MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 121084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_017530	GAG	2	6	910825	910830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386010424
19003	NC_017530	GGCT	2	8	910843	910850	0 %	25 %	50 %	25 %	386010424
19004	NC_017530	CTCG	2	8	910947	910954	0 %	25 %	25 %	50 %	386010424
19005	NC_017530	GCC	2	6	910973	910978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010424
19006	NC_017530	GGT	2	6	911001	911006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010424
19007	NC_017530	CTG	2	6	911047	911052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010424
19008	NC_017530	TCG	2	6	911111	911116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010424
19009	NC_017530	CAA	2	6	911130	911135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010424
19010	NC_017530	GTT	2	6	911161	911166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010424
19011	NC_017530	AG	3	6	911314	911319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19012	NC_017530	CGC	2	6	911322	911327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19013	NC_017530	TGG	2	6	911399	911404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19014	NC_017530	CTG	2	6	911448	911453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19015	NC_017530	CGC	2	6	911514	911519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19016	NC_017530	A	6	6	911579	911584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19017	NC_017530	TCG	2	6	911729	911734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010425
19018	NC_017530	CAA	2	6	911770	911775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010425
19019	NC_017530	AAC	2	6	911792	911797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010425
19020	NC_017530	GGC	2	6	911798	911803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010425
19021	NC_017530	CGA	2	6	911824	911829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010425
19022	NC_017530	AAG	2	6	911846	911851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010425
19023	NC_017530	GT	3	6	911916	911921	0 %	50 %	50 %	0 %	386010425
19024	NC_017530	AAGG	2	8	912002	912009	50 %	0 %	50 %	0 %	386010425
19025	NC_017530	GTC	2	6	912016	912021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010425
19026	NC_017530	GCT	2	6	912031	912036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010425
19027	NC_017530	ACT	2	6	912057	912062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010425
19028	NC_017530	CGG	3	9	912133	912141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010425
19029	NC_017530	CCG	2	6	912178	912183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010425
19030	NC_017530	AAGG	2	8	912200	912207	50 %	0 %	50 %	0 %	386010425
19031	NC_017530	GTC	2	6	912299	912304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010425
19032	NC_017530	CTT	2	6	912319	912324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010425
19033	NC_017530	CAT	2	6	912337	912342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010425
19034	NC_017530	AGC	2	6	912380	912385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010425
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19037	NC_017530	CCGT	2	8	912608	912615	0 %	25 %	25 %	50 %	386010425
19038	NC_017530	CTGC	2	8	912635	912642	0 %	25 %	25 %	50 %	386010425
19039	NC_017530	CCA	2	6	912738	912743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010425
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19041	NC_017530	GTCC	2	8	912836	912843	0 %	25 %	25 %	50 %	386010425
19042	NC_017530	GGC	2	6	912848	912853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010425
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19045	NC_017530	CGG	2	6	913018	913023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010425
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19051	NC_017530	ACG	2	6	913248	913253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010425
19052	NC_017530	ATG	2	6	913296	913301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010425
19053	NC_017530	CCTGGC	2	12	913316	913327	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386010425
19054	NC_017530	GCCTGG	2	12	913359	913370	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386010425
19055	NC_017530	CTT	2	6	913417	913422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010425
19056	NC_017530	TCG	2	6	913458	913463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010425
19057	NC_017530	GAC	2	6	913504	913509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19058	NC_017530	CTG	2	6	913533	913538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010426
19059	NC_017530	CTG	2	6	913563	913568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010426
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19064	NC_017530	TGC	2	6	913904	913909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010426
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19086	NC_017530	GGC	2	6	914948	914953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19087	NC_017530	CCT	2	6	915041	915046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19088	NC_017530	CAT	2	6	915131	915136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19089	NC_017530	CCG	2	6	915181	915186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19090	NC_017530	GCC	2	6	915285	915290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010427
19091	NC_017530	GGGC	2	8	915348	915355	0 %	0 %	75 %	25 %	386010427
19092	NC_017530	GCT	3	9	915357	915365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010427
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19095	NC_017530	GCA	2	6	915513	915518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010427
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19102	NC_017530	GAC	2	6	915667	915672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010427
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19107	NC_017530	CAGCG	2	10	915919	915928	20 %	0 %	40 %	40 %	386010427
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19118	NC_017530	GCGA	2	8	916273	916280	25 %	0 %	50 %	25 %	386010427
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19120	NC_017530	GCC	2	6	916384	916389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010427
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19122	NC_017530	CTG	2	6	916420	916425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010427
19123	NC_017530	TGC	2	6	916448	916453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010427
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19127	NC_017530	CTGG	2	8	916561	916568	0 %	25 %	50 %	25 %	386010427
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19139	NC_017530	GC	3	6	917061	917066	0 %	0 %	50 %	50 %	386010427
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19149	NC_017530	GGCCA	2	10	917464	917473	20 %	0 %	40 %	40 %	386010427
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19209	NC_017530	GCGG	2	8	920320	920327	0 %	0 %	75 %	25 %	386010429
19210	NC_017530	CGG	2	6	920342	920347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010429
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19212	NC_017530	GTT	2	6	920372	920377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010429
19213	NC_017530	ACG	2	6	920511	920516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19214	NC_017530	CTA	2	6	920552	920557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19217	NC_017530	CAG	2	6	920901	920906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010431
19218	NC_017530	TACT	2	8	920929	920936	25 %	50 %	0 %	25 %	386010431
19219	NC_017530	ATC	2	6	920970	920975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010431
19220	NC_017530	GTG	2	6	921313	921318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010432
19221	NC_017530	CAT	2	6	921371	921376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010432
19222	NC_017530	CTGCAC	2	12	921444	921455	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386010432
19223	NC_017530	GAC	2	6	921459	921464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010432
19224	NC_017530	GCTG	2	8	921541	921548	0 %	25 %	50 %	25 %	386010432
19225	NC_017530	GAA	2	6	921558	921563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010432
19226	NC_017530	CTGCGG	2	12	921569	921580	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386010432
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19231	NC_017530	CGT	2	6	921964	921969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010433
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19234	NC_017530	TGA	2	6	921998	922003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010433
19235	NC_017530	GC	3	6	922094	922099	0 %	0 %	50 %	50 %	386010433
19236	NC_017530	GCC	2	6	922120	922125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010433
19237	NC_017530	CAA	2	6	922134	922139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010433
19238	NC_017530	GCA	2	6	922168	922173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010433
19239	NC_017530	TGC	2	6	922179	922184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010433
19240	NC_017530	CTA	2	6	922200	922205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010433
19241	NC_017530	GC	3	6	922230	922235	0 %	0 %	50 %	50 %	386010433
19242	NC_017530	CGC	2	6	922352	922357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010433
19243	NC_017530	AAC	2	6	922360	922365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010433
19244	NC_017530	CTGG	2	8	922366	922373	0 %	25 %	50 %	25 %	386010433
19245	NC_017530	GCC	2	6	922436	922441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010433
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19247	NC_017530	CCG	2	6	922593	922598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010433
19248	NC_017530	CAG	2	6	922630	922635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010433
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19252	NC_017530	GC	3	6	922753	922758	0 %	0 %	50 %	50 %	386010434
19253	NC_017530	GCA	2	6	922854	922859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010434
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19298	NC_017530	TGA	2	6	925053	925058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19346	NC_017530	GC	3	6	927118	927123	0 %	0 %	50 %	50 %	386010437
19347	NC_017530	CAG	2	6	927124	927129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010437
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19350	NC_017530	GTACA	2	10	927250	927259	40 %	20 %	20 %	20 %	386010437
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19354	NC_017530	AAG	2	6	927650	927655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19355	NC_017530	CAA	3	9	927721	927729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010438
19356	NC_017530	CAAG	2	8	927733	927740	50 %	0 %	25 %	25 %	386010438
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19477	NC_017530	A	6	6	933338	933343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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