MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 121084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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107502	NC_017530	G	8	8	5098165	5098172	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
107503	NC_017530	GAG	2	6	5098191	5098196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107504	NC_017530	AGCAGG	5	30	5098255	5098284	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
107505	NC_017530	GAA	2	6	5098335	5098340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014046
107506	NC_017530	TCG	2	6	5098365	5098370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014046
107507	NC_017530	CAG	2	6	5098376	5098381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014046
107508	NC_017530	GGC	2	6	5098414	5098419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014046
107509	NC_017530	CAC	2	6	5098439	5098444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014046
107510	NC_017530	GCCA	2	8	5098596	5098603	25 %	0 %	25 %	50 %	386014046
107511	NC_017530	GCA	2	6	5098612	5098617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014046
107512	NC_017530	GGT	2	6	5098634	5098639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014046
107513	NC_017530	GCG	2	6	5098654	5098659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014046
107514	NC_017530	GCA	2	6	5098713	5098718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014046
107515	NC_017530	TGG	2	6	5098738	5098743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014046
107516	NC_017530	CTG	2	6	5098828	5098833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107517	NC_017530	CTG	2	6	5098900	5098905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014047
107518	NC_017530	CGG	2	6	5098959	5098964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014047
107519	NC_017530	GCC	2	6	5098984	5098989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014047
107520	NC_017530	CTA	2	6	5099067	5099072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014047
107521	NC_017530	AAG	2	6	5099114	5099119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014047
107522	NC_017530	GCA	2	6	5099228	5099233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014047
107523	NC_017530	AAC	2	6	5099237	5099242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386014047
107524	NC_017530	GCCTGG	2	12	5099249	5099260	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386014047
107525	NC_017530	GAT	2	6	5099296	5099301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014048
107526	NC_017530	CG	4	8	5099343	5099350	0 %	0 %	50 %	50 %	386014048
107527	NC_017530	TGG	2	6	5099396	5099401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014048
107528	NC_017530	CTG	2	6	5099420	5099425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014048
107529	NC_017530	CTG	2	6	5099474	5099479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014048
107530	NC_017530	CGA	3	9	5099506	5099514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014048
107531	NC_017530	TGC	2	6	5099667	5099672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014048
107532	NC_017530	CTG	2	6	5099696	5099701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014048
107533	NC_017530	GCA	2	6	5099707	5099712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014048
107534	NC_017530	TTG	2	6	5099777	5099782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014048
107535	NC_017530	GCA	2	6	5099790	5099795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014048
107536	NC_017530	CTG	2	6	5099798	5099803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014048
107537	NC_017530	TGGC	2	8	5099824	5099831	0 %	25 %	50 %	25 %	386014048
107538	NC_017530	GC	3	6	5099883	5099888	0 %	0 %	50 %	50 %	386014048
107539	NC_017530	CG	3	6	5100012	5100017	0 %	0 %	50 %	50 %	386014048
107540	NC_017530	ACC	2	6	5100174	5100179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107541	NC_017530	GCT	2	6	5100238	5100243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107542	NC_017530	GCC	2	6	5100272	5100277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107543	NC_017530	AAGC	2	8	5100355	5100362	50 %	0 %	25 %	25 %	386014049
107544	NC_017530	GCC	2	6	5100397	5100402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014049
107545	NC_017530	CGTCGC	2	12	5100411	5100422	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386014049
107546	NC_017530	CTG	2	6	5100480	5100485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014049
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107550	NC_017530	CCA	2	6	5100632	5100637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386014049
107551	NC_017530	GC	3	6	5100647	5100652	0 %	0 %	50 %	50 %	386014049
107552	NC_017530	GGC	2	6	5100679	5100684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014049
107553	NC_017530	CGG	2	6	5100708	5100713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386014049
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107555	NC_017530	GCGG	2	8	5100740	5100747	0 %	0 %	75 %	25 %	386014049
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107557	NC_017530	ATC	2	6	5100939	5100944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014049
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107560	NC_017530	TCG	2	6	5101006	5101011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014049
107561	NC_017530	CG	3	6	5101010	5101015	0 %	0 %	50 %	50 %	386014049
107562	NC_017530	GAGC	2	8	5101020	5101027	25 %	0 %	50 %	25 %	386014049
107563	NC_017530	C	7	7	5101035	5101041	0 %	0 %	0 %	100 %	386014049
107564	NC_017530	CTG	2	6	5101053	5101058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014049
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107567	NC_017530	CAC	2	6	5101214	5101219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107568	NC_017530	A	6	6	5101246	5101251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107569	NC_017530	GTC	2	6	5101282	5101287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107570	NC_017530	CTCAC	2	10	5101312	5101321	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
107571	NC_017530	TCT	2	6	5101326	5101331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107572	NC_017530	TGGC	2	8	5101371	5101378	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107573	NC_017530	CCGC	2	8	5101384	5101391	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
107574	NC_017530	GCA	2	6	5101529	5101534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107575	NC_017530	GC	3	6	5101613	5101618	0 %	0 %	50 %	50 %	386014050
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107583	NC_017530	GAA	2	6	5102108	5102113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014051
107584	NC_017530	GAT	3	9	5102116	5102124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014051
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107587	NC_017530	TCA	3	9	5102250	5102258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014051
107588	NC_017530	GTG	3	9	5102264	5102272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386014051
107589	NC_017530	A	6	6	5102292	5102297	100 %	0 %	0 %	0 %	386014051
107590	NC_017530	CCTGA	2	10	5102395	5102404	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
107591	NC_017530	GCGCAC	2	12	5102472	5102483	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386014052
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107599	NC_017530	CAT	2	6	5102789	5102794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014052
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107601	NC_017530	CCGG	2	8	5102836	5102843	0 %	0 %	50 %	50 %	386014052
107602	NC_017530	CG	3	6	5102880	5102885	0 %	0 %	50 %	50 %	386014052
107603	NC_017530	TTG	2	6	5102926	5102931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386014052
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107611	NC_017530	AC	4	8	5103221	5103228	50 %	0 %	0 %	50 %	386014053
107612	NC_017530	GCA	2	6	5103268	5103273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386014053
107613	NC_017530	GTC	2	6	5103360	5103365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014053
107614	NC_017530	CGGTGC	2	12	5103377	5103388	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386014053
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107616	NC_017530	CCT	2	6	5103440	5103445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386014053
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107846	NC_017530	GCT	2	6	5114028	5114033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014062
107847	NC_017530	GCT	2	6	5114043	5114048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014062
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107857	NC_017530	CAT	2	6	5114503	5114508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014063
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107949	NC_017530	C	6	6	5118062	5118067	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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107953	NC_017530	CTG	2	6	5118155	5118160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107954	NC_017530	TCTCT	2	10	5118232	5118241	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
107955	NC_017530	GCC	3	9	5118292	5118300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386014067
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107957	NC_017530	CTA	2	6	5118360	5118365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386014067
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