MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas stutzeri CCUG 29243 chromosome

Total Repeats: 107443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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100002	NC_018028	TCG	2	6	4384791	4384796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423110
100003	NC_018028	GGT	2	6	4384798	4384803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392423110
100004	NC_018028	TGC	2	6	4384881	4384886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423110
100005	NC_018028	TCG	2	6	4384890	4384895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423110
100006	NC_018028	CTT	2	6	4384930	4384935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423110
100007	NC_018028	CATC	2	8	4384954	4384961	25 %	25 %	0 %	50 %	392423110
100008	NC_018028	TGC	3	9	4385019	4385027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423110
100009	NC_018028	CAA	2	6	4385080	4385085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423110
100010	NC_018028	CTG	2	6	4385100	4385105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423110
100011	NC_018028	ACG	2	6	4385133	4385138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423110
100012	NC_018028	CCG	2	6	4385200	4385205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392423110
100013	NC_018028	GAT	3	9	4385242	4385250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423110
100014	NC_018028	CCG	2	6	4385283	4385288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392423110
100015	NC_018028	GCG	2	6	4385331	4385336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423110
100016	NC_018028	ATC	2	6	4385372	4385377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423110
100017	NC_018028	TGA	2	6	4385433	4385438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423110
100018	NC_018028	GACC	2	8	4385510	4385517	25 %	0 %	25 %	50 %	392423111
100019	NC_018028	GAC	2	6	4385571	4385576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423111
100020	NC_018028	CAC	2	6	4385600	4385605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392423111
100021	NC_018028	ACG	2	6	4385752	4385757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423111
100022	NC_018028	CTG	2	6	4385763	4385768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423111
100023	NC_018028	GGC	2	6	4385772	4385777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423111
100024	NC_018028	CCG	2	6	4385811	4385816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392423111
100025	NC_018028	GCG	2	6	4385845	4385850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423111
100026	NC_018028	GCC	2	6	4385899	4385904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100027	NC_018028	GCC	2	6	4385907	4385912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100028	NC_018028	TCA	2	6	4385914	4385919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100029	NC_018028	AGG	2	6	4385927	4385932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100030	NC_018028	CCAGC	2	10	4385982	4385991	20 %	0 %	20 %	60 %	392423112
100031	NC_018028	GTC	2	6	4386013	4386018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423112
100032	NC_018028	GCG	2	6	4386049	4386054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423112
100033	NC_018028	CGA	2	6	4386114	4386119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423112
100034	NC_018028	GCG	2	6	4386206	4386211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423112
100035	NC_018028	GCC	2	6	4386265	4386270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392423112
100036	NC_018028	ACGA	2	8	4386272	4386279	50 %	0 %	25 %	25 %	392423112
100037	NC_018028	CGG	2	6	4386306	4386311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423112
100038	NC_018028	CTG	2	6	4386448	4386453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423112
100039	NC_018028	CGC	2	6	4386464	4386469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392423112
100040	NC_018028	GCTGAT	2	12	4386480	4386491	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	392423112
100041	NC_018028	CCGGC	2	10	4386638	4386647	0 %	0 %	40 %	60 %	392423112
100042	NC_018028	GTG	2	6	4386655	4386660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392423112
100043	NC_018028	TTC	2	6	4386661	4386666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423112
100044	NC_018028	TCG	2	6	4386797	4386802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423112
100045	NC_018028	TGA	2	6	4386872	4386877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100046	NC_018028	ATTC	2	8	4386923	4386930	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100047	NC_018028	CG	3	6	4386959	4386964	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100048	NC_018028	CGG	2	6	4387028	4387033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423113
100049	NC_018028	ACA	2	6	4387066	4387071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423113
100050	NC_018028	TCG	2	6	4387117	4387122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423113
100051	NC_018028	CTG	3	9	4387149	4387157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423113
100052	NC_018028	AAG	2	6	4387164	4387169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423113
100053	NC_018028	GAA	2	6	4387265	4387270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423113
100054	NC_018028	CGC	2	6	4387304	4387309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392423113
100055	NC_018028	TCA	2	6	4387318	4387323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423113
100056	NC_018028	CGA	2	6	4387334	4387339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423113
100057	NC_018028	TGCA	2	8	4387350	4387357	25 %	25 %	25 %	25 %	392423113
100058	NC_018028	TGA	2	6	4387408	4387413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423113
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100061	NC_018028	GCA	2	6	4387523	4387528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423113
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100063	NC_018028	GCCA	2	8	4387560	4387567	25 %	0 %	25 %	50 %	392423113
100064	NC_018028	TGA	2	6	4387636	4387641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423113
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100067	NC_018028	ATC	2	6	4387713	4387718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423113
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100073	NC_018028	CGG	2	6	4387916	4387921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423113
100074	NC_018028	ATC	2	6	4387968	4387973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423113
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100078	NC_018028	CTA	2	6	4388117	4388122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423113
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100080	NC_018028	TCAAGG	2	12	4388239	4388250	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	392423113
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100083	NC_018028	ACG	2	6	4388362	4388367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423113
100084	NC_018028	CGC	2	6	4388375	4388380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392423113
100085	NC_018028	CG	3	6	4388388	4388393	0 %	0 %	50 %	50 %	392423113
100086	NC_018028	CGC	2	6	4388426	4388431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392423113
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100088	NC_018028	CGA	2	6	4388680	4388685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423114
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100094	NC_018028	AGCGA	2	10	4388877	4388886	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
100095	NC_018028	CAA	2	6	4388891	4388896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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100097	NC_018028	TCG	2	6	4388951	4388956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100098	NC_018028	CTC	2	6	4388962	4388967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100099	NC_018028	CGGG	2	8	4389009	4389016	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
100100	NC_018028	GCT	2	6	4389087	4389092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423115
100101	NC_018028	CGCC	2	8	4389095	4389102	0 %	0 %	25 %	75 %	392423115
100102	NC_018028	CAA	2	6	4389189	4389194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423115
100103	NC_018028	CGA	2	6	4389228	4389233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423115
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100105	NC_018028	TCA	2	6	4389305	4389310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423115
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100109	NC_018028	GC	3	6	4389572	4389577	0 %	0 %	50 %	50 %	392423115
100110	NC_018028	CTGC	2	8	4389600	4389607	0 %	25 %	25 %	50 %	392423115
100111	NC_018028	CAA	2	6	4389621	4389626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423115
100112	NC_018028	TCG	2	6	4389734	4389739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423115
100113	NC_018028	TCGGCG	2	12	4389776	4389787	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	392423115
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100344	NC_018028	CGT	2	6	4397976	4397981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100345	NC_018028	CGG	2	6	4398032	4398037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100346	NC_018028	TGC	2	6	4398070	4398075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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100375	NC_018028	CGT	2	6	4399186	4399191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423121
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100459	NC_018028	GCG	2	6	4402637	4402642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423124
100460	NC_018028	GCT	2	6	4402656	4402661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423124
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100463	NC_018028	GCT	2	6	4402791	4402796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423124
100464	NC_018028	CTG	2	6	4402810	4402815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423124
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