MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudovibrio sp. FO-BEG1 chromosome

Total Repeats: 107369

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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102002	NC_016642	GCCA	2	8	5207073	5207080	25 %	0 %	25 %	50 %	374333165
102003	NC_016642	CTT	2	6	5207084	5207089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374333165
102004	NC_016642	CTT	2	6	5207138	5207143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374333165
102005	NC_016642	CGA	2	6	5207188	5207193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333165
102006	NC_016642	TTGAAA	2	12	5207416	5207427	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374333165
102007	NC_016642	GCT	2	6	5207448	5207453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102008	NC_016642	A	6	6	5207478	5207483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102009	NC_016642	CAG	2	6	5207493	5207498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102010	NC_016642	GCC	2	6	5207504	5207509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102011	NC_016642	AT	3	6	5207512	5207517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102012	NC_016642	ATT	2	6	5207539	5207544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102013	NC_016642	CGC	2	6	5207677	5207682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374333166
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102017	NC_016642	CATC	2	8	5207916	5207923	25 %	25 %	0 %	50 %	374333166
102018	NC_016642	GCC	2	6	5207980	5207985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374333166
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102102	NC_016642	TC	3	6	5212201	5212206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102103	NC_016642	GCT	2	6	5212270	5212275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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102106	NC_016642	TAA	2	6	5212364	5212369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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102117	NC_016642	TC	3	6	5213151	5213156	0 %	50 %	0 %	50 %	374333171
102118	NC_016642	CAC	2	6	5213223	5213228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374333171
102119	NC_016642	GCT	2	6	5213289	5213294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333171
102120	NC_016642	CGTTCG	2	12	5213331	5213342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333171
102121	NC_016642	CAG	2	6	5213411	5213416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333171
102122	NC_016642	TGA	2	6	5213420	5213425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333171
102123	NC_016642	TC	3	6	5213459	5213464	0 %	50 %	0 %	50 %	374333171
102124	NC_016642	CAG	2	6	5213480	5213485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333171
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102140	NC_016642	ACG	2	6	5213906	5213911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333171
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102145	NC_016642	A	7	7	5214043	5214049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102146	NC_016642	ATA	2	6	5214051	5214056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102147	NC_016642	AAC	2	6	5214095	5214100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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102197	NC_016642	CAGATG	2	12	5217264	5217275	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374333174
102198	NC_016642	TTG	2	6	5217328	5217333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374333174
102199	NC_016642	TGA	2	6	5217392	5217397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333174
102200	NC_016642	CGG	2	6	5217458	5217463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374333174
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102202	NC_016642	GT	3	6	5217519	5217524	0 %	50 %	50 %	0 %	374333174
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102204	NC_016642	TCA	2	6	5217619	5217624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333174
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102207	NC_016642	CCAA	2	8	5217818	5217825	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102208	NC_016642	ATC	2	6	5217832	5217837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102209	NC_016642	CTTTT	2	10	5217859	5217868	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
102210	NC_016642	TCC	2	6	5217970	5217975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102211	NC_016642	A	7	7	5218084	5218090	100 %	0 %	0 %	0 %	374333175
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102214	NC_016642	TGA	2	6	5218218	5218223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333175
102215	NC_016642	CTG	2	6	5218259	5218264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333175
102216	NC_016642	ATG	3	9	5218280	5218288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333175
102217	NC_016642	CAG	2	6	5218294	5218299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333175
102218	NC_016642	GCG	2	6	5218454	5218459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374333175
102219	NC_016642	GTT	2	6	5218468	5218473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374333175
102220	NC_016642	TAG	2	6	5218537	5218542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333175
102221	NC_016642	TGCA	2	8	5218581	5218588	25 %	25 %	25 %	25 %	374333176
102222	NC_016642	ACCAA	2	10	5218624	5218633	60 %	0 %	0 %	40 %	374333176
102223	NC_016642	AGC	2	6	5218636	5218641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333176
102224	NC_016642	AAAC	2	8	5218681	5218688	75 %	0 %	0 %	25 %	374333176
102225	NC_016642	AGA	2	6	5218699	5218704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374333176
102226	NC_016642	GC	3	6	5218727	5218732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102227	NC_016642	A	6	6	5218784	5218789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102228	NC_016642	GCC	2	6	5218855	5218860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102229	NC_016642	GT	3	6	5218872	5218877	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102230	NC_016642	TGG	2	6	5218908	5218913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374333177
102231	NC_016642	AAG	2	6	5218931	5218936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374333177
102232	NC_016642	ACG	2	6	5219018	5219023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333177
102233	NC_016642	CA	5	10	5219062	5219071	50 %	0 %	0 %	50 %	374333177
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102254	NC_016642	CTC	2	6	5220466	5220471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374333179
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102345	NC_016642	GAA	2	6	5225019	5225024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374333183
102346	NC_016642	CAC	2	6	5225245	5225250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102347	NC_016642	CAACA	2	10	5225255	5225264	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
102348	NC_016642	GATCAC	2	12	5225339	5225350	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102349	NC_016642	AGC	2	6	5225351	5225356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102350	NC_016642	CCA	2	6	5225409	5225414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102351	NC_016642	TAA	2	6	5225425	5225430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102352	NC_016642	TGA	2	6	5225468	5225473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333184
102353	NC_016642	AC	3	6	5225474	5225479	50 %	0 %	0 %	50 %	374333184
102354	NC_016642	ACC	2	6	5225627	5225632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374333184
102355	NC_016642	CAC	2	6	5225670	5225675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374333184
102356	NC_016642	GCA	2	6	5225716	5225721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333184
102357	NC_016642	AGA	2	6	5225760	5225765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374333184
102358	NC_016642	CT	3	6	5225860	5225865	0 %	50 %	0 %	50 %	374333184
102359	NC_016642	TCG	2	6	5225906	5225911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333184
102360	NC_016642	GGC	2	6	5225953	5225958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374333184
102361	NC_016642	CCG	2	6	5225993	5225998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374333184
102362	NC_016642	TCT	2	6	5226023	5226028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374333184
102363	NC_016642	AGGCTG	2	12	5226038	5226049	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	374333184
102364	NC_016642	CCTGAT	2	12	5226087	5226098	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374333184
102365	NC_016642	GCT	2	6	5226139	5226144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333184
102366	NC_016642	CAA	2	6	5226180	5226185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374333184
102367	NC_016642	TTG	2	6	5226245	5226250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374333184
102368	NC_016642	CAC	2	6	5226411	5226416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374333184
102369	NC_016642	TTG	2	6	5226458	5226463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374333184
102370	NC_016642	CGC	2	6	5226513	5226518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374333184
102371	NC_016642	GCA	2	6	5226688	5226693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333184
102372	NC_016642	CA	3	6	5226740	5226745	50 %	0 %	0 %	50 %	374333184
102373	NC_016642	ACG	2	6	5226830	5226835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333184
102374	NC_016642	CTG	2	6	5226841	5226846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333184
102375	NC_016642	CGC	2	6	5226852	5226857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374333184
102376	NC_016642	AGA	2	6	5226912	5226917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374333184
102377	NC_016642	TGA	2	6	5227022	5227027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333184
102378	NC_016642	ATG	2	6	5227051	5227056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333184
102379	NC_016642	CCG	2	6	5227085	5227090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374333184
102380	NC_016642	CCG	2	6	5227097	5227102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374333184
102381	NC_016642	CGC	2	6	5227239	5227244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374333184
102382	NC_016642	GTC	2	6	5227315	5227320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333184
102383	NC_016642	GCT	3	9	5227390	5227398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333184
102384	NC_016642	GAT	2	6	5227479	5227484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333184
102385	NC_016642	CAGA	2	8	5227527	5227534	50 %	0 %	25 %	25 %	374333184
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102387	NC_016642	GCA	2	6	5227579	5227584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374333184
102388	NC_016642	GCCATG	2	12	5227618	5227629	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374333184
102389	NC_016642	GTC	2	6	5227642	5227647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333184
102390	NC_016642	TGC	3	9	5227658	5227666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333184
102391	NC_016642	AGA	2	6	5227782	5227787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102392	NC_016642	AAC	2	6	5227803	5227808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102393	NC_016642	ACT	2	6	5227838	5227843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102394	NC_016642	AT	3	6	5227855	5227860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102395	NC_016642	AT	3	6	5227909	5227914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102396	NC_016642	G	6	6	5228020	5228025	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
102397	NC_016642	GCT	2	6	5228071	5228076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333185
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102400	NC_016642	CCA	2	6	5228192	5228197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374333185
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102403	NC_016642	CAA	2	6	5228487	5228492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374333185
102404	NC_016642	CCATCC	2	12	5228542	5228553	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	374333185
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102407	NC_016642	CGG	2	6	5228577	5228582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374333185
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102414	NC_016642	CATT	2	8	5228918	5228925	25 %	50 %	0 %	25 %	374333185
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102417	NC_016642	TTTA	2	8	5229089	5229096	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102418	NC_016642	ATGG	2	8	5229162	5229169	25 %	25 %	50 %	0 %	374333186
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102422	NC_016642	GC	3	6	5229447	5229452	0 %	0 %	50 %	50 %	374333186
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102432	NC_016642	ATA	2	6	5229940	5229945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102433	NC_016642	TAC	2	6	5230030	5230035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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102435	NC_016642	GGT	2	6	5230091	5230096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102436	NC_016642	AGCCA	2	10	5230165	5230174	40 %	0 %	20 %	40 %	374333187
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102438	NC_016642	CAAG	2	8	5230312	5230319	50 %	0 %	25 %	25 %	374333187
102439	NC_016642	GCG	2	6	5230320	5230325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374333187
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102441	NC_016642	CATCC	2	10	5230571	5230580	20 %	20 %	0 %	60 %	374333187
102442	NC_016642	CTGG	2	8	5230631	5230638	0 %	25 %	50 %	25 %	374333187
102443	NC_016642	CAA	2	6	5230678	5230683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374333187
102444	NC_016642	ACC	2	6	5230717	5230722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374333187
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102447	NC_016642	AAG	2	6	5230906	5230911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374333187
102448	NC_016642	AAC	2	6	5230943	5230948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374333187
102449	NC_016642	ATC	2	6	5230952	5230957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333187
102450	NC_016642	CAA	2	6	5230989	5230994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374333187
102451	NC_016642	TGG	2	6	5231025	5231030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374333187
102452	NC_016642	CAT	2	6	5231035	5231040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374333187
102453	NC_016642	TTA	2	6	5231057	5231062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374333187
102454	NC_016642	CT	3	6	5231189	5231194	0 %	50 %	0 %	50 %	374333187
102455	NC_016642	GAAA	2	8	5231209	5231216	75 %	0 %	25 %	0 %	374333187
102456	NC_016642	GACA	2	8	5231227	5231234	50 %	0 %	25 %	25 %	374333187
102457	NC_016642	A	7	7	5231369	5231375	100 %	0 %	0 %	0 %	374333187
102458	NC_016642	AGA	2	6	5231416	5231421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374333187
102459	NC_016642	ATG	2	6	5231478	5231483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374333187
102460	NC_016642	TCG	2	6	5231502	5231507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333187
102461	NC_016642	AAC	2	6	5231534	5231539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374333187
102462	NC_016642	TCG	2	6	5231562	5231567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333187
102463	NC_016642	CTGG	2	8	5231568	5231575	0 %	25 %	50 %	25 %	374333187
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102492	NC_016642	TTG	2	6	5233360	5233365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374333190
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102499	NC_016642	TCG	2	6	5233769	5233774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374333191
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