MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 121084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
121001	NC_017530	TTG	2	6	5727393	5727398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014596
121002	NC_017530	CAA	2	6	5727463	5727468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014596
121003	NC_017530	CGC	2	6	5727472	5727477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014596
121004	NC_017530	TCTT	2	8	5727480	5727487	0 %	75 %	0 %	25 %	386014596
121005	NC_017530	GAG	2	6	5727555	5727560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386014596
121006	NC_017530	CTT	2	6	5727634	5727639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014596
121007	NC_017530	TTG	2	6	5727696	5727701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014596
121008	NC_017530	GGA	2	6	5727770	5727775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386014596
121009	NC_017530	CTGGAT	2	12	5727995	5728006	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386014596
121010	NC_017530	CTT	2	6	5728025	5728030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014596
121011	NC_017530	GCG	2	6	5728173	5728178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014596
121012	NC_017530	GCC	2	6	5728191	5728196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014596
121013	NC_017530	TGGA	2	8	5728247	5728254	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121014	NC_017530	TTG	2	6	5728461	5728466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014597
121015	NC_017530	GTA	2	6	5728517	5728522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014597
121016	NC_017530	CAG	2	6	5728547	5728552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014597
121017	NC_017530	CAC	2	6	5728559	5728564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014597
121018	NC_017530	CAC	2	6	5728631	5728636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014597
121019	NC_017530	CCCGC	2	10	5728798	5728807	0 %	0 %	20 %	80 %	386014597
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121021	NC_017530	GCA	2	6	5728918	5728923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014597
121022	NC_017530	TCA	2	6	5728933	5728938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014597
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121024	NC_017530	GCCG	2	8	5728955	5728962	0 %	0 %	50 %	50 %	386014597
121025	NC_017530	CAG	2	6	5728976	5728981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014597
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121027	NC_017530	GCA	2	6	5729014	5729019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014597
121028	NC_017530	GC	3	6	5729022	5729027	0 %	0 %	50 %	50 %	386014597
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121032	NC_017530	AC	3	6	5729125	5729130	50 %	0 %	0 %	50 %	386014597
121033	NC_017530	CAG	2	6	5729219	5729224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014597
121034	NC_017530	CGG	2	6	5729230	5729235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014597
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121038	NC_017530	GCA	2	6	5729404	5729409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014597
121039	NC_017530	CAT	2	6	5729435	5729440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014597
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121042	NC_017530	CGG	2	6	5729530	5729535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014597
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121045	NC_017530	GAA	2	6	5729615	5729620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014597
121046	NC_017530	GAT	2	6	5729627	5729632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014597
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121051	NC_017530	CA	3	6	5729855	5729860	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121052	NC_017530	GTC	2	6	5729879	5729884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121053	NC_017530	TA	3	6	5729901	5729906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121054	NC_017530	TGT	2	6	5729945	5729950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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121084	NC_017530	T	6	6	5731482	5731487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.