MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 121084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_017530	ACA	2	6	600499	600504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010149
12502	NC_017530	GCAT	2	8	600517	600524	25 %	25 %	25 %	25 %	386010149
12503	NC_017530	CTGGGC	2	12	600536	600547	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386010149
12504	NC_017530	GGCC	2	8	600550	600557	0 %	0 %	50 %	50 %	386010149
12505	NC_017530	CCG	2	6	600560	600565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010149
12506	NC_017530	TGG	2	6	600636	600641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010149
12507	NC_017530	CGC	2	6	600691	600696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010149
12508	NC_017530	TCA	2	6	600718	600723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010149
12509	NC_017530	TTC	2	6	600747	600752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010149
12510	NC_017530	AAG	2	6	600843	600848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010149
12511	NC_017530	CCA	2	6	600850	600855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010149
12512	NC_017530	CCGG	2	8	600861	600868	0 %	0 %	50 %	50 %	386010149
12513	NC_017530	TG	3	6	600884	600889	0 %	50 %	50 %	0 %	386010149
12514	NC_017530	GCAC	2	8	600901	600908	25 %	0 %	25 %	50 %	386010149
12515	NC_017530	GCG	2	6	600924	600929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010149
12516	NC_017530	ACC	2	6	600930	600935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010149
12517	NC_017530	CACTTC	2	12	600951	600962	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386010149
12518	NC_017530	AGCA	2	8	600966	600973	50 %	0 %	25 %	25 %	386010149
12519	NC_017530	TCG	2	6	601009	601014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010149
12520	NC_017530	GCGGTG	2	12	601098	601109	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386010149
12521	NC_017530	CAA	2	6	601139	601144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010149
12522	NC_017530	GCCA	2	8	601304	601311	25 %	0 %	25 %	50 %	386010150
12523	NC_017530	CAT	2	6	601315	601320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010150
12524	NC_017530	CCA	2	6	601332	601337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010150
12525	NC_017530	GCC	2	6	601345	601350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010150
12526	NC_017530	CAG	2	6	601361	601366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010150
12527	NC_017530	GAG	2	6	601367	601372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386010150
12528	NC_017530	CGA	2	6	601546	601551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010150
12529	NC_017530	TGCA	2	8	601586	601593	25 %	25 %	25 %	25 %	386010150
12530	NC_017530	ATC	2	6	601640	601645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010150
12531	NC_017530	TCG	2	6	601662	601667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010150
12532	NC_017530	GT	3	6	601810	601815	0 %	50 %	50 %	0 %	386010150
12533	NC_017530	GCA	2	6	601848	601853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010150
12534	NC_017530	TGCA	2	8	601869	601876	25 %	25 %	25 %	25 %	386010150
12535	NC_017530	TCG	2	6	601887	601892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010150
12536	NC_017530	GGT	2	6	601946	601951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010150
12537	NC_017530	TGC	2	6	601968	601973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010150
12538	NC_017530	CCAG	2	8	602014	602021	25 %	0 %	25 %	50 %	386010150
12539	NC_017530	TGG	2	6	602034	602039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010150
12540	NC_017530	GCG	2	6	602087	602092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010150
12541	NC_017530	TTC	2	6	602105	602110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010150
12542	NC_017530	GAG	2	6	602141	602146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386010150
12543	NC_017530	CCG	2	6	602162	602167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010150
12544	NC_017530	AGC	2	6	602217	602222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010150
12545	NC_017530	AGC	2	6	602238	602243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010150
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12550	NC_017530	GAG	3	9	602542	602550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386010151
12551	NC_017530	CCG	2	6	602557	602562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010151
12552	NC_017530	GCT	2	6	602589	602594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010151
12553	NC_017530	CTG	2	6	602605	602610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010151
12554	NC_017530	GTG	2	6	602641	602646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010151
12555	NC_017530	GCT	2	6	602703	602708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010151
12556	NC_017530	GGC	2	6	602718	602723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010151
12557	NC_017530	CAT	2	6	602742	602747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010151
12558	NC_017530	TGC	2	6	602795	602800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010151
12559	NC_017530	CAT	2	6	602833	602838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010151
12560	NC_017530	AAG	2	6	602894	602899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010151
12561	NC_017530	CGC	2	6	602955	602960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010152
12562	NC_017530	CCTG	2	8	602971	602978	0 %	25 %	25 %	50 %	386010152
12563	NC_017530	GC	3	6	602998	603003	0 %	0 %	50 %	50 %	386010152
12564	NC_017530	CGCC	2	8	603004	603011	0 %	0 %	25 %	75 %	386010152
12565	NC_017530	CAG	3	9	603080	603088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010152
12566	NC_017530	GAG	2	6	603125	603130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386010152
12567	NC_017530	GCC	2	6	603160	603165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010152
12568	NC_017530	GGC	2	6	603169	603174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010152
12569	NC_017530	CTGGT	2	10	603203	603212	0 %	40 %	40 %	20 %	386010152
12570	NC_017530	GCG	2	6	603237	603242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010152
12571	NC_017530	TGA	2	6	603289	603294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010152
12572	NC_017530	TTGCT	2	10	603318	603327	0 %	60 %	20 %	20 %	386010152
12573	NC_017530	CAG	2	6	603351	603356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010152
12574	NC_017530	GGC	2	6	603388	603393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010152
12575	NC_017530	GTG	2	6	603491	603496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010152
12576	NC_017530	TG	3	6	603543	603548	0 %	50 %	50 %	0 %	386010152
12577	NC_017530	GAT	2	6	603626	603631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010152
12578	NC_017530	CG	3	6	603659	603664	0 %	0 %	50 %	50 %	386010152
12579	NC_017530	TGC	2	6	603668	603673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010152
12580	NC_017530	GCG	2	6	603719	603724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010152
12581	NC_017530	CCCTGG	2	12	603753	603764	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386010152
12582	NC_017530	GTA	2	6	603965	603970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12583	NC_017530	CCT	2	6	604025	604030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386010153
12584	NC_017530	CCTC	2	8	604046	604053	0 %	25 %	0 %	75 %	386010153
12585	NC_017530	GATC	2	8	604055	604062	25 %	25 %	25 %	25 %	386010153
12586	NC_017530	GCCC	2	8	604121	604128	0 %	0 %	25 %	75 %	386010153
12587	NC_017530	GCG	2	6	604183	604188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010153
12588	NC_017530	CGC	2	6	604221	604226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010153
12589	NC_017530	TGC	2	6	604249	604254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010153
12590	NC_017530	TGC	2	6	604276	604281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010153
12591	NC_017530	CCG	2	6	604309	604314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010153
12592	NC_017530	TGA	2	6	604370	604375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010153
12593	NC_017530	CAA	3	9	604430	604438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010153
12594	NC_017530	GCC	3	9	604440	604448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010153
12595	NC_017530	TGC	2	6	604450	604455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010153
12596	NC_017530	GC	4	8	604474	604481	0 %	0 %	50 %	50 %	386010153
12597	NC_017530	AAGG	2	8	604482	604489	50 %	0 %	50 %	0 %	386010153
12598	NC_017530	CAT	2	6	604490	604495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010153
12599	NC_017530	GGT	2	6	604521	604526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010153
12600	NC_017530	CAT	2	6	604544	604549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010153
12601	NC_017530	GCC	2	6	604617	604622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010153
12602	NC_017530	CTG	2	6	604641	604646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010153
12603	NC_017530	GCA	2	6	604660	604665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010153
12604	NC_017530	CAC	2	6	604685	604690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010153
12605	NC_017530	CCA	2	6	604724	604729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010153
12606	NC_017530	GCT	2	6	604742	604747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010153
12607	NC_017530	CCG	2	6	604798	604803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010153
12608	NC_017530	CTG	2	6	604866	604871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010153
12609	NC_017530	TCG	2	6	604894	604899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010153
12610	NC_017530	A	8	8	604926	604933	100 %	0 %	0 %	0 %	386010153
12611	NC_017530	ATC	2	6	604965	604970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010153
12612	NC_017530	CTG	2	6	605046	605051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010153
12613	NC_017530	CCAGGC	2	12	605072	605083	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386010153
12614	NC_017530	GC	3	6	605109	605114	0 %	0 %	50 %	50 %	386010153
12615	NC_017530	CAGC	2	8	605171	605178	25 %	0 %	25 %	50 %	386010153
12616	NC_017530	AAG	2	6	605229	605234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010153
12617	NC_017530	GAGC	2	8	605262	605269	25 %	0 %	50 %	25 %	386010153
12618	NC_017530	CCGGTG	2	12	605283	605294	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386010153
12619	NC_017530	GAC	2	6	605307	605312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010153
12620	NC_017530	TGGC	2	8	605358	605365	0 %	25 %	50 %	25 %	386010153
12621	NC_017530	CTG	3	9	605444	605452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010154
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12624	NC_017530	GC	3	6	605547	605552	0 %	0 %	50 %	50 %	386010154
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12663	NC_017530	T	6	6	607424	607429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12664	NC_017530	TCG	2	6	607482	607487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12739	NC_017530	CTGCG	2	10	611460	611469	0 %	20 %	40 %	40 %	386010158
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12742	NC_017530	CG	3	6	611695	611700	0 %	0 %	50 %	50 %	386010158
12743	NC_017530	C	6	6	611701	611706	0 %	0 %	0 %	100 %	386010158
12744	NC_017530	GC	3	6	611725	611730	0 %	0 %	50 %	50 %	386010158
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