MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudovibrio sp. FO-BEG1 chromosome

Total Repeats: 107369

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
103001	NC_016642	CGC	2	6	5258249	5258254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374333209
103002	NC_016642	CCG	2	6	5258297	5258302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374333209
103003	NC_016642	A	6	6	5258366	5258371	100 %	0 %	0 %	0 %	374333209
103004	NC_016642	CGC	2	6	5258375	5258380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374333209
103005	NC_016642	A	6	6	5258534	5258539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103006	NC_016642	CGT	2	6	5258621	5258626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103007	NC_016642	TCAT	2	8	5258713	5258720	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103008	NC_016642	AAGA	2	8	5258859	5258866	75 %	0 %	25 %	0 %	374333210
103009	NC_016642	AGC	2	6	5258879	5258884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333210
103010	NC_016642	TTA	2	6	5258981	5258986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103011	NC_016642	CT	3	6	5259020	5259025	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103012	NC_016642	GA	3	6	5259031	5259036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103013	NC_016642	T	6	6	5259069	5259074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103014	NC_016642	T	7	7	5259117	5259123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103015	NC_016642	AAT	2	6	5259152	5259157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103016	NC_016642	GTT	2	6	5259310	5259315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103017	NC_016642	CCA	2	6	5259336	5259341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103018	NC_016642	A	6	6	5259378	5259383	100 %	0 %	0 %	0 %	374333211
103019	NC_016642	CAT	2	6	5259420	5259425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333211
103020	NC_016642	GATT	2	8	5259446	5259453	25 %	50 %	25 %	0 %	374333211
103021	NC_016642	CT	3	6	5259486	5259491	0 %	50 %	0 %	50 %	374333211
103022	NC_016642	A	6	6	5259598	5259603	100 %	0 %	0 %	0 %	374333211
103023	NC_016642	GCC	2	6	5259653	5259658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374333211
103024	NC_016642	CGAAG	2	10	5259672	5259681	40 %	0 %	40 %	20 %	374333211
103025	NC_016642	GTT	2	6	5259715	5259720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374333211
103026	NC_016642	TGC	2	6	5259888	5259893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333211
103027	NC_016642	CTG	3	9	5259905	5259913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333211
103028	NC_016642	ACTT	2	8	5259959	5259966	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103029	NC_016642	CTG	2	6	5259980	5259985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103030	NC_016642	CTTT	2	8	5259995	5260002	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103031	NC_016642	GAG	2	6	5260053	5260058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103032	NC_016642	AGA	3	9	5260139	5260147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374333212
103033	NC_016642	CTT	2	6	5260155	5260160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374333212
103034	NC_016642	CG	3	6	5260188	5260193	0 %	0 %	50 %	50 %	374333212
103035	NC_016642	AAG	2	6	5260285	5260290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374333212
103036	NC_016642	AGC	2	6	5260310	5260315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333212
103037	NC_016642	TGG	2	6	5260365	5260370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374333212
103038	NC_016642	TTCA	2	8	5260380	5260387	25 %	50 %	0 %	25 %	374333212
103039	NC_016642	TCC	2	6	5260396	5260401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374333212
103040	NC_016642	CAAT	2	8	5260403	5260410	50 %	25 %	0 %	25 %	374333212
103041	NC_016642	CGG	2	6	5260421	5260426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374333212
103042	NC_016642	GC	3	6	5260472	5260477	0 %	0 %	50 %	50 %	374333212
103043	NC_016642	AGCA	2	8	5260484	5260491	50 %	0 %	25 %	25 %	374333212
103044	NC_016642	TCA	2	6	5260520	5260525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333212
103045	NC_016642	CAAAC	2	10	5260534	5260543	60 %	0 %	0 %	40 %	374333212
103046	NC_016642	GAT	2	6	5260568	5260573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333212
103047	NC_016642	AAAC	2	8	5260630	5260637	75 %	0 %	0 %	25 %	374333212
103048	NC_016642	GCA	2	6	5260659	5260664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333212
103049	NC_016642	TAA	2	6	5260771	5260776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374333212
103050	NC_016642	AGA	2	6	5260793	5260798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374333212
103051	NC_016642	CGTC	2	8	5260850	5260857	0 %	25 %	25 %	50 %	374333212
103052	NC_016642	TCA	2	6	5260948	5260953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333213
103053	NC_016642	AAC	2	6	5261004	5261009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374333213
103054	NC_016642	CGG	2	6	5261016	5261021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374333213
103055	NC_016642	CGC	2	6	5261032	5261037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374333213
103056	NC_016642	CAC	2	6	5261068	5261073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374333213
103057	NC_016642	AAT	2	6	5261084	5261089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374333213
103058	NC_016642	GC	3	6	5261111	5261116	0 %	0 %	50 %	50 %	374333213
103059	NC_016642	GA	3	6	5261150	5261155	50 %	0 %	50 %	0 %	374333213
103060	NC_016642	ACCA	2	8	5261254	5261261	50 %	0 %	0 %	50 %	374333213
103061	NC_016642	TGT	2	6	5261320	5261325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374333213
103062	NC_016642	CCAG	2	8	5261342	5261349	25 %	0 %	25 %	50 %	374333213
103063	NC_016642	GAAA	2	8	5261673	5261680	75 %	0 %	25 %	0 %	374333213
103064	NC_016642	CAC	2	6	5261701	5261706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374333213
103065	NC_016642	GCT	2	6	5261710	5261715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333213
103066	NC_016642	CG	3	6	5261751	5261756	0 %	0 %	50 %	50 %	374333213
103067	NC_016642	CAT	2	6	5261803	5261808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333213
103068	NC_016642	TCA	2	6	5261905	5261910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333213
103069	NC_016642	CTGACG	2	12	5261939	5261950	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374333213
103070	NC_016642	CAG	2	6	5261998	5262003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333213
103071	NC_016642	GCAAGC	2	12	5262024	5262035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333213
103072	NC_016642	CCCG	2	8	5262059	5262066	0 %	0 %	25 %	75 %	374333213
103073	NC_016642	CAG	2	6	5262085	5262090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333213
103074	NC_016642	CAA	2	6	5262142	5262147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374333213
103075	NC_016642	ACC	2	6	5262149	5262154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374333213
103076	NC_016642	AAC	2	6	5262155	5262160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374333213
103077	NC_016642	CAA	2	6	5262319	5262324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374333213
103078	NC_016642	TGC	2	6	5262326	5262331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333213
103079	NC_016642	ACT	2	6	5262386	5262391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103080	NC_016642	CT	3	6	5262504	5262509	0 %	50 %	0 %	50 %	374333214
103081	NC_016642	TCA	2	6	5262516	5262521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333214
103082	NC_016642	AAT	2	6	5262571	5262576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374333214
103083	NC_016642	ATTA	2	8	5262709	5262716	50 %	50 %	0 %	0 %	374333214
103084	NC_016642	TAA	2	6	5262771	5262776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374333214
103085	NC_016642	ACC	2	6	5262940	5262945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374333214
103086	NC_016642	AG	3	6	5262994	5262999	50 %	0 %	50 %	0 %	374333214
103087	NC_016642	ATA	2	6	5263000	5263005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374333214
103088	NC_016642	GCA	2	6	5263022	5263027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333214
103089	NC_016642	CCA	2	6	5263056	5263061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374333214
103090	NC_016642	TCA	2	6	5263097	5263102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103091	NC_016642	CAC	2	6	5263168	5263173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103092	NC_016642	TAA	2	6	5263198	5263203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103093	NC_016642	AAG	2	6	5263247	5263252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103094	NC_016642	CAAAA	2	10	5263343	5263352	80 %	0 %	0 %	20 %	374333215
103095	NC_016642	AGC	2	6	5263510	5263515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103096	NC_016642	CCT	2	6	5263518	5263523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103097	NC_016642	CCA	2	6	5263616	5263621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103098	NC_016642	TA	3	6	5263663	5263668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103099	NC_016642	AAGT	2	8	5263747	5263754	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103100	NC_016642	CCA	2	6	5263819	5263824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103101	NC_016642	AGA	2	6	5263843	5263848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374333216
103102	NC_016642	TCT	2	6	5263888	5263893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374333216
103103	NC_016642	TCA	2	6	5263905	5263910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333216
103104	NC_016642	CTTG	2	8	5263936	5263943	0 %	50 %	25 %	25 %	374333216
103105	NC_016642	CCA	2	6	5264023	5264028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374333216
103106	NC_016642	AAC	2	6	5264076	5264081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374333216
103107	NC_016642	CAA	2	6	5264168	5264173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374333216
103108	NC_016642	AAG	2	6	5264252	5264257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374333216
103109	NC_016642	GCA	2	6	5264367	5264372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333216
103110	NC_016642	CTG	2	6	5264395	5264400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333216
103111	NC_016642	TCAA	2	8	5264556	5264563	50 %	25 %	0 %	25 %	374333216
103112	NC_016642	GCT	2	6	5264587	5264592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333216
103113	NC_016642	TTGC	2	8	5264597	5264604	0 %	50 %	25 %	25 %	374333216
103114	NC_016642	AT	3	6	5264722	5264727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103115	NC_016642	CACAA	2	10	5264736	5264745	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
103116	NC_016642	ACAA	2	8	5264801	5264808	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
103117	NC_016642	AAT	2	6	5264908	5264913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103118	NC_016642	G	6	6	5265009	5265014	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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103233	NC_016642	GCA	2	6	5271100	5271105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333221
103234	NC_016642	ACG	2	6	5271116	5271121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333221
103235	NC_016642	CAG	2	6	5271128	5271133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333221
103236	NC_016642	CAT	2	6	5271134	5271139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333221
103237	NC_016642	GCA	2	6	5271143	5271148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333221
103238	NC_016642	CCA	2	6	5271184	5271189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374333221
103239	NC_016642	GCA	2	6	5271232	5271237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333221
103240	NC_016642	GTT	2	6	5271304	5271309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374333221
103241	NC_016642	CAG	2	6	5271311	5271316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333221
103242	NC_016642	CCG	2	6	5271362	5271367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374333221
103243	NC_016642	CTT	2	6	5271455	5271460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374333221
103244	NC_016642	GGTC	2	8	5271485	5271492	0 %	25 %	50 %	25 %	374333221
103245	NC_016642	TCT	2	6	5271584	5271589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374333221
103246	NC_016642	CAG	2	6	5271602	5271607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333221
103247	NC_016642	CAG	2	6	5271617	5271622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333221
103248	NC_016642	CAT	2	6	5271713	5271718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333221
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103251	NC_016642	CTGG	2	8	5271894	5271901	0 %	25 %	50 %	25 %	374333221
103252	NC_016642	CAG	2	6	5272040	5272045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333221
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103255	NC_016642	GCA	3	9	5272141	5272149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333221
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103260	NC_016642	GCT	2	6	5272252	5272257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333221
103261	NC_016642	TCT	2	6	5272262	5272267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374333221
103262	NC_016642	GCA	2	6	5272291	5272296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333221
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103267	NC_016642	TTG	2	6	5272419	5272424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374333221
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103270	NC_016642	GCA	2	6	5272474	5272479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333221
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103278	NC_016642	CAA	2	6	5272809	5272814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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103285	NC_016642	GGCA	2	8	5273151	5273158	25 %	0 %	50 %	25 %	374333222
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103294	NC_016642	TCA	2	6	5273860	5273865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333223
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103304	NC_016642	GA	3	6	5274579	5274584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103305	NC_016642	GCT	2	6	5274664	5274669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333224
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103312	NC_016642	TC	3	6	5274849	5274854	0 %	50 %	0 %	50 %	374333224
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103329	NC_016642	GTC	2	6	5275699	5275704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333224
103330	NC_016642	TTC	2	6	5275748	5275753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103331	NC_016642	TGC	2	6	5275767	5275772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103332	NC_016642	GCAC	2	8	5275792	5275799	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
103333	NC_016642	GCGAA	2	10	5275813	5275822	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
103334	NC_016642	GCA	2	6	5275936	5275941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333225
103335	NC_016642	GCA	2	6	5276080	5276085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103336	NC_016642	CCT	2	6	5276224	5276229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103337	NC_016642	GAA	2	6	5276265	5276270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103338	NC_016642	AACA	2	8	5276279	5276286	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
103339	NC_016642	TGCC	2	8	5276297	5276304	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103340	NC_016642	TTA	2	6	5276378	5276383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103341	NC_016642	TGCCT	2	10	5276401	5276410	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
103342	NC_016642	GAC	2	6	5276478	5276483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103343	NC_016642	ACATG	2	10	5276513	5276522	40 %	20 %	20 %	20 %	374333226
103344	NC_016642	CACC	2	8	5276526	5276533	25 %	0 %	0 %	75 %	374333226
103345	NC_016642	TGA	2	6	5276544	5276549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333226
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103347	NC_016642	GAA	2	6	5276644	5276649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374333226
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103463	NC_016642	GCAG	2	8	5282376	5282383	25 %	0 %	50 %	25 %	374333233
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103490	NC_016642	TGG	2	6	5283568	5283573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374333234
103491	NC_016642	CAA	2	6	5283595	5283600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374333234
103492	NC_016642	AAAAG	2	10	5283618	5283627	80 %	0 %	20 %	0 %	374333234
103493	NC_016642	ACC	2	6	5283632	5283637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103494	NC_016642	GGT	2	6	5283642	5283647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103495	NC_016642	ATC	2	6	5283701	5283706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333235
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103497	NC_016642	GGC	2	6	5283729	5283734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374333235
103498	NC_016642	CAA	2	6	5283742	5283747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374333235
103499	NC_016642	CGCC	2	8	5283750	5283757	0 %	0 %	25 %	75 %	374333235
103500	NC_016642	GT	3	6	5283806	5283811	0 %	50 %	50 %	0 %	374333235

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