MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 121084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_017530	CTT	2	6	98843	98848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386009726
2003	NC_017530	GGGC	2	8	98906	98913	0 %	0 %	75 %	25 %	386009726
2004	NC_017530	TGC	2	6	98926	98931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009726
2005	NC_017530	GCT	2	6	98938	98943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009726
2006	NC_017530	GAC	2	6	98974	98979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009726
2007	NC_017530	GCG	2	6	98980	98985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009726
2008	NC_017530	CAG	2	6	99019	99024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009726
2009	NC_017530	GTAC	2	8	99245	99252	25 %	25 %	25 %	25 %	386009727
2010	NC_017530	GCG	2	6	99292	99297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009727
2011	NC_017530	CAG	2	6	99304	99309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009727
2012	NC_017530	CGGCAG	2	12	99349	99360	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386009727
2013	NC_017530	TGG	2	6	99470	99475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009727
2014	NC_017530	GCC	2	6	99613	99618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009727
2015	NC_017530	TTG	2	6	99622	99627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386009727
2016	NC_017530	CCCAG	2	10	99672	99681	20 %	0 %	20 %	60 %	386009727
2017	NC_017530	CGA	2	6	99720	99725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009727
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2020	NC_017530	TGC	2	6	99836	99841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009727
2021	NC_017530	GAC	2	6	99879	99884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009727
2022	NC_017530	GGC	2	6	99901	99906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009727
2023	NC_017530	GC	3	6	99929	99934	0 %	0 %	50 %	50 %	386009727
2024	NC_017530	CA	3	6	99994	99999	50 %	0 %	0 %	50 %	386009727
2025	NC_017530	AGT	2	6	100014	100019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009727
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2027	NC_017530	TCGCC	2	10	100132	100141	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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2029	NC_017530	CGA	2	6	100184	100189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2031	NC_017530	CGA	2	6	100376	100381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009728
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2033	NC_017530	CAT	2	6	100412	100417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009728
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2044	NC_017530	TGC	2	6	100788	100793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009729
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2050	NC_017530	ATC	2	6	101165	101170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009729
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2125	NC_017530	CAG	2	6	104207	104212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009732
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2242	NC_017530	GCG	2	6	110112	110117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2244	NC_017530	GGT	2	6	110129	110134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2245	NC_017530	TTC	2	6	110150	110155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2367	NC_017530	GT	3	6	115296	115301	0 %	50 %	50 %	0 %	386009743
2368	NC_017530	TCC	2	6	115319	115324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386009743
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2374	NC_017530	GC	3	6	115633	115638	0 %	0 %	50 %	50 %	386009743
2375	NC_017530	CCT	2	6	115650	115655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386009743
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2398	NC_017530	TGG	2	6	117005	117010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009744
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2400	NC_017530	TTGG	2	8	117123	117130	0 %	50 %	50 %	0 %	386009744
2401	NC_017530	GCA	2	6	117244	117249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2423	NC_017530	GCAT	2	8	118044	118051	25 %	25 %	25 %	25 %	386009746
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2428	NC_017530	GAC	2	6	118371	118376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2433	NC_017530	GTC	2	6	118712	118717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009747
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2488	NC_017530	GCT	2	6	121531	121536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009750
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