MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 121084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_017530	GCG	2	6	50443	50448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009686
1003	NC_017530	GAT	2	6	50478	50483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009686
1004	NC_017530	CCA	2	6	50494	50499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009686
1005	NC_017530	AAC	2	6	50577	50582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009686
1006	NC_017530	GCG	2	6	50635	50640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009686
1007	NC_017530	AC	3	6	50779	50784	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_017530	TGC	2	6	50803	50808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_017530	CCG	2	6	50820	50825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_017530	CAAA	2	8	50891	50898	75 %	0 %	0 %	25 %	386009687
1011	NC_017530	CAG	2	6	50919	50924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009687
1012	NC_017530	ATAC	2	8	50945	50952	50 %	25 %	0 %	25 %	386009687
1013	NC_017530	CAA	2	6	50981	50986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009687
1014	NC_017530	GC	3	6	51046	51051	0 %	0 %	50 %	50 %	386009687
1015	NC_017530	AG	3	6	51086	51091	50 %	0 %	50 %	0 %	386009687
1016	NC_017530	AGT	2	6	51165	51170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009687
1017	NC_017530	GCG	2	6	51222	51227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009687
1018	NC_017530	ACC	2	6	51276	51281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009687
1019	NC_017530	AGCG	2	8	51415	51422	25 %	0 %	50 %	25 %	386009687
1020	NC_017530	GC	3	6	51527	51532	0 %	0 %	50 %	50 %	386009687
1021	NC_017530	CCAA	2	8	51587	51594	50 %	0 %	0 %	50 %	386009687
1022	NC_017530	AAG	3	9	51610	51618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386009687
1023	NC_017530	CAG	2	6	51630	51635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009687
1024	NC_017530	ATG	2	6	51703	51708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009687
1025	NC_017530	AGG	2	6	51748	51753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386009687
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1028	NC_017530	ATC	3	9	51856	51864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009687
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1030	NC_017530	AGCC	2	8	51958	51965	25 %	0 %	25 %	50 %	386009687
1031	NC_017530	AAC	2	6	51982	51987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009687
1032	NC_017530	CCG	2	6	52001	52006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009687
1033	NC_017530	A	6	6	52133	52138	100 %	0 %	0 %	0 %	386009687
1034	NC_017530	TTGGC	2	10	52180	52189	0 %	40 %	40 %	20 %	386009687
1035	NC_017530	TGC	2	6	52225	52230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009687
1036	NC_017530	TAT	2	6	52251	52256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017530	CAC	2	6	52351	52356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_017530	T	6	6	52370	52375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_017530	CTG	2	6	52407	52412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_017530	GAT	2	6	52553	52558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017530	GA	3	6	52614	52619	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017530	TGC	3	9	52627	52635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_017530	TGT	2	6	52677	52682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017530	TCTT	2	8	52699	52706	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1045	NC_017530	T	6	6	52719	52724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_017530	T	7	7	52737	52743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017530	T	6	6	52789	52794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017530	T	6	6	52810	52815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_017530	C	6	6	52833	52838	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1050	NC_017530	GTT	2	6	52866	52871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_017530	CT	3	6	52889	52894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_017530	ATC	2	6	52942	52947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_017530	TGGT	2	8	52948	52955	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017530	TGCGC	2	10	53070	53079	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1055	NC_017530	TGC	2	6	53106	53111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009688
1056	NC_017530	GGT	2	6	53116	53121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009688
1057	NC_017530	CTG	2	6	53160	53165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009688
1058	NC_017530	GC	3	6	53197	53202	0 %	0 %	50 %	50 %	386009688
1059	NC_017530	AAACCG	2	12	53224	53235	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_017530	ATC	2	6	53256	53261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_017530	GGC	3	9	53289	53297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_017530	CAGA	2	8	53322	53329	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1063	NC_017530	TGA	2	6	53605	53610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017530	AAG	2	6	53652	53657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017530	ATG	2	6	53744	53749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_017530	CGCTCT	2	12	53786	53797	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_017530	AGA	2	6	53830	53835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_017530	CGA	2	6	53869	53874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_017530	AAG	2	6	53882	53887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_017530	TTG	2	6	53906	53911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_017530	ATT	2	6	54025	54030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_017530	GCTG	2	8	54079	54086	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1073	NC_017530	CG	3	6	54117	54122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_017530	GCG	2	6	54255	54260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1077	NC_017530	T	6	6	54383	54388	0 %	100 %	0 %	0 %	386009689
1078	NC_017530	GC	3	6	54396	54401	0 %	0 %	50 %	50 %	386009689
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1084	NC_017530	CGAAG	2	10	54649	54658	40 %	0 %	40 %	20 %	386009689
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1093	NC_017530	GGC	2	6	55627	55632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009689
1094	NC_017530	TCA	2	6	55643	55648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009689
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1097	NC_017530	CAA	2	6	55820	55825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_017530	GCT	2	6	55840	55845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_017530	GAA	2	6	55846	55851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_017530	GCA	2	6	55865	55870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_017530	TGC	2	6	55950	55955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009690
1102	NC_017530	TGG	2	6	56003	56008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009690
1103	NC_017530	CAAT	2	8	56287	56294	50 %	25 %	0 %	25 %	386009690
1104	NC_017530	TTCC	2	8	56302	56309	0 %	50 %	0 %	50 %	386009690
1105	NC_017530	TC	4	8	56368	56375	0 %	50 %	0 %	50 %	386009690
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1109	NC_017530	GCG	3	9	56578	56586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009690
1110	NC_017530	CAAG	2	8	56608	56615	50 %	0 %	25 %	25 %	386009690
1111	NC_017530	GGA	2	6	56742	56747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017530	ACG	2	6	56774	56779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_017530	TTC	2	6	56820	56825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_017530	CCT	2	6	56831	56836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1115	NC_017530	AGG	2	6	56850	56855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017530	GCA	2	6	56884	56889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_017530	C	6	6	56944	56949	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1118	NC_017530	AAC	2	6	56995	57000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_017530	CAT	2	6	57131	57136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009691
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1121	NC_017530	GGCA	2	8	57173	57180	25 %	0 %	50 %	25 %	386009691
1122	NC_017530	CAT	2	6	57233	57238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009691
1123	NC_017530	CAA	2	6	57242	57247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009691
1124	NC_017530	GCC	2	6	57273	57278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009691
1125	NC_017530	TGCG	2	8	57294	57301	0 %	25 %	50 %	25 %	386009691
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1128	NC_017530	CCGCG	2	10	57416	57425	0 %	0 %	40 %	60 %	386009691
1129	NC_017530	TTC	2	6	57444	57449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386009691
1130	NC_017530	CTG	2	6	57471	57476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009691
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1132	NC_017530	CG	3	6	57605	57610	0 %	0 %	50 %	50 %	386009691
1133	NC_017530	CATGGC	2	12	57626	57637	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386009691
1134	NC_017530	TCG	2	6	57670	57675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009691
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1136	NC_017530	TGC	2	6	57749	57754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009691
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1152	NC_017530	GAG	2	6	58680	58685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1153	NC_017530	AGCG	2	8	58687	58694	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1154	NC_017530	CGA	2	6	58727	58732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1244	NC_017530	GCCA	2	8	62871	62878	25 %	0 %	25 %	50 %	386009695
1245	NC_017530	CGG	2	6	62927	62932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009695
1246	NC_017530	AGAAAA	2	12	63006	63017	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1247	NC_017530	GCG	3	9	63137	63145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009696
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1250	NC_017530	ACC	2	6	63292	63297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009696
1251	NC_017530	GCG	2	6	63372	63377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009696
1252	NC_017530	TC	3	6	63450	63455	0 %	50 %	0 %	50 %	386009696
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1254	NC_017530	TGC	2	6	63574	63579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009697
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1256	NC_017530	GAA	2	6	63704	63709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386009697
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1363	NC_017530	CAGG	2	8	68861	68868	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1364	NC_017530	CAT	2	6	68941	68946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009702
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1375	NC_017530	CGGAA	2	10	69332	69341	40 %	0 %	40 %	20 %	386009702
1376	NC_017530	TCA	2	6	69411	69416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009702
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1378	NC_017530	GCC	2	6	69566	69571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009702
1379	NC_017530	GTG	2	6	69727	69732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009702
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