MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 121084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_017530	GT	3	6	672787	672792	0 %	50 %	50 %	0 %	386010216
14002	NC_017530	CGG	2	6	672841	672846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010216
14003	NC_017530	TGG	3	9	672850	672858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010216
14004	NC_017530	CAA	2	6	672905	672910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010216
14005	NC_017530	TGC	2	6	672923	672928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010216
14006	NC_017530	CGT	2	6	672948	672953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010216
14007	NC_017530	CCA	2	6	672988	672993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010216
14008	NC_017530	CGG	2	6	673045	673050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010216
14009	NC_017530	CGA	2	6	673082	673087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010216
14010	NC_017530	CTG	2	6	673122	673127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010216
14011	NC_017530	CAC	2	6	673164	673169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010216
14012	NC_017530	GAT	2	6	673179	673184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010216
14013	NC_017530	TGGG	2	8	673224	673231	0 %	25 %	75 %	0 %	386010217
14014	NC_017530	CAA	2	6	673258	673263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010217
14015	NC_017530	GGT	2	6	673276	673281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010217
14016	NC_017530	GCA	2	6	673386	673391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010217
14017	NC_017530	TGC	2	6	673392	673397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010217
14018	NC_017530	CTG	3	9	673406	673414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010217
14019	NC_017530	CGGC	2	8	673434	673441	0 %	0 %	50 %	50 %	386010217
14020	NC_017530	GCG	2	6	673458	673463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010217
14021	NC_017530	CGA	2	6	673533	673538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010218
14022	NC_017530	TCT	2	6	673550	673555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010218
14023	NC_017530	TCC	2	6	673556	673561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386010218
14024	NC_017530	GCC	2	6	673569	673574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010218
14025	NC_017530	TCAG	2	8	673655	673662	25 %	25 %	25 %	25 %	386010218
14026	NC_017530	TCGC	2	8	673675	673682	0 %	25 %	25 %	50 %	386010218
14027	NC_017530	CAG	2	6	673684	673689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010218
14028	NC_017530	CTT	2	6	673740	673745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010218
14029	NC_017530	GAC	2	6	673778	673783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010218
14030	NC_017530	CACTG	2	10	673798	673807	20 %	20 %	20 %	40 %	386010218
14031	NC_017530	ACC	2	6	673808	673813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010218
14032	NC_017530	ACC	2	6	673859	673864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010218
14033	NC_017530	GTG	2	6	673916	673921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010218
14034	NC_017530	GCA	2	6	673927	673932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010218
14035	NC_017530	CCCG	2	8	673947	673954	0 %	0 %	25 %	75 %	386010218
14036	NC_017530	GGAA	2	8	673964	673971	50 %	0 %	50 %	0 %	386010218
14037	NC_017530	TGG	2	6	674052	674057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010218
14038	NC_017530	ATG	2	6	674141	674146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010218
14039	NC_017530	TC	3	6	674147	674152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14040	NC_017530	AC	3	6	674160	674165	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14041	NC_017530	AGTG	2	8	674172	674179	25 %	25 %	50 %	0 %	386010219
14042	NC_017530	TG	3	6	674213	674218	0 %	50 %	50 %	0 %	386010219
14043	NC_017530	CTT	2	6	674232	674237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010219
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14046	NC_017530	GTC	2	6	674377	674382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010219
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14050	NC_017530	TGG	2	6	674645	674650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010219
14051	NC_017530	GGC	2	6	674719	674724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010219
14052	NC_017530	GGT	2	6	674778	674783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010219
14053	NC_017530	CGAG	2	8	674917	674924	25 %	0 %	50 %	25 %	386010219
14054	NC_017530	CAG	2	6	674947	674952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010219
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14059	NC_017530	TGC	2	6	675120	675125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010219
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14061	NC_017530	GTC	2	6	675508	675513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010219
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14064	NC_017530	GCCAT	2	10	675679	675688	20 %	20 %	20 %	40 %	386010219
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14068	NC_017530	CGG	2	6	675829	675834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010219
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14084	NC_017530	CAC	2	6	676639	676644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010220
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14089	NC_017530	CAG	2	6	677163	677168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010220
14090	NC_017530	CATT	2	8	677193	677200	25 %	50 %	0 %	25 %	386010220
14091	NC_017530	GTT	2	6	677201	677206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14101	NC_017530	GC	3	6	677684	677689	0 %	0 %	50 %	50 %	386010221
14102	NC_017530	GCCA	2	8	677723	677730	25 %	0 %	25 %	50 %	386010221
14103	NC_017530	GGT	2	6	677752	677757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010221
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14105	NC_017530	CAGC	2	8	677866	677873	25 %	0 %	25 %	50 %	386010221
14106	NC_017530	GGT	2	6	677878	677883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010221
14107	NC_017530	GTT	2	6	677894	677899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010221
14108	NC_017530	GCC	2	6	677939	677944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010221
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14110	NC_017530	GGCC	2	8	677999	678006	0 %	0 %	50 %	50 %	386010221
14111	NC_017530	GCC	2	6	678023	678028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010221
14112	NC_017530	CGA	2	6	678034	678039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010221
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14115	NC_017530	ACC	3	9	678099	678107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010221
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14119	NC_017530	CGC	2	6	678166	678171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010221
14120	NC_017530	GCT	3	9	678188	678196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010221
14121	NC_017530	TCG	2	6	678225	678230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010221
14122	NC_017530	CGG	2	6	678369	678374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010222
14123	NC_017530	CGC	2	6	678385	678390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010222
14124	NC_017530	TCC	2	6	678407	678412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386010222
14125	NC_017530	TGCGG	2	10	678440	678449	0 %	20 %	60 %	20 %	386010222
14126	NC_017530	CCA	2	6	678495	678500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010222
14127	NC_017530	GC	3	6	678501	678506	0 %	0 %	50 %	50 %	386010222
14128	NC_017530	AGC	2	6	678525	678530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010222
14129	NC_017530	CAC	2	6	678550	678555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010222
14130	NC_017530	GGC	2	6	678558	678563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010222
14131	NC_017530	TCT	2	6	678567	678572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010222
14132	NC_017530	GTT	2	6	678658	678663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010222
14133	NC_017530	GGC	2	6	678664	678669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010222
14134	NC_017530	CGT	2	6	678714	678719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010222
14135	NC_017530	AAG	2	6	678731	678736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010222
14136	NC_017530	ACGGT	2	10	678750	678759	20 %	20 %	40 %	20 %	386010222
14137	NC_017530	AGA	2	6	678813	678818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010222
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14140	NC_017530	GCC	2	6	679003	679008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010222
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14143	NC_017530	CGA	2	6	679071	679076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010222
14144	NC_017530	GCA	2	6	679112	679117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010222
14145	NC_017530	GCG	2	6	679152	679157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010222
14146	NC_017530	GCC	2	6	679249	679254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010222
14147	NC_017530	ATG	2	6	679271	679276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010222
14148	NC_017530	CTG	2	6	679327	679332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010222
14149	NC_017530	TCTT	2	8	679341	679348	0 %	75 %	0 %	25 %	386010222
14150	NC_017530	TGG	2	6	679353	679358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010222
14151	NC_017530	TGT	2	6	679365	679370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14152	NC_017530	CGG	2	6	679422	679427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010223
14153	NC_017530	GCG	2	6	679453	679458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010223
14154	NC_017530	TTG	2	6	679541	679546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010223
14155	NC_017530	TTC	2	6	679583	679588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010223
14156	NC_017530	TCA	2	6	679592	679597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010223
14157	NC_017530	GTA	2	6	679636	679641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010223
14158	NC_017530	GC	3	6	679688	679693	0 %	0 %	50 %	50 %	386010223
14159	NC_017530	CGG	2	6	679707	679712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010223
14160	NC_017530	AAG	2	6	679727	679732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010223
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14169	NC_017530	GCC	2	6	680065	680070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010223
14170	NC_017530	GCC	2	6	680074	680079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010223
14171	NC_017530	CAT	2	6	680113	680118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010223
14172	NC_017530	CTT	2	6	680223	680228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010223
14173	NC_017530	TTC	2	6	680290	680295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010223
14174	NC_017530	GCA	2	6	680331	680336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010223
14175	NC_017530	TTG	2	6	680366	680371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14176	NC_017530	CG	3	6	680419	680424	0 %	0 %	50 %	50 %	386010224
14177	NC_017530	CAG	2	6	680432	680437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010224
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14179	NC_017530	GCGG	2	8	680444	680451	0 %	0 %	75 %	25 %	386010224
14180	NC_017530	TGG	2	6	680493	680498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010224
14181	NC_017530	TGG	2	6	680509	680514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010224
14182	NC_017530	CCAGGG	2	12	680554	680565	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386010224
14183	NC_017530	GCAG	2	8	680615	680622	25 %	0 %	50 %	25 %	386010224
14184	NC_017530	GCA	2	6	680638	680643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010224
14185	NC_017530	CAC	2	6	680733	680738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010224
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14188	NC_017530	GCG	2	6	680921	680926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010224
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14190	NC_017530	GTT	2	6	681014	681019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010224
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14196	NC_017530	CTGG	2	8	681227	681234	0 %	25 %	50 %	25 %	386010224
14197	NC_017530	CGG	2	6	681244	681249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010224
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14200	NC_017530	GGC	2	6	681376	681381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010224
14201	NC_017530	TTTG	2	8	681458	681465	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14202	NC_017530	TTC	2	6	681495	681500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14203	NC_017530	AGCC	2	8	681629	681636	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14204	NC_017530	CA	3	6	681643	681648	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14205	NC_017530	CAG	2	6	681764	681769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14206	NC_017530	GAA	2	6	681776	681781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010225
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14208	NC_017530	CAG	2	6	681873	681878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010225
14209	NC_017530	GC	3	6	681963	681968	0 %	0 %	50 %	50 %	386010225
14210	NC_017530	GCG	2	6	681985	681990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010225
14211	NC_017530	ACT	2	6	681994	681999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010225
14212	NC_017530	TGC	2	6	682003	682008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010225
14213	NC_017530	CTG	2	6	682097	682102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010225
14214	NC_017530	GAG	2	6	682113	682118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386010225
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14216	NC_017530	GGC	2	6	682133	682138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010225
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14219	NC_017530	GTT	2	6	682247	682252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010225
14220	NC_017530	CAGC	2	8	682298	682305	25 %	0 %	25 %	50 %	386010225
14221	NC_017530	CTT	2	6	682355	682360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010225
14222	NC_017530	GC	3	6	682391	682396	0 %	0 %	50 %	50 %	386010225
14223	NC_017530	AGCC	2	8	682422	682429	25 %	0 %	25 %	50 %	386010225
14224	NC_017530	CTG	2	6	682437	682442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010225
14225	NC_017530	TGG	2	6	682498	682503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010225
14226	NC_017530	CGT	2	6	682573	682578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010225
14227	NC_017530	CAC	2	6	682627	682632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010225
14228	NC_017530	AGC	2	6	682684	682689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010225
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14230	NC_017530	CGCC	2	8	682772	682779	0 %	0 %	25 %	75 %	386010225
14231	NC_017530	CGTT	2	8	682813	682820	0 %	50 %	25 %	25 %	386010225
14232	NC_017530	GTT	2	6	682865	682870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010225
14233	NC_017530	GCA	2	6	682928	682933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010225
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14235	NC_017530	CGA	2	6	682958	682963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010225
14236	NC_017530	CTG	2	6	682998	683003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010225
14237	NC_017530	GCG	2	6	683040	683045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010225
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14479	NC_017530	CGC	2	6	693559	693564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14480	NC_017530	GC	3	6	693597	693602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14481	NC_017530	GC	3	6	693677	693682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14482	NC_017530	GCA	2	6	693707	693712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14483	NC_017530	GCC	2	6	693718	693723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14484	NC_017530	CTT	2	6	693815	693820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010234
14485	NC_017530	CCTGCA	2	12	693899	693910	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386010234
14486	NC_017530	AGC	2	6	693911	693916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010234
14487	NC_017530	ATC	2	6	693919	693924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010234
14488	NC_017530	GGC	2	6	693973	693978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010234
14489	NC_017530	ACC	2	6	693988	693993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010234
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14492	NC_017530	CG	3	6	694180	694185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14493	NC_017530	T	6	6	694187	694192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14494	NC_017530	CTGC	2	8	694281	694288	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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14498	NC_017530	CAG	2	6	694660	694665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010235
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