MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 121084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
108001	NC_017530	ATG	2	6	5120218	5120223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014067
108002	NC_017530	TCGCC	2	10	5120225	5120234	0 %	20 %	20 %	60 %	386014067
108003	NC_017530	GGCTCA	2	12	5120310	5120321	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386014067
108004	NC_017530	GCC	2	6	5120356	5120361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014067
108005	NC_017530	GAC	2	6	5120365	5120370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014067
108006	NC_017530	CCG	2	6	5120385	5120390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014067
108007	NC_017530	TGA	2	6	5120468	5120473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014067
108008	NC_017530	TGA	2	6	5120477	5120482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014067
108009	NC_017530	CTG	2	6	5120527	5120532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014067
108010	NC_017530	CTG	3	9	5120557	5120565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014067
108011	NC_017530	TC	3	6	5120585	5120590	0 %	50 %	0 %	50 %	386014067
108012	NC_017530	GCA	2	6	5120601	5120606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014067
108013	NC_017530	GCC	2	6	5120635	5120640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014067
108014	NC_017530	CGA	2	6	5120652	5120657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014067
108015	NC_017530	TGG	2	6	5120687	5120692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014067
108016	NC_017530	TGCC	2	8	5120729	5120736	0 %	25 %	25 %	50 %	386014067
108017	NC_017530	GAA	2	6	5120749	5120754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014067
108018	NC_017530	GCA	2	6	5120771	5120776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014067
108019	NC_017530	TCG	2	6	5120852	5120857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014067
108020	NC_017530	TGA	2	6	5120863	5120868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014067
108021	NC_017530	CAA	2	6	5120920	5120925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108022	NC_017530	GC	4	8	5121039	5121046	0 %	0 %	50 %	50 %	386014068
108023	NC_017530	GCG	2	6	5121096	5121101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014068
108024	NC_017530	GAGCGC	2	12	5121152	5121163	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386014068
108025	NC_017530	ACA	2	6	5121174	5121179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014068
108026	NC_017530	CCG	2	6	5121192	5121197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014068
108027	NC_017530	ACC	2	6	5121209	5121214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014068
108028	NC_017530	AAC	2	6	5121242	5121247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014068
108029	NC_017530	TGA	2	6	5121255	5121260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014068
108030	NC_017530	CGTG	2	8	5121289	5121296	0 %	25 %	50 %	25 %	386014068
108031	NC_017530	GAA	2	6	5121344	5121349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014068
108032	NC_017530	CGA	2	6	5121433	5121438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014068
108033	NC_017530	GC	3	6	5121439	5121444	0 %	0 %	50 %	50 %	386014068
108034	NC_017530	CGC	2	6	5121476	5121481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014068
108035	NC_017530	CAA	2	6	5121595	5121600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014069
108036	NC_017530	GCG	2	6	5121639	5121644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014069
108037	NC_017530	GCT	2	6	5121652	5121657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014069
108038	NC_017530	CG	3	6	5121691	5121696	0 %	0 %	50 %	50 %	386014069
108039	NC_017530	GCC	2	6	5121798	5121803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014069
108040	NC_017530	CGCTG	2	10	5121850	5121859	0 %	20 %	40 %	40 %	386014069
108041	NC_017530	CCG	2	6	5121879	5121884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014069
108042	NC_017530	GCT	3	9	5121892	5121900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014069
108043	NC_017530	CAG	2	6	5121922	5121927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014069
108044	NC_017530	AGA	2	6	5121933	5121938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014069
108045	NC_017530	GGCC	2	8	5122045	5122052	0 %	0 %	50 %	50 %	386014069
108046	NC_017530	CG	4	8	5122087	5122094	0 %	0 %	50 %	50 %	386014069
108047	NC_017530	CTG	2	6	5122106	5122111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014069
108048	NC_017530	GCT	2	6	5122141	5122146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014069
108049	NC_017530	GCC	2	6	5122300	5122305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014069
108050	NC_017530	CAG	2	6	5122358	5122363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014069
108051	NC_017530	GCCC	3	12	5122403	5122414	0 %	0 %	25 %	75 %	386014069
108052	NC_017530	CTG	2	6	5122484	5122489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014069
108053	NC_017530	TGGC	2	8	5122575	5122582	0 %	25 %	50 %	25 %	386014069
108054	NC_017530	GGCC	2	8	5122646	5122653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108055	NC_017530	CTG	2	6	5122654	5122659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108056	NC_017530	CCG	2	6	5122672	5122677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108057	NC_017530	GCC	2	6	5122687	5122692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108058	NC_017530	CAAT	2	8	5122753	5122760	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108059	NC_017530	G	6	6	5122776	5122781	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
108060	NC_017530	ACCC	2	8	5122800	5122807	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
108061	NC_017530	CAA	2	6	5122854	5122859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014070
108062	NC_017530	GCC	2	6	5122895	5122900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014070
108063	NC_017530	CCG	2	6	5122932	5122937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014070
108064	NC_017530	GA	3	6	5122953	5122958	50 %	0 %	50 %	0 %	386014070
108065	NC_017530	ATGGT	2	10	5123009	5123018	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
108066	NC_017530	ACCTG	2	10	5123023	5123032	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
108067	NC_017530	CCG	3	9	5123141	5123149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014071
108068	NC_017530	CCCAA	2	10	5123171	5123180	40 %	0 %	0 %	60 %	386014071
108069	NC_017530	GTG	2	6	5123185	5123190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014071
108070	NC_017530	AGCC	2	8	5123365	5123372	25 %	0 %	25 %	50 %	386014071
108071	NC_017530	AAG	2	6	5123440	5123445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014071
108072	NC_017530	CTG	2	6	5123446	5123451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014071
108073	NC_017530	GCT	2	6	5123466	5123471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014071
108074	NC_017530	GCA	2	6	5123558	5123563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014071
108075	NC_017530	CGCT	2	8	5123575	5123582	0 %	25 %	25 %	50 %	386014071
108076	NC_017530	GCC	3	9	5123603	5123611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014071
108077	NC_017530	ATC	2	6	5123650	5123655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014071
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108082	NC_017530	AGTG	2	8	5123928	5123935	25 %	25 %	50 %	0 %	386014071
108083	NC_017530	TGGC	2	8	5123938	5123945	0 %	25 %	50 %	25 %	386014071
108084	NC_017530	CAG	2	6	5123963	5123968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014071
108085	NC_017530	GCC	2	6	5124004	5124009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014071
108086	NC_017530	CTG	3	9	5124010	5124018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014071
108087	NC_017530	CCGG	2	8	5124019	5124026	0 %	0 %	50 %	50 %	386014071
108088	NC_017530	ACA	2	6	5124080	5124085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014071
108089	NC_017530	TCG	2	6	5124088	5124093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014071
108090	NC_017530	AGCG	2	8	5124190	5124197	25 %	0 %	50 %	25 %	386014071
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108099	NC_017530	TGCC	2	8	5124627	5124634	0 %	25 %	25 %	50 %	386014072
108100	NC_017530	CAG	2	6	5124649	5124654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014072
108101	NC_017530	C	6	6	5124764	5124769	0 %	0 %	0 %	100 %	386014072
108102	NC_017530	AGC	2	6	5124770	5124775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014072
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108107	NC_017530	TCGG	2	8	5124884	5124891	0 %	25 %	50 %	25 %	386014072
108108	NC_017530	TGC	2	6	5125059	5125064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014072
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108110	NC_017530	TGCA	2	8	5125117	5125124	25 %	25 %	25 %	25 %	386014072
108111	NC_017530	GCCGC	2	10	5125245	5125254	0 %	0 %	40 %	60 %	386014072
108112	NC_017530	CCG	2	6	5125257	5125262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014072
108113	NC_017530	GGGT	2	8	5125308	5125315	0 %	25 %	75 %	0 %	386014072
108114	NC_017530	ACAA	2	8	5125364	5125371	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
108115	NC_017530	ATGCCG	2	12	5125374	5125385	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108116	NC_017530	GC	3	6	5125393	5125398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108117	NC_017530	GCTCT	2	10	5125412	5125421	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
108118	NC_017530	CTG	2	6	5125464	5125469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014073
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108345	NC_017530	GTG	2	6	5135758	5135763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014084
108346	NC_017530	TGA	2	6	5135880	5135885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014084
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108353	NC_017530	CGGT	2	8	5136221	5136228	0 %	25 %	50 %	25 %	386014084
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108365	NC_017530	ATGG	2	8	5136871	5136878	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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108368	NC_017530	CATT	2	8	5137043	5137050	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108369	NC_017530	ATC	2	6	5137054	5137059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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108487	NC_017530	CG	3	6	5142183	5142188	0 %	0 %	50 %	50 %	386014091
108488	NC_017530	CAACG	2	10	5142197	5142206	40 %	0 %	20 %	40 %	386014091
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