MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 121084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_017530	AC	3	6	718772	718777	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15002	NC_017530	GCA	2	6	718800	718805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15003	NC_017530	TATT	2	8	718834	718841	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15004	NC_017530	TGGT	2	8	718853	718860	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15005	NC_017530	CAG	2	6	718920	718925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010253
15006	NC_017530	GTC	2	6	718976	718981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010253
15007	NC_017530	CTC	2	6	719033	719038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386010253
15008	NC_017530	GTTCA	2	10	719048	719057	20 %	40 %	20 %	20 %	386010253
15009	NC_017530	TGA	2	6	719173	719178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010253
15010	NC_017530	GTA	2	6	719264	719269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010253
15011	NC_017530	ATC	2	6	719274	719279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010253
15012	NC_017530	GCG	2	6	719297	719302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010253
15013	NC_017530	GGC	2	6	719303	719308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010253
15014	NC_017530	CCT	2	6	719328	719333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386010254
15015	NC_017530	TGC	2	6	719337	719342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010254
15016	NC_017530	TGG	2	6	719343	719348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010254
15017	NC_017530	GAC	2	6	719380	719385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010254
15018	NC_017530	GGC	2	6	719407	719412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010254
15019	NC_017530	GCG	2	6	719444	719449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010254
15020	NC_017530	GCG	2	6	719534	719539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010254
15021	NC_017530	CGG	2	6	719577	719582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010254
15022	NC_017530	ACC	2	6	719678	719683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010254
15023	NC_017530	CAG	2	6	719803	719808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010254
15024	NC_017530	GCT	2	6	719812	719817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010254
15025	NC_017530	GCG	2	6	719852	719857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010254
15026	NC_017530	CAC	2	6	719893	719898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010254
15027	NC_017530	GC	3	6	719907	719912	0 %	0 %	50 %	50 %	386010254
15028	NC_017530	GGCCTG	2	12	719956	719967	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386010254
15029	NC_017530	GGC	2	6	719968	719973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010254
15030	NC_017530	CGG	2	6	720011	720016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010254
15031	NC_017530	CCA	2	6	720123	720128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010254
15032	NC_017530	ACC	2	6	720224	720229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010254
15033	NC_017530	GGCG	2	8	720330	720337	0 %	0 %	75 %	25 %	386010254
15034	NC_017530	CGG	2	6	720363	720368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010254
15035	NC_017530	ACGGCG	2	12	720410	720421	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386010254
15036	NC_017530	CAGC	2	8	720450	720457	25 %	0 %	25 %	50 %	386010254
15037	NC_017530	GGC	2	6	720550	720555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010254
15038	NC_017530	CCA	2	6	720567	720572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010254
15039	NC_017530	GAT	2	6	720577	720582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010254
15040	NC_017530	GC	3	6	720583	720588	0 %	0 %	50 %	50 %	386010254
15041	NC_017530	CAG	2	6	720625	720630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010254
15042	NC_017530	GTT	2	6	720675	720680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010254
15043	NC_017530	CGC	2	6	720699	720704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010254
15044	NC_017530	GCT	2	6	720727	720732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010254
15045	NC_017530	CAC	2	6	720949	720954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010254
15046	NC_017530	CCA	2	6	721050	721055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010254
15047	NC_017530	GCCGGC	2	12	721069	721080	0 %	0 %	50 %	50 %	386010254
15048	NC_017530	GC	3	6	721079	721084	0 %	0 %	50 %	50 %	386010254
15049	NC_017530	CAG	2	6	721144	721149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010254
15050	NC_017530	GGC	2	6	721266	721271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010254
15051	NC_017530	GTC	2	6	721288	721293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010254
15052	NC_017530	GCCT	2	8	721324	721331	0 %	25 %	25 %	50 %	386010254
15053	NC_017530	CAG	2	6	721348	721353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010254
15054	NC_017530	TCA	2	6	721358	721363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010254
15055	NC_017530	GC	3	6	721386	721391	0 %	0 %	50 %	50 %	386010254
15056	NC_017530	GC	3	6	721445	721450	0 %	0 %	50 %	50 %	386010254
15057	NC_017530	GCC	2	6	721483	721488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010254
15058	NC_017530	GC	3	6	721643	721648	0 %	0 %	50 %	50 %	386010254
15059	NC_017530	TGG	2	6	721704	721709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010254
15060	NC_017530	CTC	2	6	721724	721729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15061	NC_017530	TTG	2	6	721833	721838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010255
15062	NC_017530	TGC	2	6	721867	721872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010255
15063	NC_017530	GCA	2	6	721915	721920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010255
15064	NC_017530	GGCGCA	2	12	721921	721932	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386010255
15065	NC_017530	GGC	2	6	721947	721952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010255
15066	NC_017530	TGG	2	6	722029	722034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010255
15067	NC_017530	CAC	2	6	722105	722110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010255
15068	NC_017530	CGA	2	6	722131	722136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010255
15069	NC_017530	TGC	2	6	722144	722149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010255
15070	NC_017530	AGG	2	6	722290	722295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15071	NC_017530	GCAGGA	2	12	722369	722380	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386010256
15072	NC_017530	GGCA	2	8	722408	722415	25 %	0 %	50 %	25 %	386010256
15073	NC_017530	CAG	2	6	722564	722569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15074	NC_017530	TGA	2	6	722607	722612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010257
15075	NC_017530	TGG	3	9	722892	722900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010257
15076	NC_017530	GGT	2	6	722921	722926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010257
15077	NC_017530	TGGG	2	8	723048	723055	0 %	25 %	75 %	0 %	386010257
15078	NC_017530	CTGC	2	8	723118	723125	0 %	25 %	25 %	50 %	386010257
15079	NC_017530	GCCT	2	8	723153	723160	0 %	25 %	25 %	50 %	386010257
15080	NC_017530	GCT	2	6	723211	723216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010257
15081	NC_017530	CGG	2	6	723250	723255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010257
15082	NC_017530	TCA	2	6	723306	723311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010257
15083	NC_017530	GGCT	2	8	723341	723348	0 %	25 %	50 %	25 %	386010257
15084	NC_017530	CGC	2	6	723361	723366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010257
15085	NC_017530	TGG	2	6	723378	723383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010257
15086	NC_017530	CGCC	2	8	723394	723401	0 %	0 %	25 %	75 %	386010257
15087	NC_017530	CTG	2	6	723428	723433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010257
15088	NC_017530	TGC	2	6	723471	723476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010257
15089	NC_017530	GGC	2	6	723484	723489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010257
15090	NC_017530	CAT	2	6	723556	723561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010257
15091	NC_017530	GC	3	6	723597	723602	0 %	0 %	50 %	50 %	386010257
15092	NC_017530	TG	3	6	723632	723637	0 %	50 %	50 %	0 %	386010257
15093	NC_017530	TGC	2	6	723658	723663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010257
15094	NC_017530	GCT	2	6	723676	723681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010257
15095	NC_017530	TGG	2	6	723735	723740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010257
15096	NC_017530	CGA	2	6	723827	723832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15097	NC_017530	GC	4	8	723835	723842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15098	NC_017530	CCG	2	6	723985	723990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15099	NC_017530	CTGA	2	8	724017	724024	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15100	NC_017530	GT	3	6	724031	724036	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15101	NC_017530	GTTT	2	8	724155	724162	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15102	NC_017530	TCA	2	6	724163	724168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15103	NC_017530	TTGC	2	8	724246	724253	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15104	NC_017530	ACG	2	6	724291	724296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010258
15105	NC_017530	GTC	2	6	724304	724309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010258
15106	NC_017530	GCCAG	2	10	724343	724352	20 %	0 %	40 %	40 %	386010258
15107	NC_017530	CAGC	2	8	724435	724442	25 %	0 %	25 %	50 %	386010258
15108	NC_017530	CAC	2	6	724516	724521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010258
15109	NC_017530	GCT	2	6	724586	724591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010258
15110	NC_017530	GTC	2	6	724592	724597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010258
15111	NC_017530	AGC	2	6	724667	724672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010258
15112	NC_017530	TCG	2	6	724737	724742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010258
15113	NC_017530	GC	3	6	724764	724769	0 %	0 %	50 %	50 %	386010258
15114	NC_017530	TGGG	2	8	724786	724793	0 %	25 %	75 %	0 %	386010258
15115	NC_017530	TGG	3	9	724822	724830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010258
15116	NC_017530	GGGC	2	8	724878	724885	0 %	0 %	75 %	25 %	386010258
15117	NC_017530	GAATG	2	10	724965	724974	40 %	20 %	40 %	0 %	386010258
15118	NC_017530	G	6	6	724991	724996	0 %	0 %	100 %	0 %	386010258
15119	NC_017530	GTT	2	6	725021	725026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010258
15120	NC_017530	CTGG	2	8	725035	725042	0 %	25 %	50 %	25 %	386010258
15121	NC_017530	GGA	2	6	725054	725059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386010258
15122	NC_017530	CAG	2	6	725094	725099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010258
15123	NC_017530	CGT	2	6	725148	725153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15124	NC_017530	GTC	2	6	725282	725287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010259
15125	NC_017530	CAC	2	6	725308	725313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010259
15126	NC_017530	TGT	2	6	725332	725337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010259
15127	NC_017530	TCG	2	6	725406	725411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010259
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15130	NC_017530	CAG	2	6	725477	725482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010259
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15134	NC_017530	TGGG	2	8	725587	725594	0 %	25 %	75 %	0 %	386010259
15135	NC_017530	GCT	2	6	725717	725722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010259
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15142	NC_017530	CATA	2	8	726103	726110	50 %	25 %	0 %	25 %	386010259
15143	NC_017530	GCCG	2	8	726154	726161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15144	NC_017530	TGA	2	6	726225	726230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010260
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15158	NC_017530	TG	3	6	727052	727057	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15159	NC_017530	G	7	7	727070	727076	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15160	NC_017530	CAG	2	6	727119	727124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15162	NC_017530	AG	3	6	727196	727201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15163	NC_017530	GTT	2	6	727233	727238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15192	NC_017530	CGG	2	6	728410	728415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010262
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15194	NC_017530	CCTG	2	8	728553	728560	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15195	NC_017530	GCTCAG	2	12	728672	728683	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386010263
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15214	NC_017530	CATC	2	8	729595	729602	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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15229	NC_017530	TGC	2	6	730333	730338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010264
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15349	NC_017530	GCCTG	2	10	738544	738553	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15350	NC_017530	GCAG	2	8	738568	738575	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15351	NC_017530	CAGG	2	8	738645	738652	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15352	NC_017530	CTG	3	9	738814	738822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010266
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15369	NC_017530	GCG	2	6	739541	739546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010267
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15490	NC_017530	TCG	2	6	746810	746815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010272
15491	NC_017530	CTG	2	6	746877	746882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010272
15492	NC_017530	AGC	2	6	746942	746947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010272
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15494	NC_017530	GAT	2	6	747039	747044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010272
15495	NC_017530	TTC	2	6	747103	747108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010272
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