MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 121084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017530	CAC	2	6	25014	25019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009662
502	NC_017530	CG	3	6	25050	25055	0 %	0 %	50 %	50 %	386009662
503	NC_017530	ACCGCC	2	12	25093	25104	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386009662
504	NC_017530	ATG	2	6	25156	25161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009662
505	NC_017530	CAC	2	6	25269	25274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009662
506	NC_017530	TGA	2	6	25283	25288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009662
507	NC_017530	ATC	2	6	25330	25335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009662
508	NC_017530	CGA	2	6	25346	25351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009662
509	NC_017530	AGA	2	6	25352	25357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386009662
510	NC_017530	CAG	2	6	25482	25487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009662
511	NC_017530	CGA	2	6	25598	25603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009662
512	NC_017530	CAG	2	6	25680	25685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009662
513	NC_017530	CGA	2	6	25715	25720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009662
514	NC_017530	TTC	2	6	25756	25761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386009662
515	NC_017530	GAT	2	6	25788	25793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009662
516	NC_017530	GGT	2	6	25794	25799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009662
517	NC_017530	GGA	2	6	25800	25805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386009662
518	NC_017530	ATC	2	6	25885	25890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009662
519	NC_017530	CAGA	2	8	25968	25975	50 %	0 %	25 %	25 %	386009662
520	NC_017530	TTC	2	6	26019	26024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386009662
521	NC_017530	ATG	2	6	26062	26067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009662
522	NC_017530	CAC	2	6	26091	26096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009662
523	NC_017530	GCT	2	6	26099	26104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009662
524	NC_017530	GAC	2	6	26127	26132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009662
525	NC_017530	ATG	2	6	26146	26151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009662
526	NC_017530	GCAT	2	8	26179	26186	25 %	25 %	25 %	25 %	386009662
527	NC_017530	T	6	6	26210	26215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017530	GAGC	2	8	26254	26261	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
529	NC_017530	GCA	2	6	26285	26290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_017530	CGC	2	6	26333	26338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_017530	GAC	2	6	26405	26410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_017530	GC	3	6	26412	26417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
533	NC_017530	CAG	2	6	26470	26475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_017530	TGA	2	6	26563	26568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009663
535	NC_017530	GGC	2	6	26604	26609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009663
536	NC_017530	CGA	2	6	26627	26632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009663
537	NC_017530	ATGC	2	8	26641	26648	25 %	25 %	25 %	25 %	386009663
538	NC_017530	GTCG	2	8	26684	26691	0 %	25 %	50 %	25 %	386009663
539	NC_017530	CCTT	2	8	26737	26744	0 %	50 %	0 %	50 %	386009663
540	NC_017530	GCT	2	6	26839	26844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009663
541	NC_017530	CGA	2	6	26864	26869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009663
542	NC_017530	CCG	2	6	26873	26878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009663
543	NC_017530	CCA	2	6	26892	26897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009663
544	NC_017530	CAG	2	6	26909	26914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009663
545	NC_017530	GAA	2	6	26916	26921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386009663
546	NC_017530	CAG	2	6	26943	26948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009663
547	NC_017530	CAG	2	6	27110	27115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009664
548	NC_017530	AGC	2	6	27171	27176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009664
549	NC_017530	AGGTC	2	10	27199	27208	20 %	20 %	40 %	20 %	386009664
550	NC_017530	ACCC	2	8	27209	27216	25 %	0 %	0 %	75 %	386009664
551	NC_017530	GCG	2	6	27248	27253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009664
552	NC_017530	CGG	2	6	27271	27276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009664
553	NC_017530	TTC	2	6	27299	27304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386009664
554	NC_017530	GCCC	2	8	27306	27313	0 %	0 %	25 %	75 %	386009664
555	NC_017530	CAG	2	6	27359	27364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009664
556	NC_017530	GC	3	6	27368	27373	0 %	0 %	50 %	50 %	386009664
557	NC_017530	TCC	2	6	27387	27392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386009664
558	NC_017530	GC	3	6	27402	27407	0 %	0 %	50 %	50 %	386009664
559	NC_017530	GGC	2	6	27498	27503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009664
560	NC_017530	TCGC	2	8	27598	27605	0 %	25 %	25 %	50 %	386009664
561	NC_017530	CCA	2	6	27682	27687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009664
562	NC_017530	TG	4	8	27738	27745	0 %	50 %	50 %	0 %	386009664
563	NC_017530	GCGCA	2	10	27914	27923	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
564	NC_017530	CG	3	6	28329	28334	0 %	0 %	50 %	50 %	386009665
565	NC_017530	GCA	2	6	28354	28359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009665
566	NC_017530	GTTGCG	2	12	28435	28446	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386009666
567	NC_017530	ACC	2	6	28534	28539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009666
568	NC_017530	GCCA	2	8	28642	28649	25 %	0 %	25 %	50 %	386009666
569	NC_017530	CTG	2	6	28670	28675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009666
570	NC_017530	TGC	2	6	28712	28717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009666
571	NC_017530	CAA	2	6	28768	28773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009666
572	NC_017530	TCTTT	2	10	28837	28846	0 %	80 %	0 %	20 %	386009666
573	NC_017530	CAA	2	6	28862	28867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009666
574	NC_017530	CTG	2	6	28931	28936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009666
575	NC_017530	TTG	2	6	29030	29035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386009666
576	NC_017530	CAG	2	6	29045	29050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009666
577	NC_017530	GCA	2	6	29153	29158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009666
578	NC_017530	GCC	2	6	29165	29170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009666
579	NC_017530	TGGG	2	8	29343	29350	0 %	25 %	75 %	0 %	386009666
580	NC_017530	GGC	2	6	29378	29383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_017530	GCCA	2	8	29410	29417	25 %	0 %	25 %	50 %	386009667
582	NC_017530	AGC	2	6	29428	29433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009667
583	NC_017530	CTG	2	6	29442	29447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009667
584	NC_017530	TG	3	6	29565	29570	0 %	50 %	50 %	0 %	386009667
585	NC_017530	CAC	2	6	29576	29581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009667
586	NC_017530	GGT	2	6	29628	29633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009667
587	NC_017530	CGT	2	6	29713	29718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009667
588	NC_017530	GCC	2	6	29740	29745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009667
589	NC_017530	AACG	2	8	29766	29773	50 %	0 %	25 %	25 %	386009667
590	NC_017530	CCG	2	6	29792	29797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009667
591	NC_017530	GCA	2	6	29804	29809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009667
592	NC_017530	TCC	2	6	29902	29907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386009667
593	NC_017530	GCC	3	9	29924	29932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009667
594	NC_017530	GCA	2	6	29957	29962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009667
595	NC_017530	TGC	2	6	30032	30037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009667
596	NC_017530	GCAT	2	8	30122	30129	25 %	25 %	25 %	25 %	386009668
597	NC_017530	GGC	2	6	30187	30192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009668
598	NC_017530	CCA	2	6	30278	30283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009668
599	NC_017530	GCCA	2	8	30287	30294	25 %	0 %	25 %	50 %	386009668
600	NC_017530	CAT	2	6	30305	30310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009668
601	NC_017530	GCC	2	6	30311	30316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009668
602	NC_017530	GCA	2	6	30379	30384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009668
603	NC_017530	CAGC	2	8	30518	30525	25 %	0 %	25 %	50 %	386009668
604	NC_017530	GGC	2	6	30536	30541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009668
605	NC_017530	TTC	2	6	30653	30658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386009668
606	NC_017530	CAG	3	9	30692	30700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009668
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608	NC_017530	CAC	2	6	30772	30777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009668
609	NC_017530	CTG	2	6	30793	30798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009668
610	NC_017530	AATA	2	8	30948	30955	75 %	25 %	0 %	0 %	386009668
611	NC_017530	CCT	2	6	30988	30993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386009668
612	NC_017530	GCA	2	6	31016	31021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009668
613	NC_017530	GCA	2	6	31159	31164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009668
614	NC_017530	AGC	2	6	31173	31178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009668
615	NC_017530	ACAAT	2	10	31296	31305	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
616	NC_017530	GACG	2	8	31323	31330	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
617	NC_017530	TGCC	2	8	31391	31398	0 %	25 %	25 %	50 %	386009669
618	NC_017530	ACT	2	6	31484	31489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009669
619	NC_017530	GCA	2	6	31508	31513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009669
620	NC_017530	CAG	2	6	31539	31544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009669
621	NC_017530	CCG	2	6	31545	31550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009669
622	NC_017530	T	8	8	31590	31597	0 %	100 %	0 %	0 %	386009669
623	NC_017530	TGGG	2	8	31624	31631	0 %	25 %	75 %	0 %	386009669
624	NC_017530	GCC	2	6	31637	31642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009669
625	NC_017530	ACC	2	6	31654	31659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009669
626	NC_017530	CCT	2	6	31734	31739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_017530	CTG	2	6	31760	31765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_017530	GCCT	2	8	31803	31810	0 %	25 %	25 %	50 %	386009670
629	NC_017530	AAATG	2	10	31869	31878	60 %	20 %	20 %	0 %	386009670
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