MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas stutzeri CCUG 29243 chromosome

Total Repeats: 107443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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76002	NC_018028	GAC	2	6	3337091	3337096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392422129
76003	NC_018028	CAG	2	6	3337214	3337219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392422129
76004	NC_018028	TCCA	2	8	3337221	3337228	25 %	25 %	0 %	50 %	392422129
76005	NC_018028	CGA	2	6	3337258	3337263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392422129
76006	NC_018028	TAGGCG	2	12	3337296	3337307	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	392422129
76007	NC_018028	CGTC	2	8	3337354	3337361	0 %	25 %	25 %	50 %	392422129
76008	NC_018028	CAT	2	6	3337379	3337384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392422129
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76010	NC_018028	GTAGAA	2	12	3337409	3337420	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	392422129
76011	NC_018028	CAC	2	6	3337571	3337576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392422129
76012	NC_018028	CAG	2	6	3337634	3337639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392422129
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76014	NC_018028	CAG	2	6	3337661	3337666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392422129
76015	NC_018028	AGGT	2	8	3337689	3337696	25 %	25 %	50 %	0 %	392422129
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76017	NC_018028	CAGC	2	8	3337722	3337729	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76018	NC_018028	CG	3	6	3337751	3337756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76019	NC_018028	CCA	2	6	3337796	3337801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392422130
76020	NC_018028	GTC	2	6	3337887	3337892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392422130
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76022	NC_018028	CGG	3	9	3338000	3338008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392422130
76023	NC_018028	GCCG	2	8	3338057	3338064	0 %	0 %	50 %	50 %	392422130
76024	NC_018028	CTG	2	6	3338082	3338087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392422130
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76026	NC_018028	GTCG	2	8	3338157	3338164	0 %	25 %	50 %	25 %	392422130
76027	NC_018028	CGA	2	6	3338186	3338191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392422130
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76031	NC_018028	GAGCGC	2	12	3338302	3338313	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	392422130
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76037	NC_018028	GCA	2	6	3338518	3338523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76038	NC_018028	CA	3	6	3338522	3338527	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76039	NC_018028	GCG	2	6	3338566	3338571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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76054	NC_018028	GCT	3	9	3338983	3338991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392422131
76055	NC_018028	AAG	2	6	3339077	3339082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392422131
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76089	NC_018028	TGC	2	6	3340578	3340583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392422132
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76115	NC_018028	CTC	2	6	3342194	3342199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76116	NC_018028	CGA	2	6	3342223	3342228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76117	NC_018028	GT	3	6	3342232	3342237	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76118	NC_018028	GAG	2	6	3342242	3342247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76119	NC_018028	AGC	2	6	3342269	3342274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76120	NC_018028	CAG	2	6	3342277	3342282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76121	NC_018028	GCCG	2	8	3342295	3342302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76122	NC_018028	CAT	2	6	3342441	3342446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76123	NC_018028	GCTC	2	8	3342447	3342454	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76124	NC_018028	CGT	2	6	3342457	3342462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76125	NC_018028	TTG	2	6	3342503	3342508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392422134
76126	NC_018028	GC	3	6	3342570	3342575	0 %	0 %	50 %	50 %	392422134
76127	NC_018028	TGGG	2	8	3342609	3342616	0 %	25 %	75 %	0 %	392422134
76128	NC_018028	AGC	2	6	3342638	3342643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392422134
76129	NC_018028	CTGCA	2	10	3342654	3342663	20 %	20 %	20 %	40 %	392422134
76130	NC_018028	GCG	2	6	3342678	3342683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392422134
76131	NC_018028	CGA	2	6	3342739	3342744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392422134
76132	NC_018028	CAC	2	6	3342754	3342759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392422134
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76135	NC_018028	CG	3	6	3342858	3342863	0 %	0 %	50 %	50 %	392422134
76136	NC_018028	GAT	3	9	3342880	3342888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392422134
76137	NC_018028	GCCG	2	8	3342907	3342914	0 %	0 %	50 %	50 %	392422134
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76145	NC_018028	AAGC	2	8	3343254	3343261	50 %	0 %	25 %	25 %	392422134
76146	NC_018028	TGC	3	9	3343393	3343401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392422135
76147	NC_018028	TCG	2	6	3343450	3343455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392422135
76148	NC_018028	ATC	2	6	3343476	3343481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392422135
76149	NC_018028	CGG	2	6	3343541	3343546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392422135
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76151	NC_018028	TCT	2	6	3343576	3343581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392422135
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76188	NC_018028	CCGCT	2	10	3344853	3344862	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
76189	NC_018028	CTCGG	2	10	3344944	3344953	0 %	20 %	40 %	40 %	392422136
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76216	NC_018028	CGC	2	6	3345886	3345891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392422137
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76230	NC_018028	GCA	2	6	3346376	3346381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392422138
76231	NC_018028	CCA	2	6	3346454	3346459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392422138
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76233	NC_018028	GC	6	12	3346509	3346520	0 %	0 %	50 %	50 %	392422138
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76335	NC_018028	TCG	2	6	3350611	3350616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392422139
76336	NC_018028	GGC	2	6	3350622	3350627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392422139
76337	NC_018028	TCG	2	6	3350641	3350646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392422139
76338	NC_018028	CTGC	2	8	3350667	3350674	0 %	25 %	25 %	50 %	392422139
76339	NC_018028	GC	3	6	3350673	3350678	0 %	0 %	50 %	50 %	392422139
76340	NC_018028	GGC	2	6	3350688	3350693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392422139
76341	NC_018028	GCT	2	6	3350741	3350746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392422139
76342	NC_018028	TTC	2	6	3350809	3350814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392422139
76343	NC_018028	CGGC	2	8	3350899	3350906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76344	NC_018028	GT	3	6	3350919	3350924	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76345	NC_018028	CTG	2	6	3351004	3351009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392422140
76346	NC_018028	TGCTC	2	10	3351027	3351036	0 %	40 %	20 %	40 %	392422140
76347	NC_018028	GCG	2	6	3351044	3351049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392422140
76348	NC_018028	ATC	2	6	3351062	3351067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392422140
76349	NC_018028	TGG	2	6	3351090	3351095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392422140
76350	NC_018028	GCC	2	6	3351199	3351204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392422140
76351	NC_018028	CTC	2	6	3351220	3351225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392422140
76352	NC_018028	CCG	2	6	3351257	3351262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392422140
76353	NC_018028	GAA	2	6	3351280	3351285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392422140
76354	NC_018028	GCA	2	6	3351357	3351362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392422140
76355	NC_018028	GGC	2	6	3351373	3351378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392422140
76356	NC_018028	G	6	6	3351385	3351390	0 %	0 %	100 %	0 %	392422140
76357	NC_018028	GTA	2	6	3351517	3351522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392422140
76358	NC_018028	CCA	2	6	3351531	3351536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392422140
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76360	NC_018028	CCA	2	6	3351556	3351561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392422140
76361	NC_018028	TCA	2	6	3351597	3351602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392422140
76362	NC_018028	GCCC	2	8	3351652	3351659	0 %	0 %	25 %	75 %	392422140
76363	NC_018028	GC	3	6	3351681	3351686	0 %	0 %	50 %	50 %	392422140
76364	NC_018028	CGC	2	6	3351711	3351716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392422140
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76373	NC_018028	TGG	2	6	3352047	3352052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392422140
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76379	NC_018028	GGC	2	6	3352260	3352265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392422140
76380	NC_018028	TCGA	2	8	3352277	3352284	25 %	25 %	25 %	25 %	392422140
76381	NC_018028	CGT	2	6	3352320	3352325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392422140
76382	NC_018028	TCA	2	6	3352326	3352331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392422140
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76388	NC_018028	GA	3	6	3352528	3352533	50 %	0 %	50 %	0 %	392422140
76389	NC_018028	T	8	8	3352556	3352563	0 %	100 %	0 %	0 %	392422140
76390	NC_018028	GCC	2	6	3352604	3352609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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76393	NC_018028	GTA	2	6	3352709	3352714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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76395	NC_018028	GCC	2	6	3352819	3352824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76396	NC_018028	GACC	2	8	3352852	3352859	25 %	0 %	25 %	50 %	392422141
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76420	NC_018028	GTCGCC	2	12	3353768	3353779	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	392422141
76421	NC_018028	CAG	3	9	3353810	3353818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392422141
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76424	NC_018028	ATG	2	6	3353895	3353900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392422141
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76427	NC_018028	GC	3	6	3354099	3354104	0 %	0 %	50 %	50 %	392422141
76428	NC_018028	CG	3	6	3354274	3354279	0 %	0 %	50 %	50 %	392422141
76429	NC_018028	CGG	2	6	3354295	3354300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392422141
76430	NC_018028	GC	3	6	3354329	3354334	0 %	0 %	50 %	50 %	392422141
76431	NC_018028	CTG	2	6	3354401	3354406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392422141
76432	NC_018028	GC	3	6	3354417	3354422	0 %	0 %	50 %	50 %	392422141
76433	NC_018028	GAG	2	6	3354446	3354451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392422141
76434	NC_018028	CAG	2	6	3354488	3354493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392422141
76435	NC_018028	GATC	2	8	3354527	3354534	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76436	NC_018028	A	6	6	3354568	3354573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76437	NC_018028	CTTT	2	8	3354632	3354639	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76438	NC_018028	ACG	2	6	3354649	3354654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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76441	NC_018028	GGC	2	6	3354787	3354792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392422142
76442	NC_018028	CGG	2	6	3354858	3354863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392422142
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76444	NC_018028	GC	3	6	3354992	3354997	0 %	0 %	50 %	50 %	392422142
76445	NC_018028	CGAT	2	8	3355037	3355044	25 %	25 %	25 %	25 %	392422142
76446	NC_018028	CTG	2	6	3355069	3355074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392422142
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76449	NC_018028	CAG	2	6	3355171	3355176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392422142
76450	NC_018028	CGA	2	6	3355218	3355223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392422142
76451	NC_018028	CGC	2	6	3355260	3355265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392422142
76452	NC_018028	CCA	2	6	3355281	3355286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392422142
76453	NC_018028	CTG	2	6	3355339	3355344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392422142
76454	NC_018028	CG	4	8	3355353	3355360	0 %	0 %	50 %	50 %	392422142
76455	NC_018028	CGG	2	6	3355365	3355370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392422142
76456	NC_018028	CGCTG	2	10	3355446	3355455	0 %	20 %	40 %	40 %	392422142
76457	NC_018028	CTGG	2	8	3355486	3355493	0 %	25 %	50 %	25 %	392422142
76458	NC_018028	CACC	2	8	3355500	3355507	25 %	0 %	0 %	75 %	392422142
76459	NC_018028	GGT	2	6	3355525	3355530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392422142
76460	NC_018028	TCT	2	6	3355560	3355565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392422142
76461	NC_018028	CGA	2	6	3355566	3355571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392422142
76462	NC_018028	GTC	2	6	3355660	3355665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392422142
76463	NC_018028	GCA	2	6	3355683	3355688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392422142
76464	NC_018028	TCA	2	6	3355710	3355715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392422142
76465	NC_018028	AGC	4	12	3355742	3355753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392422142
76466	NC_018028	GC	3	6	3355789	3355794	0 %	0 %	50 %	50 %	392422142
76467	NC_018028	TGC	2	6	3355917	3355922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392422142
76468	NC_018028	CGT	2	6	3356079	3356084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392422142
76469	NC_018028	CAG	2	6	3356125	3356130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392422142
76470	NC_018028	CGG	2	6	3356166	3356171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392422142
76471	NC_018028	GTCG	2	8	3356235	3356242	0 %	25 %	50 %	25 %	392422142
76472	NC_018028	CTG	2	6	3356272	3356277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392422142
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76475	NC_018028	GCAA	2	8	3356351	3356358	50 %	0 %	25 %	25 %	392422142
76476	NC_018028	AGC	2	6	3356360	3356365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392422142
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76478	NC_018028	AGT	2	6	3356424	3356429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76479	NC_018028	GAG	2	6	3356455	3356460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76480	NC_018028	A	6	6	3356525	3356530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76481	NC_018028	CCG	2	6	3356533	3356538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76482	NC_018028	T	6	6	3356547	3356552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76483	NC_018028	CTT	2	6	3356573	3356578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392422143
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