MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 121084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
112501	NC_017530	GGT	2	6	5330505	5330510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014256
112502	NC_017530	CGCC	2	8	5330533	5330540	0 %	0 %	25 %	75 %	386014256
112503	NC_017530	ACAGCA	2	12	5330574	5330585	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386014256
112504	NC_017530	GCC	2	6	5330590	5330595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014256
112505	NC_017530	AGC	2	6	5330671	5330676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014256
112506	NC_017530	CCT	2	6	5330742	5330747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112507	NC_017530	TGT	2	6	5330765	5330770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112508	NC_017530	TGA	2	6	5330776	5330781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112509	NC_017530	CCG	2	6	5330860	5330865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112510	NC_017530	CTG	2	6	5330869	5330874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112511	NC_017530	ACC	2	6	5330913	5330918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112512	NC_017530	CACC	2	8	5331018	5331025	25 %	0 %	0 %	75 %	386014257
112513	NC_017530	GCTG	2	8	5331075	5331082	0 %	25 %	50 %	25 %	386014257
112514	NC_017530	GCA	2	6	5331111	5331116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014257
112515	NC_017530	CAC	3	9	5331160	5331168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014257
112516	NC_017530	CGC	2	6	5331180	5331185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014257
112517	NC_017530	CAC	2	6	5331195	5331200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014257
112518	NC_017530	GCA	2	6	5331360	5331365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014257
112519	NC_017530	GCT	2	6	5331379	5331384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014257
112520	NC_017530	CAG	2	6	5331443	5331448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014258
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112522	NC_017530	CAA	2	6	5331626	5331631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014258
112523	NC_017530	CAG	2	6	5331653	5331658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014258
112524	NC_017530	CAG	2	6	5331713	5331718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014258
112525	NC_017530	CCA	3	9	5331754	5331762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014258
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112527	NC_017530	GCT	2	6	5331841	5331846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014258
112528	NC_017530	CAG	2	6	5331863	5331868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014258
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112530	NC_017530	CAC	2	6	5331956	5331961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014258
112531	NC_017530	CAG	2	6	5332025	5332030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014258
112532	NC_017530	CAG	2	6	5332055	5332060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014258
112533	NC_017530	GCA	2	6	5332081	5332086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014258
112534	NC_017530	CGC	2	6	5332157	5332162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014258
112535	NC_017530	CCT	2	6	5332345	5332350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386014258
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112537	NC_017530	GCCCA	2	10	5332367	5332376	20 %	0 %	20 %	60 %	386014258
112538	NC_017530	CGG	2	6	5332402	5332407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014258
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112541	NC_017530	GCA	2	6	5332567	5332572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014258
112542	NC_017530	CGG	2	6	5332606	5332611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014258
112543	NC_017530	GCA	2	6	5332657	5332662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014258
112544	NC_017530	GCG	2	6	5332672	5332677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014258
112545	NC_017530	CCA	2	6	5332678	5332683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014258
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112548	NC_017530	CCT	2	6	5332834	5332839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386014258
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112550	NC_017530	GCA	2	6	5332870	5332875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014258
112551	NC_017530	CCT	2	6	5332885	5332890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386014258
112552	NC_017530	GC	3	6	5332893	5332898	0 %	0 %	50 %	50 %	386014258
112553	NC_017530	TGC	2	6	5332962	5332967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014258
112554	NC_017530	GTC	2	6	5333003	5333008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014258
112555	NC_017530	CTG	2	6	5333027	5333032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014258
112556	NC_017530	GCA	2	6	5333071	5333076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014258
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112613	NC_017530	GCC	2	6	5335098	5335103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014258
112614	NC_017530	TCA	2	6	5335215	5335220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014258
112615	NC_017530	CGG	2	6	5335223	5335228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014258
112616	NC_017530	TCC	2	6	5335233	5335238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386014258
112617	NC_017530	TGC	2	6	5335242	5335247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014258
112618	NC_017530	GCA	2	6	5335300	5335305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014258
112619	NC_017530	CTG	2	6	5335331	5335336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014258
112620	NC_017530	CAG	2	6	5335337	5335342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014258
112621	NC_017530	ATTC	2	8	5335432	5335439	25 %	50 %	0 %	25 %	386014258
112622	NC_017530	TCC	2	6	5335497	5335502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386014258
112623	NC_017530	CAG	2	6	5335541	5335546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014258
112624	NC_017530	CATC	2	8	5335558	5335565	25 %	25 %	0 %	50 %	386014258
112625	NC_017530	CGT	2	6	5335573	5335578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014258
112626	NC_017530	CCGC	2	8	5335582	5335589	0 %	0 %	25 %	75 %	386014258
112627	NC_017530	GAT	2	6	5335628	5335633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014258
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112632	NC_017530	GTC	2	6	5335775	5335780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014258
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112639	NC_017530	GCA	2	6	5335975	5335980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014258
112640	NC_017530	CTC	2	6	5336123	5336128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386014258
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112651	NC_017530	CGGC	2	8	5336793	5336800	0 %	0 %	50 %	50 %	386014259
112652	NC_017530	GGC	2	6	5336825	5336830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014259
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112654	NC_017530	GTC	2	6	5336864	5336869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014259
112655	NC_017530	TGT	2	6	5336956	5336961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014259
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112664	NC_017530	CTG	2	6	5337353	5337358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014259
112665	NC_017530	CGTT	2	8	5337363	5337370	0 %	50 %	25 %	25 %	386014259
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112670	NC_017530	GCCA	2	8	5337494	5337501	25 %	0 %	25 %	50 %	386014259
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112674	NC_017530	GCC	2	6	5337780	5337785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014259
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112683	NC_017530	AGGATC	2	12	5338323	5338334	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386014259
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112685	NC_017530	GCG	3	9	5338551	5338559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014260
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112687	NC_017530	CGA	2	6	5338620	5338625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014260
112688	NC_017530	GTC	2	6	5338630	5338635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014260
112689	NC_017530	CCAGCA	2	12	5338641	5338652	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386014260
112690	NC_017530	CGC	2	6	5338655	5338660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014260
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112692	NC_017530	GAA	2	6	5338690	5338695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014260
112693	NC_017530	GCA	2	6	5338794	5338799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014260
112694	NC_017530	CGA	2	6	5338824	5338829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014260
112695	NC_017530	CTG	2	6	5338867	5338872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014260
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112700	NC_017530	CTT	2	6	5338994	5338999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014261
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112703	NC_017530	TGG	2	6	5339096	5339101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014261
112704	NC_017530	GGGCCA	2	12	5339222	5339233	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386014261
112705	NC_017530	GTC	2	6	5339319	5339324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014261
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112708	NC_017530	ACC	2	6	5339499	5339504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014262
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112710	NC_017530	TGT	2	6	5339575	5339580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014262
112711	NC_017530	CGA	2	6	5339632	5339637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014262
112712	NC_017530	CGA	2	6	5339659	5339664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014262
112713	NC_017530	GCG	2	6	5339741	5339746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112714	NC_017530	TCG	2	6	5339760	5339765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112715	NC_017530	ATCACC	2	12	5339766	5339777	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
112716	NC_017530	GTT	2	6	5339785	5339790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112717	NC_017530	AGC	2	6	5339849	5339854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112718	NC_017530	TTTC	2	8	5339988	5339995	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
112719	NC_017530	GCC	2	6	5340014	5340019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112720	NC_017530	C	6	6	5340027	5340032	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
112721	NC_017530	AAG	2	6	5340084	5340089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014263
112722	NC_017530	TGC	2	6	5340106	5340111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014263
112723	NC_017530	GCC	2	6	5340114	5340119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014263
112724	NC_017530	AAGGC	2	10	5340175	5340184	40 %	0 %	40 %	20 %	386014263
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112726	NC_017530	CTG	2	6	5340336	5340341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014263
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