MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 121084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_017530	GT	3	6	552867	552872	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_017530	TGG	2	6	552959	552964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_017530	GAC	2	6	553061	553066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11504	NC_017530	ACC	2	6	553081	553086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11505	NC_017530	ATCCC	2	10	553089	553098	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
11506	NC_017530	AGT	2	6	553105	553110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_017530	CTC	2	6	553254	553259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11508	NC_017530	TGCC	2	8	553330	553337	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11509	NC_017530	GTT	2	6	553367	553372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010096
11510	NC_017530	CGGT	2	8	553388	553395	0 %	25 %	50 %	25 %	386010096
11511	NC_017530	CGCAG	2	10	553437	553446	20 %	0 %	40 %	40 %	386010096
11512	NC_017530	GCA	2	6	553460	553465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010096
11513	NC_017530	GGC	2	6	553655	553660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010096
11514	NC_017530	TTCTGG	2	12	553666	553677	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386010096
11515	NC_017530	TGC	2	6	553759	553764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010096
11516	NC_017530	ATG	2	6	553876	553881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010096
11517	NC_017530	AGA	2	6	553897	553902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010096
11518	NC_017530	TGTC	2	8	553943	553950	0 %	50 %	25 %	25 %	386010096
11519	NC_017530	CAG	2	6	554007	554012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010096
11520	NC_017530	GCG	2	6	554024	554029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010096
11521	NC_017530	TCAG	2	8	554074	554081	25 %	25 %	25 %	25 %	386010096
11522	NC_017530	GC	3	6	554100	554105	0 %	0 %	50 %	50 %	386010096
11523	NC_017530	CGC	2	6	554109	554114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010096
11524	NC_017530	AGG	2	6	554134	554139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386010096
11525	NC_017530	GGT	2	6	554235	554240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010096
11526	NC_017530	GTG	3	9	554278	554286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010096
11527	NC_017530	TGA	2	6	554306	554311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010096
11528	NC_017530	TCA	2	6	554339	554344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010097
11529	NC_017530	GGT	2	6	554383	554388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010097
11530	NC_017530	TCG	2	6	554393	554398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010097
11531	NC_017530	TGG	2	6	554414	554419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010097
11532	NC_017530	GAA	3	9	554482	554490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010097
11533	NC_017530	GAC	2	6	554587	554592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010097
11534	NC_017530	TGGC	2	8	554617	554624	0 %	25 %	50 %	25 %	386010097
11535	NC_017530	CGT	2	6	554782	554787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010097
11536	NC_017530	GC	3	6	554814	554819	0 %	0 %	50 %	50 %	386010097
11537	NC_017530	GT	3	6	554921	554926	0 %	50 %	50 %	0 %	386010097
11538	NC_017530	GAG	2	6	554935	554940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386010097
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11541	NC_017530	CTG	2	6	555080	555085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010098
11542	NC_017530	TTA	2	6	555106	555111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386010098
11543	NC_017530	GT	3	6	555213	555218	0 %	50 %	50 %	0 %	386010098
11544	NC_017530	CGT	2	6	555233	555238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010098
11545	NC_017530	TGCGC	2	10	555286	555295	0 %	20 %	40 %	40 %	386010098
11546	NC_017530	CTG	2	6	555302	555307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010098
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11550	NC_017530	AGC	2	6	555557	555562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11551	NC_017530	A	6	6	555582	555587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11552	NC_017530	A	6	6	555592	555597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_017530	GGAC	2	8	555668	555675	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11554	NC_017530	CCA	2	6	555721	555726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11555	NC_017530	TGA	2	6	555790	555795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_017530	TCT	2	6	555986	555991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11557	NC_017530	GGA	2	6	555994	555999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_017530	TTCCC	2	10	556031	556040	0 %	40 %	0 %	60 %	386010099
11559	NC_017530	TTCGG	2	10	556125	556134	0 %	40 %	40 %	20 %	386010099
11560	NC_017530	GAA	2	6	556170	556175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010099
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11562	NC_017530	GAA	2	6	556274	556279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010099
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11589	NC_017530	TCT	2	6	557354	557359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11590	NC_017530	TCC	2	6	557367	557372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11591	NC_017530	TGGC	2	8	557424	557431	0 %	25 %	50 %	25 %	386010100
11592	NC_017530	TGG	2	6	557443	557448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010100
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11595	NC_017530	GAAG	2	8	557585	557592	50 %	0 %	50 %	0 %	386010100
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11603	NC_017530	ATGA	2	8	557964	557971	50 %	25 %	25 %	0 %	386010101
11604	NC_017530	CTG	2	6	558028	558033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010101
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11608	NC_017530	GTC	2	6	558336	558341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11610	NC_017530	GGCC	2	8	558448	558455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11611	NC_017530	CAT	2	6	558508	558513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010102
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11617	NC_017530	GCT	2	6	558776	558781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010102
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11622	NC_017530	CTGC	2	8	558934	558941	0 %	25 %	25 %	50 %	386010103
11623	NC_017530	TCG	2	6	558950	558955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010103
11624	NC_017530	CGTA	2	8	559011	559018	25 %	25 %	25 %	25 %	386010103
11625	NC_017530	TGC	2	6	559028	559033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010103
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11637	NC_017530	GGC	2	6	559610	559615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11842	NC_017530	AGCG	2	8	569130	569137	25 %	0 %	50 %	25 %	386010107
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11846	NC_017530	TAG	2	6	569437	569442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11854	NC_017530	CT	3	6	569742	569747	0 %	50 %	0 %	50 %	386010108
11855	NC_017530	T	7	7	569836	569842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11856	NC_017530	CGT	2	6	569930	569935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11857	NC_017530	AGC	2	6	569938	569943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11859	NC_017530	CGT	2	6	570152	570157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010109
11860	NC_017530	CGG	2	6	570160	570165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010109
11861	NC_017530	CGT	2	6	570203	570208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010109
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11864	NC_017530	TGC	2	6	570298	570303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010109
11865	NC_017530	TGC	2	6	570316	570321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010109
11866	NC_017530	AAG	2	6	570326	570331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010109
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11943	NC_017530	T	8	8	573829	573836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11972	NC_017530	GCT	2	6	575446	575451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010114
11973	NC_017530	ACGT	2	8	575471	575478	25 %	25 %	25 %	25 %	386010114
11974	NC_017530	GAA	2	6	575547	575552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010114
11975	NC_017530	GAG	2	6	575557	575562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386010114
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