MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus terrae HPL-003 chromosome

Total Repeats: 117866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19121	NC_016641	CAA	2	6	996826	996831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19122	NC_016641	ATA	2	6	996850	996855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19123	NC_016641	CCG	2	6	996954	996959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19124	NC_016641	CAT	2	6	997032	997037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19125	NC_016641	TTCGC	2	10	997135	997144	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
19126	NC_016641	T	6	6	997181	997186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19127	NC_016641	ACA	2	6	997332	997337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19128	NC_016641	AAC	2	6	997363	997368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19129	NC_016641	AT	3	6	997378	997383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19130	NC_016641	CAT	2	6	997398	997403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19131	NC_016641	GTTTT	2	10	997457	997466	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
19132	NC_016641	TA	3	6	997467	997472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19133	NC_016641	CA	3	6	997478	997483	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19134	NC_016641	GGCA	2	8	997523	997530	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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19137	NC_016641	ATCAA	2	10	997712	997721	60 %	20 %	0 %	20 %	374320801
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19156	NC_016641	GCT	2	6	998698	998703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320802
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19161	NC_016641	CCGT	2	8	998959	998966	0 %	25 %	25 %	50 %	374320803
19162	NC_016641	ACGA	2	8	998997	999004	50 %	0 %	25 %	25 %	374320803
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19170	NC_016641	CA	3	6	999736	999741	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19171	NC_016641	GAC	2	6	999827	999832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320804
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19193	NC_016641	GCCA	2	8	1000918	1000925	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19194	NC_016641	TA	3	6	1000932	1000937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19195	NC_016641	CTT	2	6	1000969	1000974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320805
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19197	NC_016641	TCG	2	6	1001003	1001008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320805
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19201	NC_016641	TA	3	6	1001281	1001286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19202	NC_016641	TATT	2	8	1001323	1001330	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19203	NC_016641	GAT	3	9	1001388	1001396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19206	NC_016641	CCG	2	6	1001530	1001535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320806
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19214	NC_016641	GCT	2	6	1002024	1002029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320806
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19218	NC_016641	TCCT	2	8	1002315	1002322	0 %	50 %	0 %	50 %	374320807
19219	NC_016641	CCGTAG	2	12	1002367	1002378	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374320807
19220	NC_016641	CGATC	2	10	1002389	1002398	20 %	20 %	20 %	40 %	374320807
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19222	NC_016641	CCT	2	6	1002475	1002480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374320807
19223	NC_016641	CTCC	2	8	1002541	1002548	0 %	25 %	0 %	75 %	374320807
19224	NC_016641	GGC	2	6	1002605	1002610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320807
19225	NC_016641	GCT	2	6	1002644	1002649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320807
19226	NC_016641	AC	3	6	1002665	1002670	50 %	0 %	0 %	50 %	374320807
19227	NC_016641	A	8	8	1002737	1002744	100 %	0 %	0 %	0 %	374320807
19228	NC_016641	CT	3	6	1002849	1002854	0 %	50 %	0 %	50 %	374320807
19229	NC_016641	CCG	2	6	1002914	1002919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320807
19230	NC_016641	TCA	2	6	1002934	1002939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320807
19231	NC_016641	CG	3	6	1002967	1002972	0 %	0 %	50 %	50 %	374320807
19232	NC_016641	GGC	2	6	1003012	1003017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320807
19233	NC_016641	CGG	2	6	1003022	1003027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320807
19234	NC_016641	CTA	2	6	1003028	1003033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320807
19235	NC_016641	GACGT	2	10	1003081	1003090	20 %	20 %	40 %	20 %	374320807
19236	NC_016641	GCC	2	6	1003111	1003116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320807
19237	NC_016641	GC	3	6	1003128	1003133	0 %	0 %	50 %	50 %	374320807
19238	NC_016641	GCG	2	6	1003138	1003143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320807
19239	NC_016641	GGC	2	6	1003231	1003236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320807
19240	NC_016641	CAG	2	6	1003266	1003271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320807
19241	NC_016641	CAG	2	6	1003296	1003301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320807
19242	NC_016641	GCG	3	9	1003312	1003320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320807
19243	NC_016641	GCG	2	6	1003332	1003337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320807
19244	NC_016641	GCG	2	6	1003385	1003390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320807
19245	NC_016641	GGC	2	6	1003393	1003398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320807
19246	NC_016641	CGCGGG	2	12	1003406	1003417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320807
19247	NC_016641	GCG	2	6	1003439	1003444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320807
19248	NC_016641	CCG	3	9	1003475	1003483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320807
19249	NC_016641	CGG	2	6	1003527	1003532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320807
19250	NC_016641	CTG	2	6	1003539	1003544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320807
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19252	NC_016641	ATG	2	6	1003626	1003631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320807
19253	NC_016641	CAG	2	6	1003722	1003727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19254	NC_016641	GTC	2	6	1003747	1003752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19255	NC_016641	A	7	7	1003812	1003818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19256	NC_016641	TA	3	6	1003885	1003890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19257	NC_016641	CAGTC	2	10	1004104	1004113	20 %	20 %	20 %	40 %	374320808
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19261	NC_016641	CAT	2	6	1004314	1004319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320808
19262	NC_016641	TTC	2	6	1004440	1004445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320808
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19264	NC_016641	CGA	2	6	1004667	1004672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320808
19265	NC_016641	GCA	2	6	1004687	1004692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320808
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19268	NC_016641	TG	3	6	1004923	1004928	0 %	50 %	50 %	0 %	374320808
19269	NC_016641	GC	3	6	1004969	1004974	0 %	0 %	50 %	50 %	374320808
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19273	NC_016641	GCG	2	6	1005158	1005163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320808
19274	NC_016641	CG	3	6	1005263	1005268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19275	NC_016641	CAT	2	6	1005283	1005288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19277	NC_016641	A	7	7	1005340	1005346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19278	NC_016641	CAT	2	6	1005373	1005378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19289	NC_016641	CTT	2	6	1005854	1005859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19331	NC_016641	CAAAGC	2	12	1009076	1009087	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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19346	NC_016641	GCT	3	9	1010131	1010139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320814
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19352	NC_016641	GT	3	6	1010814	1010819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19353	NC_016641	TCT	2	6	1010829	1010834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320815
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19356	NC_016641	T	6	6	1011006	1011011	0 %	100 %	0 %	0 %	374320815
19357	NC_016641	TCTGC	2	10	1011113	1011122	0 %	40 %	20 %	40 %	374320815
19358	NC_016641	TGA	2	6	1011150	1011155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320815
19359	NC_016641	TTGCTC	2	12	1011310	1011321	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	374320815
19360	NC_016641	CAAA	2	8	1011330	1011337	75 %	0 %	0 %	25 %	374320815
19361	NC_016641	CCT	2	6	1011385	1011390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374320816
19362	NC_016641	GCTT	2	8	1011601	1011608	0 %	50 %	25 %	25 %	374320816
19363	NC_016641	TGTT	2	8	1011615	1011622	0 %	75 %	25 %	0 %	374320816
19364	NC_016641	AAT	2	6	1011633	1011638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320816
19365	NC_016641	CTT	2	6	1011647	1011652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320816
19366	NC_016641	TCA	2	6	1011682	1011687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320816
19367	NC_016641	AGC	3	9	1011693	1011701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320816
19368	NC_016641	GCC	2	6	1011718	1011723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320816
19369	NC_016641	TCAT	2	8	1011724	1011731	25 %	50 %	0 %	25 %	374320816
19370	NC_016641	CGC	2	6	1011751	1011756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320816
19371	NC_016641	AG	3	6	1011773	1011778	50 %	0 %	50 %	0 %	374320816
19372	NC_016641	AAG	2	6	1011923	1011928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19373	NC_016641	GCT	2	6	1011978	1011983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320817
19374	NC_016641	AATG	2	8	1011992	1011999	50 %	25 %	25 %	0 %	374320817
19375	NC_016641	ACA	2	6	1012005	1012010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374320817
19376	NC_016641	GAT	2	6	1012013	1012018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320817
19377	NC_016641	AAG	2	6	1012066	1012071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374320817
19378	NC_016641	TTAC	2	8	1012110	1012117	25 %	50 %	0 %	25 %	374320817
19379	NC_016641	GCT	3	9	1012170	1012178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320817
19380	NC_016641	TCC	2	6	1012207	1012212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19381	NC_016641	TGT	2	6	1012230	1012235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19382	NC_016641	CTT	2	6	1012311	1012316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320818
19383	NC_016641	ATCC	2	8	1012436	1012443	25 %	25 %	0 %	50 %	374320818
19384	NC_016641	CAG	2	6	1012468	1012473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320818
19385	NC_016641	AAAG	2	8	1012570	1012577	75 %	0 %	25 %	0 %	374320818
19386	NC_016641	ATC	2	6	1012652	1012657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320818
19387	NC_016641	CCA	2	6	1012702	1012707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374320818
19388	NC_016641	GCTTGT	2	12	1012745	1012756	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	374320818
19389	NC_016641	CTT	2	6	1012764	1012769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320818
19390	NC_016641	CGA	2	6	1012860	1012865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320818
19391	NC_016641	TTC	2	6	1012913	1012918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320818
19392	NC_016641	TAC	2	6	1013053	1013058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320818
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19394	NC_016641	ATG	2	6	1013069	1013074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320818
19395	NC_016641	CAT	2	6	1013155	1013160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320819
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19399	NC_016641	TCT	2	6	1013327	1013332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320819
19400	NC_016641	CGG	2	6	1013342	1013347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320819
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19412	NC_016641	TCC	2	6	1014254	1014259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374320821
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19415	NC_016641	CCA	2	6	1014318	1014323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374320821
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19420	NC_016641	TTCC	2	8	1014637	1014644	0 %	50 %	0 %	50 %	374320821
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19423	NC_016641	TCA	2	6	1014930	1014935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320821
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19426	NC_016641	TA	3	6	1015204	1015209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19430	NC_016641	TCA	2	6	1015386	1015391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320822
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19435	NC_016641	GCA	2	6	1015584	1015589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320822
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19441	NC_016641	TAT	2	6	1015877	1015882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19442	NC_016641	TAT	2	6	1015995	1016000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19447	NC_016641	TA	3	6	1016283	1016288	50 %	50 %	0 %	0 %	374320823
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19451	NC_016641	A	7	7	1016414	1016420	100 %	0 %	0 %	0 %	374320823
19452	NC_016641	GAA	2	6	1016444	1016449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19455	NC_016641	AAC	2	6	1016537	1016542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19456	NC_016641	GATT	2	8	1016544	1016551	25 %	50 %	25 %	0 %	374320824
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19467	NC_016641	CAGC	2	8	1016918	1016925	25 %	0 %	25 %	50 %	374320824
19468	NC_016641	GAAG	2	8	1016964	1016971	50 %	0 %	50 %	0 %	374320824
19469	NC_016641	TG	3	6	1017122	1017127	0 %	50 %	50 %	0 %	374320824
19470	NC_016641	GTT	3	9	1017130	1017138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374320824
19471	NC_016641	CTG	2	6	1017176	1017181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320824
19472	NC_016641	TCA	2	6	1017337	1017342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320824
19473	NC_016641	ACA	2	6	1017392	1017397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374320824
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19475	NC_016641	CCA	2	6	1017436	1017441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374320824
19476	NC_016641	GTA	2	6	1017615	1017620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320824
19477	NC_016641	ATTT	2	8	1017647	1017654	25 %	75 %	0 %	0 %	374320824
19478	NC_016641	CAT	2	6	1017795	1017800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320824
19479	NC_016641	GATT	2	8	1017801	1017808	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19480	NC_016641	CTC	2	6	1017854	1017859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19481	NC_016641	TCA	3	9	1017871	1017879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19482	NC_016641	A	7	7	1017884	1017890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19483	NC_016641	GCC	2	6	1017906	1017911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19484	NC_016641	AAATGC	2	12	1017919	1017930	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	374320825
19485	NC_016641	CCG	2	6	1017943	1017948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320825
19486	NC_016641	CTT	2	6	1017950	1017955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320825
19487	NC_016641	CGCT	2	8	1017972	1017979	0 %	25 %	25 %	50 %	374320825
19488	NC_016641	TCC	2	6	1017981	1017986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374320825
19489	NC_016641	CGC	2	6	1018008	1018013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320825
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19499	NC_016641	CTA	2	6	1018448	1018453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320825
19500	NC_016641	CCT	2	6	1018523	1018528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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