MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 121084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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114502	NC_017530	GCA	2	6	5420542	5420547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014330
114503	NC_017530	ACC	2	6	5420562	5420567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014330
114504	NC_017530	ACG	2	6	5420639	5420644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014330
114505	NC_017530	CCA	2	6	5420719	5420724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014330
114506	NC_017530	TGC	2	6	5420767	5420772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014330
114507	NC_017530	TTCG	2	8	5420785	5420792	0 %	50 %	25 %	25 %	386014330
114508	NC_017530	CGC	2	6	5420804	5420809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014330
114509	NC_017530	GCA	2	6	5420833	5420838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014330
114510	NC_017530	TTCG	2	8	5420845	5420852	0 %	50 %	25 %	25 %	386014330
114511	NC_017530	CAG	2	6	5420876	5420881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014330
114512	NC_017530	ATG	2	6	5420882	5420887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014330
114513	NC_017530	GTC	2	6	5421027	5421032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014330
114514	NC_017530	AAT	2	6	5421044	5421049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386014330
114515	NC_017530	TGA	2	6	5421139	5421144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014330
114516	NC_017530	GCT	2	6	5421151	5421156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014330
114517	NC_017530	TCA	2	6	5421282	5421287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014330
114518	NC_017530	GAA	2	6	5421290	5421295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014330
114519	NC_017530	TC	3	6	5421348	5421353	0 %	50 %	0 %	50 %	386014330
114520	NC_017530	TC	3	6	5421437	5421442	0 %	50 %	0 %	50 %	386014330
114521	NC_017530	CTG	2	6	5421491	5421496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014330
114522	NC_017530	AAC	2	6	5421510	5421515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014330
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114524	NC_017530	T	7	7	5421587	5421593	0 %	100 %	0 %	0 %	386014330
114525	NC_017530	CTCA	2	8	5421620	5421627	25 %	25 %	0 %	50 %	386014330
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114527	NC_017530	TCGC	2	8	5421725	5421732	0 %	25 %	25 %	50 %	386014330
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114530	NC_017530	ATC	2	6	5421905	5421910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014330
114531	NC_017530	GCC	2	6	5421978	5421983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014330
114532	NC_017530	GGTG	2	8	5422057	5422064	0 %	25 %	75 %	0 %	386014330
114533	NC_017530	TGC	2	6	5422112	5422117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014330
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114537	NC_017530	GTT	2	6	5422244	5422249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014330
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114550	NC_017530	GCC	2	6	5423060	5423065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014330
114551	NC_017530	TG	3	6	5423146	5423151	0 %	50 %	50 %	0 %	386014330
114552	NC_017530	CAC	2	6	5423153	5423158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014330
114553	NC_017530	CCT	2	6	5423160	5423165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386014330
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114575	NC_017530	GC	3	6	5424122	5424127	0 %	0 %	50 %	50 %	386014330
114576	NC_017530	CTCGA	2	10	5424162	5424171	20 %	20 %	20 %	40 %	386014330
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114582	NC_017530	GCG	2	6	5424586	5424591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114583	NC_017530	CACG	2	8	5424661	5424668	25 %	0 %	25 %	50 %	386014331
114584	NC_017530	TCTGG	2	10	5424670	5424679	0 %	40 %	40 %	20 %	386014331
114585	NC_017530	CTT	2	6	5424835	5424840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014331
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114599	NC_017530	CGA	2	6	5425333	5425338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014331
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114601	NC_017530	GCCAG	2	10	5425489	5425498	20 %	0 %	40 %	40 %	386014331
114602	NC_017530	CAG	2	6	5425517	5425522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014331
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114606	NC_017530	CGC	2	6	5425759	5425764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014331
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114609	NC_017530	GGC	2	6	5425819	5425824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014331
114610	NC_017530	GCCA	2	8	5425868	5425875	25 %	0 %	25 %	50 %	386014331
114611	NC_017530	CAC	2	6	5425886	5425891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014331
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114613	NC_017530	GAC	2	6	5425941	5425946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014331
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114729	NC_017530	GGC	2	6	5431916	5431921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014335
114730	NC_017530	CG	3	6	5431945	5431950	0 %	0 %	50 %	50 %	386014335
114731	NC_017530	G	6	6	5431950	5431955	0 %	0 %	100 %	0 %	386014335
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114837	NC_017530	CTG	3	9	5436151	5436159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014337
114838	NC_017530	AAACAG	2	12	5436175	5436186	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386014337
114839	NC_017530	AGC	2	6	5436283	5436288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014337
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114841	NC_017530	GGC	2	6	5436315	5436320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014337
114842	NC_017530	CTG	2	6	5436361	5436366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014337
114843	NC_017530	GCT	2	6	5436423	5436428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014337
114844	NC_017530	AGC	2	6	5436461	5436466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014337
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114870	NC_017530	CTGG	2	8	5437329	5437336	0 %	25 %	50 %	25 %	386014337
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114897	NC_017530	GCA	2	6	5438423	5438428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014337
114898	NC_017530	AGC	2	6	5438450	5438455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014337
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