MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus terrae HPL-003 chromosome

Total Repeats: 117866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_016641	CCCA	2	8	1196261	1196268	25 %	0 %	0 %	75 %	374321000
23003	NC_016641	AAAT	2	8	1196405	1196412	75 %	25 %	0 %	0 %	374321000
23004	NC_016641	TGA	2	6	1196591	1196596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374321000
23005	NC_016641	AAT	2	6	1196622	1196627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374321000
23006	NC_016641	A	6	6	1196662	1196667	100 %	0 %	0 %	0 %	374321000
23007	NC_016641	TCC	3	9	1196728	1196736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23008	NC_016641	CGG	2	6	1196742	1196747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374321001
23009	NC_016641	GCA	2	6	1196899	1196904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374321001
23010	NC_016641	ATC	2	6	1196921	1196926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374321001
23011	NC_016641	TGCT	2	8	1196976	1196983	0 %	50 %	25 %	25 %	374321001
23012	NC_016641	CTC	2	6	1197014	1197019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374321001
23013	NC_016641	T	6	6	1197026	1197031	0 %	100 %	0 %	0 %	374321001
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23015	NC_016641	CAG	2	6	1197266	1197271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374321001
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23017	NC_016641	CCA	2	6	1197355	1197360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374321001
23018	NC_016641	GAAGG	2	10	1197380	1197389	40 %	0 %	60 %	0 %	374321001
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23021	NC_016641	TGT	2	6	1197520	1197525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374321001
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23026	NC_016641	AGG	3	9	1198121	1198129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23027	NC_016641	CGTT	2	8	1198130	1198137	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23028	NC_016641	GA	3	6	1198141	1198146	50 %	0 %	50 %	0 %	374321002
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23047	NC_016641	ATG	2	6	1199223	1199228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23049	NC_016641	TAA	2	6	1199283	1199288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23051	NC_016641	CA	3	6	1199316	1199321	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23052	NC_016641	TGA	2	6	1199423	1199428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374321003
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23065	NC_016641	AT	3	6	1199937	1199942	50 %	50 %	0 %	0 %	374321004
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23104	NC_016641	CTTT	2	8	1201556	1201563	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23105	NC_016641	TAAAA	2	10	1201569	1201578	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23106	NC_016641	ATT	2	6	1201601	1201606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23107	NC_016641	TAA	2	6	1201608	1201613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23108	NC_016641	TTA	2	6	1201618	1201623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23109	NC_016641	ATG	2	6	1201635	1201640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23110	NC_016641	TA	3	6	1201698	1201703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23111	NC_016641	GTC	2	6	1201831	1201836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374321006
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23118	NC_016641	GCTG	2	8	1202095	1202102	0 %	25 %	50 %	25 %	374321006
23119	NC_016641	GCC	2	6	1202134	1202139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374321006
23120	NC_016641	GCG	2	6	1202144	1202149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374321006
23121	NC_016641	CGTG	2	8	1202167	1202174	0 %	25 %	50 %	25 %	374321006
23122	NC_016641	CTT	2	6	1202221	1202226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374321006
23123	NC_016641	GCC	2	6	1202245	1202250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374321006
23124	NC_016641	TCC	2	6	1202273	1202278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374321006
23125	NC_016641	TCC	2	6	1202366	1202371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374321006
23126	NC_016641	TGGT	2	8	1202399	1202406	0 %	50 %	50 %	0 %	374321006
23127	NC_016641	CCAGCA	2	12	1202415	1202426	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	374321006
23128	NC_016641	CTT	2	6	1202571	1202576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374321006
23129	NC_016641	CT	3	6	1202614	1202619	0 %	50 %	0 %	50 %	374321006
23130	NC_016641	CTG	2	6	1202623	1202628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374321006
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23133	NC_016641	TTC	2	6	1202821	1202826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374321006
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23140	NC_016641	TCT	2	6	1203018	1203023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374321006
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23142	NC_016641	TTC	2	6	1203073	1203078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374321006
23143	NC_016641	TCC	2	6	1203131	1203136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374321006
23144	NC_016641	ATC	2	6	1203143	1203148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374321006
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23151	NC_016641	GCC	2	6	1203427	1203432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374321006
23152	NC_016641	GCA	2	6	1203458	1203463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374321006
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23156	NC_016641	TCGG	2	8	1203678	1203685	0 %	25 %	50 %	25 %	374321006
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23159	NC_016641	TTG	2	6	1203820	1203825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374321006
23160	NC_016641	TTTA	2	8	1203857	1203864	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23161	NC_016641	TAG	2	6	1203907	1203912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23166	NC_016641	CCT	2	6	1204102	1204107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23167	NC_016641	TG	3	6	1204118	1204123	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23168	NC_016641	GTGCCC	2	12	1204189	1204200	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	374321008
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23184	NC_016641	ATA	2	6	1205225	1205230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374321008
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23189	NC_016641	T	6	6	1205440	1205445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23190	NC_016641	ATT	2	6	1205489	1205494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23191	NC_016641	CATT	2	8	1205513	1205520	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23192	NC_016641	AAG	2	6	1205655	1205660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374321009
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23202	NC_016641	C	6	6	1206180	1206185	0 %	0 %	0 %	100 %	374321009
23203	NC_016641	CGC	2	6	1206254	1206259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374321009
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23218	NC_016641	TGGA	2	8	1206804	1206811	25 %	25 %	50 %	0 %	374321010
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23220	NC_016641	CCG	2	6	1206923	1206928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374321010
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23222	NC_016641	TCA	2	6	1206969	1206974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374321010
23223	NC_016641	CGC	2	6	1207186	1207191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374321010
23224	NC_016641	GAT	2	6	1207213	1207218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374321010
23225	NC_016641	ATA	2	6	1207219	1207224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374321010
23226	NC_016641	TCC	2	6	1207229	1207234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374321010
23227	NC_016641	TCA	2	6	1207289	1207294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374321010
23228	NC_016641	CCGCT	2	10	1207306	1207315	0 %	20 %	20 %	60 %	374321010
23229	NC_016641	AGCC	2	8	1207327	1207334	25 %	0 %	25 %	50 %	374321010
23230	NC_016641	CGT	2	6	1207335	1207340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374321010
23231	NC_016641	CTCTC	2	10	1207613	1207622	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
23232	NC_016641	T	7	7	1207632	1207638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23233	NC_016641	AT	3	6	1207684	1207689	50 %	50 %	0 %	0 %	374321011
23234	NC_016641	AAT	2	6	1207722	1207727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374321011
23235	NC_016641	TA	3	6	1207858	1207863	50 %	50 %	0 %	0 %	374321011
23236	NC_016641	ATA	2	6	1207876	1207881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374321011
23237	NC_016641	AAT	2	6	1207917	1207922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374321011
23238	NC_016641	AGG	2	6	1207943	1207948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374321011
23239	NC_016641	AAT	2	6	1208022	1208027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374321011
23240	NC_016641	ACA	2	6	1208042	1208047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374321011
23241	NC_016641	CGC	2	6	1208052	1208057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374321011
23242	NC_016641	TTG	2	6	1208083	1208088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374321011
23243	NC_016641	ATC	2	6	1208203	1208208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374321011
23244	NC_016641	GAT	2	6	1208229	1208234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374321011
23245	NC_016641	GCA	2	6	1208405	1208410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374321011
23246	NC_016641	CGA	2	6	1208414	1208419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374321011
23247	NC_016641	TGC	2	6	1208450	1208455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374321011
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23250	NC_016641	CAG	2	6	1208543	1208548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374321012
23251	NC_016641	GACC	2	8	1208575	1208582	25 %	0 %	25 %	50 %	374321012
23252	NC_016641	GCC	2	6	1208642	1208647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374321012
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23257	NC_016641	AGCCC	2	10	1208926	1208935	20 %	0 %	20 %	60 %	374321012
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23262	NC_016641	CAG	2	6	1209287	1209292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374321012
23263	NC_016641	AAT	2	6	1209320	1209325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374321012
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23267	NC_016641	CGT	2	6	1209485	1209490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374321013
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23269	NC_016641	AAT	2	6	1209546	1209551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374321013
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23286	NC_016641	TAT	2	6	1210818	1210823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23287	NC_016641	TAT	2	6	1210847	1210852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23288	NC_016641	GCA	2	6	1210915	1210920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23290	NC_016641	TAA	2	6	1211029	1211034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23291	NC_016641	AGG	2	6	1211044	1211049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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23325	NC_016641	CCTG	2	8	1213446	1213453	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23326	NC_016641	AAC	2	6	1213478	1213483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23327	NC_016641	GTT	2	6	1213503	1213508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23329	NC_016641	TGC	2	6	1213554	1213559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23331	NC_016641	AGC	2	6	1213647	1213652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374321016
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23337	NC_016641	GAA	2	6	1213923	1213928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374321016
23338	NC_016641	TTC	2	6	1213978	1213983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374321016
23339	NC_016641	AT	3	6	1214003	1214008	50 %	50 %	0 %	0 %	374321016
23340	NC_016641	ATG	2	6	1214056	1214061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374321016
23341	NC_016641	GTA	2	6	1214082	1214087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374321016
23342	NC_016641	CCA	2	6	1214176	1214181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374321016
23343	NC_016641	CTA	2	6	1214207	1214212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374321016
23344	NC_016641	GAC	2	6	1214271	1214276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374321016
23345	NC_016641	ACC	2	6	1214460	1214465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374321016
23346	NC_016641	GAT	2	6	1214510	1214515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374321016
23347	NC_016641	A	7	7	1214517	1214523	100 %	0 %	0 %	0 %	374321016
23348	NC_016641	C	6	6	1214967	1214972	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23349	NC_016641	CCG	2	6	1215012	1215017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23350	NC_016641	CTC	2	6	1215035	1215040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23351	NC_016641	CCA	2	6	1215112	1215117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374321018
23352	NC_016641	CCT	2	6	1215277	1215282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23353	NC_016641	TAA	2	6	1215395	1215400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374321019
23354	NC_016641	T	6	6	1215451	1215456	0 %	100 %	0 %	0 %	374321019
23355	NC_016641	CCCG	2	8	1215494	1215501	0 %	0 %	25 %	75 %	374321019
23356	NC_016641	CCAG	2	8	1215506	1215513	25 %	0 %	25 %	50 %	374321019
23357	NC_016641	T	6	6	1215608	1215613	0 %	100 %	0 %	0 %	374321019
23358	NC_016641	GCA	2	6	1215751	1215756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374321019
23359	NC_016641	AAT	2	6	1215813	1215818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374321019
23360	NC_016641	AAT	2	6	1215822	1215827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374321019
23361	NC_016641	ATAA	2	8	1215832	1215839	75 %	25 %	0 %	0 %	374321019
23362	NC_016641	CAT	2	6	1215895	1215900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23363	NC_016641	CTCG	2	8	1215907	1215914	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23364	NC_016641	ACTA	2	8	1215922	1215929	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23365	NC_016641	AAT	2	6	1215950	1215955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23366	NC_016641	TTGTT	2	10	1216024	1216033	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
23367	NC_016641	TTGTT	2	10	1216038	1216047	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
23368	NC_016641	GAC	2	6	1216049	1216054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23369	NC_016641	A	7	7	1216060	1216066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23370	NC_016641	CTGTTG	2	12	1216092	1216103	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23371	NC_016641	TAAA	2	8	1216203	1216210	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23372	NC_016641	CGA	2	6	1216220	1216225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23381	NC_016641	ACA	2	6	1216743	1216748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374321020
23382	NC_016641	CAA	2	6	1216774	1216779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374321020
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23388	NC_016641	GATA	2	8	1217036	1217043	50 %	25 %	25 %	0 %	374321020
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23393	NC_016641	TACG	2	8	1217225	1217232	25 %	25 %	25 %	25 %	374321020
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23401	NC_016641	TA	3	6	1217380	1217385	50 %	50 %	0 %	0 %	374321021
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23445	NC_016641	CTT	2	6	1220217	1220222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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23449	NC_016641	A	6	6	1220386	1220391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23469	NC_016641	GCCC	2	8	1221307	1221314	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
23470	NC_016641	GTTAA	2	10	1221365	1221374	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23471	NC_016641	ATTC	2	8	1221375	1221382	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23472	NC_016641	AT	3	6	1221416	1221421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23473	NC_016641	TTC	2	6	1221480	1221485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23474	NC_016641	C	6	6	1221518	1221523	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23475	NC_016641	TGG	2	6	1221529	1221534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23476	NC_016641	TA	3	6	1221544	1221549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23477	NC_016641	AGG	2	6	1221553	1221558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23478	NC_016641	ATG	2	6	1221564	1221569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374321025
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23480	NC_016641	GAA	2	6	1221632	1221637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374321025
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23499	NC_016641	GTAT	2	8	1222876	1222883	25 %	50 %	25 %	0 %	374321025
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