MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 121084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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108502	NC_017530	GCC	2	6	5142720	5142725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014092
108503	NC_017530	CCG	2	6	5142751	5142756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014092
108504	NC_017530	CCT	2	6	5142774	5142779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386014092
108505	NC_017530	CTCGAC	2	12	5142819	5142830	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386014092
108506	NC_017530	CCGGCC	2	12	5142864	5142875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014092
108507	NC_017530	GCCA	2	8	5142882	5142889	25 %	0 %	25 %	50 %	386014092
108508	NC_017530	AGA	2	6	5142941	5142946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014092
108509	NC_017530	TGC	2	6	5143009	5143014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014092
108510	NC_017530	GGAACC	2	12	5143016	5143027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014092
108511	NC_017530	GCA	2	6	5143081	5143086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014092
108512	NC_017530	C	6	6	5143113	5143118	0 %	0 %	0 %	100 %	386014092
108513	NC_017530	CGA	2	6	5143214	5143219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014092
108514	NC_017530	GAC	2	6	5143251	5143256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014092
108515	NC_017530	CGA	2	6	5143352	5143357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014092
108516	NC_017530	CTG	2	6	5143407	5143412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014092
108517	NC_017530	CTG	2	6	5143428	5143433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014092
108518	NC_017530	GCC	2	6	5143434	5143439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014092
108519	NC_017530	CTG	2	6	5143443	5143448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014092
108520	NC_017530	CGA	2	6	5143475	5143480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014092
108521	NC_017530	CAG	2	6	5143515	5143520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014092
108522	NC_017530	AGC	2	6	5143578	5143583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014092
108523	NC_017530	TGG	2	6	5143588	5143593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014092
108524	NC_017530	ATC	2	6	5143638	5143643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014092
108525	NC_017530	CCAG	2	8	5143783	5143790	25 %	0 %	25 %	50 %	386014092
108526	NC_017530	GGC	2	6	5143874	5143879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014092
108527	NC_017530	CAG	2	6	5143887	5143892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108528	NC_017530	AAG	2	6	5143906	5143911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108529	NC_017530	TGC	2	6	5143944	5143949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108530	NC_017530	CGG	2	6	5144086	5144091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014093
108531	NC_017530	AC	3	6	5144107	5144112	50 %	0 %	0 %	50 %	386014093
108532	NC_017530	AAC	2	6	5144118	5144123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014093
108533	NC_017530	TGG	2	6	5144197	5144202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014093
108534	NC_017530	AGC	2	6	5144217	5144222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014093
108535	NC_017530	CGG	2	6	5144306	5144311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014093
108536	NC_017530	GAT	2	6	5144321	5144326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014093
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108539	NC_017530	A	7	7	5144396	5144402	100 %	0 %	0 %	0 %	386014093
108540	NC_017530	CAA	2	6	5144408	5144413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014093
108541	NC_017530	GA	3	6	5144435	5144440	50 %	0 %	50 %	0 %	386014093
108542	NC_017530	TCC	2	6	5144461	5144466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386014093
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108549	NC_017530	CG	3	6	5145030	5145035	0 %	0 %	50 %	50 %	386014093
108550	NC_017530	GGAC	2	8	5145071	5145078	25 %	0 %	50 %	25 %	386014093
108551	NC_017530	GAT	2	6	5145097	5145102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108552	NC_017530	AAC	2	6	5145124	5145129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108553	NC_017530	ACT	2	6	5145225	5145230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014094
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108558	NC_017530	T	6	6	5145458	5145463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108559	NC_017530	GACC	2	8	5145496	5145503	25 %	0 %	25 %	50 %	386014095
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108957	NC_017530	GCT	2	6	5163852	5163857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014111
108958	NC_017530	GCC	2	6	5163858	5163863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014111
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108992	NC_017530	CGC	2	6	5165159	5165164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014114
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108999	NC_017530	GAC	2	6	5165629	5165634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014114
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