MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 121084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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120002	NC_017530	CGG	2	6	5679983	5679988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014547
120003	NC_017530	TTC	2	6	5680026	5680031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014547
120004	NC_017530	GCC	2	6	5680089	5680094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014547
120005	NC_017530	GCC	2	6	5680116	5680121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014547
120006	NC_017530	CAG	2	6	5680125	5680130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014547
120007	NC_017530	CTG	2	6	5680182	5680187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014547
120008	NC_017530	ACC	2	6	5680261	5680266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014547
120009	NC_017530	CAG	2	6	5680302	5680307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014547
120010	NC_017530	GGC	3	9	5680356	5680364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014547
120011	NC_017530	CGG	2	6	5680367	5680372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014547
120012	NC_017530	CCAG	2	8	5680430	5680437	25 %	0 %	25 %	50 %	386014547
120013	NC_017530	GCT	2	6	5680475	5680480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014547
120014	NC_017530	GCG	2	6	5680637	5680642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014547
120015	NC_017530	CAG	2	6	5680713	5680718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014547
120016	NC_017530	TCG	2	6	5680807	5680812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014547
120017	NC_017530	CAG	2	6	5680832	5680837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014547
120018	NC_017530	GGA	2	6	5680878	5680883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386014547
120019	NC_017530	GCA	2	6	5680946	5680951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014547
120020	NC_017530	CGTC	2	8	5681092	5681099	0 %	25 %	25 %	50 %	386014547
120021	NC_017530	TGA	2	6	5681156	5681161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014547
120022	NC_017530	GTT	2	6	5681195	5681200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014547
120023	NC_017530	GGT	2	6	5681220	5681225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014547
120024	NC_017530	CTC	3	9	5681235	5681243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120025	NC_017530	CGC	2	6	5681258	5681263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120026	NC_017530	AT	3	6	5681355	5681360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120027	NC_017530	ACA	3	9	5681405	5681413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120028	NC_017530	CAT	2	6	5681439	5681444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014548
120029	NC_017530	TCA	2	6	5681459	5681464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014548
120030	NC_017530	ATT	2	6	5681537	5681542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386014548
120031	NC_017530	TGC	2	6	5681651	5681656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014548
120032	NC_017530	CCG	2	6	5681711	5681716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014548
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120034	NC_017530	ACG	2	6	5682004	5682009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014549
120035	NC_017530	GCCGAC	2	12	5682030	5682041	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386014549
120036	NC_017530	TGA	2	6	5682043	5682048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014549
120037	NC_017530	AGCTTC	2	12	5682054	5682065	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386014549
120038	NC_017530	CAG	2	6	5682078	5682083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120039	NC_017530	A	9	9	5682086	5682094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120040	NC_017530	CCT	2	6	5682099	5682104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120041	NC_017530	T	7	7	5682117	5682123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120042	NC_017530	AAC	2	6	5682178	5682183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014550
120043	NC_017530	GTG	2	6	5682218	5682223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014550
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120050	NC_017530	TGT	2	6	5682491	5682496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014551
120051	NC_017530	TC	3	6	5682595	5682600	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120052	NC_017530	GCT	2	6	5682686	5682691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120053	NC_017530	CAA	2	6	5682714	5682719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120054	NC_017530	GTC	2	6	5682782	5682787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120055	NC_017530	TCG	2	6	5682794	5682799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120056	NC_017530	A	6	6	5682810	5682815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120057	NC_017530	CGG	2	6	5682832	5682837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120058	NC_017530	CCA	2	6	5682899	5682904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014552
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120061	NC_017530	CCGCT	2	10	5682965	5682974	0 %	20 %	20 %	60 %	386014552
120062	NC_017530	GTG	2	6	5683012	5683017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014552
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120065	NC_017530	TGA	2	6	5683061	5683066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014552
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120109	NC_017530	TGC	2	6	5685322	5685327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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120111	NC_017530	CGC	2	6	5685401	5685406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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120114	NC_017530	GC	3	6	5685531	5685536	0 %	0 %	50 %	50 %	386014554
120115	NC_017530	CGT	2	6	5685544	5685549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014554
120116	NC_017530	GTG	2	6	5685561	5685566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014554
120117	NC_017530	TCA	2	6	5685573	5685578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014554
120118	NC_017530	AGC	2	6	5685646	5685651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014554
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120120	NC_017530	GAC	2	6	5685746	5685751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014554
120121	NC_017530	CTG	2	6	5685752	5685757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014554
120122	NC_017530	GCT	2	6	5685853	5685858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014554
120123	NC_017530	CCG	2	6	5686014	5686019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014554
120124	NC_017530	GCC	2	6	5686103	5686108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014554
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120137	NC_017530	GC	3	6	5686746	5686751	0 %	0 %	50 %	50 %	386014555
120138	NC_017530	GGC	2	6	5686839	5686844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014555
120139	NC_017530	GCTGGT	2	12	5687004	5687015	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386014555
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120156	NC_017530	GGCCT	2	10	5687938	5687947	0 %	20 %	40 %	40 %	386014557
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120170	NC_017530	ACC	2	6	5688499	5688504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014557
120171	NC_017530	GGTGCT	2	12	5688507	5688518	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386014557
120172	NC_017530	TGC	2	6	5688581	5688586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014557
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120192	NC_017530	GC	3	6	5689421	5689426	0 %	0 %	50 %	50 %	386014558
120193	NC_017530	CAT	2	6	5689461	5689466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014558
120194	NC_017530	TGC	2	6	5689490	5689495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014558
120195	NC_017530	GCG	2	6	5689514	5689519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014558
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120199	NC_017530	A	7	7	5689685	5689691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120200	NC_017530	GAA	2	6	5689703	5689708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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120205	NC_017530	CTG	2	6	5689947	5689952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014559
120206	NC_017530	TGA	2	6	5689958	5689963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014559
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120216	NC_017530	CGAT	2	8	5690335	5690342	25 %	25 %	25 %	25 %	386014559
120217	NC_017530	ATC	2	6	5690465	5690470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014560
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120220	NC_017530	TGCC	2	8	5690643	5690650	0 %	25 %	25 %	50 %	386014560
120221	NC_017530	GGT	2	6	5690654	5690659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014560
120222	NC_017530	TCA	2	6	5690694	5690699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014560
120223	NC_017530	CTG	3	9	5690777	5690785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014560
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120225	NC_017530	GAC	2	6	5690837	5690842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014560
120226	NC_017530	AGC	2	6	5690862	5690867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014560
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120458	NC_017530	CAC	2	6	5702649	5702654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014572
120459	NC_017530	GCA	2	6	5702658	5702663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014572
120460	NC_017530	GGT	2	6	5702696	5702701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014572
120461	NC_017530	TCG	2	6	5702712	5702717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014572
120462	NC_017530	CAA	2	6	5702833	5702838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014572
120463	NC_017530	GTG	2	6	5702868	5702873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014572
120464	NC_017530	TCA	3	9	5702880	5702888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014572
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120485	NC_017530	CCCA	2	8	5703978	5703985	25 %	0 %	0 %	75 %	386014573
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120491	NC_017530	T	6	6	5704190	5704195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120492	NC_017530	TCA	2	6	5704198	5704203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120493	NC_017530	CG	3	6	5704253	5704258	0 %	0 %	50 %	50 %	386014574
120494	NC_017530	GC	3	6	5704263	5704268	0 %	0 %	50 %	50 %	386014574
120495	NC_017530	CGC	2	6	5704272	5704277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014574
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120500	NC_017530	TGCCAC	2	12	5704407	5704418	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386014574

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