MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prevotella intermedia 17 chromosome chromosome I

Total Repeats: 12017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017860	GTT	2	6	151	156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017860	A	7	7	272	278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017860	TAAAAA	2	12	300	311	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017860	ATA	2	6	330	335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017860	TAAC	2	8	339	346	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017860	ACT	2	6	433	438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017860	ACTT	2	8	453	460	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017860	CAC	2	6	514	519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017860	GCAGGC	2	12	523	534	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017860	CA	3	6	564	569	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017860	TGC	2	6	600	605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017860	GAC	2	6	662	667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017860	CCA	2	6	674	679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017860	GCA	2	6	809	814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017860	GAT	2	6	872	877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017860	AGGC	2	8	888	895	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017860	CAA	2	6	934	939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017860	GGC	2	6	1001	1006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017860	CAA	2	6	1030	1035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017860	CCCTCG	2	12	1083	1094	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_017860	GAA	3	9	1121	1129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017860	ACC	2	6	1229	1234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_017860	GTTA	2	8	1300	1307	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017860	ACA	3	9	1353	1361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017860	CAA	2	6	1378	1383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017860	CCA	2	6	1386	1391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_017860	GGT	2	6	1537	1542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017860	CAA	2	6	1762	1767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017860	GAC	2	6	1853	1858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017860	CTAT	2	8	1863	1870	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017860	CTG	2	6	2064	2069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017860	AGT	2	6	2116	2121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017860	GGT	2	6	2131	2136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017860	AAG	2	6	2273	2278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017860	TAG	2	6	2387	2392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017860	T	7	7	2418	2424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017860	TTGC	2	8	2454	2461	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017860	ACCACG	2	12	2500	2511	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017860	TCT	2	6	2541	2546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017860	AAT	2	6	2683	2688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017860	GTT	2	6	2702	2707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017860	CTT	2	6	2759	2764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017860	T	6	6	2763	2768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017860	TAT	2	6	2779	2784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017860	ATTT	2	8	2805	2812	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017860	T	6	6	2834	2839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017860	TG	3	6	2923	2928	0 %	50 %	50 %	0 %	387131619
48	NC_017860	CTT	2	6	2942	2947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387131619
49	NC_017860	TCT	2	6	2953	2958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387131619
50	NC_017860	TTCT	2	8	2995	3002	0 %	75 %	0 %	25 %	387131619
51	NC_017860	TGG	2	6	3094	3099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387131619
52	NC_017860	GCGA	2	8	3114	3121	25 %	0 %	50 %	25 %	387131619
53	NC_017860	CTG	2	6	3136	3141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387131619
54	NC_017860	T	7	7	3274	3280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017860	ATA	2	6	3298	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017860	CAAA	2	8	3320	3327	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017860	ATT	2	6	3337	3342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017860	GAT	2	6	3401	3406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017860	CTTA	2	8	3431	3438	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017860	ATT	2	6	3446	3451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017860	AATA	2	8	3459	3466	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017860	T	6	6	3474	3479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017860	TCTA	2	8	3499	3506	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017860	GTT	2	6	3530	3535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017860	TAT	2	6	3555	3560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017860	AT	3	6	3559	3564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017860	AGA	2	6	3565	3570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017860	A	6	6	3572	3577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017860	CTG	2	6	3691	3696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387131620
70	NC_017860	GGA	2	6	3755	3760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387131620
71	NC_017860	CTA	2	6	3814	3819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387131620
72	NC_017860	CAG	2	6	3904	3909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387131620
73	NC_017860	TGG	2	6	3970	3975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387131620
74	NC_017860	TAT	2	6	4098	4103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387131620
75	NC_017860	ATA	2	6	4104	4109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387131620
76	NC_017860	TGG	2	6	4110	4115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387131620
77	NC_017860	CAG	2	6	4146	4151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387131620
78	NC_017860	TTCATT	2	12	4227	4238	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387131620
79	NC_017860	GAA	2	6	4275	4280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387131620
80	NC_017860	AAGGA	2	10	4297	4306	60 %	0 %	40 %	0 %	387131620
81	NC_017860	GAT	2	6	4312	4317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017860	AGT	2	6	4318	4323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017860	ATG	2	6	4337	4342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017860	CT	3	6	4403	4408	0 %	50 %	0 %	50 %	387131621
85	NC_017860	AAAGCC	2	12	4424	4435	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387131621
86	NC_017860	CAC	2	6	4444	4449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387131621
87	NC_017860	GCCA	2	8	4479	4486	25 %	0 %	25 %	50 %	387131621
88	NC_017860	A	6	6	4551	4556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017860	ATA	2	6	4560	4565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017860	ACT	2	6	4658	4663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017860	GAC	2	6	4674	4679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017860	GAAA	2	8	4721	4728	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017860	ACA	2	6	4731	4736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017860	CCA	2	6	4807	4812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387131622
95	NC_017860	CTA	2	6	4901	4906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387131622
96	NC_017860	AAC	2	6	4917	4922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387131622
97	NC_017860	CGA	2	6	4982	4987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387131622
98	NC_017860	TTG	2	6	5007	5012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387131622
99	NC_017860	GAC	2	6	5049	5054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387131622
100	NC_017860	CTTG	2	8	5170	5177	0 %	50 %	25 %	25 %	387131622
101	NC_017860	GTG	2	6	5244	5249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387131622
102	NC_017860	GCC	2	6	5332	5337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387131622
103	NC_017860	GCA	2	6	5350	5355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387131622
104	NC_017860	GTT	2	6	5433	5438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387131622
105	NC_017860	GTG	2	6	5439	5444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387131622
106	NC_017860	AAGC	2	8	5470	5477	50 %	0 %	25 %	25 %	387131622
107	NC_017860	GAAG	2	8	5510	5517	50 %	0 %	50 %	0 %	387131622
108	NC_017860	TGG	2	6	5539	5544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387131622
109	NC_017860	AGAC	2	8	5620	5627	50 %	0 %	25 %	25 %	387131622
110	NC_017860	TC	3	6	5669	5674	0 %	50 %	0 %	50 %	387131622
111	NC_017860	CAA	2	6	5705	5710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387131622
112	NC_017860	CAT	2	6	5813	5818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387131622
113	NC_017860	AAGGAA	2	12	5838	5849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387131622
114	NC_017860	ACA	2	6	5959	5964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387131622
115	NC_017860	TCA	2	6	6004	6009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387131622
116	NC_017860	CAT	2	6	6119	6124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387131622
117	NC_017860	GAA	2	6	6137	6142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387131622
118	NC_017860	TTC	2	6	6160	6165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387131622
119	NC_017860	TGC	2	6	6221	6226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387131622
120	NC_017860	GAAG	2	8	6263	6270	50 %	0 %	50 %	0 %	387131622
121	NC_017860	ATG	2	6	6276	6281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387131622
122	NC_017860	AGGC	2	8	6295	6302	25 %	0 %	50 %	25 %	387131622
123	NC_017860	CT	3	6	6354	6359	0 %	50 %	0 %	50 %	387131622
124	NC_017860	GAA	2	6	6380	6385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387131622
125	NC_017860	GACC	2	8	6386	6393	25 %	0 %	25 %	50 %	387131622
126	NC_017860	ATG	2	6	6414	6419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387131622
127	NC_017860	GCGG	2	8	6429	6436	0 %	0 %	75 %	25 %	387131622
128	NC_017860	AAGA	2	8	6450	6457	75 %	0 %	25 %	0 %	387131622
129	NC_017860	TGC	2	6	6488	6493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387131622
130	NC_017860	GAT	2	6	6641	6646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387131622
131	NC_017860	GAA	2	6	6668	6673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387131622
132	NC_017860	TAC	2	6	6684	6689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387131622
133	NC_017860	TCA	2	6	6694	6699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387131622
134	NC_017860	GTG	2	6	6747	6752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387131622
135	NC_017860	TAC	2	6	6771	6776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387131622
136	NC_017860	CAA	2	6	6782	6787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387131622
137	NC_017860	CT	3	6	6801	6806	0 %	50 %	0 %	50 %	387131622
138	NC_017860	CAA	2	6	6872	6877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387131622
139	NC_017860	ACCTTC	2	12	6891	6902	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	387131622
140	NC_017860	CGA	2	6	6914	6919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387131622
141	NC_017860	TCGCT	2	10	6952	6961	0 %	40 %	20 %	40 %	387131622
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401	NC_017860	AGAT	2	8	19852	19859	50 %	25 %	25 %	0 %	387131632
402	NC_017860	TGAA	2	8	19860	19867	50 %	25 %	25 %	0 %	387131632
403	NC_017860	A	6	6	19936	19941	100 %	0 %	0 %	0 %	387131632
404	NC_017860	GAA	2	6	20000	20005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387131632
405	NC_017860	AG	4	8	20032	20039	50 %	0 %	50 %	0 %	387131632
406	NC_017860	TAGA	2	8	20091	20098	50 %	25 %	25 %	0 %	387131632
407	NC_017860	GGA	2	6	20185	20190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387131632
408	NC_017860	A	7	7	20251	20257	100 %	0 %	0 %	0 %	387131632
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411	NC_017860	TAT	2	6	20429	20434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387131632
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413	NC_017860	AGC	2	6	20553	20558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
414	NC_017860	AGGT	2	8	20818	20825	25 %	25 %	50 %	0 %	387131633
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427	NC_017860	GCC	2	6	21552	21557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387131633
428	NC_017860	TGC	2	6	21567	21572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387131633
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446	NC_017860	TTAAAA	2	12	22301	22312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_017860	ATT	2	6	22320	22325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387131634
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500	NC_017860	CGG	2	6	25396	25401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387131637

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