MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas stutzeri CCUG 29243 chromosome

Total Repeats: 107443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
103001	NC_018028	CTG	2	6	4505309	4505314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423215
103002	NC_018028	GCT	2	6	4505371	4505376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423215
103003	NC_018028	GGC	2	6	4505378	4505383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423215
103004	NC_018028	CTGGAG	2	12	4505390	4505401	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	392423215
103005	NC_018028	CGA	2	6	4505509	4505514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423215
103006	NC_018028	TTC	2	6	4505516	4505521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423215
103007	NC_018028	GGT	2	6	4505599	4505604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392423215
103008	NC_018028	GAG	2	6	4505609	4505614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423215
103009	NC_018028	CTG	2	6	4505624	4505629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423215
103010	NC_018028	CAGC	2	8	4505677	4505684	25 %	0 %	25 %	50 %	392423215
103011	NC_018028	GCCA	2	8	4505786	4505793	25 %	0 %	25 %	50 %	392423215
103012	NC_018028	GC	3	6	4505817	4505822	0 %	0 %	50 %	50 %	392423215
103013	NC_018028	GCC	2	6	4505865	4505870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392423215
103014	NC_018028	CAG	2	6	4505884	4505889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423215
103015	NC_018028	TCA	2	6	4505925	4505930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423215
103016	NC_018028	CCG	2	6	4505995	4506000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392423215
103017	NC_018028	GC	4	8	4506016	4506023	0 %	0 %	50 %	50 %	392423215
103018	NC_018028	CGG	2	6	4506058	4506063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423215
103019	NC_018028	GCG	2	6	4506135	4506140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423215
103020	NC_018028	CGC	2	6	4506251	4506256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392423215
103021	NC_018028	ACG	2	6	4506297	4506302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423215
103022	NC_018028	CCG	2	6	4506307	4506312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392423215
103023	NC_018028	GCT	3	9	4506325	4506333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423215
103024	NC_018028	GTCG	2	8	4506341	4506348	0 %	25 %	50 %	25 %	392423215
103025	NC_018028	GCT	2	6	4506394	4506399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423215
103026	NC_018028	GC	3	6	4506409	4506414	0 %	0 %	50 %	50 %	392423215
103027	NC_018028	GCG	2	6	4506449	4506454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423215
103028	NC_018028	CTGG	2	8	4506466	4506473	0 %	25 %	50 %	25 %	392423215
103029	NC_018028	CCG	2	6	4506474	4506479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392423215
103030	NC_018028	CTG	2	6	4506545	4506550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423215
103031	NC_018028	GAG	2	6	4506551	4506556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423215
103032	NC_018028	TGG	2	6	4506588	4506593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392423215
103033	NC_018028	GCA	2	6	4506629	4506634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423215
103034	NC_018028	TGC	2	6	4506648	4506653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423215
103035	NC_018028	GC	3	6	4506662	4506667	0 %	0 %	50 %	50 %	392423215
103036	NC_018028	TCG	2	6	4506720	4506725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423215
103037	NC_018028	CGC	2	6	4506781	4506786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392423215
103038	NC_018028	GCC	2	6	4506870	4506875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392423215
103039	NC_018028	TGG	2	6	4506879	4506884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392423215
103040	NC_018028	AGC	2	6	4506891	4506896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423215
103041	NC_018028	CA	3	6	4506916	4506921	50 %	0 %	0 %	50 %	392423215
103042	NC_018028	TCC	2	6	4506951	4506956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392423215
103043	NC_018028	GCG	2	6	4506968	4506973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423215
103044	NC_018028	CGC	2	6	4507014	4507019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392423215
103045	NC_018028	TGC	2	6	4507020	4507025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423215
103046	NC_018028	CTG	3	9	4507028	4507036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423215
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103049	NC_018028	CGG	2	6	4507161	4507166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423215
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103051	NC_018028	CGCA	2	8	4507207	4507214	25 %	0 %	25 %	50 %	392423215
103052	NC_018028	CGC	2	6	4507226	4507231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392423215
103053	NC_018028	CGC	2	6	4507236	4507241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392423215
103054	NC_018028	GCT	2	6	4507249	4507254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423215
103055	NC_018028	CGA	2	6	4507255	4507260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423215
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103057	NC_018028	GCA	2	6	4507422	4507427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423215
103058	NC_018028	CTG	2	6	4507469	4507474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423215
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103064	NC_018028	CAG	2	6	4507901	4507906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423215
103065	NC_018028	CGA	2	6	4507963	4507968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423215
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103068	NC_018028	GCGTC	2	10	4508005	4508014	0 %	20 %	40 %	40 %	392423215
103069	NC_018028	GAA	2	6	4508023	4508028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423215
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103072	NC_018028	CTG	2	6	4508141	4508146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423215
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103074	NC_018028	TGA	2	6	4508216	4508221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423215
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103077	NC_018028	GGCC	2	8	4508313	4508320	0 %	0 %	50 %	50 %	392423216
103078	NC_018028	GC	3	6	4508360	4508365	0 %	0 %	50 %	50 %	392423216
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103086	NC_018028	GCAT	2	8	4508563	4508570	25 %	25 %	25 %	25 %	392423216
103087	NC_018028	GGC	2	6	4508609	4508614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423216
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103096	NC_018028	ACA	2	6	4508918	4508923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423216
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103099	NC_018028	CAG	2	6	4509013	4509018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423217
103100	NC_018028	TCGGCG	2	12	4509091	4509102	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	392423217
103101	NC_018028	CG	5	10	4509120	4509129	0 %	0 %	50 %	50 %	392423217
103102	NC_018028	CTG	2	6	4509132	4509137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423217
103103	NC_018028	GC	3	6	4509217	4509222	0 %	0 %	50 %	50 %	392423217
103104	NC_018028	GAC	2	6	4509245	4509250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423217
103105	NC_018028	GCCA	2	8	4509303	4509310	25 %	0 %	25 %	50 %	392423217
103106	NC_018028	GC	3	6	4509311	4509316	0 %	0 %	50 %	50 %	392423217
103107	NC_018028	TCA	2	6	4509319	4509324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423217
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103111	NC_018028	GCT	2	6	4509548	4509553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423217
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103113	NC_018028	CGG	2	6	4509629	4509634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423217
103114	NC_018028	GCC	2	6	4509767	4509772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392423217
103115	NC_018028	CTG	2	6	4509788	4509793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423217
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103220	NC_018028	TAT	2	6	4514825	4514830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423220
103221	NC_018028	CTG	2	6	4514921	4514926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423220
103222	NC_018028	TTG	2	6	4514966	4514971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423220
103223	NC_018028	TCGA	2	8	4514986	4514993	25 %	25 %	25 %	25 %	392423220
103224	NC_018028	CATT	2	8	4515136	4515143	25 %	50 %	0 %	25 %	392423220
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103226	NC_018028	ATT	2	6	4515222	4515227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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103342	NC_018028	TCG	2	6	4520242	4520247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423224
103343	NC_018028	CTG	2	6	4520295	4520300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423224
103344	NC_018028	ACG	2	6	4520333	4520338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423224
103345	NC_018028	GCTGGC	2	12	4520465	4520476	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	392423224
103346	NC_018028	CGC	2	6	4520492	4520497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392423224
103347	NC_018028	CGA	2	6	4520510	4520515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423224
103348	NC_018028	CGG	2	6	4520522	4520527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423224
103349	NC_018028	CGC	2	6	4520540	4520545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392423224
103350	NC_018028	GC	5	10	4520550	4520559	0 %	0 %	50 %	50 %	392423224
103351	NC_018028	CGA	2	6	4520588	4520593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423224
103352	NC_018028	CCG	2	6	4520599	4520604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392423224
103353	NC_018028	TGG	2	6	4520755	4520760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392423224
103354	NC_018028	GGT	2	6	4520774	4520779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392423224
103355	NC_018028	CGA	2	6	4520789	4520794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423224
103356	NC_018028	ACT	2	6	4520809	4520814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423224
103357	NC_018028	GCG	2	6	4520835	4520840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423224
103358	NC_018028	AGGC	2	8	4520878	4520885	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103359	NC_018028	AGTTT	2	10	4520916	4520925	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
103360	NC_018028	CGG	2	6	4521065	4521070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423225
103361	NC_018028	CTG	2	6	4521075	4521080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423225
103362	NC_018028	CTGG	2	8	4521089	4521096	0 %	25 %	50 %	25 %	392423225
103363	NC_018028	CG	3	6	4521147	4521152	0 %	0 %	50 %	50 %	392423225
103364	NC_018028	GAC	2	6	4521234	4521239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423225
103365	NC_018028	GC	3	6	4521255	4521260	0 %	0 %	50 %	50 %	392423225
103366	NC_018028	CGCC	2	8	4521302	4521309	0 %	0 %	25 %	75 %	392423225
103367	NC_018028	GCA	2	6	4521331	4521336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423225
103368	NC_018028	ATC	2	6	4521339	4521344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423225
103369	NC_018028	GCG	2	6	4521391	4521396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423225
103370	NC_018028	GCC	2	6	4521398	4521403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392423225
103371	NC_018028	ATC	2	6	4521408	4521413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423225
103372	NC_018028	CGC	2	6	4521424	4521429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392423225
103373	NC_018028	GC	3	6	4521433	4521438	0 %	0 %	50 %	50 %	392423225
103374	NC_018028	TGA	2	6	4521460	4521465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423225
103375	NC_018028	CAA	2	6	4521473	4521478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423225
103376	NC_018028	CTG	2	6	4521480	4521485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423225
103377	NC_018028	GCA	2	6	4521626	4521631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423225
103378	NC_018028	GAT	2	6	4521690	4521695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423225
103379	NC_018028	GCT	2	6	4521707	4521712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423225
103380	NC_018028	GGC	2	6	4521734	4521739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423225
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103382	NC_018028	GC	3	6	4521790	4521795	0 %	0 %	50 %	50 %	392423225
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103384	NC_018028	GC	3	6	4521862	4521867	0 %	0 %	50 %	50 %	392423225
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103387	NC_018028	CTG	2	6	4522049	4522054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423226
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103392	NC_018028	GAGCTG	2	12	4522310	4522321	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	392423226
103393	NC_018028	CGC	2	6	4522433	4522438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392423226
103394	NC_018028	GCCC	2	8	4522453	4522460	0 %	0 %	25 %	75 %	392423226
103395	NC_018028	CGT	2	6	4522480	4522485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423226
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103398	NC_018028	TCG	2	6	4522737	4522742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423227
103399	NC_018028	CTG	2	6	4522760	4522765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423227
103400	NC_018028	CGA	2	6	4522888	4522893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423227
103401	NC_018028	ATC	2	6	4522919	4522924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423227
103402	NC_018028	GC	3	6	4522925	4522930	0 %	0 %	50 %	50 %	392423227
103403	NC_018028	GCGAGA	2	12	4523031	4523042	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	392423227
103404	NC_018028	GGT	2	6	4523059	4523064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392423227
103405	NC_018028	GCG	2	6	4523071	4523076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423227
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103408	NC_018028	CAG	2	6	4523150	4523155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423227
103409	NC_018028	GAC	3	9	4523159	4523167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423227
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103411	NC_018028	GC	3	6	4523184	4523189	0 %	0 %	50 %	50 %	392423227
103412	NC_018028	GCTG	2	8	4523197	4523204	0 %	25 %	50 %	25 %	392423227
103413	NC_018028	CGC	3	9	4523242	4523250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392423227
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103420	NC_018028	GCG	2	6	4523519	4523524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423227
103421	NC_018028	GAGC	2	8	4523602	4523609	25 %	0 %	50 %	25 %	392423227
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103423	NC_018028	CG	3	6	4523827	4523832	0 %	0 %	50 %	50 %	392423228
103424	NC_018028	AGCCTG	2	12	4523845	4523856	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	392423228
103425	NC_018028	GC	3	6	4523860	4523865	0 %	0 %	50 %	50 %	392423228
103426	NC_018028	CTG	2	6	4523911	4523916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423228
103427	NC_018028	GC	3	6	4523932	4523937	0 %	0 %	50 %	50 %	392423228
103428	NC_018028	GCA	2	6	4523943	4523948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423228
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103431	NC_018028	TTC	2	6	4524085	4524090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423228
103432	NC_018028	GCA	2	6	4524149	4524154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423228
103433	NC_018028	TCG	2	6	4524170	4524175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423228
103434	NC_018028	CGG	2	6	4524182	4524187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423228
103435	NC_018028	CGG	2	6	4524198	4524203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423228
103436	NC_018028	CTG	2	6	4524225	4524230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423228
103437	NC_018028	CTG	2	6	4524253	4524258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423228
103438	NC_018028	CAC	2	6	4524273	4524278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392423228
103439	NC_018028	CG	4	8	4524296	4524303	0 %	0 %	50 %	50 %	392423228
103440	NC_018028	TGG	2	6	4524404	4524409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392423228
103441	NC_018028	GCT	2	6	4524453	4524458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423228
103442	NC_018028	GC	3	6	4524460	4524465	0 %	0 %	50 %	50 %	392423228
103443	NC_018028	CTG	2	6	4524502	4524507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423228
103444	NC_018028	CAGC	2	8	4524522	4524529	25 %	0 %	25 %	50 %	392423228
103445	NC_018028	TCG	2	6	4524614	4524619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423228
103446	NC_018028	ACC	3	9	4524694	4524702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392423228
103447	NC_018028	CTG	2	6	4524721	4524726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423228
103448	NC_018028	CTG	2	6	4524748	4524753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423228
103449	NC_018028	TGCA	2	8	4524863	4524870	25 %	25 %	25 %	25 %	392423228
103450	NC_018028	CG	3	6	4524905	4524910	0 %	0 %	50 %	50 %	392423228
103451	NC_018028	AGC	2	6	4524964	4524969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423228
103452	NC_018028	ATCCTC	2	12	4525030	4525041	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	392423228
103453	NC_018028	GC	3	6	4525072	4525077	0 %	0 %	50 %	50 %	392423228
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103455	NC_018028	CCAC	2	8	4525139	4525146	25 %	0 %	0 %	75 %	392423228
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103463	NC_018028	CCGG	2	8	4525354	4525361	0 %	0 %	50 %	50 %	392423228
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