MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 121084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_017530	TGC	2	6	528090	528095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010076
11002	NC_017530	CTG	2	6	528114	528119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010076
11003	NC_017530	CG	3	6	528173	528178	0 %	0 %	50 %	50 %	386010076
11004	NC_017530	GGCG	2	8	528181	528188	0 %	0 %	75 %	25 %	386010076
11005	NC_017530	GGCGCT	2	12	528229	528240	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386010076
11006	NC_017530	GCTG	2	8	528309	528316	0 %	25 %	50 %	25 %	386010076
11007	NC_017530	CAA	2	6	528349	528354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010076
11008	NC_017530	TTG	2	6	528366	528371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010076
11009	NC_017530	TTC	2	6	528404	528409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010076
11010	NC_017530	TGG	2	6	528421	528426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010076
11011	NC_017530	CGG	2	6	528456	528461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010076
11012	NC_017530	GCA	2	6	528499	528504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010076
11013	NC_017530	GGC	2	6	528541	528546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010076
11014	NC_017530	GGC	2	6	528550	528555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010076
11015	NC_017530	GGCC	2	8	528596	528603	0 %	0 %	50 %	50 %	386010076
11016	NC_017530	CGA	3	9	528607	528615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010076
11017	NC_017530	CGA	2	6	528634	528639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010076
11018	NC_017530	GC	3	6	528643	528648	0 %	0 %	50 %	50 %	386010076
11019	NC_017530	TGC	2	6	528651	528656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010076
11020	NC_017530	AG	3	6	528716	528721	50 %	0 %	50 %	0 %	386010076
11021	NC_017530	TCA	2	6	528759	528764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010076
11022	NC_017530	CGTTGG	2	12	528776	528787	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386010076
11023	NC_017530	CCGT	2	8	528822	528829	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11024	NC_017530	TGC	2	6	528843	528848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11025	NC_017530	GAA	2	6	528875	528880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010077
11026	NC_017530	CGC	2	6	528951	528956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010077
11027	NC_017530	GCG	2	6	529017	529022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010077
11028	NC_017530	GAT	2	6	529042	529047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010077
11029	NC_017530	GGC	2	6	529214	529219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010077
11030	NC_017530	CGTT	2	8	529246	529253	0 %	50 %	25 %	25 %	386010077
11031	NC_017530	CTG	2	6	529313	529318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010077
11032	NC_017530	GGT	3	9	529333	529341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010077
11033	NC_017530	TTG	2	6	529436	529441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010077
11034	NC_017530	GCCA	2	8	529452	529459	25 %	0 %	25 %	50 %	386010077
11035	NC_017530	CGC	2	6	529469	529474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010077
11036	NC_017530	GGC	2	6	529498	529503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010077
11037	NC_017530	GTCG	2	8	529553	529560	0 %	25 %	50 %	25 %	386010077
11038	NC_017530	GGT	2	6	529597	529602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010077
11039	NC_017530	TCGA	2	8	529619	529626	25 %	25 %	25 %	25 %	386010077
11040	NC_017530	CG	3	6	529655	529660	0 %	0 %	50 %	50 %	386010077
11041	NC_017530	GCT	2	6	529665	529670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010077
11042	NC_017530	AT	3	6	529684	529689	50 %	50 %	0 %	0 %	386010077
11043	NC_017530	CTT	2	6	529693	529698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010077
11044	NC_017530	CCCG	2	8	529791	529798	0 %	0 %	25 %	75 %	386010077
11045	NC_017530	GTG	2	6	529800	529805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010077
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11048	NC_017530	GAC	2	6	529850	529855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010077
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11050	NC_017530	GT	3	6	529911	529916	0 %	50 %	50 %	0 %	386010077
11051	NC_017530	GATG	2	8	530026	530033	25 %	25 %	50 %	0 %	386010077
11052	NC_017530	CG	3	6	530084	530089	0 %	0 %	50 %	50 %	386010077
11053	NC_017530	CGA	2	6	530101	530106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010077
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11055	NC_017530	GGC	2	6	530237	530242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010077
11056	NC_017530	GAA	2	6	530276	530281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010077
11057	NC_017530	CAA	2	6	530287	530292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010077
11058	NC_017530	ATTG	2	8	530348	530355	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_017530	GCT	2	6	530358	530363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11060	NC_017530	CGT	2	6	530428	530433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11061	NC_017530	GGGCC	2	10	530456	530465	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11062	NC_017530	GCC	3	9	530498	530506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11063	NC_017530	CTG	2	6	530653	530658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010078
11064	NC_017530	TCA	2	6	530666	530671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010078
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11069	NC_017530	GACGT	2	10	530922	530931	20 %	20 %	40 %	20 %	386010078
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11080	NC_017530	CGCTG	2	10	531390	531399	0 %	20 %	40 %	40 %	386010078
11081	NC_017530	TGA	2	6	531497	531502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010078
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11086	NC_017530	GCTG	2	8	531819	531826	0 %	25 %	50 %	25 %	386010078
11087	NC_017530	AGC	2	6	531917	531922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010078
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11090	NC_017530	CCT	2	6	531944	531949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386010078
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11092	NC_017530	CGG	2	6	531987	531992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010078
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11102	NC_017530	TTA	2	6	532217	532222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386010078
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11108	NC_017530	GGCCAG	2	12	532459	532470	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386010078
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11110	NC_017530	CGTTGG	2	12	532721	532732	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11111	NC_017530	GCCC	2	8	532757	532764	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11112	NC_017530	GCCC	2	8	532766	532773	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11113	NC_017530	TGA	2	6	532884	532889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010079
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11116	NC_017530	TCG	2	6	533016	533021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010079
11117	NC_017530	AGGC	2	8	533049	533056	25 %	0 %	50 %	25 %	386010079
11118	NC_017530	CCA	2	6	533119	533124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010079
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11120	NC_017530	AAC	2	6	533231	533236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010079
11121	NC_017530	TGG	2	6	533265	533270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010079
11122	NC_017530	CGG	2	6	533455	533460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010079
11123	NC_017530	CCG	2	6	533461	533466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010079
11124	NC_017530	TCG	2	6	533508	533513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010080
11125	NC_017530	TAC	2	6	533527	533532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010080
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11128	NC_017530	TCG	2	6	533643	533648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010080
11129	NC_017530	GTC	2	6	533708	533713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010080
11130	NC_017530	CGG	2	6	533728	533733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010080
11131	NC_017530	GGC	3	9	533782	533790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010080
11132	NC_017530	CTG	2	6	533852	533857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010080
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11136	NC_017530	GGT	2	6	534055	534060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010080
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11138	NC_017530	GCC	2	6	534084	534089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010080
11139	NC_017530	GCTG	2	8	534091	534098	0 %	25 %	50 %	25 %	386010080
11140	NC_017530	TGC	2	6	534102	534107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010080
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11142	NC_017530	CACC	2	8	534177	534184	25 %	0 %	0 %	75 %	386010080
11143	NC_017530	AGAGCC	2	12	534252	534263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010080
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11148	NC_017530	ATG	2	6	534441	534446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010080
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11150	NC_017530	GC	3	6	534592	534597	0 %	0 %	50 %	50 %	386010081
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11153	NC_017530	CAAG	2	8	534725	534732	50 %	0 %	25 %	25 %	386010081
11154	NC_017530	CCTG	2	8	534797	534804	0 %	25 %	25 %	50 %	386010081
11155	NC_017530	ATT	2	6	534824	534829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386010081
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11158	NC_017530	TCG	2	6	534920	534925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010081
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11173	NC_017530	T	6	6	535387	535392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11174	NC_017530	GCCC	2	8	535421	535428	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11175	NC_017530	CAT	2	6	535491	535496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11182	NC_017530	GTCG	2	8	535884	535891	0 %	25 %	50 %	25 %	386010082
11183	NC_017530	TGG	2	6	535952	535957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010082
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11203	NC_017530	T	7	7	536884	536890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11204	NC_017530	GTC	2	6	537107	537112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010084
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11221	NC_017530	GGC	2	6	537983	537988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010085
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11225	NC_017530	GCA	2	6	538097	538102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010085
11226	NC_017530	CAG	2	6	538104	538109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010085
11227	NC_017530	GCCA	3	12	538138	538149	25 %	0 %	25 %	50 %	386010085
11228	NC_017530	GTA	2	6	538164	538169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010085
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11230	NC_017530	CCA	2	6	538203	538208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010085
11231	NC_017530	GCG	2	6	538279	538284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010085
11232	NC_017530	GCG	2	6	538296	538301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010085
11233	NC_017530	GAT	2	6	538350	538355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010085
11234	NC_017530	GC	3	6	538361	538366	0 %	0 %	50 %	50 %	386010085
11235	NC_017530	GCC	2	6	538411	538416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010085
11236	NC_017530	GTG	2	6	538472	538477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010085
11237	NC_017530	GC	4	8	538546	538553	0 %	0 %	50 %	50 %	386010085
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11360	NC_017530	GCG	2	6	544371	544376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010093
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11472	NC_017530	CGTC	2	8	550986	550993	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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11477	NC_017530	AGTCG	2	10	551131	551140	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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11482	NC_017530	TGA	2	6	551544	551549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11483	NC_017530	CGA	2	6	551565	551570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11484	NC_017530	GGT	2	6	551645	551650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11485	NC_017530	GA	3	6	551675	551680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11486	NC_017530	TTA	2	6	551801	551806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11487	NC_017530	CGG	2	6	551925	551930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11488	NC_017530	GGC	2	6	552006	552011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11489	NC_017530	TGAAAT	2	12	552034	552045	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11490	NC_017530	ACC	2	6	552196	552201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11491	NC_017530	TGG	2	6	552256	552261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11492	NC_017530	TCC	2	6	552282	552287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11493	NC_017530	GGA	2	6	552299	552304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11494	NC_017530	GC	3	6	552360	552365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11495	NC_017530	GGT	2	6	552419	552424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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