MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 121084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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110614	NC_017530	CGC	2	6	5239353	5239358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014182
110615	NC_017530	CGC	2	6	5239377	5239382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014182
110616	NC_017530	TCG	2	6	5239393	5239398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014182
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110842	NC_017530	GCT	2	6	5250158	5250163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014190
110843	NC_017530	CGC	2	6	5250166	5250171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014190
110844	NC_017530	CCA	2	6	5250179	5250184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014190
110845	NC_017530	TGC	2	6	5250221	5250226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014190
110846	NC_017530	CAC	2	6	5250264	5250269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014190
110847	NC_017530	GGC	2	6	5250292	5250297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014190
110848	NC_017530	CAGGC	2	10	5250416	5250425	20 %	0 %	40 %	40 %	386014191
110849	NC_017530	CGT	2	6	5250489	5250494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014191
110850	NC_017530	TGC	2	6	5250510	5250515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014191
110851	NC_017530	GT	3	6	5250527	5250532	0 %	50 %	50 %	0 %	386014191
110852	NC_017530	GTG	2	6	5250635	5250640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014191
110853	NC_017530	CAC	2	6	5250658	5250663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014191
110854	NC_017530	GCG	2	6	5250712	5250717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014191
110855	NC_017530	GTG	2	6	5250728	5250733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014191
110856	NC_017530	CAA	2	6	5250745	5250750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014191
110857	NC_017530	CTGC	2	8	5250783	5250790	0 %	25 %	25 %	50 %	386014191
110858	NC_017530	GCA	2	6	5250822	5250827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014191
110859	NC_017530	ATG	2	6	5250886	5250891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014192
110860	NC_017530	TCC	2	6	5250979	5250984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386014192
110861	NC_017530	GCT	2	6	5251011	5251016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014192
110862	NC_017530	GCC	2	6	5251053	5251058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014192
110863	NC_017530	CTT	3	9	5251112	5251120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386014192
110864	NC_017530	GCT	2	6	5251148	5251153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014192
110865	NC_017530	CAC	2	6	5251242	5251247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014192
110866	NC_017530	TCG	2	6	5251249	5251254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014192
110867	NC_017530	CG	3	6	5251253	5251258	0 %	0 %	50 %	50 %	386014192
110868	NC_017530	GCA	2	6	5251271	5251276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014192
110869	NC_017530	GAT	2	6	5251404	5251409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014192
110870	NC_017530	CAG	2	6	5251544	5251549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110871	NC_017530	ATC	2	6	5251628	5251633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110872	NC_017530	TCG	2	6	5251839	5251844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014193
110873	NC_017530	CTG	2	6	5251853	5251858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014193
110874	NC_017530	GCACC	2	10	5251884	5251893	20 %	0 %	20 %	60 %	386014193
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110878	NC_017530	TCA	2	6	5252058	5252063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014193
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110891	NC_017530	AGC	3	9	5252776	5252784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014194
110892	NC_017530	CAG	2	6	5252814	5252819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014194
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110898	NC_017530	AGT	2	6	5252954	5252959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014194
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110901	NC_017530	CAGC	2	8	5253170	5253177	25 %	0 %	25 %	50 %	386014194
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110907	NC_017530	GC	4	8	5253342	5253349	0 %	0 %	50 %	50 %	386014194
110908	NC_017530	CGC	2	6	5253417	5253422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014194
110909	NC_017530	GCA	2	6	5253515	5253520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014194
110910	NC_017530	GCT	2	6	5253581	5253586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014194
110911	NC_017530	GA	3	6	5253608	5253613	50 %	0 %	50 %	0 %	386014194
110912	NC_017530	CTGG	2	8	5253615	5253622	0 %	25 %	50 %	25 %	386014194
110913	NC_017530	GTCATG	2	12	5253628	5253639	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386014194
110914	NC_017530	ACC	2	6	5253668	5253673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110915	NC_017530	TGCT	2	8	5253729	5253736	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110916	NC_017530	TGC	2	6	5253768	5253773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110917	NC_017530	GCTG	2	8	5253794	5253801	0 %	25 %	50 %	25 %	386014195
110918	NC_017530	TCG	2	6	5253976	5253981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014195
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110921	NC_017530	TGA	2	6	5254133	5254138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014195
110922	NC_017530	CGT	2	6	5254151	5254156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014195
110923	NC_017530	ATC	2	6	5254225	5254230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014195
110924	NC_017530	GGT	2	6	5254278	5254283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014195
110925	NC_017530	TCG	2	6	5254312	5254317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014195
110926	NC_017530	GCT	2	6	5254328	5254333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014195
110927	NC_017530	CGT	2	6	5254397	5254402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014195
110928	NC_017530	GCG	2	6	5254456	5254461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014195
110929	NC_017530	CGT	2	6	5254517	5254522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014195
110930	NC_017530	TCG	2	6	5254546	5254551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014195
110931	NC_017530	CAC	2	6	5254591	5254596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014195
110932	NC_017530	GCA	2	6	5254664	5254669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014195
110933	NC_017530	AC	3	6	5254670	5254675	50 %	0 %	0 %	50 %	386014195
110934	NC_017530	AGT	2	6	5254691	5254696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014195
110935	NC_017530	CAGGT	2	10	5254744	5254753	20 %	20 %	40 %	20 %	386014195
110936	NC_017530	TCGA	2	8	5254930	5254937	25 %	25 %	25 %	25 %	386014195
110937	NC_017530	GAT	2	6	5254995	5255000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014195
110938	NC_017530	GGT	2	6	5255018	5255023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014195
110939	NC_017530	CG	3	6	5255043	5255048	0 %	0 %	50 %	50 %	386014195
110940	NC_017530	TTTC	2	8	5255087	5255094	0 %	75 %	0 %	25 %	386014195
110941	NC_017530	CAG	2	6	5255136	5255141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014195
110942	NC_017530	CGG	2	6	5255144	5255149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014195
110943	NC_017530	CCT	2	6	5255156	5255161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386014195
110944	NC_017530	CGG	2	6	5255201	5255206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014195
110945	NC_017530	TGA	2	6	5255207	5255212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014195
110946	NC_017530	GCT	2	6	5255321	5255326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014195
110947	NC_017530	GAT	2	6	5255421	5255426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014195
110948	NC_017530	CGC	2	6	5255486	5255491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014195
110949	NC_017530	TCGG	2	8	5255497	5255504	0 %	25 %	50 %	25 %	386014195
110950	NC_017530	CTG	2	6	5255601	5255606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014195
110951	NC_017530	TCA	2	6	5255654	5255659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014195
110952	NC_017530	CG	3	6	5255711	5255716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110953	NC_017530	GAT	2	6	5255967	5255972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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