MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 121084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
119001	NC_017530	TGA	2	6	5634868	5634873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014511
119002	NC_017530	ATG	2	6	5634898	5634903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014511
119003	NC_017530	GC	3	6	5634970	5634975	0 %	0 %	50 %	50 %	386014511
119004	NC_017530	TCGAC	2	10	5635048	5635057	20 %	20 %	20 %	40 %	386014511
119005	NC_017530	GCT	2	6	5635084	5635089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014511
119006	NC_017530	ACC	2	6	5635099	5635104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014511
119007	NC_017530	CTG	2	6	5635215	5635220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014511
119008	NC_017530	TCG	2	6	5635234	5635239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014511
119009	NC_017530	GCCCC	2	10	5635261	5635270	0 %	0 %	20 %	80 %	386014511
119010	NC_017530	CAC	2	6	5635292	5635297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014511
119011	NC_017530	TTC	2	6	5635302	5635307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014511
119012	NC_017530	CGC	2	6	5635319	5635324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014511
119013	NC_017530	GCA	2	6	5635558	5635563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014511
119014	NC_017530	GCT	2	6	5635624	5635629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014511
119015	NC_017530	CGC	2	6	5635646	5635651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014511
119016	NC_017530	GCTG	2	8	5635697	5635704	0 %	25 %	50 %	25 %	386014511
119017	NC_017530	CCAC	2	8	5635861	5635868	25 %	0 %	0 %	75 %	386014511
119018	NC_017530	CAGGC	2	10	5635869	5635878	20 %	0 %	40 %	40 %	386014511
119019	NC_017530	CG	3	6	5635904	5635909	0 %	0 %	50 %	50 %	386014511
119020	NC_017530	TGC	2	6	5635927	5635932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014511
119021	NC_017530	GC	3	6	5635993	5635998	0 %	0 %	50 %	50 %	386014511
119022	NC_017530	GCG	2	6	5636011	5636016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014511
119023	NC_017530	GCC	2	6	5636031	5636036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014511
119024	NC_017530	CGA	2	6	5636048	5636053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014511
119025	NC_017530	TCA	2	6	5636116	5636121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014511
119026	NC_017530	ACC	2	6	5636124	5636129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014511
119027	NC_017530	AGTG	2	8	5636169	5636176	25 %	25 %	50 %	0 %	386014511
119028	NC_017530	GC	3	6	5636205	5636210	0 %	0 %	50 %	50 %	386014511
119029	NC_017530	TGCC	2	8	5636229	5636236	0 %	25 %	25 %	50 %	386014511
119030	NC_017530	CCTCG	2	10	5636333	5636342	0 %	20 %	20 %	60 %	386014511
119031	NC_017530	GC	3	6	5636451	5636456	0 %	0 %	50 %	50 %	386014511
119032	NC_017530	ATGA	2	8	5636475	5636482	50 %	25 %	25 %	0 %	386014511
119033	NC_017530	CAGC	2	8	5636510	5636517	25 %	0 %	25 %	50 %	386014511
119034	NC_017530	GCTG	2	8	5636557	5636564	0 %	25 %	50 %	25 %	386014511
119035	NC_017530	GAA	2	6	5636586	5636591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014511
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119037	NC_017530	CGC	2	6	5636747	5636752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014511
119038	NC_017530	GCA	2	6	5636822	5636827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014511
119039	NC_017530	CGG	2	6	5636905	5636910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014511
119040	NC_017530	GAC	2	6	5636940	5636945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014511
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119045	NC_017530	TCA	2	6	5637329	5637334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014512
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119047	NC_017530	TGC	2	6	5637373	5637378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014512
119048	NC_017530	CAC	2	6	5637411	5637416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014512
119049	NC_017530	CA	3	6	5637466	5637471	50 %	0 %	0 %	50 %	386014512
119050	NC_017530	CAC	2	6	5637477	5637482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014512
119051	NC_017530	GAT	2	6	5637489	5637494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014512
119052	NC_017530	TTGC	2	8	5637498	5637505	0 %	50 %	25 %	25 %	386014512
119053	NC_017530	TGG	2	6	5637644	5637649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014512
119054	NC_017530	GTT	2	6	5637702	5637707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014512
119055	NC_017530	TGG	2	6	5637757	5637762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014512
119056	NC_017530	CAG	2	6	5637768	5637773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014512
119057	NC_017530	CAC	2	6	5637774	5637779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014512
119058	NC_017530	CGT	2	6	5637782	5637787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014512
119059	NC_017530	TTGGG	2	10	5637833	5637842	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
119060	NC_017530	GCC	2	6	5637914	5637919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014513
119061	NC_017530	TGGC	2	8	5637930	5637937	0 %	25 %	50 %	25 %	386014513
119062	NC_017530	GGC	2	6	5637944	5637949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014513
119063	NC_017530	GCAA	2	8	5638024	5638031	50 %	0 %	25 %	25 %	386014513
119064	NC_017530	GC	3	6	5638050	5638055	0 %	0 %	50 %	50 %	386014513
119065	NC_017530	CAG	2	6	5638056	5638061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014513
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119068	NC_017530	CG	3	6	5638198	5638203	0 %	0 %	50 %	50 %	386014513
119069	NC_017530	GCG	2	6	5638229	5638234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014513
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119072	NC_017530	CTG	2	6	5638343	5638348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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119074	NC_017530	CACCG	2	10	5638455	5638464	20 %	0 %	20 %	60 %	386014514
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119090	NC_017530	TCG	2	6	5639119	5639124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014514
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119099	NC_017530	CTT	2	6	5639430	5639435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119100	NC_017530	GC	3	6	5639441	5639446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119101	NC_017530	TTC	2	6	5639524	5639529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119102	NC_017530	GAT	2	6	5639536	5639541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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119114	NC_017530	ATC	2	6	5640216	5640221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014515
119115	NC_017530	CTG	2	6	5640300	5640305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014515
119116	NC_017530	GTG	2	6	5640306	5640311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014515
119117	NC_017530	GAA	2	6	5640333	5640338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014515
119118	NC_017530	CTG	3	9	5640378	5640386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014515
119119	NC_017530	TTC	2	6	5640456	5640461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014515
119120	NC_017530	ACCTGC	2	12	5640484	5640495	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386014515
119121	NC_017530	TGG	2	6	5640511	5640516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014515
119122	NC_017530	TGG	2	6	5640538	5640543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014515
119123	NC_017530	CTG	2	6	5640552	5640557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014515
119124	NC_017530	CAGCGC	2	12	5640596	5640607	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386014515
119125	NC_017530	GGC	2	6	5640629	5640634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014515
119126	NC_017530	GTG	2	6	5640654	5640659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014515
119127	NC_017530	CTG	3	9	5640708	5640716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014515
119128	NC_017530	GCT	2	6	5640749	5640754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014515
119129	NC_017530	GCGCCC	2	12	5640766	5640777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014515
119130	NC_017530	GTG	2	6	5640846	5640851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014515
119131	NC_017530	TCG	2	6	5640853	5640858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014515
119132	NC_017530	TCG	2	6	5640880	5640885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014515
119133	NC_017530	CG	3	6	5640884	5640889	0 %	0 %	50 %	50 %	386014515
119134	NC_017530	AGA	2	6	5640904	5640909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014515
119135	NC_017530	CGTT	2	8	5640913	5640920	0 %	50 %	25 %	25 %	386014515
119136	NC_017530	CGC	2	6	5641016	5641021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014515
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119141	NC_017530	CCG	2	6	5641084	5641089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014515
119142	NC_017530	GC	3	6	5641134	5641139	0 %	0 %	50 %	50 %	386014515
119143	NC_017530	CCG	2	6	5641220	5641225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014515
119144	NC_017530	TGG	2	6	5641231	5641236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014515
119145	NC_017530	GGC	2	6	5641259	5641264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014515
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119151	NC_017530	CG	3	6	5641464	5641469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119152	NC_017530	CGC	2	6	5641546	5641551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119153	NC_017530	AC	3	6	5641562	5641567	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119154	NC_017530	AC	3	6	5641660	5641665	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119155	NC_017530	CT	3	6	5641703	5641708	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119156	NC_017530	GCC	2	6	5641852	5641857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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119160	NC_017530	ACCA	2	8	5642272	5642279	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119161	NC_017530	TGA	2	6	5642370	5642375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119162	NC_017530	GCC	2	6	5642457	5642462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119163	NC_017530	CAA	2	6	5642491	5642496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119164	NC_017530	A	7	7	5642495	5642501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119165	NC_017530	AG	4	8	5642514	5642521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119166	NC_017530	TTAC	2	8	5642552	5642559	25 %	50 %	0 %	25 %	386014517
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119184	NC_017530	CTA	2	6	5643432	5643437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014518
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119197	NC_017530	TGA	2	6	5644086	5644091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014518
119198	NC_017530	GGC	2	6	5644170	5644175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014518
119199	NC_017530	TGC	2	6	5644256	5644261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014518
119200	NC_017530	GATC	2	8	5644278	5644285	25 %	25 %	25 %	25 %	386014518
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119202	NC_017530	GGCT	2	8	5644330	5644337	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119203	NC_017530	GGT	2	6	5644396	5644401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119204	NC_017530	ACCC	2	8	5644455	5644462	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
119205	NC_017530	CTT	2	6	5644493	5644498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119206	NC_017530	ATC	2	6	5644511	5644516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119207	NC_017530	CA	3	6	5644542	5644547	50 %	0 %	0 %	50 %	386014519
119208	NC_017530	GCT	2	6	5644623	5644628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014519
119209	NC_017530	GTCGGC	2	12	5644750	5644761	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386014519
119210	NC_017530	GGC	2	6	5644798	5644803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014519
119211	NC_017530	CTG	2	6	5644825	5644830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014519
119212	NC_017530	CCGAGT	2	12	5644853	5644864	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386014519
119213	NC_017530	GAT	2	6	5644926	5644931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014519
119214	NC_017530	TGG	2	6	5644993	5644998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014519
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119216	NC_017530	ACA	2	6	5645066	5645071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014519
119217	NC_017530	CCAC	2	8	5645075	5645082	25 %	0 %	0 %	75 %	386014519
119218	NC_017530	ACC	2	6	5645107	5645112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014519
119219	NC_017530	AACCTG	2	12	5645221	5645232	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386014519
119220	NC_017530	CTG	2	6	5645326	5645331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014519
119221	NC_017530	TCG	2	6	5645405	5645410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014519
119222	NC_017530	GCG	2	6	5645411	5645416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014519
119223	NC_017530	GCCTGA	2	12	5645525	5645536	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386014519
119224	NC_017530	CGG	2	6	5645568	5645573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014519
119225	NC_017530	GCGG	2	8	5645584	5645591	0 %	0 %	75 %	25 %	386014519
119226	NC_017530	ACGGCG	2	12	5645609	5645620	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386014519
119227	NC_017530	GTG	2	6	5645656	5645661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014519
119228	NC_017530	GTCA	2	8	5645704	5645711	25 %	25 %	25 %	25 %	386014519
119229	NC_017530	CCAGGC	2	12	5645721	5645732	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386014519
119230	NC_017530	GAT	2	6	5645737	5645742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014519
119231	NC_017530	ATC	2	6	5645761	5645766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014519
119232	NC_017530	ACC	2	6	5645837	5645842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014520
119233	NC_017530	CCA	2	6	5645862	5645867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014520
119234	NC_017530	GGCT	2	8	5645909	5645916	0 %	25 %	50 %	25 %	386014520
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119242	NC_017530	TGA	2	6	5646165	5646170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014520
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119246	NC_017530	CTG	2	6	5646398	5646403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014520
119247	NC_017530	TGC	2	6	5646480	5646485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014520
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119254	NC_017530	CTG	2	6	5646701	5646706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014520
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119317	NC_017530	TGGA	2	8	5649570	5649577	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
119318	NC_017530	GAA	2	6	5649591	5649596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119319	NC_017530	TGC	2	6	5649619	5649624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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119321	NC_017530	GCT	2	6	5649738	5649743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014522
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119325	NC_017530	GTCTGC	2	12	5649983	5649994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014522
119326	NC_017530	CTG	2	6	5650009	5650014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014522
119327	NC_017530	GC	3	6	5650062	5650067	0 %	0 %	50 %	50 %	386014522
119328	NC_017530	CGCT	2	8	5650187	5650194	0 %	25 %	25 %	50 %	386014522
119329	NC_017530	GGCG	2	8	5650200	5650207	0 %	0 %	75 %	25 %	386014522
119330	NC_017530	C	6	6	5650229	5650234	0 %	0 %	0 %	100 %	386014522
119331	NC_017530	CCA	2	6	5650245	5650250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014522
119332	NC_017530	GTCGTA	2	12	5650309	5650320	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386014522
119333	NC_017530	GGCT	2	8	5650331	5650338	0 %	25 %	50 %	25 %	386014522
119334	NC_017530	AACG	2	8	5650507	5650514	50 %	0 %	25 %	25 %	386014522
119335	NC_017530	ATG	2	6	5650605	5650610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014523
119336	NC_017530	CGC	2	6	5650666	5650671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014523
119337	NC_017530	GC	3	6	5650685	5650690	0 %	0 %	50 %	50 %	386014523
119338	NC_017530	GCG	2	6	5650696	5650701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014523
119339	NC_017530	CAG	2	6	5650703	5650708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014523
119340	NC_017530	AGGT	2	8	5650743	5650750	25 %	25 %	50 %	0 %	386014523
119341	NC_017530	CAG	2	6	5650751	5650756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014523
119342	NC_017530	GCG	2	6	5650771	5650776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014523
119343	NC_017530	CAC	2	6	5650835	5650840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014523
119344	NC_017530	CGG	2	6	5650912	5650917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119345	NC_017530	TGGAT	2	10	5650926	5650935	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
119346	NC_017530	TGC	2	6	5650941	5650946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119347	NC_017530	GGGC	2	8	5650950	5650957	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
119348	NC_017530	TTG	2	6	5650992	5650997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014524
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119350	NC_017530	TCA	2	6	5651125	5651130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014524
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119496	NC_017530	AC	3	6	5657557	5657562	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119497	NC_017530	T	7	7	5657567	5657573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119498	NC_017530	CG	3	6	5657675	5657680	0 %	0 %	50 %	50 %	386014529
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