MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrobaculum oguniense TE7 chromosome

Total Repeats: 54382

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016885	GTA	2	6	40	45	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379002963
2	NC_016885	CCG	2	6	120	125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379002963
3	NC_016885	CGA	2	6	132	137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379002963
4	NC_016885	CTG	2	6	169	174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379002963
5	NC_016885	GCG	2	6	182	187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379002963
6	NC_016885	CGC	2	6	273	278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379002964
7	NC_016885	GGTG	2	8	323	330	0 %	25 %	75 %	0 %	379002964
8	NC_016885	GGC	2	6	429	434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379002964
9	NC_016885	CCG	2	6	440	445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379002964
10	NC_016885	CCCG	2	8	488	495	0 %	0 %	25 %	75 %	379002964
11	NC_016885	G	6	6	500	505	0 %	0 %	100 %	0 %	379002964
12	NC_016885	CGC	2	6	531	536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379002964
13	NC_016885	CGGC	2	8	591	598	0 %	0 %	50 %	50 %	379002964
14	NC_016885	CTC	2	6	636	641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379002965
15	NC_016885	GCC	2	6	642	647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379002965
16	NC_016885	CTC	2	6	654	659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379002965
17	NC_016885	CAGC	2	8	682	689	25 %	0 %	25 %	50 %	379002965
18	NC_016885	AGC	2	6	693	698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379002965
19	NC_016885	AG	3	6	724	729	50 %	0 %	50 %	0 %	379002965
20	NC_016885	CCG	2	6	775	780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379002965
21	NC_016885	ACGGCG	2	12	798	809	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	379002965
22	NC_016885	CCG	2	6	820	825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379002965
23	NC_016885	CTC	2	6	921	926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379002965
24	NC_016885	GTC	2	6	971	976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379002965
25	NC_016885	ACC	2	6	987	992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379002965
26	NC_016885	GAA	2	6	1091	1096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379002965
27	NC_016885	T	6	6	1129	1134	0 %	100 %	0 %	0 %	379002965
28	NC_016885	G	6	6	1136	1141	0 %	0 %	100 %	0 %	379002965
29	NC_016885	CG	3	6	1162	1167	0 %	0 %	50 %	50 %	379002965
30	NC_016885	CTC	2	6	1203	1208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379002965
31	NC_016885	AC	3	6	1224	1229	50 %	0 %	0 %	50 %	379002965
32	NC_016885	GAG	2	6	1248	1253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379002966
33	NC_016885	CTT	2	6	1288	1293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379002966
34	NC_016885	GGC	2	6	1306	1311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379002966
35	NC_016885	GCC	2	6	1314	1319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379002966
36	NC_016885	CTCC	2	8	1341	1348	0 %	25 %	0 %	75 %	379002966
37	NC_016885	AGGGCC	2	12	1372	1383	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	379002966
38	NC_016885	CCT	2	6	1389	1394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379002966
39	NC_016885	GGA	2	6	1404	1409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379002966
40	NC_016885	CTC	2	6	1434	1439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379002966
41	NC_016885	G	6	6	1444	1449	0 %	0 %	100 %	0 %	379002966
42	NC_016885	G	6	6	1463	1468	0 %	0 %	100 %	0 %	379002966
43	NC_016885	CCT	2	6	1476	1481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379002966
44	NC_016885	CTC	2	6	1485	1490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379002966
45	NC_016885	CCT	2	6	1496	1501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379002966
46	NC_016885	GCC	2	6	1504	1509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379002966
47	NC_016885	GCGCC	2	10	1535	1544	0 %	0 %	40 %	60 %	379002966
48	NC_016885	CT	3	6	1551	1556	0 %	50 %	0 %	50 %	379002966
49	NC_016885	CTT	2	6	1560	1565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379002966
50	NC_016885	GGC	2	6	1606	1611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379002966
51	NC_016885	GAG	2	6	1612	1617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379002966
52	NC_016885	AGG	2	6	1618	1623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379002966
53	NC_016885	TCC	2	6	1711	1716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379002966
54	NC_016885	CAC	2	6	1729	1734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379002966
55	NC_016885	GAG	2	6	1764	1769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379002966
56	NC_016885	CCT	2	6	1800	1805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379002966
57	NC_016885	AGCC	2	8	1835	1842	25 %	0 %	25 %	50 %	379002966
58	NC_016885	C	6	6	1876	1881	0 %	0 %	0 %	100 %	379002966
59	NC_016885	CTC	2	6	1896	1901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379002966
60	NC_016885	CAA	2	6	1914	1919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379002966
61	NC_016885	CGC	2	6	1968	1973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379002966
62	NC_016885	TATT	2	8	2030	2037	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016885	ACT	2	6	2064	2069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016885	AAT	2	6	2110	2115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016885	TCT	2	6	2191	2196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016885	AT	3	6	2201	2206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016885	TTA	2	6	2257	2262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016885	CT	3	6	2276	2281	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_016885	AAC	2	6	2288	2293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_016885	CGA	2	6	2412	2417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016885	GC	3	6	2470	2475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_016885	CGG	2	6	2477	2482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016885	CTA	2	6	2544	2549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016885	GATG	2	8	2791	2798	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016885	CCG	2	6	2861	2866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_016885	CGGCG	2	10	2927	2936	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
77	NC_016885	GAC	2	6	2940	2945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016885	AT	3	6	3012	3017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016885	GCA	2	6	3070	3075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379002967
80	NC_016885	CGA	2	6	3103	3108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379002967
81	NC_016885	CCA	2	6	3126	3131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379002967
82	NC_016885	AGA	2	6	3148	3153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379002967
83	NC_016885	AAT	2	6	3184	3189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379002967
84	NC_016885	GGC	2	6	3335	3340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379002967
85	NC_016885	CT	3	6	3348	3353	0 %	50 %	0 %	50 %	379002967
86	NC_016885	GAG	2	6	3479	3484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379002967
87	NC_016885	GGC	2	6	3508	3513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379002967
88	NC_016885	CGG	2	6	3531	3536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379002967
89	NC_016885	CCGC	2	8	3572	3579	0 %	0 %	25 %	75 %	379002967
90	NC_016885	GTA	2	6	3653	3658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379002967
91	NC_016885	CGG	2	6	3681	3686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379002967
92	NC_016885	CCA	2	6	3708	3713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379002967
93	NC_016885	GGC	2	6	3736	3741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379002967
94	NC_016885	GGT	2	6	3742	3747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379002967
95	NC_016885	CGG	2	6	3819	3824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379002967
96	NC_016885	GC	3	6	3850	3855	0 %	0 %	50 %	50 %	379002967
97	NC_016885	CCT	2	6	3898	3903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379002967
98	NC_016885	GGCCA	2	10	3933	3942	20 %	0 %	40 %	40 %	379002967
99	NC_016885	G	6	6	3944	3949	0 %	0 %	100 %	0 %	379002967
100	NC_016885	A	6	6	3992	3997	100 %	0 %	0 %	0 %	379002968
101	NC_016885	GTA	2	6	4041	4046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379002968
102	NC_016885	ACC	2	6	4120	4125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379002968
103	NC_016885	CTA	2	6	4135	4140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379002968
104	NC_016885	CT	3	6	4148	4153	0 %	50 %	0 %	50 %	379002968
105	NC_016885	GAC	2	6	4155	4160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379002968
106	NC_016885	CGC	2	6	4266	4271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379002968
107	NC_016885	CCGCG	2	10	4289	4298	0 %	0 %	40 %	60 %	379002968
108	NC_016885	CCAC	2	8	4321	4328	25 %	0 %	0 %	75 %	379002968
109	NC_016885	TC	3	6	4380	4385	0 %	50 %	0 %	50 %	379002968
110	NC_016885	CGC	2	6	4482	4487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379002968
111	NC_016885	GA	3	6	4505	4510	50 %	0 %	50 %	0 %	379002968
112	NC_016885	CCG	2	6	4522	4527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379002968
113	NC_016885	GGCC	2	8	4539	4546	0 %	0 %	50 %	50 %	379002968
114	NC_016885	CCA	2	6	4553	4558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379002968
115	NC_016885	T	6	6	4589	4594	0 %	100 %	0 %	0 %	379002968
116	NC_016885	G	6	6	4605	4610	0 %	0 %	100 %	0 %	379002968
117	NC_016885	CACC	2	8	4611	4618	25 %	0 %	0 %	75 %	379002968
118	NC_016885	TGAGC	2	10	4659	4668	20 %	20 %	40 %	20 %	379002968
119	NC_016885	C	6	6	4678	4683	0 %	0 %	0 %	100 %	379002968
120	NC_016885	TCC	2	6	4696	4701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379002968
121	NC_016885	CTG	2	6	4708	4713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379002968
122	NC_016885	AGG	2	6	4885	4890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379002968
123	NC_016885	TCG	2	6	4921	4926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379002968
124	NC_016885	AGCT	2	8	4944	4951	25 %	25 %	25 %	25 %	379002968
125	NC_016885	CTC	2	6	5118	5123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379002968
126	NC_016885	CGT	3	9	5138	5146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379002968
127	NC_016885	GCCAGC	2	12	5236	5247	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379002968
128	NC_016885	GGTT	2	8	5273	5280	0 %	50 %	50 %	0 %	379002968
129	NC_016885	TTC	2	6	5293	5298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379002968
130	NC_016885	GGA	2	6	5306	5311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379002968
131	NC_016885	CGC	2	6	5356	5361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_016885	CCG	2	6	5470	5475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379002969
133	NC_016885	G	6	6	5491	5496	0 %	0 %	100 %	0 %	379002969
134	NC_016885	GGC	2	6	5525	5530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379002969
135	NC_016885	CT	3	6	5540	5545	0 %	50 %	0 %	50 %	379002969
136	NC_016885	ACC	2	6	5682	5687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379002969
137	NC_016885	CCT	2	6	5702	5707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379002969
138	NC_016885	CCCCA	2	10	5718	5727	20 %	0 %	0 %	80 %	379002969
139	NC_016885	CGC	2	6	5899	5904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379002970
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274	NC_016885	CGG	2	6	11359	11364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379002974
275	NC_016885	CAC	2	6	11412	11417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379002974
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381	NC_016885	GAC	2	6	15528	15533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379002976
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383	NC_016885	GC	3	6	15705	15710	0 %	0 %	50 %	50 %	379002977
384	NC_016885	CGA	2	6	15726	15731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379002977
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387	NC_016885	CAT	2	6	15984	15989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379002978
388	NC_016885	AGTT	2	8	16008	16015	25 %	50 %	25 %	0 %	379002978
389	NC_016885	TG	3	6	16071	16076	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
390	NC_016885	A	6	6	16137	16142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
391	NC_016885	GAA	2	6	16165	16170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379002979
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396	NC_016885	GGA	2	6	16540	16545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379002979
397	NC_016885	AG	3	6	16546	16551	50 %	0 %	50 %	0 %	379002979
398	NC_016885	GTT	2	6	16568	16573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379002979
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