MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 121084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12119	NC_017530	TGGT	2	8	582155	582162	0 %	50 %	50 %	0 %	386010130
12120	NC_017530	CG	3	6	582200	582205	0 %	0 %	50 %	50 %	386010130
12121	NC_017530	GCT	2	6	582238	582243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010130
12122	NC_017530	CAC	2	6	582276	582281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010130
12123	NC_017530	CCA	2	6	582293	582298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010130
12124	NC_017530	GCCT	2	8	582333	582340	0 %	25 %	25 %	50 %	386010130
12125	NC_017530	ATC	2	6	582355	582360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010130
12126	NC_017530	GCC	2	6	582502	582507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010130
12127	NC_017530	GAG	2	6	582526	582531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386010130
12128	NC_017530	TCT	2	6	582533	582538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010130
12129	NC_017530	TG	3	6	582604	582609	0 %	50 %	50 %	0 %	386010131
12130	NC_017530	GAT	2	6	582677	582682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010131
12131	NC_017530	CAA	2	6	582683	582688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010131
12132	NC_017530	TAC	2	6	582693	582698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010131
12133	NC_017530	CGG	2	6	582812	582817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010132
12134	NC_017530	GGT	2	6	582849	582854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010132
12135	NC_017530	CCA	2	6	583102	583107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010132
12136	NC_017530	AGC	2	6	583130	583135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010132
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12138	NC_017530	CT	4	8	583174	583181	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12139	NC_017530	ATC	2	6	583242	583247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010133
12140	NC_017530	GC	3	6	583363	583368	0 %	0 %	50 %	50 %	386010133
12141	NC_017530	ATC	2	6	583422	583427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010133
12142	NC_017530	TGA	2	6	583435	583440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010133
12143	NC_017530	CGG	2	6	583441	583446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010133
12144	NC_017530	GAA	2	6	583469	583474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010133
12145	NC_017530	TGGCC	2	10	583565	583574	0 %	20 %	40 %	40 %	386010133
12146	NC_017530	GGCGT	2	10	583581	583590	0 %	20 %	60 %	20 %	386010133
12147	NC_017530	GTC	2	6	583614	583619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010133
12148	NC_017530	ATG	2	6	583653	583658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010133
12149	NC_017530	GCAC	2	8	583770	583777	25 %	0 %	25 %	50 %	386010133
12150	NC_017530	CTG	2	6	583815	583820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010133
12151	NC_017530	CGT	2	6	583866	583871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010133
12152	NC_017530	CAG	2	6	583896	583901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010133
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12154	NC_017530	CTG	2	6	583992	583997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010133
12155	NC_017530	GCTG	2	8	584044	584051	0 %	25 %	50 %	25 %	386010133
12156	NC_017530	CTG	2	6	584097	584102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010133
12157	NC_017530	TCT	2	6	584122	584127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010133
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12161	NC_017530	ATG	2	6	584283	584288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010133
12162	NC_017530	TGG	3	9	584314	584322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010133
12163	NC_017530	TGA	2	6	584437	584442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010133
12164	NC_017530	TGC	2	6	584479	584484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010133
12165	NC_017530	GAG	2	6	584506	584511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12166	NC_017530	ATC	2	6	584563	584568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010134
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12169	NC_017530	TGC	2	6	584668	584673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12170	NC_017530	ATT	2	6	584681	584686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12171	NC_017530	GTAG	2	8	584736	584743	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12172	NC_017530	GTCG	2	8	584838	584845	0 %	25 %	50 %	25 %	386010135
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12182	NC_017530	GGT	2	6	585282	585287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010136
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12185	NC_017530	GTCCAG	2	12	585403	585414	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386010136
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12189	NC_017530	AGA	2	6	585540	585545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12190	NC_017530	TCG	2	6	585581	585586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010137
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12197	NC_017530	CTG	2	6	585813	585818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010137
12198	NC_017530	CGT	2	6	585845	585850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010137
12199	NC_017530	TGC	2	6	586067	586072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010137
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12205	NC_017530	GCCG	2	8	586644	586651	0 %	0 %	50 %	50 %	386010138
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12212	NC_017530	GATC	2	8	586929	586936	25 %	25 %	25 %	25 %	386010138
12213	NC_017530	CTG	2	6	586942	586947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010138
12214	NC_017530	GAC	2	6	586957	586962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010138
12215	NC_017530	ACTG	2	8	586968	586975	25 %	25 %	25 %	25 %	386010138
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12218	NC_017530	CTGA	2	8	587083	587090	25 %	25 %	25 %	25 %	386010138
12219	NC_017530	GTCT	2	8	587117	587124	0 %	50 %	25 %	25 %	386010138
12220	NC_017530	GCC	2	6	587148	587153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010138
12221	NC_017530	AAGA	2	8	587164	587171	75 %	0 %	25 %	0 %	386010138
12222	NC_017530	TCG	2	6	587191	587196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12223	NC_017530	GAAT	2	8	587224	587231	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12224	NC_017530	ACC	2	6	587338	587343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010139
12225	NC_017530	CGT	2	6	587419	587424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010139
12226	NC_017530	GGC	2	6	587506	587511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010139
12227	NC_017530	CGG	2	6	587592	587597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010139
12228	NC_017530	GCT	2	6	587608	587613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010139
12229	NC_017530	TCTG	2	8	587625	587632	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12230	NC_017530	T	6	6	587660	587665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12231	NC_017530	GAA	2	6	587771	587776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12232	NC_017530	CAC	2	6	587806	587811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010140
12233	NC_017530	CCG	2	6	587853	587858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010140
12234	NC_017530	CG	3	6	587862	587867	0 %	0 %	50 %	50 %	386010140
12235	NC_017530	GCT	3	9	587872	587880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010140
12236	NC_017530	CGA	2	6	587881	587886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010140
12237	NC_017530	AAAC	2	8	588038	588045	75 %	0 %	0 %	25 %	386010140
12238	NC_017530	TGG	2	6	588073	588078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010140
12239	NC_017530	GAA	2	6	588140	588145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010140
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12347	NC_017530	CTG	3	9	593769	593777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010143
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12355	NC_017530	TGG	3	9	594181	594189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010143
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12477	NC_017530	GCT	3	9	599525	599533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010149
12478	NC_017530	GACC	2	8	599600	599607	25 %	0 %	25 %	50 %	386010149
12479	NC_017530	GCT	2	6	599612	599617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010149
12480	NC_017530	CGC	2	6	599672	599677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010149
12481	NC_017530	GC	3	6	599690	599695	0 %	0 %	50 %	50 %	386010149
12482	NC_017530	TGA	2	6	599761	599766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010149
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12493	NC_017530	GAGC	2	8	600200	600207	25 %	0 %	50 %	25 %	386010149
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12497	NC_017530	CCGAC	2	10	600358	600367	20 %	0 %	20 %	60 %	386010149
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