MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudovibrio sp. FO-BEG1 chromosome

Total Repeats: 107369

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_016642	TGGA	2	8	608808	608815	25 %	25 %	50 %	0 %	374328935
12003	NC_016642	ACG	2	6	608859	608864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374328935
12004	NC_016642	GCA	2	6	608973	608978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374328935
12005	NC_016642	AC	3	6	609025	609030	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12006	NC_016642	AGGGC	2	10	609086	609095	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
12007	NC_016642	CAC	2	6	609182	609187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12008	NC_016642	GCA	2	6	609194	609199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374328936
12009	NC_016642	GAA	2	6	609215	609220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374328936
12010	NC_016642	TTC	2	6	609234	609239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374328936
12011	NC_016642	AGC	2	6	609240	609245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374328936
12012	NC_016642	CAG	2	6	609280	609285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374328936
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12014	NC_016642	ATCA	2	8	609458	609465	50 %	25 %	0 %	25 %	374328936
12015	NC_016642	GCC	2	6	609494	609499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374328936
12016	NC_016642	ATC	2	6	609558	609563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374328936
12017	NC_016642	GTC	2	6	609647	609652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374328936
12018	NC_016642	TCA	2	6	609690	609695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374328936
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12021	NC_016642	TCA	2	6	609852	609857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374328936
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12023	NC_016642	AGC	2	6	609978	609983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12024	NC_016642	AACC	2	8	609987	609994	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12025	NC_016642	TGC	2	6	610035	610040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12026	NC_016642	CAA	2	6	610111	610116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12027	NC_016642	ATG	2	6	610206	610211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374328937
12028	NC_016642	TCA	2	6	610234	610239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374328937
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12031	NC_016642	CCA	2	6	610387	610392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374328937
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12034	NC_016642	GCCCG	2	10	610501	610510	0 %	0 %	40 %	60 %	374328937
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12045	NC_016642	CAG	2	6	610952	610957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374328937
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12050	NC_016642	GAG	2	6	611155	611160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12051	NC_016642	GCA	2	6	611224	611229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374328938
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12053	NC_016642	TTC	2	6	611305	611310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374328938
12054	NC_016642	GTT	2	6	611337	611342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374328938
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12062	NC_016642	GATG	2	8	611729	611736	25 %	25 %	50 %	0 %	374328938
12063	NC_016642	CTTG	2	8	611868	611875	0 %	50 %	25 %	25 %	374328938
12064	NC_016642	CCAG	2	8	611940	611947	25 %	0 %	25 %	50 %	374328938
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12089	NC_016642	TGAAA	2	10	612990	612999	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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12091	NC_016642	CCT	2	6	613261	613266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12092	NC_016642	CGCCC	2	10	613274	613283	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
12093	NC_016642	CAGC	2	8	613334	613341	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12094	NC_016642	TC	3	6	613351	613356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12095	NC_016642	GC	3	6	613483	613488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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12100	NC_016642	GC	3	6	613801	613806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12101	NC_016642	AATAC	2	10	613837	613846	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12102	NC_016642	G	6	6	613853	613858	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12103	NC_016642	CTGT	2	8	613870	613877	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12104	NC_016642	TTG	2	6	613923	613928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12105	NC_016642	CG	3	6	613930	613935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12106	NC_016642	GTT	2	6	613936	613941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12107	NC_016642	CGCATG	2	12	613981	613992	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374328940
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12110	NC_016642	GCA	2	6	614098	614103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374328940
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12113	NC_016642	AGCC	2	8	614325	614332	25 %	0 %	25 %	50 %	374328941
12114	NC_016642	CTG	2	6	614516	614521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12115	NC_016642	GCG	2	6	614526	614531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12116	NC_016642	ACC	2	6	614534	614539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12117	NC_016642	CGC	2	6	614540	614545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12118	NC_016642	CCAC	2	8	614576	614583	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
12119	NC_016642	CAA	2	6	614682	614687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12120	NC_016642	CAC	2	6	614691	614696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12121	NC_016642	CCA	2	6	614697	614702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12122	NC_016642	GATT	2	8	614746	614753	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12123	NC_016642	GCT	2	6	614820	614825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12124	NC_016642	CT	3	6	614862	614867	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12125	NC_016642	CAA	2	6	614887	614892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12126	NC_016642	GTT	2	6	615085	615090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12127	NC_016642	CAT	2	6	615119	615124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12128	NC_016642	TGA	2	6	615220	615225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12129	NC_016642	GCG	2	6	615247	615252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12130	NC_016642	ATT	2	6	615295	615300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12131	NC_016642	TGTAA	2	10	615321	615330	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12132	NC_016642	AG	3	6	615436	615441	50 %	0 %	50 %	0 %	374328942
12133	NC_016642	GTA	2	6	615487	615492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374328942
12134	NC_016642	GCC	2	6	615499	615504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374328942
12135	NC_016642	TGG	2	6	615522	615527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374328942
12136	NC_016642	CGA	2	6	615537	615542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374328942
12137	NC_016642	TGGC	2	8	615665	615672	0 %	25 %	50 %	25 %	374328942
12138	NC_016642	C	6	6	615799	615804	0 %	0 %	0 %	100 %	374328942
12139	NC_016642	AAT	2	6	615811	615816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374328942
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12142	NC_016642	CCA	2	6	616087	616092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374328944
12143	NC_016642	CCG	2	6	616219	616224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374328944
12144	NC_016642	TCCA	2	8	616275	616282	25 %	25 %	0 %	50 %	374328944
12145	NC_016642	GC	3	6	616316	616321	0 %	0 %	50 %	50 %	374328944
12146	NC_016642	ACC	2	6	616369	616374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374328944
12147	NC_016642	TGG	2	6	616379	616384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374328944
12148	NC_016642	TCTT	2	8	616513	616520	0 %	75 %	0 %	25 %	374328944
12149	NC_016642	GCG	2	6	616537	616542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374328944
12150	NC_016642	AGC	2	6	616582	616587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374328944
12151	NC_016642	CT	3	6	616647	616652	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12152	NC_016642	GAAA	2	8	616657	616664	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12153	NC_016642	GAG	2	6	616718	616723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12154	NC_016642	GCC	2	6	616757	616762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12155	NC_016642	GAA	2	6	616806	616811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12156	NC_016642	CAT	2	6	616861	616866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374328945
12157	NC_016642	TGCG	2	8	616871	616878	0 %	25 %	50 %	25 %	374328945
12158	NC_016642	CAT	2	6	616911	616916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374328945
12159	NC_016642	TCT	2	6	616937	616942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374328945
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12161	NC_016642	TGA	2	6	616965	616970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374328945
12162	NC_016642	GA	3	6	616969	616974	50 %	0 %	50 %	0 %	374328945
12163	NC_016642	GATC	2	8	616977	616984	25 %	25 %	25 %	25 %	374328945
12164	NC_016642	T	6	6	617091	617096	0 %	100 %	0 %	0 %	374328945
12165	NC_016642	GCTTG	2	10	617106	617115	0 %	40 %	40 %	20 %	374328945
12166	NC_016642	TCA	2	6	617118	617123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374328945
12167	NC_016642	TCT	2	6	617253	617258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374328946
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12179	NC_016642	GC	3	6	617757	617762	0 %	0 %	50 %	50 %	374328946
12180	NC_016642	CCG	2	6	617781	617786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374328946
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12182	NC_016642	CTG	2	6	617836	617841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374328946
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12191	NC_016642	GC	4	8	618375	618382	0 %	0 %	50 %	50 %	374328946
12192	NC_016642	TCAGCG	2	12	618385	618396	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374328946
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12204	NC_016642	GCT	2	6	619232	619237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12207	NC_016642	TGA	2	6	619386	619391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12208	NC_016642	GTC	2	6	619409	619414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12226	NC_016642	AT	3	6	620520	620525	50 %	50 %	0 %	0 %	374328948
12227	NC_016642	ACCC	2	8	620529	620536	25 %	0 %	0 %	75 %	374328948
12228	NC_016642	AAG	2	6	620667	620672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374328948
12229	NC_016642	ATC	2	6	620691	620696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374328948
12230	NC_016642	TTC	2	6	620805	620810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374328948
12231	NC_016642	GCC	2	6	620812	620817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374328948
12232	NC_016642	A	7	7	620882	620888	100 %	0 %	0 %	0 %	374328948
12233	NC_016642	ACC	2	6	620895	620900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374328948
12234	NC_016642	GCG	2	6	620908	620913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374328948
12235	NC_016642	GCT	2	6	620951	620956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374328948
12236	NC_016642	CAA	2	6	620972	620977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374328948
12237	NC_016642	TGAT	2	8	621094	621101	25 %	50 %	25 %	0 %	374328948
12238	NC_016642	GCT	2	6	621181	621186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12239	NC_016642	TTG	2	6	621203	621208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12240	NC_016642	TG	3	6	621302	621307	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12241	NC_016642	GCA	2	6	621367	621372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374328949
12242	NC_016642	CTT	2	6	621445	621450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374328949
12243	NC_016642	CTC	2	6	621451	621456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374328949
12244	NC_016642	TTGG	2	8	621481	621488	0 %	50 %	50 %	0 %	374328949
12245	NC_016642	ACA	2	6	621523	621528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374328949
12246	NC_016642	TGG	2	6	621596	621601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374328949
12247	NC_016642	T	6	6	621757	621762	0 %	100 %	0 %	0 %	374328949
12248	NC_016642	AGG	2	6	621860	621865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374328949
12249	NC_016642	GCA	2	6	621904	621909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374328949
12250	NC_016642	TTG	2	6	621917	621922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374328949
12251	NC_016642	CGTT	2	8	621923	621930	0 %	50 %	25 %	25 %	374328949
12252	NC_016642	TCA	2	6	621953	621958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374328949
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12255	NC_016642	TAC	2	6	622043	622048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12256	NC_016642	GT	3	6	622074	622079	0 %	50 %	50 %	0 %	374328950
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12266	NC_016642	CTG	2	6	622607	622612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12269	NC_016642	AAC	2	6	622727	622732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12270	NC_016642	CTG	2	6	622762	622767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12277	NC_016642	CTG	2	6	623177	623182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374328951
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12285	NC_016642	CAG	2	6	623448	623453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374328952
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12297	NC_016642	ACGTAA	2	12	624084	624095	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12298	NC_016642	TAAAA	2	10	624139	624148	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12299	NC_016642	ATA	2	6	624168	624173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12300	NC_016642	TAG	2	6	624265	624270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12301	NC_016642	TTGTT	2	10	624343	624352	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
12302	NC_016642	GA	4	8	624387	624394	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12303	NC_016642	GCATC	2	10	624487	624496	20 %	20 %	20 %	40 %	374328953
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12485	NC_016642	CTAAC	2	10	633233	633242	40 %	20 %	0 %	40 %	374328963
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12487	NC_016642	GAAGA	2	10	633364	633373	60 %	0 %	40 %	0 %	374328963
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12489	NC_016642	TTC	2	6	633484	633489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374328963
12490	NC_016642	AAG	2	6	633508	633513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374328963
12491	NC_016642	GGA	2	6	633540	633545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374328963
12492	NC_016642	ATC	2	6	633613	633618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374328963
12493	NC_016642	CCT	2	6	633651	633656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374328963
12494	NC_016642	GTC	2	6	633707	633712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374328963
12495	NC_016642	GTT	2	6	633723	633728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374328963
12496	NC_016642	GTT	2	6	633739	633744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374328963
12497	NC_016642	GTG	2	6	633763	633768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374328963
12498	NC_016642	GGAC	2	8	633786	633793	25 %	0 %	50 %	25 %	374328963
12499	NC_016642	TTC	2	6	633809	633814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374328963
12500	NC_016642	CTG	2	6	634071	634076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374328963

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