MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 121084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017530	GAG	2	6	218381	218386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386009831
4502	NC_017530	AGC	2	6	218559	218564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009831
4503	NC_017530	GCG	2	6	218597	218602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009831
4504	NC_017530	CGAG	2	8	218629	218636	25 %	0 %	50 %	25 %	386009831
4505	NC_017530	TGG	2	6	218700	218705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009831
4506	NC_017530	CG	3	6	218738	218743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4507	NC_017530	GCC	2	6	218765	218770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4508	NC_017530	CAG	2	6	218841	218846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_017530	GC	3	6	218879	218884	0 %	0 %	50 %	50 %	386009832
4510	NC_017530	ATG	2	6	218913	218918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009832
4511	NC_017530	ATG	2	6	218934	218939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009832
4512	NC_017530	CCA	2	6	218950	218955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009832
4513	NC_017530	CAG	2	6	218969	218974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009832
4514	NC_017530	TCT	2	6	219037	219042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386009832
4515	NC_017530	GTC	2	6	219203	219208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009832
4516	NC_017530	GAT	2	6	219224	219229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009832
4517	NC_017530	CTGG	2	8	219238	219245	0 %	25 %	50 %	25 %	386009832
4518	NC_017530	CAG	2	6	219269	219274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009832
4519	NC_017530	GTC	2	6	219326	219331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009832
4520	NC_017530	TGG	2	6	219343	219348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009832
4521	NC_017530	GC	3	6	219371	219376	0 %	0 %	50 %	50 %	386009832
4522	NC_017530	CGC	2	6	219452	219457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009832
4523	NC_017530	GC	3	6	219462	219467	0 %	0 %	50 %	50 %	386009832
4524	NC_017530	GGCGCA	2	12	219520	219531	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386009832
4525	NC_017530	CCA	2	6	219562	219567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009832
4526	NC_017530	GCA	2	6	219595	219600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009832
4527	NC_017530	CTG	2	6	219653	219658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009832
4528	NC_017530	CTG	3	9	219671	219679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009832
4529	NC_017530	GCC	2	6	219683	219688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009832
4530	NC_017530	GCC	2	6	219741	219746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009832
4531	NC_017530	TCG	2	6	219774	219779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009832
4532	NC_017530	GCGG	2	8	219787	219794	0 %	0 %	75 %	25 %	386009832
4533	NC_017530	GCA	2	6	219895	219900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009832
4534	NC_017530	TGGC	2	8	219902	219909	0 %	25 %	50 %	25 %	386009832
4535	NC_017530	CGA	2	6	219916	219921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009832
4536	NC_017530	CCT	2	6	219928	219933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386009832
4537	NC_017530	CGA	2	6	219949	219954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009832
4538	NC_017530	GCC	2	6	219956	219961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009832
4539	NC_017530	TCT	2	6	219976	219981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386009832
4540	NC_017530	TCG	2	6	220026	220031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009832
4541	NC_017530	GAA	2	6	220067	220072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386009832
4542	NC_017530	CAC	2	6	220100	220105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009832
4543	NC_017530	GCG	2	6	220108	220113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009832
4544	NC_017530	GCC	2	6	220154	220159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009832
4545	NC_017530	CTT	2	6	220242	220247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386009833
4546	NC_017530	CGAT	2	8	220297	220304	25 %	25 %	25 %	25 %	386009833
4547	NC_017530	ACG	2	6	220334	220339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009833
4548	NC_017530	CAG	2	6	220353	220358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009833
4549	NC_017530	CCA	2	6	220373	220378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009833
4550	NC_017530	GCT	2	6	220391	220396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009833
4551	NC_017530	TTC	2	6	220404	220409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386009833
4552	NC_017530	CAG	3	9	220443	220451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009833
4553	NC_017530	AGC	2	6	220468	220473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009833
4554	NC_017530	GCC	2	6	220503	220508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009833
4555	NC_017530	CGCC	2	8	220580	220587	0 %	0 %	25 %	75 %	386009833
4556	NC_017530	CAG	2	6	220665	220670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009833
4557	NC_017530	TGT	2	6	220697	220702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386009833
4558	NC_017530	CAG	2	6	220749	220754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009833
4559	NC_017530	GCC	2	6	220758	220763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009833
4560	NC_017530	CGA	2	6	220781	220786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009833
4561	NC_017530	GAT	2	6	220827	220832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009833
4562	NC_017530	TTC	2	6	220870	220875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386009833
4563	NC_017530	CTG	2	6	220887	220892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009833
4564	NC_017530	GCA	2	6	220937	220942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009833
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4566	NC_017530	CAT	2	6	220992	220997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009833
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4569	NC_017530	GCC	2	6	221109	221114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009833
4570	NC_017530	GAT	2	6	221133	221138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009833
4571	NC_017530	CAG	2	6	221187	221192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009833
4572	NC_017530	GAT	2	6	221439	221444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009833
4573	NC_017530	ATG	2	6	221470	221475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009833
4574	NC_017530	GGTCAG	2	12	221523	221534	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386009833
4575	NC_017530	CGAGG	2	10	221535	221544	20 %	0 %	60 %	20 %	386009833
4576	NC_017530	GCCG	2	8	221599	221606	0 %	0 %	50 %	50 %	386009833
4577	NC_017530	GAT	2	6	221652	221657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009833
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4579	NC_017530	CAC	2	6	221784	221789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009833
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4583	NC_017530	TGC	2	6	221882	221887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009833
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4588	NC_017530	AGC	3	9	222109	222117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009833
4589	NC_017530	GC	3	6	222196	222201	0 %	0 %	50 %	50 %	386009833
4590	NC_017530	GCA	2	6	222203	222208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009833
4591	NC_017530	TGT	2	6	222246	222251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386009833
4592	NC_017530	AC	3	6	222286	222291	50 %	0 %	0 %	50 %	386009833
4593	NC_017530	CAG	2	6	222297	222302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009833
4594	NC_017530	CAG	2	6	222309	222314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009833
4595	NC_017530	GACT	2	8	222359	222366	25 %	25 %	25 %	25 %	386009833
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4597	NC_017530	TGG	2	6	222399	222404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_017530	GTGGG	2	10	222405	222414	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_017530	CGT	2	6	222420	222425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4600	NC_017530	CT	3	6	222450	222455	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4601	NC_017530	TGC	2	6	222460	222465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_017530	AGC	2	6	222505	222510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_017530	CAT	2	6	222611	222616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_017530	TTG	2	6	222622	222627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_017530	TTG	2	6	222707	222712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_017530	ATT	2	6	222814	222819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_017530	GCT	2	6	222859	222864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_017530	TGG	2	6	222890	222895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_017530	CTGG	2	8	222922	222929	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4610	NC_017530	GTCG	2	8	223047	223054	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4611	NC_017530	CGC	2	6	223055	223060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4612	NC_017530	GCT	2	6	223071	223076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_017530	TGA	2	6	223121	223126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_017530	TCC	2	6	223140	223145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4615	NC_017530	ACATT	2	10	223180	223189	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4616	NC_017530	ATC	2	6	223288	223293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_017530	AGC	2	6	223374	223379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009834
4618	NC_017530	GCTG	2	8	223520	223527	0 %	25 %	50 %	25 %	386009834
4619	NC_017530	GGC	2	6	223604	223609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009834
4620	NC_017530	GCA	2	6	223640	223645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009834
4621	NC_017530	TGC	2	6	223652	223657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009834
4622	NC_017530	ACT	2	6	223671	223676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009834
4623	NC_017530	CCG	2	6	223690	223695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009834
4624	NC_017530	TCA	2	6	223704	223709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009834
4625	NC_017530	GGT	3	9	223713	223721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009834
4626	NC_017530	CGG	2	6	223727	223732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009834
4627	NC_017530	GGGCT	2	10	223803	223812	0 %	20 %	60 %	20 %	386009834
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4629	NC_017530	CTG	2	6	223845	223850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009834
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4633	NC_017530	TACT	2	8	223999	224006	25 %	50 %	0 %	25 %	386009834
4634	NC_017530	AC	3	6	224083	224088	50 %	0 %	0 %	50 %	386009834
4635	NC_017530	GTA	2	6	224128	224133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009834
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4638	NC_017530	GTGACC	2	12	224298	224309	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386009834
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4642	NC_017530	ACC	3	9	224505	224513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009834
4643	NC_017530	GGC	2	6	224547	224552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009834
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4650	NC_017530	ACA	2	6	225292	225297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009834
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4654	NC_017530	ACA	2	6	225592	225597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009834
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4675	NC_017530	CCGT	2	8	226991	226998	0 %	25 %	25 %	50 %	386009834
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4678	NC_017530	CAA	2	6	227282	227287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009834
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4733	NC_017530	CGA	2	6	229493	229498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009834
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4981	NC_017530	CGA	2	6	242759	242764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009834
4982	NC_017530	CCG	2	6	242812	242817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009834
4983	NC_017530	CAA	2	6	242906	242911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009834
4984	NC_017530	GC	3	6	242944	242949	0 %	0 %	50 %	50 %	386009834
4985	NC_017530	ACG	2	6	242959	242964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009834
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