MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 121084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
115001	NC_017530	CTG	2	6	5443209	5443214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014342
115002	NC_017530	CTG	2	6	5443275	5443280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014342
115003	NC_017530	CTG	2	6	5443323	5443328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014342
115004	NC_017530	TGA	2	6	5443486	5443491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014342
115005	NC_017530	TGGTGA	2	12	5443507	5443518	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386014342
115006	NC_017530	CTT	2	6	5443547	5443552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014342
115007	NC_017530	CAG	2	6	5443571	5443576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014342
115008	NC_017530	GCC	2	6	5443585	5443590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014342
115009	NC_017530	CGT	2	6	5443615	5443620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014342
115010	NC_017530	CTA	2	6	5443637	5443642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014342
115011	NC_017530	CGG	2	6	5443666	5443671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014342
115012	NC_017530	TGG	2	6	5443747	5443752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014342
115013	NC_017530	ACC	2	6	5443772	5443777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014342
115014	NC_017530	GC	3	6	5443833	5443838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115015	NC_017530	ATCAG	2	10	5443852	5443861	40 %	20 %	20 %	20 %	386014343
115016	NC_017530	TGA	2	6	5443863	5443868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014343
115017	NC_017530	ATCCAC	2	12	5443879	5443890	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386014343
115018	NC_017530	TCA	2	6	5443899	5443904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014343
115019	NC_017530	CGG	2	6	5443960	5443965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014343
115020	NC_017530	TCG	2	6	5443976	5443981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014343
115021	NC_017530	GTC	2	6	5444026	5444031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014343
115022	NC_017530	GTT	2	6	5444032	5444037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014343
115023	NC_017530	TCT	2	6	5444040	5444045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014343
115024	NC_017530	GCA	2	6	5444061	5444066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014343
115025	NC_017530	CGG	2	6	5444082	5444087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014343
115026	NC_017530	CGT	2	6	5444088	5444093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014343
115027	NC_017530	CGG	2	6	5444097	5444102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014343
115028	NC_017530	GTTTCG	2	12	5444220	5444231	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115029	NC_017530	ACG	2	6	5444246	5444251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115030	NC_017530	TGA	2	6	5444363	5444368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014344
115031	NC_017530	GC	3	6	5444460	5444465	0 %	0 %	50 %	50 %	386014344
115032	NC_017530	CGG	3	9	5444548	5444556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014344
115033	NC_017530	GTCCA	2	10	5444575	5444584	20 %	20 %	20 %	40 %	386014344
115034	NC_017530	ACC	2	6	5444631	5444636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014344
115035	NC_017530	GCC	2	6	5444754	5444759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014344
115036	NC_017530	CAG	3	9	5444844	5444852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014344
115037	NC_017530	CGA	2	6	5444907	5444912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014344
115038	NC_017530	GCC	2	6	5444913	5444918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014344
115039	NC_017530	CGG	2	6	5445068	5445073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014344
115040	NC_017530	TGA	2	6	5445080	5445085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014344
115041	NC_017530	CTT	2	6	5445087	5445092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014344
115042	NC_017530	CAGGCC	2	12	5445123	5445134	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386014344
115043	NC_017530	CGGC	2	8	5445298	5445305	0 %	0 %	50 %	50 %	386014344
115044	NC_017530	CAT	2	6	5445312	5445317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014344
115045	NC_017530	TTC	2	6	5445373	5445378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014344
115046	NC_017530	GGCCAT	2	12	5445446	5445457	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115047	NC_017530	CAC	2	6	5445644	5445649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014345
115048	NC_017530	CCA	2	6	5445675	5445680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014345
115049	NC_017530	CTGGT	2	10	5445699	5445708	0 %	40 %	40 %	20 %	386014345
115050	NC_017530	GCG	2	6	5445869	5445874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014345
115051	NC_017530	CAATGG	2	12	5445943	5445954	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386014345
115052	NC_017530	TTC	2	6	5445996	5446001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014345
115053	NC_017530	ACG	2	6	5446037	5446042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014345
115054	NC_017530	CAC	2	6	5446108	5446113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014345
115055	NC_017530	CAC	3	9	5446121	5446129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014345
115056	NC_017530	CGA	2	6	5446147	5446152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014345
115057	NC_017530	GCC	2	6	5446250	5446255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014345
115058	NC_017530	TGTAGG	2	12	5446261	5446272	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386014345
115059	NC_017530	CCCATG	2	12	5446275	5446286	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386014345
115060	NC_017530	CGT	2	6	5446294	5446299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014345
115061	NC_017530	AGC	2	6	5446308	5446313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014345
115062	NC_017530	CGG	2	6	5446386	5446391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014345
115063	NC_017530	CAG	2	6	5446439	5446444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014345
115064	NC_017530	ACC	2	6	5446473	5446478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014345
115065	NC_017530	GC	3	6	5446491	5446496	0 %	0 %	50 %	50 %	386014345
115066	NC_017530	GCCGG	2	10	5446524	5446533	0 %	0 %	60 %	40 %	386014345
115067	NC_017530	GAT	2	6	5446538	5446543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014345
115068	NC_017530	CGT	2	6	5446657	5446662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014345
115069	NC_017530	CCG	2	6	5446750	5446755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014345
115070	NC_017530	CTG	2	6	5446877	5446882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014345
115071	NC_017530	GCA	2	6	5446930	5446935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014345
115072	NC_017530	T	8	8	5446938	5446945	0 %	100 %	0 %	0 %	386014345
115073	NC_017530	CAG	2	6	5447020	5447025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115074	NC_017530	ACA	2	6	5447152	5447157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014346
115075	NC_017530	GCT	2	6	5447158	5447163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014346
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115081	NC_017530	GCC	2	6	5447396	5447401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014346
115082	NC_017530	GCC	2	6	5447453	5447458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014346
115083	NC_017530	CAG	2	6	5447472	5447477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014346
115084	NC_017530	CAA	2	6	5447494	5447499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014346
115085	NC_017530	GCC	2	6	5447564	5447569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014346
115086	NC_017530	CAGG	2	8	5447582	5447589	25 %	0 %	50 %	25 %	386014346
115087	NC_017530	CGA	2	6	5447596	5447601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014346
115088	NC_017530	GGC	2	6	5447637	5447642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014346
115089	NC_017530	CA	3	6	5447730	5447735	50 %	0 %	0 %	50 %	386014346
115090	NC_017530	GGCG	2	8	5447809	5447816	0 %	0 %	75 %	25 %	386014346
115091	NC_017530	AC	3	6	5447827	5447832	50 %	0 %	0 %	50 %	386014346
115092	NC_017530	TCT	2	6	5447923	5447928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014346
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115094	NC_017530	CAG	2	6	5448011	5448016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014346
115095	NC_017530	TTC	2	6	5448137	5448142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014346
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115097	NC_017530	GTT	2	6	5448239	5448244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014346
115098	NC_017530	GCC	2	6	5448327	5448332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014346
115099	NC_017530	GCC	2	6	5448359	5448364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014346
115100	NC_017530	TGG	2	6	5448414	5448419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014346
115101	NC_017530	GCG	2	6	5448472	5448477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014346
115102	NC_017530	ACC	2	6	5448488	5448493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014346
115103	NC_017530	TCGA	2	8	5448642	5448649	25 %	25 %	25 %	25 %	386014346
115104	NC_017530	TGG	2	6	5448660	5448665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014346
115105	NC_017530	GCC	2	6	5448749	5448754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014346
115106	NC_017530	GCA	2	6	5448790	5448795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014346
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115109	NC_017530	CCAGCG	2	12	5449039	5449050	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386014346
115110	NC_017530	ATC	2	6	5449086	5449091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014346
115111	NC_017530	CCA	2	6	5449108	5449113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014346
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115320	NC_017530	CGA	2	6	5458970	5458975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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115332	NC_017530	GC	3	6	5459392	5459397	0 %	0 %	50 %	50 %	386014354
115333	NC_017530	CGG	2	6	5459434	5459439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014354
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115337	NC_017530	AGCG	2	8	5459483	5459490	25 %	0 %	50 %	25 %	386014354
115338	NC_017530	CTG	2	6	5459519	5459524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014354
115339	NC_017530	GCA	3	9	5459618	5459626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014354
115340	NC_017530	CGTGA	2	10	5459651	5459660	20 %	20 %	40 %	20 %	386014354
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115342	NC_017530	GC	3	6	5459734	5459739	0 %	0 %	50 %	50 %	386014354
115343	NC_017530	CGC	2	6	5459747	5459752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014354
115344	NC_017530	GCC	2	6	5459810	5459815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014354
115345	NC_017530	CG	3	6	5459891	5459896	0 %	0 %	50 %	50 %	386014354
115346	NC_017530	ACC	2	6	5459951	5459956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014354
115347	NC_017530	CAA	2	6	5459983	5459988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014354
115348	NC_017530	GCAA	2	8	5460093	5460100	50 %	0 %	25 %	25 %	386014354
115349	NC_017530	GGC	2	6	5460110	5460115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014354
115350	NC_017530	AGCC	2	8	5460120	5460127	25 %	0 %	25 %	50 %	386014354
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115352	NC_017530	GC	3	6	5460215	5460220	0 %	0 %	50 %	50 %	386014354
115353	NC_017530	TCA	2	6	5460225	5460230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014354
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115372	NC_017530	CGC	2	6	5461449	5461454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014354
115373	NC_017530	GAAC	2	8	5461462	5461469	50 %	0 %	25 %	25 %	386014354
115374	NC_017530	CG	3	6	5461585	5461590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115375	NC_017530	CAA	2	6	5461664	5461669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115376	NC_017530	ATG	2	6	5461857	5461862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014355
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115394	NC_017530	GT	3	6	5463129	5463134	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115395	NC_017530	TAG	2	6	5463141	5463146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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115451	NC_017530	TCG	2	6	5465989	5465994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014358
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115455	NC_017530	CGGG	2	8	5466137	5466144	0 %	0 %	75 %	25 %	386014358
115456	NC_017530	TCA	2	6	5466163	5466168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014358
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115458	NC_017530	CTG	2	6	5466195	5466200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014358
115459	NC_017530	CTTCGC	2	12	5466224	5466235	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386014358
115460	NC_017530	GCC	2	6	5466261	5466266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014358
115461	NC_017530	GCC	2	6	5466272	5466277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014358
115462	NC_017530	TGC	2	6	5466295	5466300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014358
115463	NC_017530	CA	3	6	5466310	5466315	50 %	0 %	0 %	50 %	386014358
115464	NC_017530	CGA	2	6	5466341	5466346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014358
115465	NC_017530	GCC	3	9	5466354	5466362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014358
115466	NC_017530	TGG	2	6	5466370	5466375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014358
115467	NC_017530	CTG	2	6	5466402	5466407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014358
115468	NC_017530	GCGCC	2	10	5466431	5466440	0 %	0 %	40 %	60 %	386014358
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115470	NC_017530	GCAA	2	8	5466615	5466622	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
115471	NC_017530	CGGG	2	8	5466627	5466634	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
115472	NC_017530	GCC	2	6	5466675	5466680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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115478	NC_017530	GCC	2	6	5467081	5467086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014359
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115489	NC_017530	GCT	2	6	5467515	5467520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014359
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115492	NC_017530	CTG	2	6	5467612	5467617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014359
115493	NC_017530	CGA	2	6	5467650	5467655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014359
115494	NC_017530	CGG	2	6	5467707	5467712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014359
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115496	NC_017530	GCA	2	6	5467754	5467759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014359
115497	NC_017530	CGC	2	6	5467840	5467845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014359
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115499	NC_017530	GCC	2	6	5467913	5467918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014359
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