MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 121084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
116001	NC_017530	TTGCC	2	10	5490884	5490893	0 %	40 %	20 %	40 %	386014385
116002	NC_017530	TGA	2	6	5491074	5491079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014385
116003	NC_017530	GCT	2	6	5491098	5491103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014385
116004	NC_017530	GGA	2	6	5491158	5491163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386014385
116005	NC_017530	CTG	2	6	5491219	5491224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014385
116006	NC_017530	AGA	2	6	5491260	5491265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014385
116007	NC_017530	AGC	2	6	5491266	5491271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014385
116008	NC_017530	AAG	2	6	5491322	5491327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014385
116009	NC_017530	GCT	2	6	5491350	5491355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014385
116010	NC_017530	TGA	2	6	5491563	5491568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014385
116011	NC_017530	ATA	2	6	5491608	5491613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386014386
116012	NC_017530	GGC	2	6	5491619	5491624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014386
116013	NC_017530	ACA	2	6	5491691	5491696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014386
116014	NC_017530	TCG	2	6	5491719	5491724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014386
116015	NC_017530	TCG	2	6	5491743	5491748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014386
116016	NC_017530	CAAGC	2	10	5491776	5491785	40 %	0 %	20 %	40 %	386014386
116017	NC_017530	C	6	6	5491785	5491790	0 %	0 %	0 %	100 %	386014386
116018	NC_017530	CGA	2	6	5491828	5491833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014386
116019	NC_017530	CAGC	2	8	5491837	5491844	25 %	0 %	25 %	50 %	386014386
116020	NC_017530	CCG	2	6	5491851	5491856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014386
116021	NC_017530	AGC	2	6	5491946	5491951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014386
116022	NC_017530	CCA	2	6	5492200	5492205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014386
116023	NC_017530	CCG	2	6	5492316	5492321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014386
116024	NC_017530	CTGC	2	8	5492327	5492334	0 %	25 %	25 %	50 %	386014386
116025	NC_017530	GCA	2	6	5492342	5492347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014386
116026	NC_017530	CAG	2	6	5492383	5492388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014386
116027	NC_017530	TGG	2	6	5492496	5492501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014386
116028	NC_017530	GCT	2	6	5492635	5492640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014386
116029	NC_017530	GC	3	6	5492687	5492692	0 %	0 %	50 %	50 %	386014386
116030	NC_017530	AGC	2	6	5492907	5492912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014386
116031	NC_017530	AGGC	2	8	5492972	5492979	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116032	NC_017530	ACA	2	6	5492980	5492985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116033	NC_017530	TGGC	2	8	5493119	5493126	0 %	25 %	50 %	25 %	386014387
116034	NC_017530	TGGTGC	2	12	5493183	5493194	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386014387
116035	NC_017530	GCA	2	6	5493241	5493246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014387
116036	NC_017530	GCAC	2	8	5493253	5493260	25 %	0 %	25 %	50 %	386014387
116037	NC_017530	GCT	2	6	5493294	5493299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014387
116038	NC_017530	GC	3	6	5493376	5493381	0 %	0 %	50 %	50 %	386014387
116039	NC_017530	G	6	6	5493424	5493429	0 %	0 %	100 %	0 %	386014387
116040	NC_017530	CTG	2	6	5493437	5493442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014387
116041	NC_017530	GCCA	2	8	5493467	5493474	25 %	0 %	25 %	50 %	386014387
116042	NC_017530	GGC	2	6	5493481	5493486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014387
116043	NC_017530	AGC	3	9	5493603	5493611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014387
116044	NC_017530	C	6	6	5493714	5493719	0 %	0 %	0 %	100 %	386014387
116045	NC_017530	ACT	2	6	5493744	5493749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014387
116046	NC_017530	TCG	2	6	5493751	5493756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014387
116047	NC_017530	TCT	2	6	5493771	5493776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014387
116048	NC_017530	ATC	2	6	5493803	5493808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014387
116049	NC_017530	TTG	2	6	5494035	5494040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014388
116050	NC_017530	CACT	2	8	5494044	5494051	25 %	25 %	0 %	50 %	386014388
116051	NC_017530	AAG	2	6	5494212	5494217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014388
116052	NC_017530	CAG	2	6	5494388	5494393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014388
116053	NC_017530	CAC	2	6	5494408	5494413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014388
116054	NC_017530	CCAG	2	8	5494519	5494526	25 %	0 %	25 %	50 %	386014388
116055	NC_017530	CCA	2	6	5494535	5494540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014388
116056	NC_017530	GCGG	2	8	5494544	5494551	0 %	0 %	75 %	25 %	386014388
116057	NC_017530	CGT	3	9	5494567	5494575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014388
116058	NC_017530	CAC	2	6	5494580	5494585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014388
116059	NC_017530	GTT	2	6	5494595	5494600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014388
116060	NC_017530	GCT	2	6	5494630	5494635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014388
116061	NC_017530	CTG	2	6	5494826	5494831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014388
116062	NC_017530	CCAGCA	2	12	5494986	5494997	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386014389
116063	NC_017530	CGC	2	6	5495007	5495012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014389
116064	NC_017530	CTT	2	6	5495022	5495027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014389
116065	NC_017530	GTG	2	6	5495054	5495059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014389
116066	NC_017530	ATG	2	6	5495076	5495081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014389
116067	NC_017530	CGA	2	6	5495151	5495156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014389
116068	NC_017530	CCTGGC	2	12	5495172	5495183	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386014389
116069	NC_017530	GCAG	2	8	5495184	5495191	25 %	0 %	50 %	25 %	386014389
116070	NC_017530	GGC	2	6	5495215	5495220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014389
116071	NC_017530	CAG	2	6	5495239	5495244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014389
116072	NC_017530	GCC	2	6	5495285	5495290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014389
116073	NC_017530	CG	3	6	5495332	5495337	0 %	0 %	50 %	50 %	386014389
116074	NC_017530	GCG	2	6	5495343	5495348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014389
116075	NC_017530	CCA	2	6	5495364	5495369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014389
116076	NC_017530	AAC	2	6	5495387	5495392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014389
116077	NC_017530	TTG	2	6	5495411	5495416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014389
116078	NC_017530	TGGT	2	8	5495468	5495475	0 %	50 %	50 %	0 %	386014389
116079	NC_017530	CTG	2	6	5495494	5495499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014389
116080	NC_017530	TCA	2	6	5495584	5495589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116081	NC_017530	CCCGG	2	10	5495688	5495697	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
116082	NC_017530	ACC	2	6	5495705	5495710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116083	NC_017530	TCGACC	2	12	5495745	5495756	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386014390
116084	NC_017530	CGA	2	6	5495760	5495765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014390
116085	NC_017530	CCA	2	6	5495807	5495812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014390
116086	NC_017530	GCG	2	6	5495813	5495818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014390
116087	NC_017530	GCG	2	6	5495821	5495826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014390
116088	NC_017530	AGC	2	6	5495861	5495866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014390
116089	NC_017530	ACGCCG	2	12	5496001	5496012	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386014390
116090	NC_017530	CAT	2	6	5496076	5496081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014390
116091	NC_017530	GTT	2	6	5496100	5496105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014390
116092	NC_017530	GCC	2	6	5496137	5496142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014390
116093	NC_017530	CTGGC	2	10	5496186	5496195	0 %	20 %	40 %	40 %	386014390
116094	NC_017530	GCA	2	6	5496199	5496204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014390
116095	NC_017530	GT	3	6	5496216	5496221	0 %	50 %	50 %	0 %	386014390
116096	NC_017530	CGCC	2	8	5496277	5496284	0 %	0 %	25 %	75 %	386014390
116097	NC_017530	ACC	2	6	5496294	5496299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014390
116098	NC_017530	CCA	2	6	5496315	5496320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014390
116099	NC_017530	GCC	2	6	5496327	5496332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014390
116100	NC_017530	CA	3	6	5496351	5496356	50 %	0 %	0 %	50 %	386014390
116101	NC_017530	GAC	2	6	5496410	5496415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014390
116102	NC_017530	GCC	2	6	5496431	5496436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014390
116103	NC_017530	GC	3	6	5496544	5496549	0 %	0 %	50 %	50 %	386014390
116104	NC_017530	CAT	2	6	5496598	5496603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014390
116105	NC_017530	GCA	2	6	5496628	5496633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014390
116106	NC_017530	CTG	2	6	5496635	5496640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014390
116107	NC_017530	GAT	2	6	5496641	5496646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014390
116108	NC_017530	GC	3	6	5496660	5496665	0 %	0 %	50 %	50 %	386014390
116109	NC_017530	GCC	2	6	5496712	5496717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014390
116110	NC_017530	TGC	2	6	5496723	5496728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014390
116111	NC_017530	ATCA	2	8	5496827	5496834	50 %	25 %	0 %	25 %	386014390
116112	NC_017530	GCCCAC	2	12	5496837	5496848	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386014390
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116114	NC_017530	TGC	2	6	5496894	5496899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014390
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116172	NC_017530	GC	3	6	5499434	5499439	0 %	0 %	50 %	50 %	386014393
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116220	NC_017530	TCG	2	6	5502345	5502350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014397
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116342	NC_017530	ATCG	2	8	5508009	5508016	25 %	25 %	25 %	25 %	386014400
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116441	NC_017530	CAG	2	6	5512080	5512085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116442	NC_017530	GGCC	2	8	5512086	5512093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116443	NC_017530	CGG	2	6	5512120	5512125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116444	NC_017530	C	8	8	5512132	5512139	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
116445	NC_017530	TG	3	6	5512142	5512147	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116446	NC_017530	CCA	2	6	5512149	5512154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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116451	NC_017530	CTG	2	6	5512342	5512347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014404
116452	NC_017530	GCT	2	6	5512446	5512451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014404
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