MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 121084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
111001	NC_017530	CA	3	6	5258185	5258190	50 %	0 %	0 %	50 %	386014197
111002	NC_017530	GCC	2	6	5258199	5258204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014197
111003	NC_017530	C	7	7	5258203	5258209	0 %	0 %	0 %	100 %	386014197
111004	NC_017530	GC	3	6	5258230	5258235	0 %	0 %	50 %	50 %	386014197
111005	NC_017530	GCA	2	6	5258237	5258242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014197
111006	NC_017530	TCG	2	6	5258248	5258253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014197
111007	NC_017530	GC	3	6	5258430	5258435	0 %	0 %	50 %	50 %	386014197
111008	NC_017530	ATG	3	9	5258506	5258514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014197
111009	NC_017530	CGC	2	6	5258550	5258555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014197
111010	NC_017530	TGC	2	6	5258584	5258589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014197
111011	NC_017530	CG	3	6	5258591	5258596	0 %	0 %	50 %	50 %	386014197
111012	NC_017530	TCG	2	6	5258599	5258604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014197
111013	NC_017530	GCAC	2	8	5258689	5258696	25 %	0 %	25 %	50 %	386014197
111014	NC_017530	GCA	2	6	5258707	5258712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014197
111015	NC_017530	ACC	2	6	5258748	5258753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014197
111016	NC_017530	AAAGC	2	10	5258776	5258785	60 %	0 %	20 %	20 %	386014197
111017	NC_017530	GC	5	10	5258820	5258829	0 %	0 %	50 %	50 %	386014197
111018	NC_017530	GCGCA	2	10	5258838	5258847	20 %	0 %	40 %	40 %	386014197
111019	NC_017530	AG	3	6	5258882	5258887	50 %	0 %	50 %	0 %	386014197
111020	NC_017530	GGC	2	6	5258898	5258903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111021	NC_017530	CG	3	6	5258918	5258923	0 %	0 %	50 %	50 %	386014198
111022	NC_017530	GCCA	2	8	5258946	5258953	25 %	0 %	25 %	50 %	386014198
111023	NC_017530	GCCAG	2	10	5258986	5258995	20 %	0 %	40 %	40 %	386014198
111024	NC_017530	CCA	2	6	5259001	5259006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014198
111025	NC_017530	CGG	2	6	5259011	5259016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014198
111026	NC_017530	CAC	2	6	5259068	5259073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014198
111027	NC_017530	GCCCA	2	10	5259090	5259099	20 %	0 %	20 %	60 %	386014198
111028	NC_017530	AGT	2	6	5259111	5259116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014198
111029	NC_017530	TGT	2	6	5259189	5259194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014198
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111031	NC_017530	CGCC	2	8	5259250	5259257	0 %	0 %	25 %	75 %	386014198
111032	NC_017530	GGA	2	6	5259340	5259345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386014198
111033	NC_017530	GC	3	6	5259363	5259368	0 %	0 %	50 %	50 %	386014198
111034	NC_017530	CCA	2	6	5259373	5259378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014198
111035	NC_017530	GC	3	6	5259383	5259388	0 %	0 %	50 %	50 %	386014198
111036	NC_017530	TCG	2	6	5259450	5259455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014198
111037	NC_017530	GCA	2	6	5259505	5259510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014198
111038	NC_017530	CCT	2	6	5259514	5259519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386014198
111039	NC_017530	CAGGGC	2	12	5259530	5259541	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386014198
111040	NC_017530	GCCG	2	8	5259625	5259632	0 %	0 %	50 %	50 %	386014198
111041	NC_017530	CTG	2	6	5259633	5259638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014198
111042	NC_017530	AGC	2	6	5259672	5259677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014198
111043	NC_017530	CTG	2	6	5259687	5259692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014198
111044	NC_017530	TGC	2	6	5259711	5259716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014198
111045	NC_017530	GGA	2	6	5259873	5259878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111046	NC_017530	ACCT	2	8	5259898	5259905	25 %	25 %	0 %	50 %	386014199
111047	NC_017530	CGC	2	6	5259971	5259976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014199
111048	NC_017530	CTG	2	6	5259982	5259987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014199
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111050	NC_017530	TGG	2	6	5260031	5260036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014199
111051	NC_017530	GCA	2	6	5260040	5260045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014199
111052	NC_017530	GGC	2	6	5260104	5260109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014199
111053	NC_017530	GTGG	2	8	5260168	5260175	0 %	25 %	75 %	0 %	386014199
111054	NC_017530	GTG	3	9	5260177	5260185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014199
111055	NC_017530	CGA	2	6	5260240	5260245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111056	NC_017530	GCCAT	2	10	5260304	5260313	20 %	20 %	20 %	40 %	386014200
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111060	NC_017530	GC	3	6	5260414	5260419	0 %	0 %	50 %	50 %	386014200
111061	NC_017530	GGC	2	6	5260427	5260432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014200
111062	NC_017530	CAT	2	6	5260456	5260461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014200
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111068	NC_017530	TGG	2	6	5260761	5260766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014200
111069	NC_017530	CTG	2	6	5260781	5260786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014200
111070	NC_017530	GAC	2	6	5260880	5260885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014200
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111072	NC_017530	CCCG	2	8	5260980	5260987	0 %	0 %	25 %	75 %	386014200
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111076	NC_017530	CG	3	6	5261148	5261153	0 %	0 %	50 %	50 %	386014200
111077	NC_017530	TGC	2	6	5261170	5261175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014200
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111079	NC_017530	CCTT	2	8	5261295	5261302	0 %	50 %	0 %	50 %	386014200
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111081	NC_017530	CTG	2	6	5261318	5261323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014200
111082	NC_017530	ACTGGC	2	12	5261341	5261352	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386014200
111083	NC_017530	TGC	2	6	5261472	5261477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014200
111084	NC_017530	GCA	2	6	5261519	5261524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014201
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111087	NC_017530	GCT	2	6	5261718	5261723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014201
111088	NC_017530	TGA	2	6	5261736	5261741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014201
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111092	NC_017530	CAG	2	6	5261914	5261919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014201
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111098	NC_017530	AGG	2	6	5262338	5262343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111099	NC_017530	AC	3	6	5262504	5262509	50 %	0 %	0 %	50 %	386014202
111100	NC_017530	GCC	2	6	5262603	5262608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014202
111101	NC_017530	GAG	2	6	5262704	5262709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386014202
111102	NC_017530	CTG	2	6	5262713	5262718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014202
111103	NC_017530	GGGC	2	8	5262739	5262746	0 %	0 %	75 %	25 %	386014202
111104	NC_017530	CGC	3	9	5262778	5262786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014202
111105	NC_017530	TGG	2	6	5263008	5263013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014202
111106	NC_017530	GCCA	2	8	5263065	5263072	25 %	0 %	25 %	50 %	386014202
111107	NC_017530	GTG	2	6	5263169	5263174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014202
111108	NC_017530	AGC	2	6	5263209	5263214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014202
111109	NC_017530	TGG	2	6	5263221	5263226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014202
111110	NC_017530	AAGC	2	8	5263228	5263235	50 %	0 %	25 %	25 %	386014202
111111	NC_017530	GCT	2	6	5263282	5263287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014202
111112	NC_017530	GCC	2	6	5263374	5263379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111113	NC_017530	GCC	2	6	5263472	5263477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014203
111114	NC_017530	CAG	2	6	5263562	5263567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014203
111115	NC_017530	TCGG	2	8	5263657	5263664	0 %	25 %	50 %	25 %	386014203
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111338	NC_017530	TCA	2	6	5275232	5275237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014213
111339	NC_017530	GTA	2	6	5275242	5275247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014213
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111342	NC_017530	ATC	2	6	5275384	5275389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014213
111343	NC_017530	TGG	2	6	5275453	5275458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014213
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111345	NC_017530	CTG	2	6	5275590	5275595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014213
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111455	NC_017530	CTG	2	6	5280836	5280841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014216
111456	NC_017530	GAA	2	6	5280878	5280883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014216
111457	NC_017530	CTGG	3	12	5280941	5280952	0 %	25 %	50 %	25 %	386014216
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111459	NC_017530	TGA	2	6	5281047	5281052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014216
111460	NC_017530	GCT	2	6	5281180	5281185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014216
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111482	NC_017530	TGC	2	6	5282253	5282258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014216
111483	NC_017530	CTG	2	6	5282348	5282353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014216
111484	NC_017530	GCC	2	6	5282370	5282375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014216
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111486	NC_017530	GGC	2	6	5282417	5282422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014216
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111493	NC_017530	TGC	2	6	5282731	5282736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014216
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111497	NC_017530	CCG	2	6	5282845	5282850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014216
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