MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus terrae HPL-003 chromosome

Total Repeats: 117866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_016641	TTC	2	6	1095727	1095732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320902
21003	NC_016641	CAC	2	6	1095733	1095738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374320902
21004	NC_016641	A	6	6	1095787	1095792	100 %	0 %	0 %	0 %	374320902
21005	NC_016641	ACCAAT	2	12	1095880	1095891	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	374320902
21006	NC_016641	CCA	2	6	1095975	1095980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374320903
21007	NC_016641	A	7	7	1096028	1096034	100 %	0 %	0 %	0 %	374320903
21008	NC_016641	TCA	2	6	1096054	1096059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320903
21009	NC_016641	GCT	2	6	1096098	1096103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320903
21010	NC_016641	CG	3	6	1096131	1096136	0 %	0 %	50 %	50 %	374320903
21011	NC_016641	CAT	2	6	1096184	1096189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320903
21012	NC_016641	CGA	2	6	1096228	1096233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320903
21013	NC_016641	AAT	2	6	1096235	1096240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320903
21014	NC_016641	TTC	2	6	1096242	1096247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320903
21015	NC_016641	CTT	2	6	1096309	1096314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320903
21016	NC_016641	TGCAT	2	10	1096335	1096344	20 %	40 %	20 %	20 %	374320903
21017	NC_016641	ACC	2	6	1096455	1096460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374320903
21018	NC_016641	TCT	2	6	1096519	1096524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320903
21019	NC_016641	TTC	2	6	1096532	1096537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320903
21020	NC_016641	TGA	2	6	1096552	1096557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320903
21021	NC_016641	CTC	2	6	1096586	1096591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374320903
21022	NC_016641	CGC	2	6	1096643	1096648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320903
21023	NC_016641	ACAGGC	2	12	1096656	1096667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320903
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21026	NC_016641	GACG	2	8	1096739	1096746	25 %	0 %	50 %	25 %	374320903
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21029	NC_016641	CTTC	2	8	1096885	1096892	0 %	50 %	0 %	50 %	374320903
21030	NC_016641	TGA	2	6	1096906	1096911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320903
21031	NC_016641	CGG	2	6	1097026	1097031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320903
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21033	NC_016641	TTCAT	2	10	1097091	1097100	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21034	NC_016641	GCC	2	6	1097159	1097164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320904
21035	NC_016641	ACG	2	6	1097165	1097170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320904
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21043	NC_016641	CTG	2	6	1097539	1097544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320904
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21047	NC_016641	ATC	2	6	1097696	1097701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320904
21048	NC_016641	TA	3	6	1097802	1097807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21049	NC_016641	TCTGG	2	10	1097992	1098001	0 %	40 %	40 %	20 %	374320905
21050	NC_016641	CGT	2	6	1098093	1098098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320905
21051	NC_016641	ATA	2	6	1098157	1098162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320905
21052	NC_016641	T	7	7	1098163	1098169	0 %	100 %	0 %	0 %	374320905
21053	NC_016641	TGC	2	6	1098284	1098289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320905
21054	NC_016641	GCT	2	6	1098317	1098322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320905
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21061	NC_016641	CTG	2	6	1098518	1098523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320905
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21088	NC_016641	AAT	2	6	1099571	1099576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320906
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21090	NC_016641	A	6	6	1099656	1099661	100 %	0 %	0 %	0 %	374320906
21091	NC_016641	CA	4	8	1099670	1099677	50 %	0 %	0 %	50 %	374320906
21092	NC_016641	CCAA	2	8	1099755	1099762	50 %	0 %	0 %	50 %	374320906
21093	NC_016641	CTG	2	6	1099777	1099782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320906
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21095	NC_016641	TCA	2	6	1099794	1099799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21096	NC_016641	TA	4	8	1099829	1099836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21101	NC_016641	GCC	2	6	1100093	1100098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320907
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21116	NC_016641	GGC	2	6	1100656	1100661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320907
21117	NC_016641	GCA	3	9	1100766	1100774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320907
21118	NC_016641	GCCT	2	8	1100840	1100847	0 %	25 %	25 %	50 %	374320907
21119	NC_016641	GC	3	6	1100860	1100865	0 %	0 %	50 %	50 %	374320907
21120	NC_016641	GC	3	6	1100875	1100880	0 %	0 %	50 %	50 %	374320907
21121	NC_016641	CG	3	6	1100971	1100976	0 %	0 %	50 %	50 %	374320907
21122	NC_016641	GTC	2	6	1101030	1101035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320907
21123	NC_016641	CGT	2	6	1101071	1101076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320907
21124	NC_016641	GCA	2	6	1101148	1101153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320907
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21127	NC_016641	CAT	2	6	1101304	1101309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320907
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21129	NC_016641	CCATA	2	10	1101436	1101445	40 %	20 %	0 %	40 %	374320907
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21132	NC_016641	TCC	2	6	1101528	1101533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374320907
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21135	NC_016641	CTATG	2	10	1101730	1101739	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21136	NC_016641	TCTA	2	8	1101751	1101758	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21137	NC_016641	TA	3	6	1101766	1101771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21138	NC_016641	A	7	7	1101789	1101795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21139	NC_016641	ATC	2	6	1101834	1101839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320908
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21142	NC_016641	AGGT	2	8	1102039	1102046	25 %	25 %	50 %	0 %	374320908
21143	NC_016641	T	6	6	1102069	1102074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21144	NC_016641	CTC	2	6	1102112	1102117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21145	NC_016641	TGTC	2	8	1102193	1102200	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21146	NC_016641	T	6	6	1102288	1102293	0 %	100 %	0 %	0 %	374320909
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21152	NC_016641	TCA	2	6	1102538	1102543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320909
21153	NC_016641	CATG	2	8	1102556	1102563	25 %	25 %	25 %	25 %	374320909
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21155	NC_016641	TGACC	2	10	1102640	1102649	20 %	20 %	20 %	40 %	374320909
21156	NC_016641	GCATC	2	10	1102661	1102670	20 %	20 %	20 %	40 %	374320909
21157	NC_016641	ATG	2	6	1102722	1102727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320909
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21159	NC_016641	AAAT	2	8	1102872	1102879	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21160	NC_016641	CAA	2	6	1102916	1102921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21161	NC_016641	A	7	7	1102920	1102926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21162	NC_016641	TTAGTT	2	12	1102983	1102994	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	374320910
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21177	NC_016641	TTTC	2	8	1103862	1103869	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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21187	NC_016641	CCA	2	6	1104793	1104798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374320911
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21203	NC_016641	ATT	2	6	1105752	1105757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374320913
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21215	NC_016641	ATA	2	6	1106331	1106336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320913
21216	NC_016641	CCT	2	6	1106365	1106370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374320913
21217	NC_016641	CCTT	2	8	1106434	1106441	0 %	50 %	0 %	50 %	374320913
21218	NC_016641	C	7	7	1106499	1106505	0 %	0 %	0 %	100 %	374320913
21219	NC_016641	AGAAC	2	10	1106509	1106518	60 %	0 %	20 %	20 %	374320913
21220	NC_016641	ACAG	2	8	1106525	1106532	50 %	0 %	25 %	25 %	374320913
21221	NC_016641	GCT	2	6	1106539	1106544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320913
21222	NC_016641	TCA	2	6	1106579	1106584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320913
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21224	NC_016641	T	8	8	1106619	1106626	0 %	100 %	0 %	0 %	374320914
21225	NC_016641	TTG	3	9	1106634	1106642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374320914
21226	NC_016641	CCA	2	6	1106678	1106683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374320914
21227	NC_016641	AAC	2	6	1106693	1106698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374320914
21228	NC_016641	ACG	2	6	1106758	1106763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320914
21229	NC_016641	ATA	2	6	1106925	1106930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320914
21230	NC_016641	TGCC	2	8	1106966	1106973	0 %	25 %	25 %	50 %	374320914
21231	NC_016641	GC	3	6	1106983	1106988	0 %	0 %	50 %	50 %	374320914
21232	NC_016641	CAT	2	6	1107065	1107070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320914
21233	NC_016641	CGC	2	6	1107110	1107115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320914
21234	NC_016641	GTC	2	6	1107135	1107140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320914
21235	NC_016641	GCA	2	6	1107142	1107147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320914
21236	NC_016641	ATG	2	6	1107152	1107157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320914
21237	NC_016641	GCAG	2	8	1107183	1107190	25 %	0 %	50 %	25 %	374320914
21238	NC_016641	TGA	2	6	1107241	1107246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320914
21239	NC_016641	A	6	6	1107246	1107251	100 %	0 %	0 %	0 %	374320914
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21241	NC_016641	CAT	2	6	1107278	1107283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320914
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21250	NC_016641	CGC	2	6	1107785	1107790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320914
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21269	NC_016641	ATT	2	6	1109014	1109019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21271	NC_016641	CTT	2	6	1109043	1109048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21273	NC_016641	TTAA	2	8	1109122	1109129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21274	NC_016641	ACA	2	6	1109264	1109269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21277	NC_016641	CTT	2	6	1109342	1109347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21283	NC_016641	TATTG	2	10	1109751	1109760	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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21295	NC_016641	GGA	2	6	1110675	1110680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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21347	NC_016641	GCC	2	6	1114055	1114060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320921
21348	NC_016641	AGC	2	6	1114078	1114083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320921
21349	NC_016641	TTA	2	6	1114176	1114181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21351	NC_016641	ATG	2	6	1114242	1114247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21352	NC_016641	AGG	2	6	1114279	1114284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374320922
21353	NC_016641	T	7	7	1114288	1114294	0 %	100 %	0 %	0 %	374320922
21354	NC_016641	G	6	6	1114354	1114359	0 %	0 %	100 %	0 %	374320922
21355	NC_016641	CATTG	2	10	1114379	1114388	20 %	40 %	20 %	20 %	374320922
21356	NC_016641	CAA	2	6	1114389	1114394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374320922
21357	NC_016641	TGT	2	6	1114456	1114461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374320922
21358	NC_016641	AGGGCA	2	12	1114495	1114506	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	374320922
21359	NC_016641	GCA	2	6	1114584	1114589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320922
21360	NC_016641	TAT	2	6	1114607	1114612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374320922
21361	NC_016641	GAT	2	6	1114628	1114633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320922
21362	NC_016641	GAT	2	6	1114643	1114648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320922
21363	NC_016641	GCC	2	6	1114670	1114675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320922
21364	NC_016641	AC	3	6	1114681	1114686	50 %	0 %	0 %	50 %	374320922
21365	NC_016641	CTGG	2	8	1114707	1114714	0 %	25 %	50 %	25 %	374320922
21366	NC_016641	TAC	2	6	1114774	1114779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320922
21367	NC_016641	GCT	3	9	1114781	1114789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320922
21368	NC_016641	CCTG	2	8	1114879	1114886	0 %	25 %	25 %	50 %	374320922
21369	NC_016641	GTC	2	6	1114911	1114916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320922
21370	NC_016641	CCGCCT	2	12	1114921	1114932	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	374320922
21371	NC_016641	GCA	2	6	1114958	1114963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320922
21372	NC_016641	GGTC	2	8	1114969	1114976	0 %	25 %	50 %	25 %	374320922
21373	NC_016641	CAC	2	6	1115056	1115061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374320922
21374	NC_016641	TATT	2	8	1115074	1115081	25 %	75 %	0 %	0 %	374320922
21375	NC_016641	CT	3	6	1115207	1115212	0 %	50 %	0 %	50 %	374320922
21376	NC_016641	CGC	2	6	1115232	1115237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320922
21377	NC_016641	TAT	2	6	1115372	1115377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374320923
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21381	NC_016641	GCG	2	6	1115486	1115491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320923
21382	NC_016641	ATA	2	6	1115549	1115554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320923
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21388	NC_016641	TGA	2	6	1115925	1115930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320923
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21456	NC_016641	TA	3	6	1119347	1119352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21457	NC_016641	TTC	2	6	1119388	1119393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21458	NC_016641	TA	3	6	1119403	1119408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21459	NC_016641	CCG	2	6	1119412	1119417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21460	NC_016641	CGG	2	6	1119430	1119435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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21464	NC_016641	TGC	2	6	1119572	1119577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320927
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21467	NC_016641	ATCA	2	8	1119645	1119652	50 %	25 %	0 %	25 %	374320927
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21471	NC_016641	CAG	2	6	1120011	1120016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320927
21472	NC_016641	CATCA	2	10	1120065	1120074	40 %	20 %	0 %	40 %	374320927
21473	NC_016641	ACGT	2	8	1120091	1120098	25 %	25 %	25 %	25 %	374320927
21474	NC_016641	GCG	2	6	1120143	1120148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320927
21475	NC_016641	GGAA	2	8	1120176	1120183	50 %	0 %	50 %	0 %	374320927
21476	NC_016641	GCT	2	6	1120258	1120263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320927
21477	NC_016641	GCTT	2	8	1120288	1120295	0 %	50 %	25 %	25 %	374320927
21478	NC_016641	AC	3	6	1120307	1120312	50 %	0 %	0 %	50 %	374320928
21479	NC_016641	TCC	2	6	1120313	1120318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374320928
21480	NC_016641	CATGGG	2	12	1120327	1120338	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	374320928
21481	NC_016641	TCA	2	6	1120396	1120401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320928
21482	NC_016641	ATA	2	6	1120431	1120436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320928
21483	NC_016641	TGA	2	6	1120440	1120445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320928
21484	NC_016641	CGTC	2	8	1120455	1120462	0 %	25 %	25 %	50 %	374320928
21485	NC_016641	TA	3	6	1120534	1120539	50 %	50 %	0 %	0 %	374320928
21486	NC_016641	GAT	2	6	1120603	1120608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320928
21487	NC_016641	AACG	2	8	1120687	1120694	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21488	NC_016641	TATT	2	8	1120702	1120709	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21489	NC_016641	AATT	2	8	1120732	1120739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21490	NC_016641	GCT	2	6	1120794	1120799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21491	NC_016641	CATA	2	8	1120835	1120842	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21492	NC_016641	GGA	2	6	1120846	1120851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21493	NC_016641	CTG	2	6	1120912	1120917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320929
21494	NC_016641	ATT	2	6	1120959	1120964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374320929
21495	NC_016641	AT	3	6	1120992	1120997	50 %	50 %	0 %	0 %	374320929
21496	NC_016641	TGC	2	6	1121012	1121017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320929
21497	NC_016641	GC	3	6	1121057	1121062	0 %	0 %	50 %	50 %	374320929
21498	NC_016641	CTTT	2	8	1121067	1121074	0 %	75 %	0 %	25 %	374320929
21499	NC_016641	T	6	6	1121072	1121077	0 %	100 %	0 %	0 %	374320929
21500	NC_016641	CTT	2	6	1121120	1121125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320929

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