MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas stutzeri CCUG 29243 chromosome

Total Repeats: 107443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018028	GAC	2	6	8	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018028	TGG	2	6	20	25	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018028	GC	3	6	55	60	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018028	GCTGG	2	10	69	78	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_018028	TA	3	6	251	256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018028	GCA	2	6	260	265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018028	TGT	2	6	535	540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018028	GC	3	6	554	559	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018028	GCC	2	6	570	575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_018028	GCA	2	6	625	630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018028	GT	3	6	631	636	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018028	CTGC	2	8	656	663	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_018028	TGA	2	6	712	717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018028	TTG	2	6	782	787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018028	CTG	2	6	791	796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018028	TC	3	6	830	835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_018028	CCG	2	6	861	866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_018028	CTTC	2	8	869	876	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_018028	GCT	3	9	878	886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018028	CAGCCA	2	12	896	907	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_018028	GTA	2	6	911	916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018028	GC	3	6	918	923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018028	AGC	2	6	984	989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419089
24	NC_018028	TCG	2	6	1071	1076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419089
25	NC_018028	CGG	2	6	1162	1167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419089
26	NC_018028	ATGC	2	8	1193	1200	25 %	25 %	25 %	25 %	392419089
27	NC_018028	CTG	2	6	1214	1219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419089
28	NC_018028	AAG	2	6	1220	1225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419089
29	NC_018028	GCT	2	6	1342	1347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419089
30	NC_018028	CGA	2	6	1351	1356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419089
31	NC_018028	TTC	2	6	1364	1369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392419089
32	NC_018028	A	6	6	1373	1378	100 %	0 %	0 %	0 %	392419089
33	NC_018028	AAG	2	6	1389	1394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419089
34	NC_018028	GCT	2	6	1417	1422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419089
35	NC_018028	CAG	2	6	1433	1438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419089
36	NC_018028	GCC	2	6	1534	1539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419089
37	NC_018028	TGA	2	6	1566	1571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419089
38	NC_018028	ACG	2	6	1605	1610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419089
39	NC_018028	TTC	2	6	1616	1621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392419089
40	NC_018028	TAC	2	6	1805	1810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419089
41	NC_018028	GCG	2	6	1840	1845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419089
42	NC_018028	ACCA	2	8	1901	1908	50 %	0 %	0 %	50 %	392419089
43	NC_018028	CAC	2	6	1951	1956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392419089
44	NC_018028	TGC	2	6	2031	2036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419089
45	NC_018028	GACCA	2	10	2078	2087	40 %	0 %	20 %	40 %	392419090
46	NC_018028	CGT	2	6	2143	2148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419090
47	NC_018028	GCC	2	6	2270	2275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419090
48	NC_018028	GC	3	6	2300	2305	0 %	0 %	50 %	50 %	392419090
49	NC_018028	GAT	2	6	2363	2368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419090
50	NC_018028	GTT	2	6	2375	2380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392419090
51	NC_018028	GAA	2	6	2444	2449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419090
52	NC_018028	GCA	2	6	2508	2513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419090
53	NC_018028	GCA	2	6	2527	2532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419090
54	NC_018028	CTA	2	6	2542	2547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419090
55	NC_018028	TGC	2	6	2583	2588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419090
56	NC_018028	GC	3	6	2587	2592	0 %	0 %	50 %	50 %	392419090
57	NC_018028	GACG	2	8	2599	2606	25 %	0 %	50 %	25 %	392419090
58	NC_018028	CG	3	6	2698	2703	0 %	0 %	50 %	50 %	392419090
59	NC_018028	GCT	2	6	2704	2709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419090
60	NC_018028	CCA	2	6	2763	2768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392419090
61	NC_018028	TTCACC	2	12	2777	2788	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	392419090
62	NC_018028	TGG	2	6	2796	2801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419090
63	NC_018028	TGC	2	6	2829	2834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419090
64	NC_018028	TGC	2	6	2874	2879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419090
65	NC_018028	TC	3	6	2905	2910	0 %	50 %	0 %	50 %	392419090
66	NC_018028	AAC	2	6	2972	2977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392419090
67	NC_018028	GAA	2	6	2987	2992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419090
68	NC_018028	TGA	2	6	3078	3083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419090
69	NC_018028	TCTG	2	8	3106	3113	0 %	50 %	25 %	25 %	392419090
70	NC_018028	CAG	2	6	3121	3126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419090
71	NC_018028	ACG	2	6	3150	3155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419090
72	NC_018028	CTC	2	6	3262	3267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392419091
73	NC_018028	GC	3	6	3344	3349	0 %	0 %	50 %	50 %	392419091
74	NC_018028	TCA	2	6	3378	3383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419091
75	NC_018028	GTCAG	2	10	3506	3515	20 %	20 %	40 %	20 %	392419091
76	NC_018028	TCT	2	6	3571	3576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392419091
77	NC_018028	GCA	2	6	3664	3669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419091
78	NC_018028	TGA	2	6	3760	3765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419091
79	NC_018028	TTA	2	6	3862	3867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392419091
80	NC_018028	GGGAT	2	10	3871	3880	20 %	20 %	60 %	0 %	392419091
81	NC_018028	CG	3	6	4014	4019	0 %	0 %	50 %	50 %	392419091
82	NC_018028	CAG	2	6	4022	4027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419091
83	NC_018028	TGG	2	6	4032	4037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419091
84	NC_018028	TG	3	6	4038	4043	0 %	50 %	50 %	0 %	392419091
85	NC_018028	ATCT	2	8	4097	4104	25 %	50 %	0 %	25 %	392419091
86	NC_018028	CGA	2	6	4108	4113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419091
87	NC_018028	AAG	2	6	4218	4223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419091
88	NC_018028	TCG	2	6	4333	4338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419092
89	NC_018028	CGA	2	6	4404	4409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419092
90	NC_018028	GTC	2	6	4441	4446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419092
91	NC_018028	TCGA	2	8	4453	4460	25 %	25 %	25 %	25 %	392419092
92	NC_018028	CCAT	2	8	4499	4506	25 %	25 %	0 %	50 %	392419092
93	NC_018028	CGG	2	6	4577	4582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419092
94	NC_018028	TCA	2	6	4589	4594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419092
95	NC_018028	CGG	2	6	4611	4616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419092
96	NC_018028	GGT	2	6	4674	4679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419092
97	NC_018028	GAG	2	6	4693	4698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392419092
98	NC_018028	CCG	2	6	4713	4718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419092
99	NC_018028	CGT	2	6	4823	4828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419092
100	NC_018028	CGTT	2	8	4979	4986	0 %	50 %	25 %	25 %	392419092
101	NC_018028	ACAA	2	8	4999	5006	75 %	0 %	0 %	25 %	392419092
102	NC_018028	GAC	2	6	5047	5052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419092
103	NC_018028	CAA	2	6	5118	5123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392419092
104	NC_018028	CGG	2	6	5139	5144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419092
105	NC_018028	TCCGC	2	10	5162	5171	0 %	20 %	20 %	60 %	392419092
106	NC_018028	AAG	2	6	5218	5223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419092
107	NC_018028	CGA	2	6	5244	5249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419092
108	NC_018028	TCC	2	6	5387	5392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392419092
109	NC_018028	GAT	2	6	5430	5435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419092
110	NC_018028	CGC	2	6	5439	5444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419092
111	NC_018028	GC	3	6	5461	5466	0 %	0 %	50 %	50 %	392419092
112	NC_018028	CGT	2	6	5485	5490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419092
113	NC_018028	CAAG	2	8	5604	5611	50 %	0 %	25 %	25 %	392419092
114	NC_018028	GAT	2	6	5688	5693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419092
115	NC_018028	ACA	2	6	5756	5761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392419092
116	NC_018028	CAT	4	12	5784	5795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419092
117	NC_018028	CCGACG	2	12	5798	5809	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	392419092
118	NC_018028	GCT	2	6	5832	5837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419092
119	NC_018028	CTT	3	9	5844	5852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392419092
120	NC_018028	TA	3	6	5888	5893	50 %	50 %	0 %	0 %	392419092
121	NC_018028	GCC	2	6	5901	5906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419092
122	NC_018028	GAC	2	6	5950	5955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419092
123	NC_018028	GGA	2	6	5964	5969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392419092
124	NC_018028	TGG	2	6	6036	6041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419092
125	NC_018028	TGA	2	6	6077	6082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419092
126	NC_018028	CGC	2	6	6177	6182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419092
127	NC_018028	CTGG	2	8	6192	6199	0 %	25 %	50 %	25 %	392419092
128	NC_018028	TTC	2	6	6349	6354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392419092
129	NC_018028	CAAG	2	8	6465	6472	50 %	0 %	25 %	25 %	392419092
130	NC_018028	TGA	2	6	6485	6490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419092
131	NC_018028	CGC	2	6	6502	6507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419092
132	NC_018028	ACC	2	6	6565	6570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392419092
133	NC_018028	CAGAT	2	10	6626	6635	40 %	20 %	20 %	20 %	392419092
134	NC_018028	CCGCG	2	10	6667	6676	0 %	0 %	40 %	60 %	392419092
135	NC_018028	GTT	2	6	6764	6769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018028	TTTG	2	8	6813	6820	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018028	ATG	2	6	6847	6852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018028	AGGG	2	8	6853	6860	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018028	ACT	2	6	6874	6879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_018028	CAT	2	6	6881	6886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_018028	A	6	6	6896	6901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018028	GGA	2	6	6911	6916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018028	GTCC	2	8	6971	6978	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_018028	CGA	2	6	7011	7016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_018028	CAA	2	6	7053	7058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_018028	A	6	6	7057	7062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018028	GCA	2	6	7089	7094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419093
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160	NC_018028	GCTG	2	8	7810	7817	0 %	25 %	50 %	25 %	392419093
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268	NC_018028	CGG	2	6	14106	14111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
269	NC_018028	T	6	6	14113	14118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_018028	GTG	2	6	14243	14248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
271	NC_018028	AGG	2	6	14257	14262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
272	NC_018028	GT	3	6	14273	14278	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
273	NC_018028	ACG	2	6	14309	14314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_018028	CGA	3	9	14387	14395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419100
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276	NC_018028	GAT	2	6	14592	14597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419100
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280	NC_018028	GGT	3	9	14802	14810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419101
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282	NC_018028	GGT	2	6	14910	14915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
283	NC_018028	GTG	2	6	14929	14934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419102
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288	NC_018028	CTGA	2	8	15264	15271	25 %	25 %	25 %	25 %	392419102
289	NC_018028	GA	3	6	15298	15303	50 %	0 %	50 %	0 %	392419102
290	NC_018028	TGC	2	6	15325	15330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419102
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299	NC_018028	TGG	2	6	15700	15705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419102
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332	NC_018028	CGG	2	6	17532	17537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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385	NC_018028	CG	3	6	20303	20308	0 %	0 %	50 %	50 %	392419104
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397	NC_018028	TGC	2	6	20862	20867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419104
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496	NC_018028	GC	3	6	25065	25070	0 %	0 %	50 %	50 %	392419108
497	NC_018028	C	6	6	25257	25262	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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499	NC_018028	GC	3	6	25525	25530	0 %	0 %	50 %	50 %	392419109
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