MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 121084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21502	NC_017530	GGT	2	6	1030607	1030612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010520
21503	NC_017530	GAA	2	6	1030673	1030678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010520
21504	NC_017530	GCA	2	6	1030724	1030729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010520
21505	NC_017530	GAT	2	6	1030735	1030740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010520
21506	NC_017530	GGC	2	6	1030768	1030773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010520
21507	NC_017530	CAA	2	6	1030786	1030791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010520
21508	NC_017530	ACA	2	6	1030797	1030802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010520
21509	NC_017530	CAT	2	6	1031023	1031028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010520
21510	NC_017530	GCC	2	6	1031031	1031036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010520
21511	NC_017530	GTG	2	6	1031087	1031092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010520
21512	NC_017530	ACG	2	6	1031097	1031102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010520
21513	NC_017530	CAC	2	6	1031110	1031115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010520
21514	NC_017530	CCG	2	6	1031175	1031180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010520
21515	NC_017530	GGT	2	6	1031227	1031232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010520
21516	NC_017530	CGT	2	6	1031263	1031268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010520
21517	NC_017530	CTG	2	6	1031318	1031323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010520
21518	NC_017530	GC	3	6	1031395	1031400	0 %	0 %	50 %	50 %	386010520
21519	NC_017530	TTC	2	6	1031432	1031437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010520
21520	NC_017530	GCC	2	6	1031550	1031555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010520
21521	NC_017530	GAGC	2	8	1031581	1031588	25 %	0 %	50 %	25 %	386010520
21522	NC_017530	GCC	2	6	1031593	1031598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010520
21523	NC_017530	CGC	2	6	1031612	1031617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010520
21524	NC_017530	CGG	2	6	1031641	1031646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010520
21525	NC_017530	CGC	2	6	1031732	1031737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010520
21526	NC_017530	GCG	2	6	1031781	1031786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010520
21527	NC_017530	CAA	2	6	1031833	1031838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010520
21528	NC_017530	CGC	2	6	1031843	1031848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010520
21529	NC_017530	CAC	2	6	1031858	1031863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010520
21530	NC_017530	AAG	2	6	1031864	1031869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010520
21531	NC_017530	GAA	2	6	1031875	1031880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010520
21532	NC_017530	GCC	2	6	1031925	1031930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21533	NC_017530	GCA	2	6	1032058	1032063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010521
21534	NC_017530	CAC	2	6	1032092	1032097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010521
21535	NC_017530	GC	3	6	1032124	1032129	0 %	0 %	50 %	50 %	386010521
21536	NC_017530	CAG	2	6	1032252	1032257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010521
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21538	NC_017530	CCGT	2	8	1032420	1032427	0 %	25 %	25 %	50 %	386010521
21539	NC_017530	CGCGCA	2	12	1032517	1032528	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386010521
21540	NC_017530	CA	3	6	1032547	1032552	50 %	0 %	0 %	50 %	386010521
21541	NC_017530	GCG	2	6	1032559	1032564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010521
21542	NC_017530	ACGCC	2	10	1032671	1032680	20 %	0 %	20 %	60 %	386010521
21543	NC_017530	CGC	2	6	1032781	1032786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010521
21544	NC_017530	CGC	2	6	1032844	1032849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010521
21545	NC_017530	TGA	2	6	1032896	1032901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010521
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21547	NC_017530	TGG	2	6	1033000	1033005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010521
21548	NC_017530	CCTGA	2	10	1033023	1033032	20 %	20 %	20 %	40 %	386010521
21549	NC_017530	GAG	2	6	1033155	1033160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386010521
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21551	NC_017530	TGC	2	6	1033284	1033289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010522
21552	NC_017530	ACC	2	6	1033337	1033342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010522
21553	NC_017530	GAA	2	6	1033417	1033422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010522
21554	NC_017530	ATC	2	6	1033451	1033456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010522
21555	NC_017530	GCC	2	6	1033460	1033465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010522
21556	NC_017530	TGT	2	6	1033488	1033493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010522
21557	NC_017530	CTG	3	9	1033682	1033690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010522
21558	NC_017530	CGG	2	6	1033707	1033712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010522
21559	NC_017530	CTG	2	6	1033736	1033741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010522
21560	NC_017530	GGC	2	6	1033774	1033779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010522
21561	NC_017530	ACGG	2	8	1033796	1033803	25 %	0 %	50 %	25 %	386010522
21562	NC_017530	GCG	2	6	1033907	1033912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010522
21563	NC_017530	GGC	2	6	1033918	1033923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010522
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21565	NC_017530	TGG	3	9	1034024	1034032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21566	NC_017530	AC	3	6	1034033	1034038	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21567	NC_017530	GGT	2	6	1034042	1034047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21568	NC_017530	GGCC	2	8	1034088	1034095	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21569	NC_017530	CTG	2	6	1034096	1034101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21570	NC_017530	GCCACC	2	12	1034129	1034140	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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21572	NC_017530	AC	3	6	1034178	1034183	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21573	NC_017530	GGCC	2	8	1034233	1034240	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21574	NC_017530	CTG	2	6	1034241	1034246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21575	NC_017530	GCCACC	2	12	1034274	1034285	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
21576	NC_017530	GGT	2	6	1034315	1034320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21577	NC_017530	AC	3	6	1034323	1034328	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21578	NC_017530	CCG	2	6	1034376	1034381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010523
21579	NC_017530	CTG	2	6	1034403	1034408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010523
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21581	NC_017530	CA	3	6	1034639	1034644	50 %	0 %	0 %	50 %	386010523
21582	NC_017530	CAG	2	6	1034676	1034681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010523
21583	NC_017530	GCT	2	6	1034690	1034695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010523
21584	NC_017530	CG	4	8	1034710	1034717	0 %	0 %	50 %	50 %	386010523
21585	NC_017530	GCCAG	2	10	1034737	1034746	20 %	0 %	40 %	40 %	386010523
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21589	NC_017530	CATT	2	8	1034831	1034838	25 %	50 %	0 %	25 %	386010523
21590	NC_017530	CAGC	2	8	1034853	1034860	25 %	0 %	25 %	50 %	386010523
21591	NC_017530	CCAAG	2	10	1034867	1034876	40 %	0 %	20 %	40 %	386010523
21592	NC_017530	GGT	2	6	1035011	1035016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010523
21593	NC_017530	CGCGT	2	10	1035017	1035026	0 %	20 %	40 %	40 %	386010523
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21600	NC_017530	GGC	2	6	1035354	1035359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010523
21601	NC_017530	CTG	2	6	1035397	1035402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010523
21602	NC_017530	CGA	2	6	1035433	1035438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010523
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21605	NC_017530	CAC	2	6	1035582	1035587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010523
21606	NC_017530	GC	3	6	1035593	1035598	0 %	0 %	50 %	50 %	386010523
21607	NC_017530	CTGC	2	8	1035665	1035672	0 %	25 %	25 %	50 %	386010523
21608	NC_017530	CTGG	2	8	1035717	1035724	0 %	25 %	50 %	25 %	386010523
21609	NC_017530	CAGC	2	8	1035735	1035742	25 %	0 %	25 %	50 %	386010523
21610	NC_017530	TGC	2	6	1035777	1035782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010523
21611	NC_017530	GC	3	6	1035781	1035786	0 %	0 %	50 %	50 %	386010523
21612	NC_017530	GCG	3	9	1035801	1035809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010523
21613	NC_017530	CAG	2	6	1035819	1035824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010523
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21615	NC_017530	GAT	2	6	1035873	1035878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010523
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21617	NC_017530	GCG	2	6	1036030	1036035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010523
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21967	NC_017530	TTC	2	6	1052352	1052357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010535
21968	NC_017530	TCC	2	6	1052358	1052363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386010535
21969	NC_017530	AGC	2	6	1052371	1052376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010535
21970	NC_017530	CAT	2	6	1052399	1052404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010535
21971	NC_017530	CCG	2	6	1052504	1052509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010535
21972	NC_017530	GCA	2	6	1052558	1052563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010535
21973	NC_017530	GAA	2	6	1052571	1052576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010535
21974	NC_017530	TTC	2	6	1052592	1052597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010535
21975	NC_017530	GCA	2	6	1052605	1052610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010535
21976	NC_017530	CAT	2	6	1052615	1052620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010535
21977	NC_017530	CGGT	2	8	1052629	1052636	0 %	25 %	50 %	25 %	386010535
21978	NC_017530	TGC	2	6	1052638	1052643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010535
21979	NC_017530	GCC	2	6	1052662	1052667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010535
21980	NC_017530	GAAG	2	8	1052669	1052676	50 %	0 %	50 %	0 %	386010535
21981	NC_017530	GC	3	6	1052721	1052726	0 %	0 %	50 %	50 %	386010535
21982	NC_017530	AAG	3	9	1052745	1052753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010535
21983	NC_017530	CGG	3	9	1052798	1052806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010535
21984	NC_017530	ACCT	2	8	1052814	1052821	25 %	25 %	0 %	50 %	386010535
21985	NC_017530	GCT	2	6	1052918	1052923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21986	NC_017530	GGC	2	6	1053023	1053028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21987	NC_017530	TCG	2	6	1053129	1053134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010536
21988	NC_017530	ATC	2	6	1053144	1053149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010536
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21990	NC_017530	GCA	2	6	1053247	1053252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010536
21991	NC_017530	GC	3	6	1053328	1053333	0 %	0 %	50 %	50 %	386010536
21992	NC_017530	TCG	2	6	1053378	1053383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010536
21993	NC_017530	TTC	2	6	1053390	1053395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010536
21994	NC_017530	GCA	2	6	1053400	1053405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010536
21995	NC_017530	TCA	2	6	1053502	1053507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010536
21996	NC_017530	GCA	2	6	1053583	1053588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010536
21997	NC_017530	TGT	2	6	1053715	1053720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010536
21998	NC_017530	AGC	2	6	1053795	1053800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010536
21999	NC_017530	CGT	2	6	1053904	1053909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010536
22000	NC_017530	TCA	2	6	1053925	1053930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010536

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