MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas stutzeri CCUG 29243 chromosome

Total Repeats: 107443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_018028	GAC	2	6	482726	482731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419516
11502	NC_018028	CGC	2	6	482741	482746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419516
11503	NC_018028	GCC	2	6	482761	482766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419516
11504	NC_018028	AGC	2	6	482810	482815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419516
11505	NC_018028	GCC	2	6	482863	482868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419516
11506	NC_018028	TGA	2	6	482894	482899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419516
11507	NC_018028	ACCTG	2	10	482912	482921	20 %	20 %	20 %	40 %	392419516
11508	NC_018028	CTGGCC	2	12	482950	482961	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	392419516
11509	NC_018028	CG	3	6	482976	482981	0 %	0 %	50 %	50 %	392419516
11510	NC_018028	CGCAG	2	10	482993	483002	20 %	0 %	40 %	40 %	392419516
11511	NC_018028	TCG	2	6	483035	483040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419516
11512	NC_018028	CGG	2	6	483054	483059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419516
11513	NC_018028	GGATCT	2	12	483081	483092	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	392419516
11514	NC_018028	ACG	2	6	483104	483109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419516
11515	NC_018028	GCC	2	6	483118	483123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419516
11516	NC_018028	CAT	2	6	483183	483188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419516
11517	NC_018028	ACC	2	6	483208	483213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392419516
11518	NC_018028	TGCGCC	2	12	483239	483250	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	392419516
11519	NC_018028	GCT	2	6	483267	483272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419516
11520	NC_018028	AGG	2	6	483311	483316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392419516
11521	NC_018028	GTGC	2	8	483343	483350	0 %	25 %	50 %	25 %	392419516
11522	NC_018028	CCG	2	6	483380	483385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419516
11523	NC_018028	GCGTGA	2	12	483417	483428	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	392419516
11524	NC_018028	GC	3	6	483462	483467	0 %	0 %	50 %	50 %	392419516
11525	NC_018028	CCG	2	6	483512	483517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419516
11526	NC_018028	GGT	2	6	483565	483570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419516
11527	NC_018028	CTG	2	6	483634	483639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419516
11528	NC_018028	TGA	2	6	483689	483694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419516
11529	NC_018028	TGC	2	6	483713	483718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419516
11530	NC_018028	CGC	2	6	483741	483746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419516
11531	NC_018028	AGC	2	6	483770	483775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419516
11532	NC_018028	GTG	2	6	483781	483786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419516
11533	NC_018028	ACG	2	6	483803	483808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419516
11534	NC_018028	TCG	2	6	483861	483866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11535	NC_018028	GAG	2	6	483890	483895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_018028	ACC	2	6	483971	483976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392419517
11537	NC_018028	GC	3	6	484027	484032	0 %	0 %	50 %	50 %	392419517
11538	NC_018028	ACA	2	6	484035	484040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392419517
11539	NC_018028	ACCG	2	8	484079	484086	25 %	0 %	25 %	50 %	392419517
11540	NC_018028	CA	3	6	484101	484106	50 %	0 %	0 %	50 %	392419517
11541	NC_018028	ATGCCG	2	12	484115	484126	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	392419517
11542	NC_018028	GAAG	2	8	484132	484139	50 %	0 %	50 %	0 %	392419517
11543	NC_018028	CGC	2	6	484159	484164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419517
11544	NC_018028	GC	3	6	484237	484242	0 %	0 %	50 %	50 %	392419517
11545	NC_018028	TCG	2	6	484266	484271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419517
11546	NC_018028	CGA	2	6	484300	484305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419517
11547	NC_018028	CAC	2	6	484352	484357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392419517
11548	NC_018028	CGG	2	6	484435	484440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419517
11549	NC_018028	CGA	2	6	484444	484449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419517
11550	NC_018028	TCA	3	9	484506	484514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419517
11551	NC_018028	GCCT	2	8	484547	484554	0 %	25 %	25 %	50 %	392419517
11552	NC_018028	GCC	2	6	484589	484594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419517
11553	NC_018028	TGA	2	6	484633	484638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419517
11554	NC_018028	CGA	2	6	484651	484656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419517
11555	NC_018028	CTT	2	6	484660	484665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392419517
11556	NC_018028	CCG	3	9	484674	484682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419517
11557	NC_018028	CATCGG	2	12	484717	484728	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	392419517
11558	NC_018028	CCG	2	6	484729	484734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419517
11559	NC_018028	GTT	2	6	484959	484964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392419518
11560	NC_018028	GCCG	2	8	485024	485031	0 %	0 %	50 %	50 %	392419518
11561	NC_018028	TCC	2	6	485153	485158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392419518
11562	NC_018028	TTC	2	6	485191	485196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392419518
11563	NC_018028	GCG	2	6	485225	485230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419518
11564	NC_018028	TGA	2	6	485288	485293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419518
11565	NC_018028	GGCC	2	8	485474	485481	0 %	0 %	50 %	50 %	392419518
11566	NC_018028	CG	3	6	485580	485585	0 %	0 %	50 %	50 %	392419518
11567	NC_018028	GTG	2	6	485677	485682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419518
11568	NC_018028	GGCC	2	8	485722	485729	0 %	0 %	50 %	50 %	392419518
11569	NC_018028	CGC	2	6	485771	485776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419518
11570	NC_018028	GGT	2	6	485793	485798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419518
11571	NC_018028	CAA	2	6	485853	485858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392419518
11572	NC_018028	CG	4	8	485879	485886	0 %	0 %	50 %	50 %	392419518
11573	NC_018028	CAGT	2	8	485917	485924	25 %	25 %	25 %	25 %	392419518
11574	NC_018028	TCG	2	6	485962	485967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419519
11575	NC_018028	GGA	2	6	486048	486053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392419519
11576	NC_018028	TCG	2	6	486114	486119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419519
11577	NC_018028	GCG	2	6	486152	486157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419519
11578	NC_018028	GC	3	6	486175	486180	0 %	0 %	50 %	50 %	392419519
11579	NC_018028	TGCCG	2	10	486330	486339	0 %	20 %	40 %	40 %	392419519
11580	NC_018028	AGC	2	6	486344	486349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419519
11581	NC_018028	CTG	2	6	486469	486474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419519
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11583	NC_018028	AGCA	2	8	486499	486506	50 %	0 %	25 %	25 %	392419519
11584	NC_018028	GC	4	8	486598	486605	0 %	0 %	50 %	50 %	392419519
11585	NC_018028	GCG	2	6	486620	486625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419519
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11587	NC_018028	CGGG	2	8	486780	486787	0 %	0 %	75 %	25 %	392419519
11588	NC_018028	CGG	2	6	486825	486830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419519
11589	NC_018028	CGA	2	6	486870	486875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419519
11590	NC_018028	CGT	2	6	486891	486896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419519
11591	NC_018028	CTG	2	6	486913	486918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419519
11592	NC_018028	TGG	2	6	486977	486982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419520
11593	NC_018028	GAT	2	6	487052	487057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419520
11594	NC_018028	GCG	2	6	487169	487174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419520
11595	NC_018028	CAA	2	6	487199	487204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392419520
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11598	NC_018028	GC	3	6	487322	487327	0 %	0 %	50 %	50 %	392419520
11599	NC_018028	TGA	2	6	487360	487365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419520
11600	NC_018028	GCA	2	6	487376	487381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419520
11601	NC_018028	CGCC	2	8	487408	487415	0 %	0 %	25 %	75 %	392419520
11602	NC_018028	GCC	2	6	487433	487438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419520
11603	NC_018028	CGC	2	6	487455	487460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419520
11604	NC_018028	GC	3	6	487459	487464	0 %	0 %	50 %	50 %	392419520
11605	NC_018028	TGC	2	6	487472	487477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419520
11606	NC_018028	GAG	2	6	487521	487526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392419520
11607	NC_018028	CTG	3	9	487527	487535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419520
11608	NC_018028	CG	3	6	487603	487608	0 %	0 %	50 %	50 %	392419520
11609	NC_018028	GCT	2	6	487628	487633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419520
11610	NC_018028	CTG	2	6	487740	487745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419520
11611	NC_018028	CTG	2	6	487755	487760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419520
11612	NC_018028	TGC	2	6	487795	487800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419520
11613	NC_018028	ATGT	2	8	487840	487847	25 %	50 %	25 %	0 %	392419520
11614	NC_018028	GTG	2	6	487887	487892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419520
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11617	NC_018028	CG	3	6	487959	487964	0 %	0 %	50 %	50 %	392419520
11618	NC_018028	CGG	2	6	487999	488004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419520
11619	NC_018028	GGC	2	6	488027	488032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419520
11620	NC_018028	TCG	2	6	488159	488164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419521
11621	NC_018028	ACGC	2	8	488211	488218	25 %	0 %	25 %	50 %	392419521
11622	NC_018028	GCGA	2	8	488340	488347	25 %	0 %	50 %	25 %	392419521
11623	NC_018028	GCCA	2	8	488419	488426	25 %	0 %	25 %	50 %	392419521
11624	NC_018028	TCA	3	9	488435	488443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419521
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11626	NC_018028	GCTG	2	8	488489	488496	0 %	25 %	50 %	25 %	392419521
11627	NC_018028	CACCGG	2	12	488504	488515	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	392419521
11628	NC_018028	GC	3	6	488523	488528	0 %	0 %	50 %	50 %	392419521
11629	NC_018028	ATC	2	6	488582	488587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419521
11630	NC_018028	CTG	2	6	488611	488616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419521
11631	NC_018028	CG	3	6	488674	488679	0 %	0 %	50 %	50 %	392419521
11632	NC_018028	CTGG	2	8	488722	488729	0 %	25 %	50 %	25 %	392419521
11633	NC_018028	CGA	2	6	488826	488831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419521
11634	NC_018028	GCT	2	6	488838	488843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419521
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11636	NC_018028	CTG	2	6	488915	488920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419522
11637	NC_018028	CTG	2	6	489012	489017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419522
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11639	NC_018028	TCG	2	6	489100	489105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419522
11640	NC_018028	GCCG	2	8	489106	489113	0 %	0 %	50 %	50 %	392419522
11641	NC_018028	CCG	2	6	489149	489154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419522
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11643	NC_018028	G	6	6	489220	489225	0 %	0 %	100 %	0 %	392419522
11644	NC_018028	GAT	2	6	489227	489232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419522
11645	NC_018028	GC	3	6	489336	489341	0 %	0 %	50 %	50 %	392419522
11646	NC_018028	CTG	2	6	489399	489404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419522
11647	NC_018028	CGT	2	6	489417	489422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419522
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11651	NC_018028	GCG	2	6	489671	489676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419523
11652	NC_018028	GA	3	6	489680	489685	50 %	0 %	50 %	0 %	392419523
11653	NC_018028	CTG	2	6	489729	489734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419523
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11660	NC_018028	CTG	2	6	489977	489982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419523
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11682	NC_018028	ATGC	2	8	490804	490811	25 %	25 %	25 %	25 %	392419524
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11731	NC_018028	CGG	2	6	492789	492794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419525
11732	NC_018028	GC	3	6	492797	492802	0 %	0 %	50 %	50 %	392419525
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11734	NC_018028	GAC	2	6	492838	492843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419525
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11736	NC_018028	TGC	2	6	492897	492902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419525
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11872	NC_018028	GAC	2	6	500668	500673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419532
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11874	NC_018028	TGC	2	6	500762	500767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419532
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11885	NC_018028	GGCT	2	8	501220	501227	0 %	25 %	50 %	25 %	392419533
11886	NC_018028	GCTG	2	8	501230	501237	0 %	25 %	50 %	25 %	392419533
11887	NC_018028	CTGGG	2	10	501255	501264	0 %	20 %	60 %	20 %	392419533
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11930	NC_018028	CGG	2	6	503167	503172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419534
11931	NC_018028	CTG	2	6	503190	503195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419534
11932	NC_018028	CG	3	6	503204	503209	0 %	0 %	50 %	50 %	392419534
11933	NC_018028	GCA	2	6	503237	503242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419534
11934	NC_018028	A	6	6	503268	503273	100 %	0 %	0 %	0 %	392419534
11935	NC_018028	CGC	2	6	503310	503315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419534
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11942	NC_018028	CTG	2	6	503669	503674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419535
11943	NC_018028	TGG	2	6	503678	503683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419535
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11945	NC_018028	GCG	3	9	503731	503739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419535
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11957	NC_018028	CTG	2	6	504184	504189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419535
11958	NC_018028	GGC	2	6	504279	504284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419535
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11968	NC_018028	CTG	2	6	504727	504732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419535
11969	NC_018028	GCG	2	6	504764	504769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419535
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11974	NC_018028	TCG	2	6	504869	504874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419535
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11977	NC_018028	GCC	2	6	504992	504997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419536
11978	NC_018028	TCG	2	6	505022	505027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419536
11979	NC_018028	GCG	2	6	505047	505052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419536
11980	NC_018028	CTG	2	6	505141	505146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419536
11981	NC_018028	GC	3	6	505186	505191	0 %	0 %	50 %	50 %	392419536
11982	NC_018028	GCGAG	2	10	505377	505386	20 %	0 %	60 %	20 %	392419536
11983	NC_018028	AGCC	2	8	505466	505473	25 %	0 %	25 %	50 %	392419536
11984	NC_018028	CAG	2	6	505486	505491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419536
11985	NC_018028	TTC	2	6	505495	505500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392419536
11986	NC_018028	TAC	2	6	505576	505581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419536
11987	NC_018028	GCG	3	9	505717	505725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419536
11988	NC_018028	CTGG	2	8	505783	505790	0 %	25 %	50 %	25 %	392419536
11989	NC_018028	TC	3	6	505861	505866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11990	NC_018028	CG	3	6	505887	505892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11991	NC_018028	CGC	2	6	505910	505915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11992	NC_018028	GCT	2	6	505927	505932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11993	NC_018028	GCA	3	9	505963	505971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419537
11994	NC_018028	TGC	2	6	505993	505998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419537
11995	NC_018028	GAT	2	6	506013	506018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419537
11996	NC_018028	CTT	2	6	506115	506120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392419537
11997	NC_018028	CAG	2	6	506226	506231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419537
11998	NC_018028	CCG	2	6	506233	506238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419537
11999	NC_018028	TGC	2	6	506320	506325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419537
12000	NC_018028	GCACCA	2	12	506354	506365	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	392419537

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