MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 121084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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111502	NC_017530	GGT	2	6	5283020	5283025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014216
111503	NC_017530	CGG	2	6	5283055	5283060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014216
111504	NC_017530	CCCG	2	8	5283090	5283097	0 %	0 %	25 %	75 %	386014216
111505	NC_017530	GCC	2	6	5283111	5283116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014216
111506	NC_017530	CAG	3	9	5283122	5283130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014216
111507	NC_017530	AAC	2	6	5283209	5283214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014216
111508	NC_017530	GCCA	2	8	5283251	5283258	25 %	0 %	25 %	50 %	386014216
111509	NC_017530	TCGC	2	8	5283273	5283280	0 %	25 %	25 %	50 %	386014216
111510	NC_017530	CTG	2	6	5283281	5283286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014216
111511	NC_017530	CTG	2	6	5283368	5283373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014216
111512	NC_017530	CGC	2	6	5283382	5283387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014216
111513	NC_017530	CGG	2	6	5283408	5283413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014216
111514	NC_017530	GC	3	6	5283445	5283450	0 %	0 %	50 %	50 %	386014216
111515	NC_017530	CCA	2	6	5283532	5283537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014216
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111517	NC_017530	CAG	2	6	5283569	5283574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014216
111518	NC_017530	GC	3	6	5283661	5283666	0 %	0 %	50 %	50 %	386014216
111519	NC_017530	GCG	2	6	5283686	5283691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014216
111520	NC_017530	GGT	2	6	5283692	5283697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014216
111521	NC_017530	TGA	2	6	5283708	5283713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014216
111522	NC_017530	GTT	2	6	5283734	5283739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111523	NC_017530	GAA	3	9	5283740	5283748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111524	NC_017530	T	6	6	5283767	5283772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111525	NC_017530	TCT	2	6	5283850	5283855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111526	NC_017530	GTT	2	6	5283856	5283861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111527	NC_017530	CGT	2	6	5283955	5283960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111528	NC_017530	CTG	2	6	5283992	5283997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111529	NC_017530	C	6	6	5284006	5284011	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
111530	NC_017530	GCC	2	6	5284025	5284030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111531	NC_017530	ACC	2	6	5284031	5284036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111532	NC_017530	TGG	2	6	5284059	5284064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111533	NC_017530	AC	3	6	5284065	5284070	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111534	NC_017530	CAGA	2	8	5284123	5284130	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111535	NC_017530	A	6	6	5284137	5284142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111536	NC_017530	GCA	2	6	5284148	5284153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111537	NC_017530	CAGA	2	8	5284232	5284239	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111538	NC_017530	TGC	2	6	5284297	5284302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014217
111539	NC_017530	CCTTC	2	10	5284362	5284371	0 %	40 %	0 %	60 %	386014217
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111545	NC_017530	AAAG	2	8	5284723	5284730	75 %	0 %	25 %	0 %	386014217
111546	NC_017530	GAA	2	6	5284762	5284767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014217
111547	NC_017530	GCA	2	6	5284881	5284886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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111549	NC_017530	CAC	2	6	5285039	5285044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111550	NC_017530	GCA	2	6	5285057	5285062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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111554	NC_017530	CG	3	6	5285294	5285299	0 %	0 %	50 %	50 %	386014218
111555	NC_017530	CCG	2	6	5285322	5285327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014218
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111560	NC_017530	TCG	2	6	5285594	5285599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014218
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111616	NC_017530	GGA	2	6	5288346	5288351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386014219
111617	NC_017530	TGA	2	6	5288358	5288363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014219
111618	NC_017530	GGCG	2	8	5288410	5288417	0 %	0 %	75 %	25 %	386014220
111619	NC_017530	GCC	2	6	5288538	5288543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014220
111620	NC_017530	AGC	2	6	5288613	5288618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014220
111621	NC_017530	CTG	2	6	5288735	5288740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014220
111622	NC_017530	GACCTG	2	12	5288756	5288767	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386014220
111623	NC_017530	TA	3	6	5288773	5288778	50 %	50 %	0 %	0 %	386014220
111624	NC_017530	CGC	2	6	5288779	5288784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014220
111625	NC_017530	CGA	2	6	5288926	5288931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014220
111626	NC_017530	CGG	2	6	5288985	5288990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014220
111627	NC_017530	TGT	2	6	5289057	5289062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014220
111628	NC_017530	CGC	2	6	5289210	5289215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014220
111629	NC_017530	ACT	2	6	5289423	5289428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014220
111630	NC_017530	GCG	2	6	5289440	5289445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014220
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111632	NC_017530	CAGC	2	8	5289553	5289560	25 %	0 %	25 %	50 %	386014220
111633	NC_017530	GGA	2	6	5289562	5289567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386014220
111634	NC_017530	GAT	2	6	5289586	5289591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014220
111635	NC_017530	CCTGAC	2	12	5289661	5289672	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386014220
111636	NC_017530	CCGC	2	8	5289820	5289827	0 %	0 %	25 %	75 %	386014221
111637	NC_017530	GTG	2	6	5289840	5289845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014221
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111639	NC_017530	ACTGC	2	10	5289891	5289900	20 %	20 %	20 %	40 %	386014221
111640	NC_017530	CTG	2	6	5289978	5289983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014221
111641	NC_017530	CCGA	2	8	5290006	5290013	25 %	0 %	25 %	50 %	386014221
111642	NC_017530	TCT	2	6	5290030	5290035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014221
111643	NC_017530	GCT	2	6	5290067	5290072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014221
111644	NC_017530	GCA	2	6	5290077	5290082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014221
111645	NC_017530	TGC	2	6	5290144	5290149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014221
111646	NC_017530	TGG	2	6	5290162	5290167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014221
111647	NC_017530	TGC	2	6	5290168	5290173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014221
111648	NC_017530	GC	3	6	5290172	5290177	0 %	0 %	50 %	50 %	386014221
111649	NC_017530	TCA	2	6	5290213	5290218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014221
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111651	NC_017530	GGCT	2	8	5290263	5290270	0 %	25 %	50 %	25 %	386014221
111652	NC_017530	GCG	2	6	5290366	5290371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014221
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111654	NC_017530	CTG	2	6	5290404	5290409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014221
111655	NC_017530	TGC	2	6	5290489	5290494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014221
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111658	NC_017530	TCGC	2	8	5290618	5290625	0 %	25 %	25 %	50 %	386014221
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111660	NC_017530	TGC	3	9	5290660	5290668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014221
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111667	NC_017530	GCT	2	6	5290865	5290870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014221
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111671	NC_017530	CTG	2	6	5290980	5290985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014221
111672	NC_017530	GGT	2	6	5290988	5290993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014221
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111677	NC_017530	GACG	2	8	5291168	5291175	25 %	0 %	50 %	25 %	386014221
111678	NC_017530	CGT	2	6	5291187	5291192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014221
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111681	NC_017530	ACC	2	6	5291284	5291289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014222
111682	NC_017530	GCCT	2	8	5291387	5291394	0 %	25 %	25 %	50 %	386014222
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111685	NC_017530	ACA	2	6	5291585	5291590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014222
111686	NC_017530	GCG	3	9	5291609	5291617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014222
111687	NC_017530	TCGCT	2	10	5291636	5291645	0 %	40 %	20 %	40 %	386014222
111688	NC_017530	GC	3	6	5291654	5291659	0 %	0 %	50 %	50 %	386014222
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111692	NC_017530	CAT	2	6	5291796	5291801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014222
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111694	NC_017530	CTG	2	6	5291830	5291835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014222
111695	NC_017530	CGGC	2	8	5291852	5291859	0 %	0 %	50 %	50 %	386014222
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111699	NC_017530	GCA	2	6	5291964	5291969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014222
111700	NC_017530	CCGC	2	8	5292006	5292013	0 %	0 %	25 %	75 %	386014222
111701	NC_017530	AGC	2	6	5292041	5292046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014222
111702	NC_017530	TCG	2	6	5292086	5292091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014222
111703	NC_017530	GCA	2	6	5292158	5292163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014222
111704	NC_017530	TGG	2	6	5292173	5292178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014222
111705	NC_017530	CG	4	8	5292192	5292199	0 %	0 %	50 %	50 %	386014222
111706	NC_017530	TCA	2	6	5292227	5292232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014222
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111708	NC_017530	AGA	2	6	5292368	5292373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014222
111709	NC_017530	CGCTG	2	10	5292377	5292386	0 %	20 %	40 %	40 %	386014222
111710	NC_017530	GCG	2	6	5292416	5292421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014222
111711	NC_017530	CTG	2	6	5292427	5292432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014222
111712	NC_017530	GCAA	2	8	5292530	5292537	50 %	0 %	25 %	25 %	386014222
111713	NC_017530	CATCG	2	10	5292725	5292734	20 %	20 %	20 %	40 %	386014223
111714	NC_017530	ATC	2	6	5292806	5292811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014223
111715	NC_017530	GGCGCC	2	12	5292815	5292826	0 %	0 %	50 %	50 %	386014223
111716	NC_017530	GCC	2	6	5292864	5292869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014223
111717	NC_017530	CTG	2	6	5292875	5292880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014223
111718	NC_017530	CAA	2	6	5292892	5292897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014223
111719	NC_017530	CGG	3	9	5292922	5292930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014223
111720	NC_017530	GGCGT	2	10	5293055	5293064	0 %	20 %	60 %	20 %	386014223
111721	NC_017530	GAA	2	6	5293072	5293077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014223
111722	NC_017530	ACA	2	6	5293098	5293103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014223
111723	NC_017530	TGC	2	6	5293125	5293130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014223
111724	NC_017530	CGA	2	6	5293141	5293146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014223
111725	NC_017530	CTG	2	6	5293211	5293216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014223
111726	NC_017530	GCG	2	6	5293224	5293229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014223
111727	NC_017530	CGG	2	6	5293264	5293269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014223
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111729	NC_017530	CTG	2	6	5293469	5293474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014223
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111844	NC_017530	CTT	2	6	5299072	5299077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014229
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111955	NC_017530	CGA	2	6	5304762	5304767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014234
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