MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 121084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
116501	NC_017530	CGC	2	6	5514457	5514462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014405
116502	NC_017530	GGCC	2	8	5514481	5514488	0 %	0 %	50 %	50 %	386014405
116503	NC_017530	ACGC	2	8	5514504	5514511	25 %	0 %	25 %	50 %	386014405
116504	NC_017530	CAG	2	6	5514577	5514582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014405
116505	NC_017530	ATC	2	6	5514584	5514589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014405
116506	NC_017530	GCA	2	6	5514669	5514674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014405
116507	NC_017530	GCA	2	6	5514714	5514719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014405
116508	NC_017530	GCA	2	6	5514738	5514743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014405
116509	NC_017530	GCGT	2	8	5514780	5514787	0 %	25 %	50 %	25 %	386014405
116510	NC_017530	GCC	2	6	5514905	5514910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014405
116511	NC_017530	CCA	2	6	5514917	5514922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014405
116512	NC_017530	AGA	2	6	5514954	5514959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014405
116513	NC_017530	CAG	3	9	5515000	5515008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014405
116514	NC_017530	CGA	3	9	5515020	5515028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014405
116515	NC_017530	CGCGG	2	10	5515058	5515067	0 %	0 %	60 %	40 %	386014405
116516	NC_017530	GCG	2	6	5515132	5515137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014406
116517	NC_017530	CAG	2	6	5515199	5515204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014406
116518	NC_017530	TTC	2	6	5515295	5515300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014406
116519	NC_017530	CAC	2	6	5515304	5515309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014406
116520	NC_017530	GGC	2	6	5515333	5515338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014406
116521	NC_017530	CTG	2	6	5515353	5515358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014406
116522	NC_017530	GCT	2	6	5515418	5515423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014406
116523	NC_017530	CGA	2	6	5515453	5515458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014406
116524	NC_017530	GGT	2	6	5515483	5515488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014406
116525	NC_017530	GTT	2	6	5515529	5515534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014406
116526	NC_017530	GTG	2	6	5515596	5515601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014406
116527	NC_017530	AGC	4	12	5515686	5515697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014406
116528	NC_017530	GC	3	6	5515714	5515719	0 %	0 %	50 %	50 %	386014406
116529	NC_017530	GGGCCA	2	12	5515720	5515731	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386014406
116530	NC_017530	TGC	2	6	5515737	5515742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014406
116531	NC_017530	CTT	2	6	5515769	5515774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014406
116532	NC_017530	G	6	6	5515933	5515938	0 %	0 %	100 %	0 %	386014406
116533	NC_017530	GCA	2	6	5516011	5516016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014406
116534	NC_017530	GTG	2	6	5516154	5516159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014406
116535	NC_017530	CATGG	2	10	5516165	5516174	20 %	20 %	40 %	20 %	386014406
116536	NC_017530	AGGC	2	8	5516201	5516208	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116537	NC_017530	GAT	2	6	5516243	5516248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116538	NC_017530	TAG	2	6	5516266	5516271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116539	NC_017530	GCAT	2	8	5516316	5516323	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116540	NC_017530	GAA	2	6	5516381	5516386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116541	NC_017530	CAG	2	6	5516389	5516394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116542	NC_017530	GCC	2	6	5516442	5516447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014407
116543	NC_017530	CCTGG	2	10	5516453	5516462	0 %	20 %	40 %	40 %	386014407
116544	NC_017530	GCA	2	6	5516584	5516589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014407
116545	NC_017530	CAT	2	6	5516624	5516629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014407
116546	NC_017530	CCT	2	6	5516650	5516655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386014407
116547	NC_017530	CAT	2	6	5516657	5516662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014407
116548	NC_017530	CAG	2	6	5516705	5516710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014407
116549	NC_017530	ACC	2	6	5516724	5516729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014407
116550	NC_017530	TCGA	2	8	5516730	5516737	25 %	25 %	25 %	25 %	386014407
116551	NC_017530	GGT	2	6	5516761	5516766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014407
116552	NC_017530	CCA	3	9	5516779	5516787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014407
116553	NC_017530	CCG	2	6	5516807	5516812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014407
116554	NC_017530	TCC	2	6	5516826	5516831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386014407
116555	NC_017530	CGA	2	6	5516840	5516845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014407
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116557	NC_017530	GTA	2	6	5516966	5516971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014407
116558	NC_017530	CTG	2	6	5517047	5517052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014407
116559	NC_017530	CAG	2	6	5517053	5517058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014407
116560	NC_017530	GCA	2	6	5517073	5517078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014407
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116564	NC_017530	GCTG	2	8	5517181	5517188	0 %	25 %	50 %	25 %	386014407
116565	NC_017530	CTT	2	6	5517197	5517202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014407
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116588	NC_017530	GCG	2	6	5518266	5518271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014408
116589	NC_017530	GC	3	6	5518312	5518317	0 %	0 %	50 %	50 %	386014408
116590	NC_017530	CCA	3	9	5518327	5518335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014408
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116598	NC_017530	TGA	2	6	5518507	5518512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014408
116599	NC_017530	GCG	2	6	5518539	5518544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014408
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116614	NC_017530	TCGGC	2	10	5519179	5519188	0 %	20 %	40 %	40 %	386014408
116615	NC_017530	CGG	2	6	5519224	5519229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014408
116616	NC_017530	GCG	2	6	5519413	5519418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014408
116617	NC_017530	GCA	2	6	5519435	5519440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014408
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116621	NC_017530	TGA	2	6	5519624	5519629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014409
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116701	NC_017530	CTG	2	6	5523434	5523439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014413
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116730	NC_017530	GCT	2	6	5524632	5524637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014414
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116832	NC_017530	GCCAGG	2	12	5529325	5529336	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386014418
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116837	NC_017530	TCT	2	6	5529557	5529562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014418
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116839	NC_017530	CTT	2	6	5529825	5529830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014419
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116841	NC_017530	GCG	3	9	5530010	5530018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014419
116842	NC_017530	A	6	6	5530034	5530039	100 %	0 %	0 %	0 %	386014419
116843	NC_017530	TCG	2	6	5530040	5530045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014419
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116853	NC_017530	TCCAGC	2	12	5530653	5530664	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386014420
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116883	NC_017530	GGCC	2	8	5532474	5532481	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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