MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas stutzeri CCUG 29243 chromosome

Total Repeats: 107443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6502	NC_018028	GT	3	6	272621	272626	0 %	50 %	50 %	0 %	392419338
6503	NC_018028	GCC	3	9	272631	272639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419338
6504	NC_018028	CGA	2	6	272660	272665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419338
6505	NC_018028	GCC	2	6	272675	272680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419338
6506	NC_018028	GTC	2	6	272700	272705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419338
6507	NC_018028	CGA	2	6	272726	272731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419338
6508	NC_018028	GC	4	8	272761	272768	0 %	0 %	50 %	50 %	392419338
6509	NC_018028	GCC	2	6	272784	272789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419338
6510	NC_018028	CAG	2	6	272796	272801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419338
6511	NC_018028	CAG	2	6	272875	272880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419338
6512	NC_018028	CACG	2	8	272882	272889	25 %	0 %	25 %	50 %	392419338
6513	NC_018028	GTT	2	6	272949	272954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392419338
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6516	NC_018028	CGT	2	6	273047	273052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419338
6517	NC_018028	TGC	2	6	273067	273072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419338
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6519	NC_018028	GTG	2	6	273118	273123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419338
6520	NC_018028	CCG	2	6	273124	273129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419338
6521	NC_018028	CG	3	6	273132	273137	0 %	0 %	50 %	50 %	392419338
6522	NC_018028	AGCG	2	8	273196	273203	25 %	0 %	50 %	25 %	392419338
6523	NC_018028	GCT	2	6	273234	273239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419338
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6525	NC_018028	CAG	2	6	273264	273269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419338
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6527	NC_018028	CGC	2	6	273311	273316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419338
6528	NC_018028	CGA	2	6	273329	273334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419338
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6530	NC_018028	CGT	2	6	273380	273385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419338
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6533	NC_018028	TCAG	2	8	273450	273457	25 %	25 %	25 %	25 %	392419339
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6540	NC_018028	CG	3	6	273595	273600	0 %	0 %	50 %	50 %	392419339
6541	NC_018028	ATC	2	6	273607	273612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419339
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6552	NC_018028	GA	3	6	273967	273972	50 %	0 %	50 %	0 %	392419339
6553	NC_018028	CCA	2	6	274033	274038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392419340
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6564	NC_018028	GTC	2	6	274396	274401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419340
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6591	NC_018028	CGC	2	6	275534	275539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6613	NC_018028	AC	3	6	276276	276281	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6614	NC_018028	AATG	2	8	276285	276292	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_018028	CAT	2	6	276330	276335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6616	NC_018028	CG	3	6	276342	276347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6617	NC_018028	CCT	2	6	276409	276414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392419342
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6621	NC_018028	GC	3	6	276576	276581	0 %	0 %	50 %	50 %	392419342
6622	NC_018028	CGC	3	9	276579	276587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419342
6623	NC_018028	CGGTT	2	10	276632	276641	0 %	40 %	40 %	20 %	392419342
6624	NC_018028	CTGGC	2	10	276686	276695	0 %	20 %	40 %	40 %	392419342
6625	NC_018028	CTG	2	6	276767	276772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419342
6626	NC_018028	GAC	2	6	276785	276790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419342
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6630	NC_018028	GCT	2	6	276856	276861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419342
6631	NC_018028	CTG	3	9	277019	277027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419342
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6633	NC_018028	CGT	2	6	277258	277263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419342
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6635	NC_018028	AAG	2	6	277355	277360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419342
6636	NC_018028	GCTTC	2	10	277381	277390	0 %	40 %	20 %	40 %	392419342
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6644	NC_018028	CTG	3	9	277818	277826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419343
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6649	NC_018028	GT	3	6	278146	278151	0 %	50 %	50 %	0 %	392419343
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6658	NC_018028	CA	3	6	278469	278474	50 %	0 %	0 %	50 %	392419343
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6662	NC_018028	TTCT	2	8	278628	278635	0 %	75 %	0 %	25 %	392419343
6663	NC_018028	CGC	2	6	278665	278670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419343
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6671	NC_018028	CTG	2	6	278859	278864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419343
6672	NC_018028	CTGTGG	2	12	278895	278906	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	392419343
6673	NC_018028	TGC	2	6	278980	278985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419343
6674	NC_018028	TGG	2	6	279018	279023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419343
6675	NC_018028	TGC	2	6	279025	279030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419343
6676	NC_018028	TCG	2	6	279093	279098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6677	NC_018028	GCA	3	9	279199	279207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419344
6678	NC_018028	GGGCA	2	10	279249	279258	20 %	0 %	60 %	20 %	392419344
6679	NC_018028	TAC	2	6	279296	279301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419344
6680	NC_018028	GCGCG	2	10	279404	279413	0 %	0 %	60 %	40 %	392419344
6681	NC_018028	AAC	2	6	279429	279434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392419344
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6683	NC_018028	AAC	2	6	279483	279488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392419344
6684	NC_018028	GTG	2	6	279490	279495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419344
6685	NC_018028	TGGC	2	8	279556	279563	0 %	25 %	50 %	25 %	392419344
6686	NC_018028	GAC	2	6	279678	279683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419344
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6689	NC_018028	GCA	2	6	279994	279999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419344
6690	NC_018028	GGCACA	2	12	280003	280014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419344
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6692	NC_018028	GC	3	6	280100	280105	0 %	0 %	50 %	50 %	392419344
6693	NC_018028	GCT	2	6	280118	280123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419344
6694	NC_018028	GATC	2	8	280165	280172	25 %	25 %	25 %	25 %	392419344
6695	NC_018028	TTGT	2	8	280277	280284	0 %	75 %	25 %	0 %	392419344
6696	NC_018028	CGGCG	2	10	280294	280303	0 %	0 %	60 %	40 %	392419344
6697	NC_018028	GGCCA	2	10	280335	280344	20 %	0 %	40 %	40 %	392419344
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6701	NC_018028	TCG	2	6	280641	280646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419344
6702	NC_018028	CTG	2	6	280649	280654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419344
6703	NC_018028	AGC	2	6	280707	280712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419344
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6705	NC_018028	TGGA	2	8	280748	280755	25 %	25 %	50 %	0 %	392419344
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6707	NC_018028	CTG	2	6	280830	280835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419344
6708	NC_018028	GCA	2	6	280864	280869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419344
6709	NC_018028	GTCAG	2	10	280881	280890	20 %	20 %	40 %	20 %	392419344
6710	NC_018028	TGA	2	6	280893	280898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419344
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6714	NC_018028	AGC	3	9	281173	281181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419345
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6716	NC_018028	GC	5	10	281363	281372	0 %	0 %	50 %	50 %	392419345
6717	NC_018028	GC	3	6	281466	281471	0 %	0 %	50 %	50 %	392419345
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6720	NC_018028	CG	4	8	281563	281570	0 %	0 %	50 %	50 %	392419345
6721	NC_018028	GCG	2	6	281613	281618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419345
6722	NC_018028	CTGG	2	8	281744	281751	0 %	25 %	50 %	25 %	392419345
6723	NC_018028	GCC	2	6	281755	281760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419345
6724	NC_018028	GC	3	6	281777	281782	0 %	0 %	50 %	50 %	392419345
6725	NC_018028	GAG	2	6	281784	281789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392419345
6726	NC_018028	TCG	2	6	281812	281817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419345
6727	NC_018028	CTG	2	6	281850	281855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419345
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6729	NC_018028	GCA	2	6	281959	281964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419345
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6731	NC_018028	GAC	2	6	281994	281999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419345
6732	NC_018028	CCG	2	6	282027	282032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419345
6733	NC_018028	CG	3	6	282065	282070	0 %	0 %	50 %	50 %	392419345
6734	NC_018028	GAT	2	6	282075	282080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419345
6735	NC_018028	TGC	2	6	282139	282144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419345
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6737	NC_018028	GCT	2	6	282191	282196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419346
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6741	NC_018028	ATC	2	6	282327	282332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419346
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6843	NC_018028	CGT	2	6	286250	286255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419350
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6848	NC_018028	AGC	2	6	286414	286419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419350
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6853	NC_018028	GC	3	6	286621	286626	0 %	0 %	50 %	50 %	392419350
6854	NC_018028	TCG	2	6	286630	286635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419350
6855	NC_018028	GGC	2	6	286757	286762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419350
6856	NC_018028	GGC	2	6	286804	286809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419350
6857	NC_018028	GTC	2	6	286896	286901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419350
6858	NC_018028	CAT	2	6	286986	286991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419350
6859	NC_018028	ACC	3	9	287068	287076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392419350
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6983	NC_018028	TGT	2	6	291460	291465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392419355
6984	NC_018028	CAG	2	6	291488	291493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419355
6985	NC_018028	GCG	2	6	291564	291569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419355
6986	NC_018028	ACG	2	6	291576	291581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419355
6987	NC_018028	TCG	2	6	291618	291623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419355
6988	NC_018028	GCAGGT	2	12	291649	291660	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	392419355
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6990	NC_018028	GCC	2	6	291740	291745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419355
6991	NC_018028	GCA	2	6	291751	291756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419355
6992	NC_018028	GCA	2	6	291763	291768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419355
6993	NC_018028	CGA	2	6	291793	291798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419355
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6995	NC_018028	AGTCCG	2	12	291948	291959	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	392419355
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6997	NC_018028	CTG	2	6	292160	292165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419355
6998	NC_018028	TCGG	2	8	292197	292204	0 %	25 %	50 %	25 %	392419355
6999	NC_018028	TGC	2	6	292230	292235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419355
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