MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 121084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9122	NC_017530	TGC	2	6	440294	440299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010001
9123	NC_017530	CGG	2	6	440357	440362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010002
9124	NC_017530	CCA	2	6	440411	440416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010002
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9126	NC_017530	CCG	2	6	440454	440459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010002
9127	NC_017530	TGG	2	6	440473	440478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010002
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9131	NC_017530	TAC	2	6	440604	440609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010002
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9133	NC_017530	GCT	2	6	440620	440625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010002
9134	NC_017530	TGA	2	6	440740	440745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010002
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9136	NC_017530	TCA	2	6	440770	440775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010002
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9140	NC_017530	CTG	3	9	440907	440915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010002
9141	NC_017530	GCTGC	2	10	440973	440982	0 %	20 %	40 %	40 %	386010002
9142	NC_017530	GAC	2	6	441027	441032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010002
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9144	NC_017530	CTG	2	6	441120	441125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010002
9145	NC_017530	CTG	2	6	441135	441140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010002
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9148	NC_017530	TGC	2	6	441407	441412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010002
9149	NC_017530	GGCG	2	8	441675	441682	0 %	0 %	75 %	25 %	386010003
9150	NC_017530	GCA	2	6	441760	441765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010003
9151	NC_017530	TCA	3	9	441771	441779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010003
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9153	NC_017530	CGG	2	6	441892	441897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010003
9154	NC_017530	ACC	2	6	441918	441923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010003
9155	NC_017530	CTG	2	6	441947	441952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010003
9156	NC_017530	ACCG	3	12	441956	441967	25 %	0 %	25 %	50 %	386010003
9157	NC_017530	CGG	2	6	441972	441977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010003
9158	NC_017530	CG	3	6	442010	442015	0 %	0 %	50 %	50 %	386010003
9159	NC_017530	GCC	2	6	442035	442040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010003
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9161	NC_017530	CTGG	2	8	442183	442190	0 %	25 %	50 %	25 %	386010003
9162	NC_017530	GCAA	2	8	442218	442225	50 %	0 %	25 %	25 %	386010003
9163	NC_017530	GGC	2	6	442284	442289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010004
9164	NC_017530	GGT	2	6	442359	442364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010004
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9167	NC_017530	GAT	2	6	442563	442568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010004
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9169	NC_017530	GC	3	6	442672	442677	0 %	0 %	50 %	50 %	386010004
9170	NC_017530	CTG	2	6	442735	442740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010004
9171	NC_017530	TTC	2	6	442762	442767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010004
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9174	NC_017530	AAG	2	6	442933	442938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010004
9175	NC_017530	AGGGA	2	10	442967	442976	40 %	0 %	60 %	0 %	386010004
9176	NC_017530	GCT	2	6	443009	443014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010005
9177	NC_017530	GTG	2	6	443092	443097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010005
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9181	NC_017530	TGA	2	6	443314	443319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010005
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9183	NC_017530	GCT	2	6	443458	443463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010005
9184	NC_017530	CGC	2	6	443493	443498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010005
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9186	NC_017530	GCT	2	6	443585	443590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010005
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9188	NC_017530	GTAC	2	8	443622	443629	25 %	25 %	25 %	25 %	386010005
9189	NC_017530	CTAC	2	8	443638	443645	25 %	25 %	0 %	50 %	386010005
9190	NC_017530	GC	3	6	443665	443670	0 %	0 %	50 %	50 %	386010005
9191	NC_017530	CGT	2	6	443706	443711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010005
9192	NC_017530	CTGAA	2	10	443739	443748	40 %	20 %	20 %	20 %	386010006
9193	NC_017530	GTTG	2	8	443788	443795	0 %	50 %	50 %	0 %	386010006
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9199	NC_017530	GGCT	2	8	444026	444033	0 %	25 %	50 %	25 %	386010006
9200	NC_017530	CCTG	2	8	444094	444101	0 %	25 %	25 %	50 %	386010006
9201	NC_017530	AGC	2	6	444114	444119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010006
9202	NC_017530	CTG	2	6	444203	444208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010006
9203	NC_017530	CAG	2	6	444269	444274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010006
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9206	NC_017530	CTG	2	6	444371	444376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010006
9207	NC_017530	GC	3	6	444626	444631	0 %	0 %	50 %	50 %	386010006
9208	NC_017530	CGAGC	2	10	444714	444723	20 %	0 %	40 %	40 %	386010006
9209	NC_017530	CGCCA	2	10	444769	444778	20 %	0 %	20 %	60 %	386010006
9210	NC_017530	AGC	2	6	444798	444803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010006
9211	NC_017530	GCG	2	6	444894	444899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010006
9212	NC_017530	GAG	2	6	444908	444913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386010006
9213	NC_017530	GCA	2	6	444940	444945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010006
9214	NC_017530	CAGCT	2	10	445055	445064	20 %	20 %	20 %	40 %	386010006
9215	NC_017530	GCT	2	6	445096	445101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010006
9216	NC_017530	GTT	2	6	445147	445152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010006
9217	NC_017530	GCC	2	6	445173	445178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9218	NC_017530	CGG	2	6	445199	445204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010007
9219	NC_017530	CTG	2	6	445233	445238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010007
9220	NC_017530	CCTG	2	8	445242	445249	0 %	25 %	25 %	50 %	386010007
9221	NC_017530	GCA	2	6	445285	445290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010007
9222	NC_017530	CAC	2	6	445301	445306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010007
9223	NC_017530	GCA	2	6	445351	445356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010007
9224	NC_017530	GGC	2	6	445360	445365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010007
9225	NC_017530	GCT	2	6	445402	445407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010007
9226	NC_017530	CGT	2	6	445507	445512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010007
9227	NC_017530	TGC	2	6	445569	445574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010007
9228	NC_017530	CTGG	2	8	445585	445592	0 %	25 %	50 %	25 %	386010007
9229	NC_017530	GTA	2	6	445637	445642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010007
9230	NC_017530	GTT	2	6	445646	445651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010007
9231	NC_017530	CCA	2	6	445680	445685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010007
9232	NC_017530	GCT	3	9	445745	445753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010007
9233	NC_017530	GTT	2	6	445795	445800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010007
9234	NC_017530	CG	3	6	445982	445987	0 %	0 %	50 %	50 %	386010007
9235	NC_017530	GCA	3	9	445993	446001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010007
9236	NC_017530	TGA	2	6	446005	446010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010007
9237	NC_017530	GTC	2	6	446064	446069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010007
9238	NC_017530	GTA	2	6	446117	446122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010007
9239	NC_017530	GAA	2	6	446126	446131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010007
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9488	NC_017530	GTT	2	6	457432	457437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010015
9489	NC_017530	CAGC	2	8	457482	457489	25 %	0 %	25 %	50 %	386010015
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9491	NC_017530	GGC	2	6	457591	457596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010015
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