MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas stutzeri CCUG 29243 chromosome

Total Repeats: 107443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
74501	NC_018028	GAGTC	2	10	3274698	3274707	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
74502	NC_018028	GGC	2	6	3274765	3274770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74503	NC_018028	T	6	6	3274812	3274817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74504	NC_018028	C	6	6	3274872	3274877	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
74505	NC_018028	ATG	2	6	3274953	3274958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74506	NC_018028	C	6	6	3274999	3275004	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
74507	NC_018028	TGC	2	6	3275032	3275037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74508	NC_018028	TA	3	6	3275048	3275053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74509	NC_018028	CCAGC	2	10	3275059	3275068	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
74510	NC_018028	ACA	2	6	3275156	3275161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74511	NC_018028	CAA	2	6	3275173	3275178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74512	NC_018028	AGC	2	6	3275207	3275212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74513	NC_018028	CTCA	2	8	3275246	3275253	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
74514	NC_018028	AGCACG	2	12	3275368	3275379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74515	NC_018028	CGTAC	2	10	3275447	3275456	20 %	20 %	20 %	40 %	392422069
74516	NC_018028	ACT	2	6	3275513	3275518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392422069
74517	NC_018028	AT	3	6	3275527	3275532	50 %	50 %	0 %	0 %	392422069
74518	NC_018028	A	7	7	3275541	3275547	100 %	0 %	0 %	0 %	392422069
74519	NC_018028	GGC	3	9	3275594	3275602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392422069
74520	NC_018028	GTG	2	6	3275636	3275641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392422069
74521	NC_018028	GAA	2	6	3275801	3275806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392422069
74522	NC_018028	GAT	2	6	3275835	3275840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392422069
74523	NC_018028	TGGC	2	8	3275877	3275884	0 %	25 %	50 %	25 %	392422070
74524	NC_018028	TGG	2	6	3275944	3275949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392422070
74525	NC_018028	TCA	2	6	3275970	3275975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392422070
74526	NC_018028	CAA	2	6	3275992	3275997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392422070
74527	NC_018028	CTT	2	6	3275999	3276004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392422070
74528	NC_018028	GTA	2	6	3276131	3276136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392422070
74529	NC_018028	CAG	2	6	3276154	3276159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392422070
74530	NC_018028	T	6	6	3276262	3276267	0 %	100 %	0 %	0 %	392422070
74531	NC_018028	CAGG	2	8	3276326	3276333	25 %	0 %	50 %	25 %	392422070
74532	NC_018028	CAA	2	6	3276358	3276363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392422070
74533	NC_018028	TCA	2	6	3276372	3276377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392422070
74534	NC_018028	GAC	2	6	3276428	3276433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392422070
74535	NC_018028	T	7	7	3276438	3276444	0 %	100 %	0 %	0 %	392422070
74536	NC_018028	CCTC	2	8	3276466	3276473	0 %	25 %	0 %	75 %	392422070
74537	NC_018028	TC	3	6	3276479	3276484	0 %	50 %	0 %	50 %	392422070
74538	NC_018028	ACCC	2	8	3276495	3276502	25 %	0 %	0 %	75 %	392422070
74539	NC_018028	ACG	2	6	3276546	3276551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392422070
74540	NC_018028	A	7	7	3276687	3276693	100 %	0 %	0 %	0 %	392422070
74541	NC_018028	TGA	2	6	3276708	3276713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392422070
74542	NC_018028	C	6	6	3276734	3276739	0 %	0 %	0 %	100 %	392422070
74543	NC_018028	CGA	2	6	3277040	3277045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74544	NC_018028	AGCC	2	8	3277271	3277278	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74545	NC_018028	GCC	2	6	3277292	3277297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74546	NC_018028	GTA	2	6	3277298	3277303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74547	NC_018028	TCC	2	6	3277326	3277331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74548	NC_018028	ACCCA	2	10	3277336	3277345	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
74549	NC_018028	ACC	2	6	3277407	3277412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74550	NC_018028	TCCG	2	8	3277533	3277540	0 %	25 %	25 %	50 %	392422071
74551	NC_018028	ACG	2	6	3277565	3277570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392422071
74552	NC_018028	CGG	2	6	3277626	3277631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392422071
74553	NC_018028	GGC	2	6	3277699	3277704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392422071
74554	NC_018028	ACC	2	6	3277705	3277710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392422071
74555	NC_018028	GAG	2	6	3277714	3277719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392422071
74556	NC_018028	CCG	2	6	3277720	3277725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392422071
74557	NC_018028	CAA	2	6	3277785	3277790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392422071
74558	NC_018028	CCGC	2	8	3277806	3277813	0 %	0 %	25 %	75 %	392422071
74559	NC_018028	CT	3	6	3277827	3277832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74560	NC_018028	GCG	2	6	3277853	3277858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74561	NC_018028	GCA	2	6	3277882	3277887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74562	NC_018028	GCG	2	6	3277892	3277897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74563	NC_018028	CT	3	6	3277936	3277941	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74564	NC_018028	GAC	2	6	3277962	3277967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74565	NC_018028	CACGC	2	10	3277974	3277983	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
74566	NC_018028	CG	3	6	3277985	3277990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74567	NC_018028	CAGC	2	8	3278049	3278056	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74568	NC_018028	TCG	2	6	3278092	3278097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74569	NC_018028	CGT	2	6	3278126	3278131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74570	NC_018028	GCA	2	6	3278150	3278155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74571	NC_018028	GTT	2	6	3278217	3278222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74572	NC_018028	GCC	2	6	3278256	3278261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74573	NC_018028	CG	3	6	3278294	3278299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74574	NC_018028	TGGCGT	2	12	3278348	3278359	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74575	NC_018028	GTC	2	6	3278409	3278414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74576	NC_018028	TCG	2	6	3278419	3278424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74577	NC_018028	ACC	2	6	3278449	3278454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74578	NC_018028	CGA	2	6	3278516	3278521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74579	NC_018028	GTC	2	6	3278533	3278538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74580	NC_018028	GC	3	6	3278605	3278610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74581	NC_018028	CAG	2	6	3278719	3278724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74582	NC_018028	GCT	2	6	3278775	3278780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74583	NC_018028	GCC	2	6	3278812	3278817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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74586	NC_018028	CGG	2	6	3278958	3278963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74587	NC_018028	AGT	2	6	3279066	3279071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74588	NC_018028	AAC	2	6	3279095	3279100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74589	NC_018028	CTG	2	6	3279127	3279132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74590	NC_018028	TGA	2	6	3279177	3279182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74591	NC_018028	GC	3	6	3279246	3279251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74592	NC_018028	GTC	2	6	3279301	3279306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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74594	NC_018028	CCG	2	6	3279401	3279406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74595	NC_018028	GCC	2	6	3279475	3279480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74596	NC_018028	GGC	2	6	3279496	3279501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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74599	NC_018028	CGCCA	2	10	3279586	3279595	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
74600	NC_018028	TTG	2	6	3279642	3279647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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74602	NC_018028	CAC	2	6	3279845	3279850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74603	NC_018028	GCT	2	6	3279870	3279875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74604	NC_018028	GCGG	2	8	3279898	3279905	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
74605	NC_018028	TCG	2	6	3279918	3279923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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74609	NC_018028	GCGGT	2	10	3280075	3280084	0 %	20 %	60 %	20 %	392422072
74610	NC_018028	CTC	2	6	3280104	3280109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392422072
74611	NC_018028	CGG	2	6	3280130	3280135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392422072
74612	NC_018028	CAC	2	6	3280146	3280151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392422072
74613	NC_018028	GTGC	2	8	3280197	3280204	0 %	25 %	50 %	25 %	392422072
74614	NC_018028	CGAC	2	8	3280304	3280311	25 %	0 %	25 %	50 %	392422072
74615	NC_018028	CTTCCA	2	12	3280329	3280340	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	392422072
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74617	NC_018028	TG	3	6	3280352	3280357	0 %	50 %	50 %	0 %	392422072
74618	NC_018028	CAT	2	6	3280397	3280402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392422072
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74620	NC_018028	GC	3	6	3280539	3280544	0 %	0 %	50 %	50 %	392422072
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74622	NC_018028	GCC	2	6	3280622	3280627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392422072
74623	NC_018028	GAT	2	6	3280632	3280637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392422072
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74733	NC_018028	GCT	2	6	3285631	3285636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392422077
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74839	NC_018028	TGAC	2	8	3290279	3290286	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74840	NC_018028	A	6	6	3290305	3290310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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74972	NC_018028	GCT	2	6	3295615	3295620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392422086
74973	NC_018028	GGC	2	6	3295621	3295626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392422086
74974	NC_018028	GC	3	6	3295650	3295655	0 %	0 %	50 %	50 %	392422086
74975	NC_018028	TCG	2	6	3295680	3295685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392422086
74976	NC_018028	CGA	2	6	3295693	3295698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392422086
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74979	NC_018028	CGC	2	6	3295771	3295776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392422086
74980	NC_018028	CAA	2	6	3295807	3295812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392422086
74981	NC_018028	CGA	2	6	3295855	3295860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392422086
74982	NC_018028	TGC	2	6	3295896	3295901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392422086
74983	NC_018028	CGC	2	6	3295909	3295914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392422086
74984	NC_018028	CAGCGC	2	12	3295931	3295942	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	392422086
74985	NC_018028	CGG	2	6	3295998	3296003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392422086
74986	NC_018028	CCA	2	6	3296013	3296018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392422086
74987	NC_018028	GC	3	6	3296029	3296034	0 %	0 %	50 %	50 %	392422086
74988	NC_018028	AGG	2	6	3296055	3296060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392422086
74989	NC_018028	GAC	2	6	3296156	3296161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392422086
74990	NC_018028	CCG	2	6	3296164	3296169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392422086
74991	NC_018028	GCCG	2	8	3296224	3296231	0 %	0 %	50 %	50 %	392422086
74992	NC_018028	TGG	2	6	3296250	3296255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392422086
74993	NC_018028	CGC	2	6	3296285	3296290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74994	NC_018028	GCCT	2	8	3296325	3296332	0 %	25 %	25 %	50 %	392422087
74995	NC_018028	GCC	2	6	3296370	3296375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392422087
74996	NC_018028	CGG	2	6	3296423	3296428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392422087
74997	NC_018028	GAT	2	6	3296532	3296537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392422087
74998	NC_018028	CGC	2	6	3296561	3296566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392422087
74999	NC_018028	CGC	2	6	3296570	3296575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392422087
75000	NC_018028	GAG	2	6	3296640	3296645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392422087

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