MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 121084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
117501	NC_017530	GCA	2	6	5562986	5562991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014449
117502	NC_017530	GAA	2	6	5562993	5562998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014449
117503	NC_017530	GCC	2	6	5563037	5563042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014449
117504	NC_017530	CGC	2	6	5563105	5563110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014450
117505	NC_017530	GTC	2	6	5563112	5563117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014450
117506	NC_017530	CCA	2	6	5563121	5563126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014450
117507	NC_017530	CGA	2	6	5563180	5563185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014450
117508	NC_017530	GAC	2	6	5563193	5563198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014450
117509	NC_017530	GCC	2	6	5563235	5563240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014450
117510	NC_017530	CG	3	6	5563267	5563272	0 %	0 %	50 %	50 %	386014450
117511	NC_017530	GCT	2	6	5563294	5563299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014450
117512	NC_017530	GTG	2	6	5563302	5563307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014450
117513	NC_017530	GGT	2	6	5563361	5563366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014450
117514	NC_017530	CGT	2	6	5563432	5563437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014450
117515	NC_017530	GGC	2	6	5563489	5563494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014450
117516	NC_017530	ATG	2	6	5563554	5563559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014450
117517	NC_017530	GAT	2	6	5563634	5563639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014450
117518	NC_017530	TCG	2	6	5563698	5563703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014450
117519	NC_017530	AGC	3	9	5563704	5563712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014450
117520	NC_017530	AGCG	2	8	5563731	5563738	25 %	0 %	50 %	25 %	386014450
117521	NC_017530	ACGCTG	2	12	5563751	5563762	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386014450
117522	NC_017530	GCC	2	6	5563763	5563768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014450
117523	NC_017530	CTG	2	6	5563868	5563873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014450
117524	NC_017530	CAT	2	6	5563934	5563939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014450
117525	NC_017530	GGC	2	6	5563959	5563964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014450
117526	NC_017530	GCA	2	6	5564035	5564040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014450
117527	NC_017530	GCC	2	6	5564063	5564068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014450
117528	NC_017530	CAG	2	6	5564069	5564074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014450
117529	NC_017530	TCG	2	6	5564130	5564135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014450
117530	NC_017530	T	6	6	5564201	5564206	0 %	100 %	0 %	0 %	386014450
117531	NC_017530	CAA	2	6	5564243	5564248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117532	NC_017530	TCA	2	6	5564336	5564341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014451
117533	NC_017530	TGA	2	6	5564525	5564530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014451
117534	NC_017530	GCC	2	6	5564595	5564600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014451
117535	NC_017530	CTT	2	6	5564634	5564639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014451
117536	NC_017530	CTT	2	6	5564642	5564647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014451
117537	NC_017530	CAG	2	6	5564769	5564774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014451
117538	NC_017530	GCA	2	6	5564849	5564854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014451
117539	NC_017530	CCG	2	6	5564861	5564866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014451
117540	NC_017530	CTT	2	6	5564898	5564903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014451
117541	NC_017530	TCA	2	6	5565056	5565061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014451
117542	NC_017530	GCA	2	6	5565089	5565094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014451
117543	NC_017530	CAC	3	9	5565159	5565167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014451
117544	NC_017530	TGC	2	6	5565433	5565438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117545	NC_017530	GC	3	6	5565455	5565460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117546	NC_017530	AACTT	2	10	5565461	5565470	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117547	NC_017530	ATC	2	6	5565489	5565494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117548	NC_017530	GCT	2	6	5565632	5565637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014452
117549	NC_017530	GCA	2	6	5565703	5565708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014452
117550	NC_017530	CCTT	2	8	5565850	5565857	0 %	50 %	0 %	50 %	386014452
117551	NC_017530	CGG	2	6	5566034	5566039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014452
117552	NC_017530	TCT	2	6	5566048	5566053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014452
117553	NC_017530	GTCG	2	8	5566065	5566072	0 %	25 %	50 %	25 %	386014452
117554	NC_017530	GCAGC	2	10	5566088	5566097	20 %	0 %	40 %	40 %	386014452
117555	NC_017530	TCGG	2	8	5566108	5566115	0 %	25 %	50 %	25 %	386014452
117556	NC_017530	CGC	2	6	5566133	5566138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014452
117557	NC_017530	GCCGAT	2	12	5566236	5566247	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386014452
117558	NC_017530	TTG	2	6	5566276	5566281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014452
117559	NC_017530	TTC	2	6	5566330	5566335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014452
117560	NC_017530	CTC	2	6	5566362	5566367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386014452
117561	NC_017530	CGCC	2	8	5566373	5566380	0 %	0 %	25 %	75 %	386014452
117562	NC_017530	ACG	2	6	5566414	5566419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014452
117563	NC_017530	TGCC	2	8	5566436	5566443	0 %	25 %	25 %	50 %	386014452
117564	NC_017530	AGC	2	6	5566444	5566449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014452
117565	NC_017530	CGT	2	6	5566481	5566486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014452
117566	NC_017530	GCG	2	6	5566615	5566620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014452
117567	NC_017530	TTTA	2	8	5566668	5566675	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117568	NC_017530	CAG	2	6	5566685	5566690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117569	NC_017530	GC	3	6	5566710	5566715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117570	NC_017530	CTAGC	2	10	5566802	5566811	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
117571	NC_017530	GC	3	6	5566854	5566859	0 %	0 %	50 %	50 %	386014453
117572	NC_017530	CCA	2	6	5566865	5566870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014453
117573	NC_017530	TCG	2	6	5566873	5566878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014453
117574	NC_017530	GCG	3	9	5566901	5566909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014453
117575	NC_017530	GAT	2	6	5566911	5566916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014453
117576	NC_017530	CACC	2	8	5566925	5566932	25 %	0 %	0 %	75 %	386014453
117577	NC_017530	CACC	2	8	5567066	5567073	25 %	0 %	0 %	75 %	386014453
117578	NC_017530	GCC	2	6	5567191	5567196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014453
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117582	NC_017530	GTA	2	6	5567346	5567351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014453
117583	NC_017530	TCG	2	6	5567398	5567403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014453
117584	NC_017530	CGA	2	6	5567405	5567410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014453
117585	NC_017530	CGG	2	6	5567463	5567468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014453
117586	NC_017530	GAT	2	6	5567469	5567474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014453
117587	NC_017530	TCGGC	2	10	5567495	5567504	0 %	20 %	40 %	40 %	386014453
117588	NC_017530	TCT	3	9	5567543	5567551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014453
117589	NC_017530	CGG	2	6	5567561	5567566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014453
117590	NC_017530	GCC	2	6	5567682	5567687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014453
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117592	NC_017530	AGT	2	6	5567774	5567779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014453
117593	NC_017530	CGGAGC	2	12	5567813	5567824	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386014453
117594	NC_017530	GAA	2	6	5567829	5567834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014453
117595	NC_017530	GAA	2	6	5567910	5567915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014453
117596	NC_017530	GTA	2	6	5567922	5567927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014453
117597	NC_017530	GCC	2	6	5567953	5567958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014453
117598	NC_017530	CTC	2	6	5567967	5567972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386014453
117599	NC_017530	CAC	2	6	5567995	5568000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014453
117600	NC_017530	TGA	2	6	5568068	5568073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014453
117601	NC_017530	GCT	2	6	5568095	5568100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014453
117602	NC_017530	GTT	2	6	5568165	5568170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014453
117603	NC_017530	CCG	2	6	5568199	5568204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117604	NC_017530	CAG	2	6	5568240	5568245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014454
117605	NC_017530	TGA	2	6	5568266	5568271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014454
117606	NC_017530	GC	3	6	5568295	5568300	0 %	0 %	50 %	50 %	386014454
117607	NC_017530	TGA	2	6	5568320	5568325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014454
117608	NC_017530	GCG	2	6	5568411	5568416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014454
117609	NC_017530	GC	3	6	5568440	5568445	0 %	0 %	50 %	50 %	386014454
117610	NC_017530	CA	3	6	5568479	5568484	50 %	0 %	0 %	50 %	386014454
117611	NC_017530	GGC	2	6	5568492	5568497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014454
117612	NC_017530	TTC	2	6	5568597	5568602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014454
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