MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 121084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017530	GCA	3	9	623611	623619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010172
13002	NC_017530	TGCC	2	8	623663	623670	0 %	25 %	25 %	50 %	386010172
13003	NC_017530	CAG	2	6	623722	623727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010172
13004	NC_017530	GCT	2	6	623772	623777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010172
13005	NC_017530	GTC	2	6	623799	623804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010172
13006	NC_017530	GC	3	6	623853	623858	0 %	0 %	50 %	50 %	386010172
13007	NC_017530	TTG	2	6	623883	623888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010172
13008	NC_017530	CGGG	2	8	624035	624042	0 %	0 %	75 %	25 %	386010173
13009	NC_017530	GGT	2	6	624065	624070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010173
13010	NC_017530	GCCGGT	2	12	624084	624095	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386010173
13011	NC_017530	TGC	2	6	624101	624106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010173
13012	NC_017530	CAG	2	6	624111	624116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010173
13013	NC_017530	GCGG	2	8	624122	624129	0 %	0 %	75 %	25 %	386010173
13014	NC_017530	TCG	2	6	624136	624141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010173
13015	NC_017530	CCG	2	6	624173	624178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010173
13016	NC_017530	GCGGGC	2	12	624256	624267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010173
13017	NC_017530	TGC	2	6	624293	624298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010173
13018	NC_017530	GGC	2	6	624303	624308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010173
13019	NC_017530	GCG	2	6	624316	624321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010173
13020	NC_017530	CAGCA	2	10	624322	624331	40 %	0 %	20 %	40 %	386010173
13021	NC_017530	CGA	2	6	624332	624337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010173
13022	NC_017530	CCCT	2	8	624433	624440	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13023	NC_017530	T	7	7	624440	624446	0 %	100 %	0 %	0 %	386010174
13024	NC_017530	TGCC	2	8	624449	624456	0 %	25 %	25 %	50 %	386010174
13025	NC_017530	TCG	2	6	624512	624517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010174
13026	NC_017530	GCC	3	9	624536	624544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010174
13027	NC_017530	GCG	2	6	624560	624565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010174
13028	NC_017530	CAC	2	6	624573	624578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010174
13029	NC_017530	CCG	2	6	624587	624592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010174
13030	NC_017530	TGC	2	6	624599	624604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010174
13031	NC_017530	CGA	2	6	624642	624647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010174
13032	NC_017530	GC	3	6	624657	624662	0 %	0 %	50 %	50 %	386010174
13033	NC_017530	TGG	2	6	624776	624781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010174
13034	NC_017530	CGA	2	6	624870	624875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010174
13035	NC_017530	GAA	2	6	624883	624888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010174
13036	NC_017530	ACC	2	6	625002	625007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010175
13037	NC_017530	CG	3	6	625018	625023	0 %	0 %	50 %	50 %	386010175
13038	NC_017530	GC	3	6	625076	625081	0 %	0 %	50 %	50 %	386010175
13039	NC_017530	CCA	2	6	625172	625177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010175
13040	NC_017530	CGC	2	6	625186	625191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010175
13041	NC_017530	GTA	2	6	625230	625235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010175
13042	NC_017530	GCG	2	6	625280	625285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010175
13043	NC_017530	CGTT	2	8	625384	625391	0 %	50 %	25 %	25 %	386010175
13044	NC_017530	GTG	2	6	625438	625443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010175
13045	NC_017530	CCGGC	2	10	625459	625468	0 %	0 %	40 %	60 %	386010175
13046	NC_017530	GC	3	6	625493	625498	0 %	0 %	50 %	50 %	386010175
13047	NC_017530	GTG	2	6	625509	625514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010175
13048	NC_017530	GCC	2	6	625524	625529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010175
13049	NC_017530	ACGC	2	8	625546	625553	25 %	0 %	25 %	50 %	386010175
13050	NC_017530	GTG	2	6	625564	625569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010175
13051	NC_017530	ACT	2	6	625593	625598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010175
13052	NC_017530	TTC	2	6	625671	625676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010175
13053	NC_017530	TGG	2	6	625693	625698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010175
13054	NC_017530	CTG	2	6	625702	625707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010175
13055	NC_017530	GCT	2	6	625790	625795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010175
13056	NC_017530	GCC	2	6	625806	625811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010175
13057	NC_017530	TCG	2	6	625900	625905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010175
13058	NC_017530	GCT	2	6	625937	625942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010175
13059	NC_017530	CAC	2	6	625972	625977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010175
13060	NC_017530	GC	3	6	625997	626002	0 %	0 %	50 %	50 %	386010175
13061	NC_017530	CAT	2	6	626111	626116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010176
13062	NC_017530	GTG	2	6	626155	626160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010176
13063	NC_017530	GCA	2	6	626335	626340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010176
13064	NC_017530	CAC	2	6	626369	626374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010176
13065	NC_017530	GGGC	2	8	626381	626388	0 %	0 %	75 %	25 %	386010176
13066	NC_017530	CGTG	2	8	626465	626472	0 %	25 %	50 %	25 %	386010176
13067	NC_017530	CAT	2	6	626603	626608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010176
13068	NC_017530	CTG	2	6	626652	626657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010176
13069	NC_017530	GCC	2	6	626694	626699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010176
13070	NC_017530	GCC	2	6	626739	626744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010176
13071	NC_017530	CTT	2	6	626750	626755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010176
13072	NC_017530	GAA	2	6	626802	626807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010177
13073	NC_017530	GATG	2	8	626846	626853	25 %	25 %	50 %	0 %	386010177
13074	NC_017530	CAT	3	9	626879	626887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010177
13075	NC_017530	GGC	2	6	626888	626893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010177
13076	NC_017530	TGC	2	6	626898	626903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010177
13077	NC_017530	TCGA	2	8	627045	627052	25 %	25 %	25 %	25 %	386010177
13078	NC_017530	GCC	2	6	627054	627059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010177
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13080	NC_017530	CCG	3	9	627082	627090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010177
13081	NC_017530	CGCA	2	8	627095	627102	25 %	0 %	25 %	50 %	386010177
13082	NC_017530	GCTGCC	2	12	627111	627122	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386010177
13083	NC_017530	CCAG	2	8	627179	627186	25 %	0 %	25 %	50 %	386010177
13084	NC_017530	GCC	2	6	627219	627224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010177
13085	NC_017530	GC	3	6	627234	627239	0 %	0 %	50 %	50 %	386010177
13086	NC_017530	GCG	2	6	627259	627264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010177
13087	NC_017530	TGA	2	6	627277	627282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010177
13088	NC_017530	ACG	3	9	627283	627291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010177
13089	NC_017530	CGCGC	2	10	627301	627310	0 %	0 %	40 %	60 %	386010177
13090	NC_017530	CGC	2	6	627326	627331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010177
13091	NC_017530	GAGC	2	8	627428	627435	25 %	0 %	50 %	25 %	386010177
13092	NC_017530	CTG	3	9	627567	627575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010177
13093	NC_017530	AGC	2	6	627580	627585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010177
13094	NC_017530	GC	3	6	627602	627607	0 %	0 %	50 %	50 %	386010177
13095	NC_017530	GTG	2	6	627642	627647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010177
13096	NC_017530	TGC	2	6	627649	627654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010177
13097	NC_017530	TGC	2	6	627679	627684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010177
13098	NC_017530	CTAC	2	8	627733	627740	25 %	25 %	0 %	50 %	386010177
13099	NC_017530	TGA	2	6	627799	627804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010177
13100	NC_017530	GGC	2	6	627881	627886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13101	NC_017530	TGG	2	6	628022	628027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010178
13102	NC_017530	CAT	2	6	628119	628124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010178
13103	NC_017530	TGG	2	6	628154	628159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010178
13104	NC_017530	ACG	2	6	628187	628192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010178
13105	NC_017530	ATC	2	6	628195	628200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010178
13106	NC_017530	GGCG	2	8	628248	628255	0 %	0 %	75 %	25 %	386010178
13107	NC_017530	CAA	2	6	628371	628376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010178
13108	NC_017530	CTG	2	6	628417	628422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010178
13109	NC_017530	CGA	2	6	628448	628453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010179
13110	NC_017530	CG	3	6	628471	628476	0 %	0 %	50 %	50 %	386010179
13111	NC_017530	TGC	2	6	628756	628761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010179
13112	NC_017530	CGT	2	6	628808	628813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010179
13113	NC_017530	CTGCG	2	10	628900	628909	0 %	20 %	40 %	40 %	386010179
13114	NC_017530	CGC	2	6	628991	628996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010180
13115	NC_017530	GCG	2	6	629014	629019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010180
13116	NC_017530	CGA	2	6	629042	629047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010180
13117	NC_017530	CTG	2	6	629055	629060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010180
13118	NC_017530	C	6	6	629067	629072	0 %	0 %	0 %	100 %	386010180
13119	NC_017530	CGAC	2	8	629092	629099	25 %	0 %	25 %	50 %	386010180
13120	NC_017530	CTG	2	6	629125	629130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010180
13121	NC_017530	TGC	2	6	629143	629148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010180
13122	NC_017530	CGTT	2	8	629157	629164	0 %	50 %	25 %	25 %	386010180
13123	NC_017530	CCTG	2	8	629231	629238	0 %	25 %	25 %	50 %	386010180
13124	NC_017530	CTGG	2	8	629252	629259	0 %	25 %	50 %	25 %	386010180
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13233	NC_017530	TTG	2	6	634404	634409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010186
13234	NC_017530	CGT	2	6	634417	634422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010186
13235	NC_017530	GTCGA	2	10	634452	634461	20 %	20 %	40 %	20 %	386010186
13236	NC_017530	GCC	2	6	634514	634519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010186
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13238	NC_017530	CGG	2	6	634558	634563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010186
13239	NC_017530	CTG	2	6	634596	634601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010186
13240	NC_017530	GCA	2	6	634923	634928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010186
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13243	NC_017530	CGT	2	6	634993	634998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010186
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13245	NC_017530	GGGCC	2	10	635127	635136	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13246	NC_017530	CCG	2	6	635154	635159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13247	NC_017530	CGC	3	9	635168	635176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13249	NC_017530	CGT	2	6	635238	635243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13251	NC_017530	CCG	2	6	635349	635354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13252	NC_017530	CGC	2	6	635366	635371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13253	NC_017530	CA	3	6	635408	635413	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13254	NC_017530	CCG	2	6	635432	635437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13255	NC_017530	GGGCC	2	10	635461	635470	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13256	NC_017530	CCG	2	6	635488	635493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13257	NC_017530	CGC	3	9	635502	635510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13258	NC_017530	CA	3	6	635547	635552	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13259	NC_017530	CAGC	2	8	635673	635680	25 %	0 %	25 %	50 %	386010187
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13269	NC_017530	GTTC	2	8	636111	636118	0 %	50 %	25 %	25 %	386010187
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13281	NC_017530	CTT	2	6	636628	636633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010187
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13305	NC_017530	GCCG	2	8	638110	638117	0 %	0 %	50 %	50 %	386010188
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13316	NC_017530	GCGGG	2	10	638849	638858	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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13343	NC_017530	CTC	2	6	639623	639628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13344	NC_017530	GC	4	8	639665	639672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13345	NC_017530	CTT	2	6	639703	639708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13346	NC_017530	CTG	2	6	639750	639755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13347	NC_017530	CCG	2	6	639801	639806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13348	NC_017530	GACC	2	8	639832	639839	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13349	NC_017530	CTA	2	6	639881	639886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13350	NC_017530	CGA	2	6	639891	639896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13351	NC_017530	GCA	2	6	639902	639907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13352	NC_017530	TACCGA	2	12	640008	640019	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386010191
13353	NC_017530	TCA	2	6	640106	640111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010191
13354	NC_017530	A	6	6	640151	640156	100 %	0 %	0 %	0 %	386010191
13355	NC_017530	TGC	2	6	640256	640261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010191
13356	NC_017530	GGC	2	6	640292	640297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010191
13357	NC_017530	ACA	2	6	640337	640342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010191
13358	NC_017530	TCA	2	6	640343	640348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010191
13359	NC_017530	GCC	2	6	640396	640401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010191
13360	NC_017530	CAT	2	6	640560	640565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010191
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13364	NC_017530	GGT	2	6	640812	640817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010191
13365	NC_017530	CTG	2	6	640828	640833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010191
13366	NC_017530	GGCA	2	8	640973	640980	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13367	NC_017530	GCC	2	6	641108	641113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010192
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13388	NC_017530	GAT	2	6	641932	641937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13392	NC_017530	TCGG	2	8	642237	642244	0 %	25 %	50 %	25 %	386010193
13393	NC_017530	GC	3	6	642344	642349	0 %	0 %	50 %	50 %	386010193
13394	NC_017530	GGCTG	2	10	642430	642439	0 %	20 %	60 %	20 %	386010193
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13430	NC_017530	TGGC	2	8	644231	644238	0 %	25 %	50 %	25 %	386010195
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13472	NC_017530	GCTT	2	8	646512	646519	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13473	NC_017530	GAAA	2	8	646608	646615	75 %	0 %	25 %	0 %	386010196
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13479	NC_017530	ATG	2	6	646966	646971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010196
13480	NC_017530	TCA	2	6	647014	647019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13481	NC_017530	TAA	2	6	647051	647056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13482	NC_017530	TAT	2	6	647104	647109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13483	NC_017530	A	6	6	647137	647142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13484	NC_017530	AAG	3	9	647193	647201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13485	NC_017530	G	6	6	647242	647247	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13486	NC_017530	ACG	2	6	647254	647259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13487	NC_017530	TGA	2	6	647344	647349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13489	NC_017530	GGT	2	6	647477	647482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13490	NC_017530	TAA	2	6	647509	647514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13491	NC_017530	GCT	2	6	647515	647520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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