MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 121084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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112115	NC_017530	CCTGG	2	10	5312714	5312723	0 %	20 %	40 %	40 %	386014241
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112215	NC_017530	TCG	2	6	5317254	5317259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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112218	NC_017530	GCTC	2	8	5317408	5317415	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112219	NC_017530	CTG	2	6	5317491	5317496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014246
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112230	NC_017530	GGT	2	6	5317889	5317894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014246
112231	NC_017530	CTG	2	6	5317907	5317912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014246
112232	NC_017530	AAG	2	6	5317916	5317921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014246
112233	NC_017530	ACC	3	9	5317964	5317972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014246
112234	NC_017530	CTG	2	6	5317985	5317990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014246
112235	NC_017530	TCAACG	2	12	5318028	5318039	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386014246
112236	NC_017530	ACA	2	6	5318064	5318069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014246
112237	NC_017530	ACC	2	6	5318118	5318123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014246
112238	NC_017530	ACG	2	6	5318298	5318303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014246
112239	NC_017530	CTG	2	6	5318330	5318335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014246
112240	NC_017530	ACC	3	9	5318357	5318365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014246
112241	NC_017530	AACGTC	2	12	5318369	5318380	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386014246
112242	NC_017530	ACG	2	6	5318553	5318558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014246
112243	NC_017530	CTG	2	6	5318570	5318575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014246
112244	NC_017530	GCC	2	6	5318583	5318588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014246
112245	NC_017530	CAT	2	6	5318626	5318631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014246
112246	NC_017530	GCCG	2	8	5318698	5318705	0 %	0 %	50 %	50 %	386014246
112247	NC_017530	AAAG	2	8	5318707	5318714	75 %	0 %	25 %	0 %	386014246
112248	NC_017530	TGC	2	6	5318736	5318741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014246
112249	NC_017530	GAA	2	6	5318743	5318748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014246
112250	NC_017530	CGA	2	6	5318752	5318757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014246
112251	NC_017530	CGG	2	6	5318788	5318793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014246
112252	NC_017530	AGC	2	6	5318814	5318819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014246
112253	NC_017530	CTA	2	6	5318875	5318880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014246
112254	NC_017530	GCG	2	6	5318903	5318908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112255	NC_017530	ACG	2	6	5318951	5318956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112256	NC_017530	GCC	2	6	5319003	5319008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112257	NC_017530	TTG	2	6	5319015	5319020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112258	NC_017530	CGC	2	6	5319048	5319053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014247
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112260	NC_017530	CGCC	2	8	5319113	5319120	0 %	0 %	25 %	75 %	386014247
112261	NC_017530	CTT	2	6	5319143	5319148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014247
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112281	NC_017530	TGCC	2	8	5319967	5319974	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112282	NC_017530	GCA	2	6	5319977	5319982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014248
112283	NC_017530	GCAGC	2	10	5320084	5320093	20 %	0 %	40 %	40 %	386014248
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112291	NC_017530	CTG	2	6	5320407	5320412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014248
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112302	NC_017530	ATCG	2	8	5321169	5321176	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112303	NC_017530	TCC	2	6	5321249	5321254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112304	NC_017530	CGA	2	6	5321307	5321312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014249
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112319	NC_017530	GCCCA	2	10	5322199	5322208	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
112320	NC_017530	TC	3	6	5322248	5322253	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112321	NC_017530	CCG	2	6	5322325	5322330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014250
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112328	NC_017530	ACG	2	6	5322742	5322747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014250
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112331	NC_017530	CCG	2	6	5322873	5322878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014250
112332	NC_017530	ACC	2	6	5322882	5322887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014250
112333	NC_017530	AGC	2	6	5322901	5322906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014250
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112335	NC_017530	GCCA	2	8	5322924	5322931	25 %	0 %	25 %	50 %	386014250
112336	NC_017530	GGTGTT	2	12	5322980	5322991	0 %	50 %	50 %	0 %	386014250
112337	NC_017530	CCG	3	9	5323051	5323059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014250
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112339	NC_017530	GAG	2	6	5323215	5323220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386014250
112340	NC_017530	GCT	2	6	5323304	5323309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014250
112341	NC_017530	AGC	2	6	5323333	5323338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014250
112342	NC_017530	GCCA	2	8	5323371	5323378	25 %	0 %	25 %	50 %	386014250
112343	NC_017530	AAC	2	6	5323419	5323424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014250
112344	NC_017530	CGG	2	6	5323430	5323435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014250
112345	NC_017530	GGT	2	6	5323461	5323466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014250
112346	NC_017530	CGG	2	6	5323478	5323483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014250
112347	NC_017530	GCA	2	6	5323520	5323525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014250
112348	NC_017530	GAC	2	6	5323542	5323547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014250
112349	NC_017530	GCG	2	6	5323558	5323563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014250
112350	NC_017530	AGC	2	6	5323567	5323572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014250
112351	NC_017530	AAG	2	6	5323593	5323598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014250
112352	NC_017530	GCA	2	6	5323607	5323612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014250
112353	NC_017530	CAG	2	6	5323616	5323621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014250
112354	NC_017530	GCC	2	6	5323637	5323642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014250
112355	NC_017530	GAA	2	6	5323659	5323664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014250
112356	NC_017530	GAC	2	6	5323671	5323676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014250
112357	NC_017530	CCG	2	6	5323745	5323750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014250
112358	NC_017530	GTG	2	6	5323756	5323761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014250
112359	NC_017530	GGCAA	2	10	5323777	5323786	40 %	0 %	40 %	20 %	386014250
112360	NC_017530	GCA	2	6	5323795	5323800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014250
112361	NC_017530	GGC	2	6	5323806	5323811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014250
112362	NC_017530	GGC	2	6	5323830	5323835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014250
112363	NC_017530	GTG	2	6	5323846	5323851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014250
112364	NC_017530	CGCC	2	8	5323863	5323870	0 %	0 %	25 %	75 %	386014250
112365	NC_017530	CAA	2	6	5323877	5323882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014250
112366	NC_017530	CGT	2	6	5323896	5323901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014250
112367	NC_017530	GGC	2	6	5323905	5323910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014250
112368	NC_017530	TGC	2	6	5323940	5323945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014250
112369	NC_017530	GCCG	2	8	5323955	5323962	0 %	0 %	50 %	50 %	386014250
112370	NC_017530	GCC	2	6	5324062	5324067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014250
112371	NC_017530	GCT	2	6	5324087	5324092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014250
112372	NC_017530	GA	3	6	5324107	5324112	50 %	0 %	50 %	0 %	386014250
112373	NC_017530	GCT	2	6	5324125	5324130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112374	NC_017530	TCCAGG	2	12	5324280	5324291	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386014251
112375	NC_017530	CGT	2	6	5324342	5324347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014251
112376	NC_017530	GC	3	6	5324364	5324369	0 %	0 %	50 %	50 %	386014251
112377	NC_017530	CAC	2	6	5324371	5324376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014251
112378	NC_017530	TGG	2	6	5324494	5324499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014251
112379	NC_017530	CTT	2	6	5324522	5324527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014251
112380	NC_017530	AACG	2	8	5324717	5324724	50 %	0 %	25 %	25 %	386014251
112381	NC_017530	CCTT	2	8	5324733	5324740	0 %	50 %	0 %	50 %	386014251
112382	NC_017530	TGGCC	2	10	5324764	5324773	0 %	20 %	40 %	40 %	386014251
112383	NC_017530	AG	3	6	5324777	5324782	50 %	0 %	50 %	0 %	386014251
112384	NC_017530	TTCC	2	8	5324832	5324839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112385	NC_017530	ATG	2	6	5324911	5324916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014252
112386	NC_017530	GCA	2	6	5324937	5324942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014252
112387	NC_017530	AGCC	2	8	5324965	5324972	25 %	0 %	25 %	50 %	386014252
112388	NC_017530	CAGG	2	8	5325006	5325013	25 %	0 %	50 %	25 %	386014252
112389	NC_017530	CGG	2	6	5325069	5325074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014252
112390	NC_017530	GCC	2	6	5325143	5325148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014252
112391	NC_017530	TGGT	3	12	5325167	5325178	0 %	50 %	50 %	0 %	386014252
112392	NC_017530	TGG	2	6	5325184	5325189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014252
112393	NC_017530	TGA	2	6	5325195	5325200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014252
112394	NC_017530	GCA	3	9	5325216	5325224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014252
112395	NC_017530	CAG	2	6	5325232	5325237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014252
112396	NC_017530	GTA	2	6	5325289	5325294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014252
112397	NC_017530	GAT	2	6	5325364	5325369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014252
112398	NC_017530	GAA	2	6	5325462	5325467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112399	NC_017530	A	6	6	5325474	5325479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112400	NC_017530	TAG	2	6	5325546	5325551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112401	NC_017530	ATCA	2	8	5325601	5325608	50 %	25 %	0 %	25 %	386014253
112402	NC_017530	CTT	2	6	5325639	5325644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014253
112403	NC_017530	GGTC	2	8	5325650	5325657	0 %	25 %	50 %	25 %	386014253
112404	NC_017530	CTT	2	6	5325669	5325674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014253
112405	NC_017530	GGCT	2	8	5325693	5325700	0 %	25 %	50 %	25 %	386014253
112406	NC_017530	GCC	2	6	5325751	5325756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014253
112407	NC_017530	CAGGCG	2	12	5325770	5325781	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386014253
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112411	NC_017530	GAA	2	6	5326008	5326013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014253
112412	NC_017530	GGC	2	6	5326032	5326037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014253
112413	NC_017530	GCC	3	9	5326048	5326056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014253
112414	NC_017530	CTGG	2	8	5326113	5326120	0 %	25 %	50 %	25 %	386014253
112415	NC_017530	CAC	2	6	5326268	5326273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014253
112416	NC_017530	CAC	2	6	5326322	5326327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014253
112417	NC_017530	GCA	2	6	5326397	5326402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014253
112418	NC_017530	CAC	2	6	5326431	5326436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014253
112419	NC_017530	C	8	8	5326442	5326449	0 %	0 %	0 %	100 %	386014253
112420	NC_017530	GCC	2	6	5326591	5326596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014253
112421	NC_017530	GCTG	2	8	5326601	5326608	0 %	25 %	50 %	25 %	386014253
112422	NC_017530	CCAGG	2	10	5326610	5326619	20 %	0 %	40 %	40 %	386014253
112423	NC_017530	GC	3	6	5326642	5326647	0 %	0 %	50 %	50 %	386014253
112424	NC_017530	GCT	2	6	5326766	5326771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014253
112425	NC_017530	GC	3	6	5326812	5326817	0 %	0 %	50 %	50 %	386014253
112426	NC_017530	GC	3	6	5326819	5326824	0 %	0 %	50 %	50 %	386014253
112427	NC_017530	GGTCGC	2	12	5326826	5326837	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386014253
112428	NC_017530	CGC	2	6	5326841	5326846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014253
112429	NC_017530	CTG	2	6	5326860	5326865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014253
112430	NC_017530	CAG	2	6	5326875	5326880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014253
112431	NC_017530	CTG	2	6	5326917	5326922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014253
112432	NC_017530	GCAGTT	2	12	5326949	5326960	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386014253
112433	NC_017530	CCAG	2	8	5326964	5326971	25 %	0 %	25 %	50 %	386014253
112434	NC_017530	ATCG	2	8	5327034	5327041	25 %	25 %	25 %	25 %	386014253
112435	NC_017530	TGG	2	6	5327105	5327110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014253
112436	NC_017530	TGG	2	6	5327255	5327260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014253
112437	NC_017530	CGCC	2	8	5327272	5327279	0 %	0 %	25 %	75 %	386014253
112438	NC_017530	CAG	2	6	5327298	5327303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014253
112439	NC_017530	C	6	6	5327362	5327367	0 %	0 %	0 %	100 %	386014253
112440	NC_017530	GTCTT	2	10	5327386	5327395	0 %	60 %	20 %	20 %	386014253
112441	NC_017530	CAGCG	2	10	5327400	5327409	20 %	0 %	40 %	40 %	386014253
112442	NC_017530	AC	3	6	5327417	5327422	50 %	0 %	0 %	50 %	386014253
112443	NC_017530	CAAT	2	8	5327423	5327430	50 %	25 %	0 %	25 %	386014253
112444	NC_017530	AGC	3	9	5327454	5327462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014253
112445	NC_017530	CA	3	6	5327616	5327621	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112446	NC_017530	GCA	2	6	5327721	5327726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112447	NC_017530	CCTGC	2	10	5327773	5327782	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
112448	NC_017530	CGC	2	6	5327813	5327818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112449	NC_017530	AGC	2	6	5327914	5327919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014254
112450	NC_017530	GCG	2	6	5327941	5327946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014254
112451	NC_017530	AGC	2	6	5327997	5328002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014254
112452	NC_017530	TGG	2	6	5328003	5328008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014254
112453	NC_017530	TCA	2	6	5328101	5328106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014254
112454	NC_017530	CCGG	2	8	5328147	5328154	0 %	0 %	50 %	50 %	386014254
112455	NC_017530	GT	3	6	5328163	5328168	0 %	50 %	50 %	0 %	386014254
112456	NC_017530	TCG	2	6	5328186	5328191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014254
112457	NC_017530	ACT	2	6	5328223	5328228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014254
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