MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 121084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
106001	NC_017530	GAA	2	6	5023094	5023099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386013996
106002	NC_017530	TCC	2	6	5023107	5023112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386013996
106003	NC_017530	CTT	2	6	5023127	5023132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386013996
106004	NC_017530	GGCG	2	8	5023144	5023151	0 %	0 %	75 %	25 %	386013996
106005	NC_017530	CTT	2	6	5023175	5023180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386013996
106006	NC_017530	GCAC	2	8	5023359	5023366	25 %	0 %	25 %	50 %	386013996
106007	NC_017530	GCCACC	2	12	5023380	5023391	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386013996
106008	NC_017530	GGT	2	6	5023484	5023489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386013996
106009	NC_017530	GCC	2	6	5023515	5023520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386013996
106010	NC_017530	CGT	2	6	5023537	5023542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386013996
106011	NC_017530	GTC	2	6	5023586	5023591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386013996
106012	NC_017530	CGA	2	6	5023624	5023629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386013996
106013	NC_017530	GCG	2	6	5023666	5023671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386013996
106014	NC_017530	TTG	2	6	5023695	5023700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386013996
106015	NC_017530	ACC	2	6	5023794	5023799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386013996
106016	NC_017530	GTG	2	6	5023813	5023818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386013996
106017	NC_017530	GAA	2	6	5023854	5023859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386013996
106018	NC_017530	GTT	3	9	5023928	5023936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386013996
106019	NC_017530	GGT	2	6	5023988	5023993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386013996
106020	NC_017530	CTG	2	6	5023994	5023999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386013996
106021	NC_017530	GCA	2	6	5024092	5024097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386013996
106022	NC_017530	GCG	2	6	5024116	5024121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386013996
106023	NC_017530	TGG	2	6	5024146	5024151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386013996
106024	NC_017530	CACG	2	8	5024341	5024348	25 %	0 %	25 %	50 %	386013996
106025	NC_017530	TGG	2	6	5024365	5024370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386013996
106026	NC_017530	CAG	2	6	5024408	5024413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386013996
106027	NC_017530	GGA	2	6	5024456	5024461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386013996
106028	NC_017530	GC	3	6	5024490	5024495	0 %	0 %	50 %	50 %	386013996
106029	NC_017530	AC	3	6	5024497	5024502	50 %	0 %	0 %	50 %	386013996
106030	NC_017530	CG	3	6	5024519	5024524	0 %	0 %	50 %	50 %	386013996
106031	NC_017530	CAA	2	6	5024582	5024587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386013996
106032	NC_017530	CG	3	6	5024599	5024604	0 %	0 %	50 %	50 %	386013996
106033	NC_017530	GCA	2	6	5024632	5024637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386013996
106034	NC_017530	CCG	2	6	5024857	5024862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386013996
106035	NC_017530	AAAGG	2	10	5024909	5024918	60 %	0 %	40 %	0 %	386013996
106036	NC_017530	GCA	2	6	5024947	5024952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386013996
106037	NC_017530	CGG	2	6	5024965	5024970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386013996
106038	NC_017530	GGCC	2	8	5024972	5024979	0 %	0 %	50 %	50 %	386013996
106039	NC_017530	TTCC	2	8	5024987	5024994	0 %	50 %	0 %	50 %	386013996
106040	NC_017530	CG	3	6	5025013	5025018	0 %	0 %	50 %	50 %	386013996
106041	NC_017530	AGC	2	6	5025042	5025047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386013996
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106043	NC_017530	CGG	2	6	5025154	5025159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386013996
106044	NC_017530	TGC	2	6	5025161	5025166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386013996
106045	NC_017530	CTG	2	6	5025167	5025172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386013996
106046	NC_017530	GCG	2	6	5025190	5025195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386013996
106047	NC_017530	GGT	2	6	5025232	5025237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386013996
106048	NC_017530	CAG	2	6	5025275	5025280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386013996
106049	NC_017530	CGT	2	6	5025358	5025363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386013996
106050	NC_017530	CGA	2	6	5025367	5025372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386013996
106051	NC_017530	AGC	2	6	5025517	5025522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106052	NC_017530	TTC	2	6	5025549	5025554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386013997
106053	NC_017530	GTA	2	6	5025617	5025622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386013997
106054	NC_017530	TTGG	2	8	5025651	5025658	0 %	50 %	50 %	0 %	386013997
106055	NC_017530	GC	3	6	5025687	5025692	0 %	0 %	50 %	50 %	386013997
106056	NC_017530	TTC	2	6	5025701	5025706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386013997
106057	NC_017530	TTGC	2	8	5025719	5025726	0 %	50 %	25 %	25 %	386013997
106058	NC_017530	CGCCA	2	10	5025740	5025749	20 %	0 %	20 %	60 %	386013997
106059	NC_017530	TGA	2	6	5025757	5025762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386013997
106060	NC_017530	TTTC	2	8	5025778	5025785	0 %	75 %	0 %	25 %	386013997
106061	NC_017530	GCC	2	6	5025813	5025818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386013997
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106066	NC_017530	GAC	2	6	5025976	5025981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386013997
106067	NC_017530	ACGC	2	8	5026184	5026191	25 %	0 %	25 %	50 %	386013997
106068	NC_017530	GTTT	2	8	5026271	5026278	0 %	75 %	25 %	0 %	386013997
106069	NC_017530	GCG	2	6	5026346	5026351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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106075	NC_017530	GTC	2	6	5026566	5026571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386013998
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106084	NC_017530	GTC	2	6	5027027	5027032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386013999
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106087	NC_017530	CA	3	6	5027152	5027157	50 %	0 %	0 %	50 %	386013999
106088	NC_017530	CGC	2	6	5027239	5027244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386013999
106089	NC_017530	CAT	2	6	5027287	5027292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386013999
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106102	NC_017530	TGA	2	6	5028208	5028213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386014001
106103	NC_017530	CTG	2	6	5028230	5028235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014001
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106106	NC_017530	TGGTG	2	10	5028295	5028304	0 %	40 %	60 %	0 %	386014001
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106465	NC_017530	GAA	2	6	5044484	5044489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386014014
106466	NC_017530	CTG	2	6	5044638	5044643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014014
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106470	NC_017530	CTG	2	6	5044755	5044760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386014014
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106475	NC_017530	GC	3	6	5045015	5045020	0 %	0 %	50 %	50 %	386014014
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106477	NC_017530	G	7	7	5045067	5045073	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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106500	NC_017530	GGCGCA	2	12	5046128	5046139	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386014015

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