MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pantoea ananatis LMG 5342 plasmid pPANA10

Total Repeats: 5910

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016817	TCTG	2	8	45	52	0 %	50 %	25 %	25 %	378769297
2	NC_016817	GTG	2	6	65	70	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769297
3	NC_016817	CAA	2	6	90	95	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378769297
4	NC_016817	ATA	2	6	98	103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378769297
5	NC_016817	CCA	2	6	200	205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378769297
6	NC_016817	CT	4	8	220	227	0 %	50 %	0 %	50 %	378769297
7	NC_016817	TGGATA	2	12	275	286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378769297
8	NC_016817	TAT	2	6	309	314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378769297
9	NC_016817	CA	3	6	336	341	50 %	0 %	0 %	50 %	378769297
10	NC_016817	CTC	2	6	405	410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378769297
11	NC_016817	CGA	2	6	455	460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769297
12	NC_016817	CT	4	8	464	471	0 %	50 %	0 %	50 %	378769297
13	NC_016817	TTA	2	6	519	524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378769297
14	NC_016817	ACG	2	6	765	770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769297
15	NC_016817	CG	3	6	769	774	0 %	0 %	50 %	50 %	378769297
16	NC_016817	TCA	2	6	842	847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378769297
17	NC_016817	CAG	2	6	852	857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769297
18	NC_016817	GGAA	2	8	888	895	50 %	0 %	50 %	0 %	378769297
19	NC_016817	CTC	2	6	955	960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_016817	TGGC	2	8	1032	1039	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016817	T	7	7	1114	1120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016817	AAT	2	6	1136	1141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016817	T	6	6	1169	1174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016817	CT	3	6	1182	1187	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_016817	CGT	2	6	1248	1253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016817	T	7	7	1338	1344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016817	A	8	8	1406	1413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016817	ATG	2	6	1447	1452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016817	TG	3	6	1451	1456	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016817	TTCCT	2	10	1626	1635	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_016817	GCCC	2	8	1695	1702	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
32	NC_016817	ATG	2	6	1703	1708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016817	TGG	2	6	1796	1801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016817	GTT	2	6	1813	1818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016817	TGA	2	6	1944	1949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016817	CTC	2	6	1950	1955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_016817	TTTC	2	8	2110	2117	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_016817	CA	3	6	2244	2249	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016817	ATG	2	6	2263	2268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016817	TGGCC	2	10	2395	2404	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_016817	CATT	2	8	2472	2479	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_016817	TCA	2	6	2647	2652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016817	TGATA	2	10	2715	2724	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016817	TTG	2	6	2727	2732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016817	TG	3	6	2736	2741	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016817	AGTA	2	8	2781	2788	50 %	25 %	25 %	0 %	378769298
47	NC_016817	GAT	2	6	2797	2802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378769298
48	NC_016817	CTA	2	6	2898	2903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378769298
49	NC_016817	GGC	2	6	2919	2924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769298
50	NC_016817	AG	3	6	2985	2990	50 %	0 %	50 %	0 %	378769298
51	NC_016817	GC	3	6	3009	3014	0 %	0 %	50 %	50 %	378769298
52	NC_016817	ATT	2	6	3055	3060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378769298
53	NC_016817	ATC	3	9	3068	3076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378769298
54	NC_016817	GCG	2	6	3077	3082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769298
55	NC_016817	GGC	2	6	3142	3147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769298
56	NC_016817	CTCACC	2	12	3194	3205	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	378769298
57	NC_016817	TGAT	2	8	3233	3240	25 %	50 %	25 %	0 %	378769298
58	NC_016817	TCT	2	6	3253	3258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378769298
59	NC_016817	ATT	2	6	3376	3381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378769298
60	NC_016817	TG	3	6	3446	3451	0 %	50 %	50 %	0 %	378769298
61	NC_016817	CATT	2	8	3474	3481	25 %	50 %	0 %	25 %	378769298
62	NC_016817	A	6	6	3514	3519	100 %	0 %	0 %	0 %	378769298
63	NC_016817	CTTCAT	2	12	3528	3539	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	378769298
64	NC_016817	CGC	2	6	3582	3587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769298
65	NC_016817	CCT	2	6	3594	3599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378769298
66	NC_016817	ATT	2	6	3679	3684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378769298
67	NC_016817	CT	3	6	3739	3744	0 %	50 %	0 %	50 %	378769298
68	NC_016817	CGG	2	6	3792	3797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769298
69	NC_016817	GTAG	2	8	3892	3899	25 %	25 %	50 %	0 %	378769298
70	NC_016817	GCC	2	6	3928	3933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769298
71	NC_016817	CT	3	6	4058	4063	0 %	50 %	0 %	50 %	378769299
72	NC_016817	CAG	2	6	4241	4246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769299
73	NC_016817	TTC	2	6	4247	4252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378769299
74	NC_016817	ACG	2	6	4303	4308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769299
75	NC_016817	CG	3	6	4310	4315	0 %	0 %	50 %	50 %	378769299
76	NC_016817	GCA	2	6	4316	4321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769299
77	NC_016817	TCA	2	6	4365	4370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378769299
78	NC_016817	CGG	2	6	4465	4470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769299
79	NC_016817	TC	3	6	4563	4568	0 %	50 %	0 %	50 %	378769299
80	NC_016817	TCAG	2	8	4579	4586	25 %	25 %	25 %	25 %	378769299
81	NC_016817	TGAG	2	8	4635	4642	25 %	25 %	50 %	0 %	378769299
82	NC_016817	TGT	2	6	4693	4698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378769299
83	NC_016817	A	6	6	4732	4737	100 %	0 %	0 %	0 %	378769299
84	NC_016817	GATT	2	8	4749	4756	25 %	50 %	25 %	0 %	378769299
85	NC_016817	CT	3	6	4815	4820	0 %	50 %	0 %	50 %	378769299
86	NC_016817	GC	3	6	4847	4852	0 %	0 %	50 %	50 %	378769299
87	NC_016817	A	7	7	4853	4859	100 %	0 %	0 %	0 %	378769299
88	NC_016817	GAA	2	6	4866	4871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378769299
89	NC_016817	GAA	2	6	4945	4950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378769299
90	NC_016817	T	6	6	4999	5004	0 %	100 %	0 %	0 %	378769300
91	NC_016817	AAAT	2	8	5074	5081	75 %	25 %	0 %	0 %	378769300
92	NC_016817	GCC	2	6	5165	5170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_016817	GCC	2	6	5172	5177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_016817	GCC	2	6	5179	5184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_016817	GCC	2	6	5186	5191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_016817	GCC	2	6	5193	5198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_016817	GCC	2	6	5200	5205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_016817	GCC	2	6	5207	5212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_016817	ATG	2	6	5293	5298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016817	ATC	2	6	5348	5353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016817	TCC	2	6	5384	5389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_016817	ATT	2	6	5399	5404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016817	GAA	2	6	5473	5478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016817	GA	3	6	5479	5484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016817	GGT	2	6	5539	5544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016817	ATA	2	6	5552	5557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016817	GAC	2	6	5560	5565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_016817	TGA	2	6	5604	5609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016817	CGTG	2	8	5624	5631	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_016817	TGC	2	6	5660	5665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_016817	AGC	2	6	5673	5678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_016817	TGC	2	6	5898	5903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_016817	TGA	2	6	5983	5988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016817	AGACC	2	10	6098	6107	40 %	0 %	20 %	40 %	378769301
115	NC_016817	A	7	7	6284	6290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016817	GAT	2	6	6458	6463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016817	GT	3	6	6575	6580	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016817	T	6	6	6611	6616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016817	ATG	2	6	6648	6653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016817	TCAG	2	8	6672	6679	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_016817	GA	3	6	6706	6711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016817	T	7	7	6741	6747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016817	AGTA	2	8	6893	6900	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016817	A	6	6	6938	6943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016817	ATAAC	2	10	7022	7031	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_016817	CGA	2	6	7057	7062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_016817	TCA	2	6	7097	7102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_016817	TAT	2	6	7126	7131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016817	AGG	2	6	7241	7246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016817	ATG	2	6	7312	7317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016817	TG	4	8	7404	7411	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016817	TCCA	2	8	7425	7432	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_016817	TGA	2	6	7433	7438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016817	CTG	2	6	7541	7546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_016817	TGC	2	6	7678	7683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_016817	TTG	2	6	7690	7695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016817	T	6	6	7753	7758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016817	CAT	2	6	7764	7769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_016817	ATG	2	6	7854	7859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016817	GAC	2	6	7916	7921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_016817	TCT	2	6	7993	7998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_016817	ATA	2	6	8054	8059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016817	A	8	8	8087	8094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016817	CTGG	2	8	8106	8113	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_016817	TTA	2	6	8114	8119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016817	GC	3	6	8324	8329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_016817	GCG	2	6	8408	8413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_016817	ACA	2	6	8419	8424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_016817	TC	3	6	8431	8436	0 %	50 %	0 %	50 %	378769302
150	NC_016817	GA	3	6	8496	8501	50 %	0 %	50 %	0 %	378769302
151	NC_016817	AAT	2	6	8545	8550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378769302
152	NC_016817	GTAA	2	8	8584	8591	50 %	25 %	25 %	0 %	378769302
153	NC_016817	CCA	2	6	8635	8640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378769302
154	NC_016817	ACT	2	6	8642	8647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378769302
155	NC_016817	GTTC	2	8	8711	8718	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
156	NC_016817	GA	3	6	8770	8775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
157	NC_016817	TGT	2	6	8826	8831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378769303
158	NC_016817	T	6	6	8835	8840	0 %	100 %	0 %	0 %	378769303
159	NC_016817	GTC	2	6	8872	8877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769303
160	NC_016817	AT	3	6	8883	8888	50 %	50 %	0 %	0 %	378769303
161	NC_016817	CAGC	2	8	8899	8906	25 %	0 %	25 %	50 %	378769303
162	NC_016817	CAT	2	6	9006	9011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_016817	AAT	2	6	9151	9156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378769304
164	NC_016817	TGC	2	6	9237	9242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769304
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168	NC_016817	AT	3	6	9458	9463	50 %	50 %	0 %	0 %	378769305
169	NC_016817	TTG	2	6	9467	9472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378769305
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172	NC_016817	CTG	4	12	9514	9525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769305
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174	NC_016817	T	6	6	9588	9593	0 %	100 %	0 %	0 %	378769305
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178	NC_016817	ATCC	2	8	9798	9805	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
179	NC_016817	TTC	2	6	9813	9818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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181	NC_016817	A	6	6	9944	9949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_016817	TAC	2	6	10063	10068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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279	NC_016817	AGA	2	6	14794	14799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378769315
280	NC_016817	GGTGA	2	10	14835	14844	20 %	20 %	60 %	0 %	378769315
281	NC_016817	ATC	2	6	14895	14900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378769315
282	NC_016817	TTG	2	6	14904	14909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378769315
283	NC_016817	AGG	2	6	14920	14925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378769315
284	NC_016817	CGA	2	6	15031	15036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769315
285	NC_016817	GCA	2	6	15044	15049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769315
286	NC_016817	TCA	2	6	15162	15167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378769315
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288	NC_016817	CGG	2	6	15247	15252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769316
289	NC_016817	T	6	6	15382	15387	0 %	100 %	0 %	0 %	378769316
290	NC_016817	AGA	2	6	15445	15450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378769316
291	NC_016817	CAT	2	6	15454	15459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378769316
292	NC_016817	T	6	6	15468	15473	0 %	100 %	0 %	0 %	378769316
293	NC_016817	TTC	2	6	15479	15484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378769316
294	NC_016817	GCT	2	6	15586	15591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769316
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298	NC_016817	TCTG	2	8	15777	15784	0 %	50 %	25 %	25 %	378769316
299	NC_016817	GCA	2	6	15861	15866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769316
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301	NC_016817	ATT	2	6	15923	15928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378769316
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303	NC_016817	TCG	3	9	15997	16005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769316
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313	NC_016817	TGT	2	6	16568	16573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378769317
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396	NC_016817	CGG	3	9	20948	20956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769321
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405	NC_016817	AGC	2	6	21168	21173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769321
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407	NC_016817	ATG	2	6	21197	21202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378769321
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439	NC_016817	A	6	6	22651	22656	100 %	0 %	0 %	0 %	378769323
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