MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 121084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
117001	NC_017530	CCAGGC	2	12	5538864	5538875	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386014429
117002	NC_017530	GC	3	6	5538903	5538908	0 %	0 %	50 %	50 %	386014429
117003	NC_017530	CTT	2	6	5538939	5538944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014429
117004	NC_017530	CGC	2	6	5538950	5538955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014429
117005	NC_017530	GTG	2	6	5538967	5538972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014429
117006	NC_017530	CGA	2	6	5539047	5539052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014429
117007	NC_017530	CTG	2	6	5539057	5539062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014429
117008	NC_017530	ATC	2	6	5539063	5539068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014429
117009	NC_017530	CTGC	2	8	5539087	5539094	0 %	25 %	25 %	50 %	386014429
117010	NC_017530	GCC	2	6	5539138	5539143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014429
117011	NC_017530	GAT	2	6	5539158	5539163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014429
117012	NC_017530	GCG	2	6	5539178	5539183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014429
117013	NC_017530	CTG	2	6	5539198	5539203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014429
117014	NC_017530	GCCAGC	2	12	5539208	5539219	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386014429
117015	NC_017530	AAC	2	6	5539249	5539254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014429
117016	NC_017530	TGT	2	6	5539259	5539264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014429
117017	NC_017530	TAC	2	6	5539339	5539344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014429
117018	NC_017530	GGC	2	6	5539347	5539352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014429
117019	NC_017530	GGT	2	6	5539476	5539481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014430
117020	NC_017530	GCA	2	6	5539494	5539499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014430
117021	NC_017530	CCCA	2	8	5539649	5539656	25 %	0 %	0 %	75 %	386014430
117022	NC_017530	GCA	2	6	5539767	5539772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014430
117023	NC_017530	CAG	2	6	5539825	5539830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014430
117024	NC_017530	TGCG	2	8	5539854	5539861	0 %	25 %	50 %	25 %	386014430
117025	NC_017530	GCA	2	6	5539869	5539874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014430
117026	NC_017530	C	8	8	5539893	5539900	0 %	0 %	0 %	100 %	386014430
117027	NC_017530	CTG	2	6	5539975	5539980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014430
117028	NC_017530	CGC	2	6	5540013	5540018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014430
117029	NC_017530	CTTG	2	8	5540064	5540071	0 %	50 %	25 %	25 %	386014430
117030	NC_017530	GCA	2	6	5540124	5540129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014430
117031	NC_017530	AAC	2	6	5540132	5540137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014430
117032	NC_017530	GCTGG	2	10	5540143	5540152	0 %	20 %	60 %	20 %	386014430
117033	NC_017530	CGC	2	6	5540188	5540193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014430
117034	NC_017530	GCC	2	6	5540200	5540205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014430
117035	NC_017530	CAGC	2	8	5540206	5540213	25 %	0 %	25 %	50 %	386014430
117036	NC_017530	TG	3	6	5540214	5540219	0 %	50 %	50 %	0 %	386014430
117037	NC_017530	TGGC	2	8	5540272	5540279	0 %	25 %	50 %	25 %	386014430
117038	NC_017530	GTG	2	6	5540282	5540287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014430
117039	NC_017530	AAC	2	6	5540417	5540422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117040	NC_017530	ATG	2	6	5540494	5540499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117041	NC_017530	ATC	2	6	5540629	5540634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014431
117042	NC_017530	TTG	2	6	5540659	5540664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014431
117043	NC_017530	GTG	2	6	5540803	5540808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014431
117044	NC_017530	CAAC	2	8	5540844	5540851	50 %	0 %	0 %	50 %	386014431
117045	NC_017530	ACG	2	6	5540888	5540893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014431
117046	NC_017530	TGC	2	6	5540906	5540911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014431
117047	NC_017530	CACC	2	8	5540967	5540974	25 %	0 %	0 %	75 %	386014431
117048	NC_017530	CCTG	2	8	5540991	5540998	0 %	25 %	25 %	50 %	386014431
117049	NC_017530	GGCAA	2	10	5541026	5541035	40 %	0 %	40 %	20 %	386014431
117050	NC_017530	ATC	2	6	5541103	5541108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014431
117051	NC_017530	CTTG	2	8	5541114	5541121	0 %	50 %	25 %	25 %	386014431
117052	NC_017530	GGA	2	6	5541221	5541226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117053	NC_017530	CAC	2	6	5541270	5541275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014432
117054	NC_017530	CAAG	2	8	5541445	5541452	50 %	0 %	25 %	25 %	386014432
117055	NC_017530	AGC	2	6	5541459	5541464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014432
117056	NC_017530	GGCC	2	8	5541523	5541530	0 %	0 %	50 %	50 %	386014432
117057	NC_017530	GAA	2	6	5541555	5541560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014432
117058	NC_017530	CAGC	2	8	5541571	5541578	25 %	0 %	25 %	50 %	386014432
117059	NC_017530	CAA	2	6	5541617	5541622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014432
117060	NC_017530	CAG	2	6	5541702	5541707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014432
117061	NC_017530	AGC	2	6	5541765	5541770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014432
117062	NC_017530	AGC	2	6	5541773	5541778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014432
117063	NC_017530	AAC	2	6	5541842	5541847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014432
117064	NC_017530	GATC	2	8	5541853	5541860	25 %	25 %	25 %	25 %	386014432
117065	NC_017530	AGCA	2	8	5541879	5541886	50 %	0 %	25 %	25 %	386014432
117066	NC_017530	TGC	2	6	5541901	5541906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014432
117067	NC_017530	GC	3	6	5541926	5541931	0 %	0 %	50 %	50 %	386014432
117068	NC_017530	AGC	2	6	5542213	5542218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014432
117069	NC_017530	CGA	2	6	5542303	5542308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014432
117070	NC_017530	GCAG	2	8	5542309	5542316	25 %	0 %	50 %	25 %	386014432
117071	NC_017530	CA	3	6	5542337	5542342	50 %	0 %	0 %	50 %	386014432
117072	NC_017530	CG	3	6	5542413	5542418	0 %	0 %	50 %	50 %	386014432
117073	NC_017530	CTG	2	6	5542487	5542492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014432
117074	NC_017530	ATG	2	6	5542592	5542597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014432
117075	NC_017530	GCG	2	6	5542725	5542730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014432
117076	NC_017530	TGC	2	6	5542731	5542736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014432
117077	NC_017530	ACGT	2	8	5542740	5542747	25 %	25 %	25 %	25 %	386014432
117078	NC_017530	GGT	2	6	5542807	5542812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014432
117079	NC_017530	GCT	2	6	5542818	5542823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014432
117080	NC_017530	CGC	2	6	5542838	5542843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014432
117081	NC_017530	ACG	3	9	5542862	5542870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014432
117082	NC_017530	CAT	2	6	5542935	5542940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014432
117083	NC_017530	CTC	2	6	5542943	5542948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386014432
117084	NC_017530	TGA	2	6	5542995	5543000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014432
117085	NC_017530	TGC	2	6	5543051	5543056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117086	NC_017530	CA	3	6	5543103	5543108	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117087	NC_017530	GGA	2	6	5543121	5543126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117088	NC_017530	GCG	2	6	5543146	5543151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117089	NC_017530	GGC	2	6	5543383	5543388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117090	NC_017530	TTG	2	6	5543411	5543416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117091	NC_017530	CCG	2	6	5543427	5543432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117092	NC_017530	ACC	2	6	5543441	5543446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117093	NC_017530	ACA	2	6	5543447	5543452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117094	NC_017530	AG	3	6	5543498	5543503	50 %	0 %	50 %	0 %	386014433
117095	NC_017530	T	6	6	5543529	5543534	0 %	100 %	0 %	0 %	386014433
117096	NC_017530	ACA	2	6	5543570	5543575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014433
117097	NC_017530	GAC	2	6	5543580	5543585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014433
117098	NC_017530	GAA	2	6	5543601	5543606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014433
117099	NC_017530	ATC	2	6	5543607	5543612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014433
117100	NC_017530	GATCT	2	10	5543626	5543635	20 %	40 %	20 %	20 %	386014433
117101	NC_017530	TGA	2	6	5543651	5543656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014433
117102	NC_017530	CGT	2	6	5543678	5543683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014433
117103	NC_017530	GC	3	6	5543702	5543707	0 %	0 %	50 %	50 %	386014433
117104	NC_017530	CAC	2	6	5543806	5543811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117105	NC_017530	CAC	2	6	5543839	5543844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117106	NC_017530	CGA	2	6	5543856	5543861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117107	NC_017530	C	6	6	5543883	5543888	0 %	0 %	0 %	100 %	386014434
117108	NC_017530	CGC	2	6	5543900	5543905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014434
117109	NC_017530	CCA	2	6	5543907	5543912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014434
117110	NC_017530	GTT	2	6	5543921	5543926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014434
117111	NC_017530	GCC	2	6	5543941	5543946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014434
117112	NC_017530	CGG	2	6	5543992	5543997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014434
117113	NC_017530	GTC	2	6	5544029	5544034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014434
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117115	NC_017530	TGT	2	6	5544106	5544111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014434
117116	NC_017530	CGG	2	6	5544131	5544136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014434
117117	NC_017530	AGC	2	6	5544180	5544185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014434
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117334	NC_017530	AGAT	2	8	5554813	5554820	50 %	25 %	25 %	0 %	386014444
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117341	NC_017530	GCCGAC	2	12	5555112	5555123	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386014444
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117343	NC_017530	CAT	2	6	5555157	5555162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014444
117344	NC_017530	GTA	2	6	5555208	5555213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014444
117345	NC_017530	CTG	2	6	5555226	5555231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014444
117346	NC_017530	ACC	2	6	5555329	5555334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014444
117347	NC_017530	TCGA	2	8	5555347	5555354	25 %	25 %	25 %	25 %	386014444
117348	NC_017530	CGA	2	6	5555378	5555383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014444
117349	NC_017530	AGA	2	6	5555438	5555443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014444
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117351	NC_017530	GAT	2	6	5555472	5555477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014444
117352	NC_017530	CAC	2	6	5555500	5555505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014444
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117355	NC_017530	CCA	2	6	5555615	5555620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014444
117356	NC_017530	CACGA	2	10	5555623	5555632	40 %	0 %	20 %	40 %	386014444
117357	NC_017530	CGC	2	6	5555775	5555780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014444
117358	NC_017530	ATC	2	6	5555833	5555838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014444
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117363	NC_017530	CAC	2	6	5556015	5556020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014444
117364	NC_017530	GC	3	6	5556032	5556037	0 %	0 %	50 %	50 %	386014444
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117372	NC_017530	GGCC	2	8	5556374	5556381	0 %	0 %	50 %	50 %	386014444
117373	NC_017530	GCCG	2	8	5556390	5556397	0 %	0 %	50 %	50 %	386014444
117374	NC_017530	CAGC	2	8	5556458	5556465	25 %	0 %	25 %	50 %	386014444
117375	NC_017530	CGG	2	6	5556602	5556607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014444
117376	NC_017530	TCG	2	6	5556643	5556648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014444
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117378	NC_017530	CCTTGG	2	12	5556737	5556748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014444
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117380	NC_017530	CTT	2	6	5556834	5556839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014444
117381	NC_017530	CGGT	2	8	5556847	5556854	0 %	25 %	50 %	25 %	386014444
117382	NC_017530	ACG	2	6	5556926	5556931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014444
117383	NC_017530	A	6	6	5556962	5556967	100 %	0 %	0 %	0 %	386014444
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117385	NC_017530	TCG	2	6	5557065	5557070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014445
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117397	NC_017530	TGG	2	6	5557690	5557695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014445
117398	NC_017530	CTG	3	9	5557757	5557765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014445
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117400	NC_017530	CTG	2	6	5557844	5557849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014445
117401	NC_017530	GTCG	2	8	5557850	5557857	0 %	25 %	50 %	25 %	386014445
117402	NC_017530	CCAG	2	8	5557906	5557913	25 %	0 %	25 %	50 %	386014445
117403	NC_017530	GC	3	6	5557961	5557966	0 %	0 %	50 %	50 %	386014445
117404	NC_017530	CTT	2	6	5558056	5558061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014445
117405	NC_017530	CAG	2	6	5558078	5558083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014445
117406	NC_017530	GCA	2	6	5558172	5558177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014446
117407	NC_017530	GCC	2	6	5558182	5558187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014446
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117410	NC_017530	TCGCCC	2	12	5558285	5558296	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386014446
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117412	NC_017530	GGCC	2	8	5558360	5558367	0 %	0 %	50 %	50 %	386014446
117413	NC_017530	TGG	3	9	5558376	5558384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014446
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117422	NC_017530	GCA	2	6	5558789	5558794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014446
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117424	NC_017530	GCA	2	6	5558826	5558831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014446
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117427	NC_017530	CACC	2	8	5559102	5559109	25 %	0 %	0 %	75 %	386014446
117428	NC_017530	ACA	2	6	5559159	5559164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014446
117429	NC_017530	GAC	2	6	5559175	5559180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014446
117430	NC_017530	CTTG	2	8	5559213	5559220	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117431	NC_017530	ATC	2	6	5559288	5559293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117432	NC_017530	AGC	2	6	5559408	5559413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117433	NC_017530	AGG	2	6	5559508	5559513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117434	NC_017530	ACAGC	2	10	5559631	5559640	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
117435	NC_017530	TCTTGG	2	12	5559653	5559664	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117436	NC_017530	CTA	2	6	5559804	5559809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117437	NC_017530	ACA	2	6	5559962	5559967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117438	NC_017530	ACC	2	6	5559992	5559997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117439	NC_017530	ACG	2	6	5560001	5560006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117440	NC_017530	ATTT	2	8	5560068	5560075	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117441	NC_017530	TCC	2	6	5560139	5560144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117442	NC_017530	TTCA	2	8	5560167	5560174	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117443	NC_017530	GAAA	2	8	5560211	5560218	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117444	NC_017530	TTC	2	6	5560267	5560272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117445	NC_017530	AGT	2	6	5560321	5560326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117446	NC_017530	TCG	2	6	5560330	5560335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117447	NC_017530	AG	4	8	5560416	5560423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117448	NC_017530	TG	3	6	5560451	5560456	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117449	NC_017530	ACC	2	6	5560659	5560664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014447
117450	NC_017530	CCA	2	6	5560700	5560705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014447
117451	NC_017530	TGG	2	6	5560714	5560719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014447
117452	NC_017530	AAG	2	6	5560813	5560818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014447
117453	NC_017530	GCG	2	6	5560931	5560936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014447
117454	NC_017530	GT	3	6	5560943	5560948	0 %	50 %	50 %	0 %	386014447
117455	NC_017530	TTG	2	6	5560969	5560974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014447
117456	NC_017530	CAC	2	6	5561090	5561095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117457	NC_017530	CAC	2	6	5561133	5561138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117458	NC_017530	TACCCC	2	12	5561156	5561167	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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117460	NC_017530	CTG	2	6	5561359	5561364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014448
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