588
13489	NC_018028	TGC	2	6	573124	573129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419588
13490	NC_018028	CTG	2	6	573141	573146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419588
13491	NC_018028	GC	3	6	573147	573152	0 %	0 %	50 %	50 %	392419588
13492	NC_018028	GGC	2	6	573179	573184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419588
13493	NC_018028	AGC	2	6	573186	573191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419588
13494	NC_018028	GCT	3	9	573209	573217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419588
13495	NC_018028	CCG	2	6	573222	573227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419588
13496	NC_018028	TGA	2	6	573263	573268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419588
13497	NC_018028	TCG	2	6	573280	573285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419588
13498	NC_018028	GCT	2	6	573302	573307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419588
13499	NC_018028	GGCT	2	8	573327	573334	0 %	25 %	50 %	25 %	392419588
13500	NC_018028	AGC	2	6	573358	573363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419588

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