MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pasteurella multocida subsp. multocida str. HN06 chromosome

Total Repeats: 49292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017027	TCT	2	6	16	21	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383309626
2	NC_017027	TTA	2	6	149	154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383309626
3	NC_017027	AGA	2	6	306	311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383309626
4	NC_017027	AAATC	2	10	382	391	60 %	20 %	0 %	20 %	383309626
5	NC_017027	TGG	2	6	465	470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383309626
6	NC_017027	TAA	2	6	561	566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383309626
7	NC_017027	CAA	2	6	574	579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383309626
8	NC_017027	A	6	6	619	624	100 %	0 %	0 %	0 %	383309626
9	NC_017027	GAT	2	6	655	660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383309626
10	NC_017027	AGAAAA	2	12	675	686	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383309626
11	NC_017027	A	6	6	683	688	100 %	0 %	0 %	0 %	383309626
12	NC_017027	AAG	2	6	692	697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383309626
13	NC_017027	AAT	2	6	715	720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383309626
14	NC_017027	ATCGG	2	10	753	762	20 %	20 %	40 %	20 %	383309626
15	NC_017027	ACC	2	6	823	828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383309626
16	NC_017027	CG	3	6	854	859	0 %	0 %	50 %	50 %	383309626
17	NC_017027	AAAG	2	8	873	880	75 %	0 %	25 %	0 %	383309626
18	NC_017027	GAA	2	6	883	888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383309626
19	NC_017027	ATTT	2	8	895	902	25 %	75 %	0 %	0 %	383309626
20	NC_017027	GAA	2	6	907	912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383309626
21	NC_017027	T	6	6	919	924	0 %	100 %	0 %	0 %	383309626
22	NC_017027	CGTG	2	8	948	955	0 %	25 %	50 %	25 %	383309626
23	NC_017027	GCG	2	6	1006	1011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383309626
24	NC_017027	GTG	2	6	1096	1101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383309626
25	NC_017027	TCGC	2	8	1146	1153	0 %	25 %	25 %	50 %	383309626
26	NC_017027	ACA	2	6	1255	1260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383309626
27	NC_017027	GA	3	6	1293	1298	50 %	0 %	50 %	0 %	383309626
28	NC_017027	AGA	2	6	1314	1319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383309626
29	NC_017027	CT	3	6	1345	1350	0 %	50 %	0 %	50 %	383309626
30	NC_017027	TTA	2	6	1397	1402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383309627
31	NC_017027	ACA	2	6	1411	1416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383309627
32	NC_017027	GT	3	6	1418	1423	0 %	50 %	50 %	0 %	383309627
33	NC_017027	GCC	2	6	1437	1442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383309627
34	NC_017027	AAT	2	6	1460	1465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383309627
35	NC_017027	TAC	2	6	1470	1475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383309627
36	NC_017027	GTG	2	6	1482	1487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383309627
37	NC_017027	TCAG	2	8	1634	1641	25 %	25 %	25 %	25 %	383309627
38	NC_017027	GAA	2	6	1646	1651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383309627
39	NC_017027	CGT	2	6	1775	1780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383309627
40	NC_017027	ACGC	2	8	1818	1825	25 %	0 %	25 %	50 %	383309627
41	NC_017027	GCCC	2	8	2005	2012	0 %	0 %	25 %	75 %	383309627
42	NC_017027	ATT	2	6	2057	2062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383309627
43	NC_017027	TCG	2	6	2101	2106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383309627
44	NC_017027	GC	3	6	2173	2178	0 %	0 %	50 %	50 %	383309627
45	NC_017027	AAG	2	6	2265	2270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383309627
46	NC_017027	AGA	2	6	2275	2280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383309627
47	NC_017027	GAA	2	6	2306	2311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383309627
48	NC_017027	ATT	2	6	2665	2670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383309628
49	NC_017027	AAC	2	6	2678	2683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383309628
50	NC_017027	ATTTT	2	10	2687	2696	20 %	80 %	0 %	0 %	383309628
51	NC_017027	AATT	2	8	2831	2838	50 %	50 %	0 %	0 %	383309628
52	NC_017027	TGG	2	6	2865	2870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383309628
53	NC_017027	CGT	2	6	2881	2886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383309628
54	NC_017027	T	6	6	2889	2894	0 %	100 %	0 %	0 %	383309628
55	NC_017027	TCA	3	9	2910	2918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383309628
56	NC_017027	TTA	2	6	2956	2961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383309628
57	NC_017027	AAC	2	6	2963	2968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383309628
58	NC_017027	GCG	2	6	2974	2979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383309628
59	NC_017027	ACA	2	6	2982	2987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383309628
60	NC_017027	TCA	2	6	3147	3152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383309628
61	NC_017027	TG	3	6	3320	3325	0 %	50 %	50 %	0 %	383309628
62	NC_017027	AGAA	2	8	3362	3369	75 %	0 %	25 %	0 %	383309628
63	NC_017027	TGAT	2	8	3386	3393	25 %	50 %	25 %	0 %	383309628
64	NC_017027	TTA	2	6	3430	3435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383309628
65	NC_017027	ACA	3	9	3513	3521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383309628
66	NC_017027	GAA	2	6	3538	3543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383309628
67	NC_017027	TTGCA	2	10	3546	3555	20 %	40 %	20 %	20 %	383309628
68	NC_017027	TAAA	2	8	3785	3792	75 %	25 %	0 %	0 %	383309629
69	NC_017027	TGA	2	6	3865	3870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383309629
70	NC_017027	TCT	2	6	3871	3876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383309629
71	NC_017027	ACATC	2	10	3884	3893	40 %	20 %	0 %	40 %	383309629
72	NC_017027	TG	3	6	3895	3900	0 %	50 %	50 %	0 %	383309629
73	NC_017027	AC	3	6	3923	3928	50 %	0 %	0 %	50 %	383309629
74	NC_017027	CTTT	2	8	3947	3954	0 %	75 %	0 %	25 %	383309629
75	NC_017027	TGCTT	2	10	4090	4099	0 %	60 %	20 %	20 %	383309629
76	NC_017027	CGT	2	6	4170	4175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383309629
77	NC_017027	ACC	2	6	4257	4262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383309629
78	NC_017027	A	6	6	4294	4299	100 %	0 %	0 %	0 %	383309629
79	NC_017027	CAT	2	6	4323	4328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383309629
80	NC_017027	CTC	2	6	4332	4337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_017027	TCAAA	2	10	4369	4378	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017027	A	6	6	4412	4417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017027	TCT	2	6	4512	4517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383309630
84	NC_017027	CCA	2	6	4558	4563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383309630
85	NC_017027	TAA	2	6	4643	4648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383309630
86	NC_017027	TTAC	2	8	4689	4696	25 %	50 %	0 %	25 %	383309630
87	NC_017027	AGCTG	2	10	4728	4737	20 %	20 %	40 %	20 %	383309630
88	NC_017027	AATT	2	8	4769	4776	50 %	50 %	0 %	0 %	383309630
89	NC_017027	T	6	6	4784	4789	0 %	100 %	0 %	0 %	383309630
90	NC_017027	A	7	7	4877	4883	100 %	0 %	0 %	0 %	383309630
91	NC_017027	CATCTT	2	12	4921	4932	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383309630
92	NC_017027	ATA	2	6	4964	4969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383309630
93	NC_017027	TTG	2	6	5213	5218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383309631
94	NC_017027	T	8	8	5240	5247	0 %	100 %	0 %	0 %	383309631
95	NC_017027	TCT	2	6	5325	5330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383309631
96	NC_017027	TTG	2	6	5408	5413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383309632
97	NC_017027	GT	3	6	5426	5431	0 %	50 %	50 %	0 %	383309632
98	NC_017027	CA	3	6	5476	5481	50 %	0 %	0 %	50 %	383309632
99	NC_017027	TGA	2	6	5563	5568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383309632
100	NC_017027	A	6	6	5588	5593	100 %	0 %	0 %	0 %	383309632
101	NC_017027	TTC	2	6	5621	5626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383309632
102	NC_017027	ATA	2	6	5700	5705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383309632
103	NC_017027	CG	3	6	5715	5720	0 %	0 %	50 %	50 %	383309632
104	NC_017027	ATCA	2	8	5783	5790	50 %	25 %	0 %	25 %	383309632
105	NC_017027	GCA	2	6	5859	5864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383309632
106	NC_017027	TGT	2	6	5873	5878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383309632
107	NC_017027	CAC	2	6	6013	6018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383309633
108	NC_017027	GAC	2	6	6041	6046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383309633
109	NC_017027	TGC	2	6	6124	6129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383309633
110	NC_017027	GCC	2	6	6243	6248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383309633
111	NC_017027	T	7	7	6427	6433	0 %	100 %	0 %	0 %	383309633
112	NC_017027	AAT	2	6	6473	6478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383309634
113	NC_017027	T	7	7	6505	6511	0 %	100 %	0 %	0 %	383309634
114	NC_017027	CT	3	6	6513	6518	0 %	50 %	0 %	50 %	383309634
115	NC_017027	TGC	2	6	6532	6537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383309634
116	NC_017027	CAT	2	6	6598	6603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383309634
117	NC_017027	AAT	2	6	6728	6733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383309634
118	NC_017027	TAAC	2	8	6745	6752	50 %	25 %	0 %	25 %	383309634
119	NC_017027	T	6	6	6776	6781	0 %	100 %	0 %	0 %	383309634
120	NC_017027	T	6	6	6784	6789	0 %	100 %	0 %	0 %	383309634
121	NC_017027	GCA	2	6	6825	6830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383309634
122	NC_017027	AATA	2	8	6836	6843	75 %	25 %	0 %	0 %	383309634
123	NC_017027	CTT	2	6	7051	7056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383309634
124	NC_017027	TTG	2	6	7100	7105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383309634
125	NC_017027	ACA	2	6	7206	7211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383309634
126	NC_017027	TGC	2	6	7245	7250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383309634
127	NC_017027	G	6	6	7300	7305	0 %	0 %	100 %	0 %	383309634
128	NC_017027	AG	3	6	7459	7464	50 %	0 %	50 %	0 %	383309634
129	NC_017027	GCA	2	6	7521	7526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383309634
130	NC_017027	TAA	2	6	7568	7573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383309634
131	NC_017027	AGC	2	6	7598	7603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383309634
132	NC_017027	CCA	2	6	7608	7613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383309634
133	NC_017027	CGA	3	9	7621	7629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383309634
134	NC_017027	TTGA	2	8	7636	7643	25 %	50 %	25 %	0 %	383309634
135	NC_017027	ATG	2	6	7653	7658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383309634
136	NC_017027	CAA	2	6	7687	7692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017027	AAGA	2	8	7720	7727	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017027	GT	3	6	7759	7764	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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